src/gromacs/math/vecdump.cpp

   1 /*
   2  * This file is part of the GROMACS molecular simulation package.
   3  *
   4  * Copyright (c) 1991-2000, University of Groningen, The Netherlands.
   5  * Copyright (c) 2001-2004, The GROMACS development team.
   6  * Copyright (c) 2013,2014,2015,2016, by the GROMACS development team, led by
   7  * Mark Abraham, David van der Spoel, Berk Hess, and Erik Lindahl,
   8  * and including many others, as listed in the AUTHORS file in the
   9  * top-level source directory and at http://www.gromacs.org.
  10  *
  11  * GROMACS is free software; you can redistribute it and/or
  12  * modify it under the terms of the GNU Lesser General Public License
  13  * as published by the Free Software Foundation; either version 2.1
  14  * of the License, or (at your option) any later version.
  15  *
  16  * GROMACS is distributed in the hope that it will be useful,
  17  * but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
  18  * MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the GNU
  19  * Lesser General Public License for more details.
  20  *
  21  * You should have received a copy of the GNU Lesser General Public
  22  * License along with GROMACS; if not, see
  23  * http://www.gnu.org/licenses, or write to the Free Software Foundation,
  24  * Inc., 51 Franklin Street, Fifth Floor, Boston, MA  02110-1301  USA.
  25  *
  26  * If you want to redistribute modifications to GROMACS, please
  27  * consider that scientific software is very special. Version
  28  * control is crucial - bugs must be traceable. We will be happy to
  29  * consider code for inclusion in the official distribution, but
  30  * derived work must not be called official GROMACS. Details are found
  31  * in the README & COPYING files - if they are missing, get the
  32  * official version at http://www.gromacs.org.
  33  *
  34  * To help us fund GROMACS development, we humbly ask that you cite
  35  * the research papers on the package. Check out http://www.gromacs.org.
  36  */
  37 #include "gmxpre.h"
  38
  39 #include "vecdump.h"
  40
  41 #include <cstdio>
  42 #include <cstdlib>
  43
  44 #include "gromacs/math/vec.h"
  45 #include "gromacs/utility/stringutil.h"
  46 #include "gromacs/utility/txtdump.h"
  47
  48 void pr_ivec(FILE *fp, int indent, const char *title, const int vec[], int n, gmx_bool bShowNumbers)
  49 {
  50     int i;
  51
  52     if (available(fp, vec, indent, title))
  53     {
  54         indent = pr_title_n(fp, indent, title, n);
  55         for (i = 0; i < n; i++)
  56         {
  57             pr_indent(fp, indent);
  58             fprintf(fp, "%s[%d]=%d\n", title, bShowNumbers ? i : -1, vec[i]);
  59         }
  60     }
  61 }
  62
  63 void pr_ivec_block(FILE *fp, int indent, const char *title, const int vec[], int n, gmx_bool bShowNumbers)
  64 {
  65     int i, j;
  66
  67     if (available(fp, vec, indent, title))
  68     {
  69         indent = pr_title_n(fp, indent, title, n);
  70         i      = 0;
  71         while (i < n)
  72         {
  73             j = i+1;
  74             while (j < n && vec[j] == vec[j-1]+1)
  75             {
  76                 j++;
  77             }
  78             /* Print consecutive groups of 3 or more as blocks */
  79             if (j - i < 3)
  80             {
  81                 while (i < j)
  82                 {
  83                     pr_indent(fp, indent);
  84                     fprintf(fp, "%s[%d]=%d\n",
  85                             title, bShowNumbers ? i : -1, vec[i]);
  86                     i++;
  87                 }
  88             }
  89             else
  90             {
  91                 pr_indent(fp, indent);
  92                 fprintf(fp, "%s[%d,...,%d] = {%d,...,%d}\n",
  93                         title,
  94                         bShowNumbers ? i : -1,
  95                         bShowNumbers ? j-1 : -1,
  96                         vec[i], vec[j-1]);
  97                 i = j;
  98             }
  99         }
 100     }
 101 }
 102
 103 void pr_bvec(FILE *fp, int indent, const char *title, const gmx_bool vec[], int n, gmx_bool bShowNumbers)
 104 {
 105     int i;
 106
 107     if (available(fp, vec, indent, title))
 108     {
 109         indent = pr_title_n(fp, indent, title, n);
 110         for (i = 0; i < n; i++)
 111         {
 112             pr_indent(fp, indent);
 113             fprintf(fp, "%s[%d]=%s\n", title, bShowNumbers ? i : -1,
 114                     gmx::boolToString(vec[i]));
 115         }
 116     }
 117 }
 118
 119 void pr_ivecs(FILE *fp, int indent, const char *title, const ivec vec[], int n, gmx_bool bShowNumbers)
 120 {
 121     int i, j;
 122
 123     if (available(fp, vec, indent, title))
 124     {
 125         indent = pr_title_nxn(fp, indent, title, n, DIM);
 126         for (i = 0; i < n; i++)
 127         {
 128             pr_indent(fp, indent);
 129             fprintf(fp, "%s[%d]={", title, bShowNumbers ? i : -1);
 130             for (j = 0; j < DIM; j++)
 131             {
 132                 if (j != 0)
 133                 {
 134                     fprintf(fp, ", ");
 135                 }
 136                 fprintf(fp, "%d", vec[i][j]);
 137             }
 138             fprintf(fp, "}\n");
 139         }
 140     }
 141 }
 142
 143 template <typename T>
 144 static void printRealVector(FILE *fp, int indent, const char *title, const T vec[], int n, gmx_bool bShowNumbers)
 145 {
 146     if (available(fp, vec, indent, title))
 147     {
 148         indent = pr_title_n(fp, indent, title, n);
 149         for (int i = 0; i < n; i++)
 150         {
 151             pr_indent(fp, indent);
 152             fprintf(fp, "%s[%d]=%12.5e\n", title, bShowNumbers ? i : -1, vec[i]);
 153         }
 154     }
 155 }
 156
 157 void pr_rvec(FILE *fp, int indent, const char *title, const real vec[], int n, gmx_bool bShowNumbers)
 158 {
 159     printRealVector<real>(fp, indent, title, vec, n, bShowNumbers);
 160 }
 161
 162 void pr_fvec(FILE *fp, int indent, const char *title, const float vec[], int n, gmx_bool bShowNumbers)
 163 {
 164     printRealVector<float>(fp, indent, title, vec, n, bShowNumbers);
 165 }
 166
 167 void pr_dvec(FILE *fp, int indent, const char *title, const double vec[], int n, gmx_bool bShowNumbers)
 168 {
 169     printRealVector<double>(fp, indent, title, vec, n, bShowNumbers);
 170 }
 171
 172
 173 void pr_rvecs_len(FILE *fp, int indent, const char *title, const rvec vec[], int n)
 174 {
 175     int i, j;
 176
 177     if (available(fp, vec, indent, title))
 178     {
 179         indent = pr_title_nxn(fp, indent, title, n, DIM);
 180         for (i = 0; i < n; i++)
 181         {
 182             pr_indent(fp, indent);
 183             fprintf(fp, "%s[%5d]={", title, i);
 184             for (j = 0; j < DIM; j++)
 185             {
 186                 if (j != 0)
 187                 {
 188                     fprintf(fp, ", ");
 189                 }
 190                 fprintf(fp, "%12.5e", vec[i][j]);
 191             }
 192             fprintf(fp, "} len=%12.5e\n", norm(vec[i]));
 193         }
 194     }
 195 }
 196
 197 void pr_rvecs(FILE *fp, int indent, const char *title, const rvec vec[], int n)
 198 {
 199     const char *fshort = "%12.5e";
 200     const char *flong  = "%15.8e";
 201     const char *format;
 202     int         i, j;
 203
 204     if (getenv("GMX_PRINT_LONGFORMAT") != NULL)
 205     {
 206         format = flong;
 207     }
 208     else
 209     {
 210         format = fshort;
 211     }
 212
 213     if (available(fp, vec, indent, title))
 214     {
 215         indent = pr_title_nxn(fp, indent, title, n, DIM);
 216         for (i = 0; i < n; i++)
 217         {
 218             pr_indent(fp, indent);
 219             fprintf(fp, "%s[%5d]={", title, i);
 220             for (j = 0; j < DIM; j++)
 221             {
 222                 if (j != 0)
 223                 {
 224                     fprintf(fp, ", ");
 225                 }
 226                 fprintf(fp, format, vec[i][j]);
 227             }
 228             fprintf(fp, "}\n");
 229         }
 230     }
 231 }
 232
 233
 234 void pr_rvecs_of_dim(FILE *fp, int indent, const char *title, const rvec vec[], int n, int dim)
 235 {
 236     const char *fshort = "%12.5e";
 237     const char *flong  = "%15.8e";
 238     const char *format;
 239     int         i, j;
 240
 241     if (getenv("GMX_PRINT_LONGFORMAT") != NULL)
 242     {
 243         format = flong;
 244     }
 245     else
 246     {
 247         format = fshort;
 248     }
 249
 250     if (available(fp, vec, indent, title))
 251     {
 252         indent = pr_title_nxn(fp, indent, title, n, dim);
 253         for (i = 0; i < n; i++)
 254         {
 255             pr_indent(fp, indent);
 256             fprintf(fp, "%s[%5d]={", title, i);
 257             for (j = 0; j < dim; j++)
 258             {
 259                 if (j != 0)
 260                 {
 261                     fprintf(fp, ", ");
 262                 }
 263                 fprintf(fp, format, vec[i][j]);
 264             }
 265             fprintf(fp, "}\n");
 266         }
 267     }
 268 }