src/gromacs/math/units.cpp

   1 /*
   2  * This file is part of the GROMACS molecular simulation package.
   3  *
   4  * Copyright (c) 2010,2011,2014,2015,2017 by the GROMACS development team.
   5  * Copyright (c) 2018,2019,2020, by the GROMACS development team, led by
   6  * Mark Abraham, David van der Spoel, Berk Hess, and Erik Lindahl,
   7  * and including many others, as listed in the AUTHORS file in the
   8  * top-level source directory and at http://www.gromacs.org.
   9  *
  10  * GROMACS is free software; you can redistribute it and/or
  11  * modify it under the terms of the GNU Lesser General Public License
  12  * as published by the Free Software Foundation; either version 2.1
  13  * of the License, or (at your option) any later version.
  14  *
  15  * GROMACS is distributed in the hope that it will be useful,
  16  * but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
  17  * MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the GNU
  18  * Lesser General Public License for more details.
  19  *
  20  * You should have received a copy of the GNU Lesser General Public
  21  * License along with GROMACS; if not, see
  22  * http://www.gnu.org/licenses, or write to the Free Software Foundation,
  23  * Inc., 51 Franklin Street, Fifth Floor, Boston, MA  02110-1301  USA.
  24  *
  25  * If you want to redistribute modifications to GROMACS, please
  26  * consider that scientific software is very special. Version
  27  * control is crucial - bugs must be traceable. We will be happy to
  28  * consider code for inclusion in the official distribution, but
  29  * derived work must not be called official GROMACS. Details are found
  30  * in the README & COPYING files - if they are missing, get the
  31  * official version at http://www.gromacs.org.
  32  *
  33  * To help us fund GROMACS development, we humbly ask that you cite
  34  * the research papers on the package. Check out http://www.gromacs.org.
  35  */
  36 #include "gmxpre.h"
  37
  38 #include "units.h"
  39
  40 #include <cstdio>
  41
  42 #include "gromacs/utility/cstringutil.h"
  43
  44 double convert2gmx(double x, int unit)
  45 {
  46     switch (unit)
  47     {
  48         case eg2cAngstrom: return x * A2NM;
  49         case eg2cNm: return x;
  50         case eg2cBohr: return x * BOHR2NM;
  51         case eg2cKcal_Mole: return x / CAL2JOULE;
  52         case eg2cHartree: return x * ONE_4PI_EPS0 / BOHR2NM; // NOLINT bugprone-branch-clone
  53         case eg2cHartree_e: return x * ONE_4PI_EPS0 / BOHR2NM;
  54         case eg2cAngstrom3: return x * A2NM * A2NM * A2NM;
  55         case eg2cCoulomb: return x / E_CHARGE;
  56         case eg2cDebye: return x * DEBYE2ENM;
  57         case eg2cElectron: return x;
  58         case eg2cBuckingham: return x * A2NM * DEBYE2ENM;
  59         default: fprintf(stderr, "Unknown unit %d, not converting.\n", unit);
  60     }
  61     return x;
  62 }
  63
  64 double gmx2convert(double x, int unit)
  65 {
  66     switch (unit)
  67     {
  68         case eg2cAngstrom: return x / A2NM;
  69         case eg2cNm: return x;
  70         case eg2cBohr: return x / BOHR2NM;
  71         case eg2cKcal_Mole: return x * CAL2JOULE;
  72         case eg2cHartree: return x / (ONE_4PI_EPS0 / BOHR2NM); // NOLINT bugprone-branch-clone
  73         case eg2cHartree_e: return x / (ONE_4PI_EPS0 / BOHR2NM);
  74         case eg2cAngstrom3: return x / (A2NM * A2NM * A2NM);
  75         case eg2cCoulomb: return x * E_CHARGE;
  76         case eg2cDebye: return x / DEBYE2ENM;
  77         case eg2cElectron: return x;
  78         case eg2cBuckingham: return x / (A2NM * DEBYE2ENM);
  79         default: fprintf(stderr, "Unknown unit %d, not converting.\n", unit);
  80     }
  81     return x;
  82 }
  83
  84 /* This has to have the same order as the enums. */
  85 static const char* eg2c_names[eg2cNR] = { "Angstrom", "Nm",        "Bohr",      "Kcal_Mole",
  86                                           "Hartree",  "Hartree_e", "Angstrom3", "Coulomb",
  87                                           "Debye",    "Electron",  "Buckingham" };
  88
  89 int string2unit(char* string)
  90 {
  91     int i;
  92
  93     for (i = 0; (i < eg2cNR); i++)
  94     {
  95         if (gmx_strcasecmp(string, eg2c_names[i]) == 0)
  96         {
  97             return i;
  98         }
  99     }
 100     return -1;
 101 }
 102
 103 const char* unit2string(int unit)
 104 {
 105     if ((unit >= 0) && (unit < eg2cNR))
 106     {
 107         return eg2c_names[unit];
 108     }
 109
 110     return nullptr;
 111 }