src/gromacs/mdlib/expanded.h

   1 /*
   2  * This file is part of the GROMACS molecular simulation package.
   3  *
   4  * Copyright (c) 2017,2018, by the GROMACS development team, led by
   5  * Mark Abraham, David van der Spoel, Berk Hess, and Erik Lindahl,
   6  * and including many others, as listed in the AUTHORS file in the
   7  * top-level source directory and at http://www.gromacs.org.
   8  *
   9  * GROMACS is free software; you can redistribute it and/or
  10  * modify it under the terms of the GNU Lesser General Public License
  11  * as published by the Free Software Foundation; either version 2.1
  12  * of the License, or (at your option) any later version.
  13  *
  14  * GROMACS is distributed in the hope that it will be useful,
  15  * but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
  16  * MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the GNU
  17  * Lesser General Public License for more details.
  18  *
  19  * You should have received a copy of the GNU Lesser General Public
  20  * License along with GROMACS; if not, see
  21  * http://www.gnu.org/licenses, or write to the Free Software Foundation,
  22  * Inc., 51 Franklin Street, Fifth Floor, Boston, MA  02110-1301  USA.
  23  *
  24  * If you want to redistribute modifications to GROMACS, please
  25  * consider that scientific software is very special. Version
  26  * control is crucial - bugs must be traceable. We will be happy to
  27  * consider code for inclusion in the official distribution, but
  28  * derived work must not be called official GROMACS. Details are found
  29  * in the README & COPYING files - if they are missing, get the
  30  * official version at http://www.gromacs.org.
  31  *
  32  * To help us fund GROMACS development, we humbly ask that you cite
  33  * the research papers on the package. Check out http://www.gromacs.org.
  34  */
  35 #ifndef GMX_MDLIB_EXPANDED_H
  36 #define GMX_MDLIB_EXPANDED_H
  37
  38 #include <stdio.h>
  39
  40 #include "gromacs/math/vectypes.h"
  41 #include "gromacs/utility/basedefinitions.h"
  42
  43 struct df_history_t;
  44 struct gmx_enerdata_t;
  45 struct t_expanded;
  46 struct t_extmass;
  47 struct t_inputrec;
  48 struct t_lambda;
  49 struct t_mdatoms;
  50 struct t_simtemp;
  51 class t_state;
  52
  53 void init_npt_masses(t_inputrec *ir, t_state *state, t_extmass *MassQ, gmx_bool bInit);
  54
  55 void init_expanded_ensemble(gmx_bool bStateFromCP, t_inputrec *ir, df_history_t *dfhist);
  56
  57 int ExpandedEnsembleDynamics(FILE *log, t_inputrec *ir, gmx_enerdata_t *enerd,
  58                              t_state *state, t_extmass *MassQ, int fep_state, df_history_t *dfhist,
  59                              int64_t step,
  60                              rvec *v, t_mdatoms *mdatoms);
  61
  62 void PrintFreeEnergyInfoToFile(FILE *outfile, t_lambda *fep, t_expanded *expand, t_simtemp *simtemp, df_history_t *dfhist,
  63                                int fep_state, int frequency, int64_t step);
  64
  65 #endif