src/gromacs/math/arrayrefwithpadding.h

   1 /*
   2  * This file is part of the GROMACS molecular simulation package.
   3  *
   4  * Copyright (c) 2018,2019, by the GROMACS development team, led by
   5  * Mark Abraham, David van der Spoel, Berk Hess, and Erik Lindahl,
   6  * and including many others, as listed in the AUTHORS file in the
   7  * top-level source directory and at http://www.gromacs.org.
   8  *
   9  * GROMACS is free software; you can redistribute it and/or
  10  * modify it under the terms of the GNU Lesser General Public License
  11  * as published by the Free Software Foundation; either version 2.1
  12  * of the License, or (at your option) any later version.
  13  *
  14  * GROMACS is distributed in the hope that it will be useful,
  15  * but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
  16  * MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the GNU
  17  * Lesser General Public License for more details.
  18  *
  19  * You should have received a copy of the GNU Lesser General Public
  20  * License along with GROMACS; if not, see
  21  * http://www.gnu.org/licenses, or write to the Free Software Foundation,
  22  * Inc., 51 Franklin Street, Fifth Floor, Boston, MA  02110-1301  USA.
  23  *
  24  * If you want to redistribute modifications to GROMACS, please
  25  * consider that scientific software is very special. Version
  26  * control is crucial - bugs must be traceable. We will be happy to
  27  * consider code for inclusion in the official distribution, but
  28  * derived work must not be called official GROMACS. Details are found
  29  * in the README & COPYING files - if they are missing, get the
  30  * official version at http://www.gromacs.org.
  31  *
  32  * To help us fund GROMACS development, we humbly ask that you cite
  33  * the research papers on the package. Check out http://www.gromacs.org.
  34  */
  35 /*! \file
  36  * \brief Declares gmx::ArrayRefWithPadding that refers to memory whose
  37  * size includes padding for SIMD operations.
  38  *
  39  * \author Mark Abraham <mark.j.abraham@gmail.com>
  40  *
  41  * \inpublicapi
  42  * \ingroup module_math
  43  */
  44 #ifndef GMX_MATH_ARRAYREFWITHPADDING_H
  45 #define GMX_MATH_ARRAYREFWITHPADDING_H
  46
  47 #include <cstddef>
  48
  49 #include "gromacs/utility/arrayref.h"
  50 #include "gromacs/utility/basedefinitions.h"
  51 #include "gromacs/utility/gmxassert.h"
  52
  53 namespace gmx
  54 {
  55
  56 /*! \brief Interface to a C array of T (or part of a std container of
  57  * T), that includes padding that is suitable for the kinds of SIMD
  58  * operations GROMACS uses.
  59  *
  60  * High level code e.g. in the force calculation routines need to hold
  61  * a non-owning view of memory and be able to create ArrayRef objects
  62  * that view padded or unpadded memory, suitable for the various
  63  * component routines. This class implements that non-owning view,
  64  * and the only available functionality refers to its size, and the
  65  * methods to create such ArrayRef objects.
  66  *
  67  * \copydoc ArrayRef
  68  * \inlibraryapi
  69  * \ingroup module_math
  70  */
  71 template <typename T>
  72 class ArrayRefWithPadding
  73 {
  74     public:
  75         //! Type of values stored in the reference.
  76         using value_type = T;
  77         //! Type for representing size of the reference.
  78         using size_type = index;
  79         //! Const pointer to an element.
  80         using const_pointer = const T*;
  81         //! Const iterator type to an element.
  82         using const_iterator = const T*;
  83         //! Pointer to an element.
  84         using pointer = T*;
  85         //! Iterator type to an element.
  86         using iterator = T*;
  87
  88         /*! \brief
  89          * Constructs an empty reference.
  90          */
  91         ArrayRefWithPadding()
  92             : begin_(nullptr), end_(nullptr), paddedEnd_(nullptr) {}
  93         /*! \brief
  94          * Constructs a reference to a particular range.
  95          *
  96          * \param[in] begin        Pointer to the beginning of a range.
  97          * \param[in] end          Pointer to the end of a range without padding.
  98          * \param[in] paddedEnd    Pointer to the end of a range including padding.
  99          *
 100          * Passed pointers must remain valid for the lifetime of this object.
 101          */
 102         ArrayRefWithPadding(pointer begin, pointer end, pointer paddedEnd)
 103             : begin_(begin), end_(end), paddedEnd_(paddedEnd)
 104         {
 105             GMX_ASSERT(end >= begin, "Invalid range");
 106             GMX_ASSERT(paddedEnd >= end, "Invalid range");
 107         }
 108         //! Copy constructor
 109         ArrayRefWithPadding(const ArrayRefWithPadding &o)
 110             : begin_(o.begin_), end_(o.end_), paddedEnd_(o.paddedEnd_) {}
 111         //! Move constructor
 112         ArrayRefWithPadding(ArrayRefWithPadding &&o) noexcept
 113             : begin_(std::move(o.begin_)), end_(std::move(o.end_)), paddedEnd_(std::move(o.paddedEnd_)) {}
 114         //! Copy assignment operator
 115         ArrayRefWithPadding &operator=(ArrayRefWithPadding const &o)
 116         {
 117             if (&o != this)
 118             {
 119                 begin_     = o.begin_;
 120                 end_       = o.end_;
 121                 paddedEnd_ = o.paddedEnd_;
 122             }
 123             return *this;
 124         }
 125         //! Move assignment operator
 126         ArrayRefWithPadding &operator=(ArrayRefWithPadding &&o) noexcept
 127         {
 128             if (&o != this)
 129             {
 130                 begin_     = std::move(o.begin_);
 131                 end_       = std::move(o.end_);
 132                 paddedEnd_ = std::move(o.paddedEnd_);
 133             }
 134             return *this;
 135         }
 136
 137         //! Return the size of the view, i.e with the padding.
 138         size_type size() const { return paddedEnd_ - begin_; }
 139         //! Whether the reference refers to no memory.
 140         bool empty() const { return begin_ == end_; }
 141
 142         //! Returns an ArrayRef of elements that does not include the padding region.
 143         ArrayRef<T> unpaddedArrayRef()
 144         {
 145             return {begin_, end_};
 146         }
 147         //! Returns an ArrayRef of const elements that does not include the padding region.
 148         ArrayRef<const T> unpaddedConstArrayRef() const
 149         {
 150             return {begin_, end_};
 151         }
 152         //! Returns an ArrayRef of elements that does include the padding region.
 153         ArrayRef<T> paddedArrayRef()
 154         {
 155             return {begin_, paddedEnd_};
 156         }
 157         //! Returns an ArrayRef of const elements that does include the padding region.
 158         ArrayRef<const T> paddedConstArrayRef() const
 159         {
 160             return {begin_, paddedEnd_};
 161         }
 162         /*! \brief
 163          * Swaps referenced memory with the other object.
 164          *
 165          * The actual memory areas are not modified, only the references are
 166          * swapped.
 167          */
 168         void swap(ArrayRefWithPadding<T> &other)
 169         {
 170             std::swap(begin_, other.begin_);
 171             std::swap(end_, other.end_);
 172         }
 173
 174     private:
 175         pointer begin_;
 176         pointer end_;
 177         pointer paddedEnd_;
 178 };
 179
 180 } // namespace gmx
 181
 182 #endif