src/gromacs/mdlib/nbnxn_gpu_data_mgmt.h

   1 /*
   2  * This file is part of the GROMACS molecular simulation package.
   3  *
   4  * Copyright (c) 2014,2015,2017, by the GROMACS development team, led by
   5  * Mark Abraham, David van der Spoel, Berk Hess, and Erik Lindahl,
   6  * and including many others, as listed in the AUTHORS file in the
   7  * top-level source directory and at http://www.gromacs.org.
   8  *
   9  * GROMACS is free software; you can redistribute it and/or
  10  * modify it under the terms of the GNU Lesser General Public License
  11  * as published by the Free Software Foundation; either version 2.1
  12  * of the License, or (at your option) any later version.
  13  *
  14  * GROMACS is distributed in the hope that it will be useful,
  15  * but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
  16  * MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the GNU
  17  * Lesser General Public License for more details.
  18  *
  19  * You should have received a copy of the GNU Lesser General Public
  20  * License along with GROMACS; if not, see
  21  * http://www.gnu.org/licenses, or write to the Free Software Foundation,
  22  * Inc., 51 Franklin Street, Fifth Floor, Boston, MA  02110-1301  USA.
  23  *
  24  * If you want to redistribute modifications to GROMACS, please
  25  * consider that scientific software is very special. Version
  26  * control is crucial - bugs must be traceable. We will be happy to
  27  * consider code for inclusion in the official distribution, but
  28  * derived work must not be called official GROMACS. Details are found
  29  * in the README & COPYING files - if they are missing, get the
  30  * official version at http://www.gromacs.org.
  31  *
  32  * To help us fund GROMACS development, we humbly ask that you cite
  33  * the research papers on the package. Check out http://www.gromacs.org.
  34  */
  35 /*! \libinternal \file
  36  *  \brief Declare interface for GPU data transfer for NBNXN module
  37  *
  38  *  \author Mark Abraham <mark.j.abraham@gmail.com>
  39  *  \ingroup module_mdlib
  40  *  \inlibraryapi
  41  */
  42
  43 #ifndef NBNXN_GPU_DATA_MGMT_H
  44 #define NBNXN_GPU_DATA_MGMT_H
  45
  46 #include "gromacs/gpu_utils/gpu_macros.h"
  47 #include "gromacs/mdlib/nbnxn_gpu_types.h"
  48 #include "gromacs/mdtypes/interaction_const.h"
  49
  50 #ifdef __cplusplus
  51 extern "C" {
  52 #endif
  53
  54 struct nonbonded_verlet_group_t;
  55 struct nbnxn_pairlist_t;
  56 struct nbnxn_atomdata_t;
  57 struct gmx_wallclock_gpu_t;
  58 struct gmx_gpu_info_t;
  59
  60 /** Initializes the data structures related to GPU nonbonded calculations. */
  61 GPU_FUNC_QUALIFIER
  62 void nbnxn_gpu_init(gmx_nbnxn_gpu_t gmx_unused            **p_nb,
  63                     const gmx_device_info_t gmx_unused     *deviceInfo,
  64                     const interaction_const_t gmx_unused   *ic,
  65                     nonbonded_verlet_group_t gmx_unused    *nbv_grp,
  66                     int gmx_unused                          rank,
  67                     /* true if both local and non-local are done on GPU */
  68                     gmx_bool gmx_unused                     bLocalAndNonlocal) GPU_FUNC_TERM
  69
  70 /** Initializes pair-list data for GPU, called at every pair search step. */
  71 GPU_FUNC_QUALIFIER
  72 void nbnxn_gpu_init_pairlist(gmx_nbnxn_gpu_t gmx_unused               *nb,
  73                              const struct nbnxn_pairlist_t gmx_unused *h_nblist,
  74                              int                    gmx_unused         iloc) GPU_FUNC_TERM
  75
  76 /** Initializes atom-data on the GPU, called at every pair search step. */
  77 GPU_FUNC_QUALIFIER
  78 void nbnxn_gpu_init_atomdata(gmx_nbnxn_gpu_t gmx_unused               *nb,
  79                              const struct nbnxn_atomdata_t gmx_unused *nbat) GPU_FUNC_TERM
  80
  81 /*! \brief Re-generate the GPU Ewald force table, resets rlist, and update the
  82  *  electrostatic type switching to twin cut-off (or back) if needed.
  83  */
  84 GPU_FUNC_QUALIFIER
  85 void nbnxn_gpu_pme_loadbal_update_param(const struct nonbonded_verlet_t gmx_unused *nbv,
  86                                         const interaction_const_t gmx_unused       *ic) GPU_FUNC_TERM
  87
  88 /** Uploads shift vector to the GPU if the box is dynamic (otherwise just returns). */
  89 GPU_FUNC_QUALIFIER
  90 void nbnxn_gpu_upload_shiftvec(gmx_nbnxn_gpu_t gmx_unused               *nb,
  91                                const struct nbnxn_atomdata_t gmx_unused *nbatom) GPU_FUNC_TERM
  92
  93 /** Clears GPU outputs: nonbonded force, shift force and energy. */
  94 GPU_FUNC_QUALIFIER
  95 void nbnxn_gpu_clear_outputs(gmx_nbnxn_gpu_t gmx_unused *nb,
  96                              int              gmx_unused flags) GPU_FUNC_TERM
  97
  98 /** Frees all GPU resources used for the nonbonded calculations. */
  99 GPU_FUNC_QUALIFIER
 100 void nbnxn_gpu_free(gmx_nbnxn_gpu_t gmx_unused *nb) GPU_FUNC_TERM
 101
 102 /** Returns the GPU timings structure or NULL if GPU is not used or timing is off. */
 103 GPU_FUNC_QUALIFIER
 104 struct gmx_wallclock_gpu_t * nbnxn_gpu_get_timings(gmx_nbnxn_gpu_t gmx_unused *nb) GPU_FUNC_TERM_WITH_RETURN(NULL)
 105
 106 /** Resets nonbonded GPU timings. */
 107 GPU_FUNC_QUALIFIER
 108 void nbnxn_gpu_reset_timings(struct nonbonded_verlet_t gmx_unused *nbv) GPU_FUNC_TERM
 109
 110 /** Calculates the minimum size of proximity lists to improve SM load balance
 111  *  with GPU non-bonded kernels. */
 112 GPU_FUNC_QUALIFIER
 113 int nbnxn_gpu_min_ci_balanced(gmx_nbnxn_gpu_t gmx_unused *nb) GPU_FUNC_TERM_WITH_RETURN(-1)
 114
 115 /** Returns if analytical Ewald GPU kernels are used. */
 116 GPU_FUNC_QUALIFIER
 117 gmx_bool nbnxn_gpu_is_kernel_ewald_analytical(const gmx_nbnxn_gpu_t gmx_unused *nb) GPU_FUNC_TERM_WITH_RETURN(FALSE)
 118
 119 #ifdef __cplusplus
 120 }
 121 #endif
 122
 123 #endif