src/gromacs/listed_forces/disre.cpp

   1 /*
   2  * This file is part of the GROMACS molecular simulation package.
   3  *
   4  * Copyright (c) 1991-2000, University of Groningen, The Netherlands.
   5  * Copyright (c) 2001-2004, The GROMACS development team.
   6  * Copyright (c) 2013,2014,2015,2016,2017 by the GROMACS development team.
   7  * Copyright (c) 2018,2019,2020,2021, by the GROMACS development team, led by
   8  * Mark Abraham, David van der Spoel, Berk Hess, and Erik Lindahl,
   9  * and including many others, as listed in the AUTHORS file in the
  10  * top-level source directory and at http://www.gromacs.org.
  11  *
  12  * GROMACS is free software; you can redistribute it and/or
  13  * modify it under the terms of the GNU Lesser General Public License
  14  * as published by the Free Software Foundation; either version 2.1
  15  * of the License, or (at your option) any later version.
  16  *
  17  * GROMACS is distributed in the hope that it will be useful,
  18  * but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
  19  * MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the GNU
  20  * Lesser General Public License for more details.
  21  *
  22  * You should have received a copy of the GNU Lesser General Public
  23  * License along with GROMACS; if not, see
  24  * http://www.gnu.org/licenses, or write to the Free Software Foundation,
  25  * Inc., 51 Franklin Street, Fifth Floor, Boston, MA  02110-1301  USA.
  26  *
  27  * If you want to redistribute modifications to GROMACS, please
  28  * consider that scientific software is very special. Version
  29  * control is crucial - bugs must be traceable. We will be happy to
  30  * consider code for inclusion in the official distribution, but
  31  * derived work must not be called official GROMACS. Details are found
  32  * in the README & COPYING files - if they are missing, get the
  33  * official version at http://www.gromacs.org.
  34  *
  35  * To help us fund GROMACS development, we humbly ask that you cite
  36  * the research papers on the package. Check out http://www.gromacs.org.
  37  */
  38 /* This file is completely threadsafe - keep it that way! */
  39 #include "gmxpre.h"
  40
  41 #include "disre.h"
  42
  43 #include "config.h"
  44
  45 #include <cmath>
  46 #include <cstdlib>
  47 #include <cstring>
  48
  49 #include <algorithm>
  50
  51 #include "gromacs/gmxlib/network.h"
  52 #include "gromacs/math/functions.h"
  53 #include "gromacs/math/vec.h"
  54 #include "gromacs/mdrunutility/multisim.h"
  55 #include "gromacs/mdtypes/commrec.h"
  56 #include "gromacs/mdtypes/fcdata.h"
  57 #include "gromacs/mdtypes/inputrec.h"
  58 #include "gromacs/mdtypes/md_enums.h"
  59 #include "gromacs/mdtypes/state.h"
  60 #include "gromacs/pbcutil/ishift.h"
  61 #include "gromacs/pbcutil/pbc.h"
  62 #include "gromacs/topology/mtop_util.h"
  63 #include "gromacs/topology/topology.h"
  64 #include "gromacs/utility/fatalerror.h"
  65 #include "gromacs/utility/futil.h"
  66 #include "gromacs/utility/gmxassert.h"
  67 #include "gromacs/utility/pleasecite.h"
  68 #include "gromacs/utility/smalloc.h"
  69
  70 void init_disres(FILE*                 fplog,
  71                  const gmx_mtop_t*     mtop,
  72                  t_inputrec*           ir,
  73                  DisResRunMode         disResRunMode,
  74                  DDRole                ddRole,
  75                  NumRanks              numRanks,
  76                  MPI_Comm              communicator,
  77                  const gmx_multisim_t* ms,
  78                  t_disresdata*         dd,
  79                  t_state*              state,
  80                  gmx_bool              bIsREMD)
  81 {
  82     int                  fa, nmol, npair, np;
  83     history_t*           hist;
  84     gmx_mtop_ilistloop_t iloop;
  85     char*                ptr;
  86     int                  type_min, type_max;
  87
  88     if (gmx_mtop_ftype_count(mtop, F_DISRES) == 0)
  89     {
  90         dd->nres = 0;
  91
  92         return;
  93     }
  94
  95     if (fplog)
  96     {
  97         fprintf(fplog, "Initializing the distance restraints\n");
  98     }
  99
 100     dd->dr_weighting = ir->eDisreWeighting;
 101     dd->dr_fc        = ir->dr_fc;
 102     if (EI_DYNAMICS(ir->eI))
 103     {
 104         dd->dr_tau = ir->dr_tau;
 105     }
 106     else
 107     {
 108         dd->dr_tau = 0.0;
 109     }
 110     if (dd->dr_tau == 0.0)
 111     {
 112         dd->dr_bMixed = FALSE;
 113         dd->ETerm     = 0.0;
 114     }
 115     else
 116     {
 117         /* We store the r^-6 time averages in an array that is indexed
 118          * with the local disres iatom index, so this doesn't work with DD.
 119          * Note that DD is not initialized yet here, so we check that we are on multiple ranks,
 120          * but there are probably also issues with e.g. NM MPI parallelization.
 121          */
 122         if ((disResRunMode == DisResRunMode::MDRun) && (numRanks == NumRanks::Multiple))
 123         {
 124             gmx_fatal(FARGS,
 125                       "Time-averaged distance restraints are not supported with MPI "
 126                       "parallelization. You can use OpenMP parallelization on a single node.");
 127         }
 128
 129         dd->dr_bMixed = ir->bDisreMixed;
 130         dd->ETerm     = std::exp(-(ir->delta_t / ir->dr_tau));
 131     }
 132     dd->ETerm1 = 1.0 - dd->ETerm;
 133
 134     dd->nres  = 0;
 135     dd->npair = 0;
 136     type_min  = INT_MAX;
 137     type_max  = 0;
 138     iloop     = gmx_mtop_ilistloop_init(mtop);
 139     while (const InteractionLists* il = gmx_mtop_ilistloop_next(iloop, &nmol))
 140     {
 141         if (nmol > 1 && !(*il)[F_DISRES].empty() && ir->eDisre != DistanceRestraintRefinement::Ensemble)
 142         {
 143             gmx_fatal(FARGS,
 144                       "NMR distance restraints with multiple copies of the same molecule are "
 145                       "currently only supported with ensemble averaging. If you just want to "
 146                       "restrain distances between atom pairs using a flat-bottomed potential, use "
 147                       "a restraint potential (bonds type 10) instead.");
 148         }
 149
 150         np = 0;
 151         for (fa = 0; fa < (*il)[F_DISRES].size(); fa += 3)
 152         {
 153             int type;
 154
 155             type = (*il)[F_DISRES].iatoms[fa];
 156
 157             np++;
 158             npair = mtop->ffparams.iparams[type].disres.npair;
 159             if (np == npair)
 160             {
 161                 dd->nres += (ir->eDisre == DistanceRestraintRefinement::Ensemble ? 1 : nmol);
 162                 dd->npair += nmol * npair;
 163                 np = 0;
 164
 165                 type_min = std::min(type_min, type);
 166                 type_max = std::max(type_max, type);
 167             }
 168         }
 169     }
 170
 171     if ((disResRunMode == DisResRunMode::MDRun) && (numRanks == NumRanks::Multiple) && ir->nstdisreout > 0)
 172     {
 173         /* With DD we currently only have local pair information available */
 174         gmx_fatal(FARGS,
 175                   "With MPI parallelization distance-restraint pair output is not supported. Use "
 176                   "nstdisreout=0 or use OpenMP parallelization on a single node.");
 177     }
 178
 179     /* For communicating and/or reducing (sums of) r^-6 for pairs over threads
 180      * we use multiple arrays in t_disresdata. We need to have unique indices
 181      * for each restraint that work over threads and MPI ranks. To this end
 182      * we use the type index. These should all be in one block and there should
 183      * be dd->nres types, but we check for this here.
 184      * This setup currently does not allow for multiple copies of the same
 185      * molecule without ensemble averaging, this is check for above.
 186      */
 187     GMX_RELEASE_ASSERT(
 188             type_max - type_min + 1 == dd->nres,
 189             "All distance restraint parameter entries in the topology should be consecutive");
 190
 191     dd->type_min = type_min;
 192
 193     snew(dd->rt, dd->npair);
 194
 195     if (dd->dr_tau != 0.0)
 196     {
 197         GMX_RELEASE_ASSERT(state != nullptr,
 198                            "We need a valid state when using time-averaged distance restraints");
 199
 200         hist = &state->hist;
 201         /* Set the "history lack" factor to 1 */
 202         state->flags |= (1 << estDISRE_INITF);
 203         hist->disre_initf = 1.0;
 204         /* Allocate space for the r^-3 time averages */
 205         state->flags |= (1 << estDISRE_RM3TAV);
 206         hist->ndisrepairs = dd->npair;
 207         snew(hist->disre_rm3tav, hist->ndisrepairs);
 208     }
 209     /* Allocate space for a copy of rm3tav,
 210      * so we can call do_force without modifying the state.
 211      */
 212     snew(dd->rm3tav, dd->npair);
 213
 214     /* Allocate Rt_6 and Rtav_6 consecutively in memory so they can be
 215      * averaged over the processors in one call (in calc_disre_R_6)
 216      */
 217     snew(dd->Rt_6, 2 * dd->nres);
 218     dd->Rtav_6 = &(dd->Rt_6[dd->nres]);
 219
 220     ptr = getenv("GMX_DISRE_ENSEMBLE_SIZE");
 221     if ((disResRunMode == DisResRunMode::MDRun) && ms != nullptr && ptr != nullptr && !bIsREMD)
 222     {
 223 #if GMX_MPI
 224         dd->nsystems = 0;
 225         sscanf(ptr, "%d", &dd->nsystems);
 226         if (fplog)
 227         {
 228             fprintf(fplog, "Found GMX_DISRE_ENSEMBLE_SIZE set to %d systems per ensemble\n", dd->nsystems);
 229         }
 230         /* This check is only valid on MASTER(cr), so probably
 231          * ensemble-averaged distance restraints are broken on more
 232          * than one processor per simulation system. */
 233         if (ddRole == DDRole::Master)
 234         {
 235             check_multi_int(fplog, ms, dd->nsystems, "the number of systems per ensemble", FALSE);
 236         }
 237         gmx_bcast(sizeof(int), &dd->nsystems, communicator);
 238
 239         /* We use to allow any value of nsystems which was a divisor
 240          * of ms->numSimulations_. But this required an extra communicator which
 241          * pulled in mpi.h in nearly all C files.
 242          */
 243         if (!(ms->numSimulations_ == 1 || ms->numSimulations_ == dd->nsystems))
 244         {
 245             gmx_fatal(FARGS,
 246                       "GMX_DISRE_ENSEMBLE_SIZE (%d) is not equal to 1 or the number of systems "
 247                       "(option -multidir) %d",
 248                       dd->nsystems,
 249                       ms->numSimulations_);
 250         }
 251         if (fplog)
 252         {
 253             fprintf(fplog, "Our ensemble consists of systems:");
 254             for (int i = 0; i < dd->nsystems; i++)
 255             {
 256                 fprintf(fplog, " %d", (ms->simulationIndex_ / dd->nsystems) * dd->nsystems + i);
 257             }
 258             fprintf(fplog, "\n");
 259         }
 260 #else
 261         GMX_UNUSED_VALUE(communicator);
 262 #endif
 263     }
 264     else
 265     {
 266         dd->nsystems = 1;
 267     }
 268
 269     if (dd->nsystems == 1)
 270     {
 271         dd->Rtl_6 = dd->Rt_6;
 272     }
 273     else
 274     {
 275         snew(dd->Rtl_6, dd->nres);
 276     }
 277
 278     if (dd->npair > 0)
 279     {
 280         if (fplog)
 281         {
 282             fprintf(fplog, "There are %d distance restraints involving %d atom pairs\n", dd->nres, dd->npair);
 283         }
 284         /* Have to avoid g_disre de-referencing cr blindly, mdrun not
 285          * doing consistency checks for ensemble-averaged distance
 286          * restraints when that's not happening, and only doing those
 287          * checks from appropriate processes (since check_multi_int is
 288          * too broken to check whether the communication will
 289          * succeed...) */
 290         if ((disResRunMode == DisResRunMode::MDRun) && ms && dd->nsystems > 1 && (ddRole == DDRole::Master))
 291         {
 292             check_multi_int(fplog, ms, dd->nres, "the number of distance restraints", FALSE);
 293         }
 294         please_cite(fplog, "Tropp80a");
 295         please_cite(fplog, "Torda89a");
 296     }
 297 }
 298
 299 void calc_disres_R_6(const t_commrec*      cr,
 300                      const gmx_multisim_t* ms,
 301                      int                   nfa,
 302                      const t_iatom         forceatoms[],
 303                      const rvec            x[],
 304                      const t_pbc*          pbc,
 305                      t_disresdata*         dd,
 306                      const history_t*      hist)
 307 {
 308     rvec     dx;
 309     real *   rt, *rm3tav, *Rtl_6, *Rt_6, *Rtav_6;
 310     real     ETerm, ETerm1, cf1 = 0, cf2 = 0;
 311     gmx_bool bTav;
 312
 313     bTav   = (dd->dr_tau != 0);
 314     ETerm  = dd->ETerm;
 315     ETerm1 = dd->ETerm1;
 316     rt     = dd->rt;
 317     rm3tav = dd->rm3tav;
 318     Rtl_6  = dd->Rtl_6;
 319     Rt_6   = dd->Rt_6;
 320     Rtav_6 = dd->Rtav_6;
 321
 322     if (bTav)
 323     {
 324         /* scaling factor to smoothly turn on the restraint forces *
 325          * when using time averaging                               */
 326         dd->exp_min_t_tau = hist->disre_initf * ETerm;
 327
 328         cf1 = dd->exp_min_t_tau;
 329         cf2 = 1.0 / (1.0 - dd->exp_min_t_tau);
 330     }
 331
 332     for (int res = 0; res < dd->nres; res++)
 333     {
 334         Rtav_6[res] = 0.0;
 335         Rt_6[res]   = 0.0;
 336     }
 337
 338     /* 'loop' over all atom pairs (pair_nr=fa/3) involved in restraints, *
 339      * the total number of atoms pairs is nfa/3                          */
 340     for (int fa = 0; fa < nfa; fa += 3)
 341     {
 342         int type = forceatoms[fa];
 343         int res  = type - dd->type_min;
 344         int pair = fa / 3;
 345         int ai   = forceatoms[fa + 1];
 346         int aj   = forceatoms[fa + 2];
 347
 348         if (pbc)
 349         {
 350             pbc_dx_aiuc(pbc, x[ai], x[aj], dx);
 351         }
 352         else
 353         {
 354             rvec_sub(x[ai], x[aj], dx);
 355         }
 356         real rt2  = iprod(dx, dx);
 357         real rt_1 = gmx::invsqrt(rt2);
 358         real rt_3 = rt_1 * rt_1 * rt_1;
 359
 360         rt[pair] = rt2 * rt_1;
 361         if (bTav)
 362         {
 363             /* Here we update rm3tav in t_disresdata using the data
 364              * in history_t.
 365              * Thus the results stay correct when this routine
 366              * is called multiple times.
 367              */
 368             rm3tav[pair] = cf2 * ((ETerm - cf1) * hist->disre_rm3tav[pair] + ETerm1 * rt_3);
 369         }
 370         else
 371         {
 372             rm3tav[pair] = rt_3;
 373         }
 374
 375         /* Currently divide_bondeds_over_threads() ensures that pairs within
 376          * the same restraint get assigned to the same thread, so we could
 377          * run this loop thread-parallel.
 378          */
 379         Rt_6[res] += rt_3 * rt_3;
 380         Rtav_6[res] += rm3tav[pair] * rm3tav[pair];
 381     }
 382
 383     /* NOTE: Rt_6 and Rtav_6 are stored consecutively in memory */
 384     if (cr && DOMAINDECOMP(cr))
 385     {
 386         gmx_sum(2 * dd->nres, dd->Rt_6, cr);
 387     }
 388
 389     if (dd->nsystems > 1)
 390     {
 391         real invn = 1.0 / dd->nsystems;
 392
 393         for (int res = 0; res < dd->nres; res++)
 394         {
 395             Rtl_6[res] = Rt_6[res];
 396             Rt_6[res] *= invn;
 397             Rtav_6[res] *= invn;
 398         }
 399
 400         GMX_ASSERT(cr != nullptr && ms != nullptr, "We need multisim with nsystems>1");
 401         gmx_sum_sim(2 * dd->nres, dd->Rt_6, ms);
 402
 403         if (DOMAINDECOMP(cr))
 404         {
 405             gmx_bcast(2 * dd->nres, dd->Rt_6, cr->mpi_comm_mygroup);
 406         }
 407     }
 408
 409     /* Store the base forceatoms pointer, so we can re-calculate the pair
 410      * index in ta_disres() for indexing pair data in t_disresdata when
 411      * using thread parallelization.
 412      */
 413     dd->forceatomsStart = forceatoms;
 414
 415     dd->sumviol = 0;
 416 }
 417
 418 real ta_disres(int              nfa,
 419                const t_iatom*   forceatoms,
 420                const t_iparams* ip,
 421                const rvec*      x,
 422                rvec4*           f,
 423                rvec*            fshift,
 424                const t_pbc*     pbc,
 425                real gmx_unused lambda,
 426                real gmx_unused* dvdlambda,
 427                const t_mdatoms gmx_unused* md,
 428                t_fcdata gmx_unused* fcd,
 429                t_disresdata*        disresdata,
 430                t_oriresdata gmx_unused* oriresdata,
 431                int gmx_unused* global_atom_index)
 432 {
 433     const real seven_three = 7.0 / 3.0;
 434
 435     rvec     dx;
 436     real     weight_rt_1;
 437     real     smooth_fc, Rt, Rtav, rt2, *Rtl_6, *Rt_6, *Rtav_6;
 438     real     k0, f_scal = 0, fmax_scal, fk_scal, fij;
 439     real     tav_viol, instant_viol, mixed_viol, violtot, vtot;
 440     real     tav_viol_Rtav7, instant_viol_Rtav7;
 441     real     up1, up2, low;
 442     gmx_bool bConservative, bMixed, bViolation;
 443     gmx_bool dr_bMixed;
 444
 445     DistanceRestraintWeighting dr_weighting = disresdata->dr_weighting;
 446     dr_bMixed                               = disresdata->dr_bMixed;
 447     Rtl_6                                   = disresdata->Rtl_6;
 448     Rt_6                                    = disresdata->Rt_6;
 449     Rtav_6                                  = disresdata->Rtav_6;
 450
 451     tav_viol = instant_viol = mixed_viol = tav_viol_Rtav7 = instant_viol_Rtav7 = 0;
 452
 453     smooth_fc = disresdata->dr_fc;
 454     if (disresdata->dr_tau != 0)
 455     {
 456         /* scaling factor to smoothly turn on the restraint forces *
 457          * when using time averaging                               */
 458         smooth_fc *= (1.0 - disresdata->exp_min_t_tau);
 459     }
 460
 461     violtot = 0;
 462     vtot    = 0;
 463
 464     /* 'loop' over all atom pairs (pair_nr=fa/3) involved in restraints, *
 465      * the total number of atoms pairs is nfa/3                          */
 466     int faOffset = static_cast<int>(forceatoms - disresdata->forceatomsStart);
 467     for (int fa = 0; fa < nfa; fa += 3)
 468     {
 469         int type  = forceatoms[fa];
 470         int npair = ip[type].disres.npair;
 471         up1       = ip[type].disres.up1;
 472         up2       = ip[type].disres.up2;
 473         low       = ip[type].disres.low;
 474         k0        = smooth_fc * ip[type].disres.kfac;
 475
 476         int res = type - disresdata->type_min;
 477
 478         /* save some flops when there is only one pair */
 479         if (ip[type].disres.type != 2)
 480         {
 481             bConservative = (dr_weighting == DistanceRestraintWeighting::Conservative) && (npair > 1);
 482             bMixed        = dr_bMixed;
 483             Rt            = gmx::invsixthroot(Rt_6[res]);
 484             Rtav          = gmx::invsixthroot(Rtav_6[res]);
 485         }
 486         else
 487         {
 488             /* When rtype=2 use instantaneous not ensemble averaged distance */
 489             bConservative = (npair > 1);
 490             bMixed        = FALSE;
 491             Rt            = gmx::invsixthroot(Rtl_6[res]);
 492             Rtav          = Rt;
 493         }
 494
 495         if (Rtav > up1)
 496         {
 497             bViolation = TRUE;
 498             tav_viol   = Rtav - up1;
 499         }
 500         else if (Rtav < low)
 501         {
 502             bViolation = TRUE;
 503             tav_viol   = Rtav - low;
 504         }
 505         else
 506         {
 507             bViolation = FALSE;
 508         }
 509
 510         if (bViolation)
 511         {
 512             /* Add 1/npair energy and violation for each of the npair pairs */
 513             real pairFac = 1 / static_cast<real>(npair);
 514
 515             /* NOTE:
 516              * there is no real potential when time averaging is applied
 517              */
 518             vtot += 0.5 * k0 * gmx::square(tav_viol) * pairFac;
 519             if (!bMixed)
 520             {
 521                 f_scal = -k0 * tav_viol;
 522                 violtot += fabs(tav_viol) * pairFac;
 523             }
 524             else
 525             {
 526                 if (Rt > up1)
 527                 {
 528                     if (tav_viol > 0)
 529                     {
 530                         instant_viol = Rt - up1;
 531                     }
 532                     else
 533                     {
 534                         bViolation = FALSE;
 535                     }
 536                 }
 537                 else if (Rt < low)
 538                 {
 539                     if (tav_viol < 0)
 540                     {
 541                         instant_viol = Rt - low;
 542                     }
 543                     else
 544                     {
 545                         bViolation = FALSE;
 546                     }
 547                 }
 548                 else
 549                 {
 550                     bViolation = FALSE;
 551                 }
 552                 if (bViolation)
 553                 {
 554                     mixed_viol = std::sqrt(tav_viol * instant_viol);
 555                     f_scal     = -k0 * mixed_viol;
 556                     violtot += mixed_viol * pairFac;
 557                 }
 558             }
 559         }
 560
 561         if (bViolation)
 562         {
 563             fmax_scal = -k0 * (up2 - up1);
 564             /* Correct the force for the number of restraints */
 565             if (bConservative)
 566             {
 567                 f_scal = std::max(f_scal, fmax_scal);
 568                 if (!bMixed)
 569                 {
 570                     f_scal *= Rtav / Rtav_6[res];
 571                 }
 572                 else
 573                 {
 574                     f_scal /= 2 * mixed_viol;
 575                     tav_viol_Rtav7     = tav_viol * Rtav / Rtav_6[res];
 576                     instant_viol_Rtav7 = instant_viol * Rt / Rt_6[res];
 577                 }
 578             }
 579             else
 580             {
 581                 f_scal /= npair;
 582                 f_scal = std::max(f_scal, fmax_scal);
 583             }
 584
 585             /* Exert the force ... */
 586
 587             int pair = (faOffset + fa) / 3;
 588             int ai   = forceatoms[fa + 1];
 589             int aj   = forceatoms[fa + 2];
 590             int ki   = CENTRAL;
 591             if (pbc)
 592             {
 593                 ki = pbc_dx_aiuc(pbc, x[ai], x[aj], dx);
 594             }
 595             else
 596             {
 597                 rvec_sub(x[ai], x[aj], dx);
 598             }
 599             rt2 = iprod(dx, dx);
 600
 601             weight_rt_1 = gmx::invsqrt(rt2);
 602
 603             if (bConservative)
 604             {
 605                 if (!dr_bMixed)
 606                 {
 607                     weight_rt_1 *= std::pow(disresdata->rm3tav[pair], seven_three);
 608                 }
 609                 else
 610                 {
 611                     weight_rt_1 *=
 612                             tav_viol_Rtav7 * std::pow(disresdata->rm3tav[pair], seven_three)
 613                             + instant_viol_Rtav7
 614                                       / (disresdata->rt[pair] * gmx::power6(disresdata->rt[pair]));
 615                 }
 616             }
 617
 618             fk_scal = f_scal * weight_rt_1;
 619
 620             for (int m = 0; m < DIM; m++)
 621             {
 622                 fij = fk_scal * dx[m];
 623
 624                 f[ai][m] += fij;
 625                 f[aj][m] -= fij;
 626                 if (fshift)
 627                 {
 628                     fshift[ki][m] += fij;
 629                     fshift[CENTRAL][m] -= fij;
 630                 }
 631             }
 632         }
 633     }
 634
 635 #pragma omp atomic
 636     disresdata->sumviol += violtot;
 637
 638     /* Return energy */
 639     return vtot;
 640 }
 641
 642 void update_disres_history(const t_disresdata& dd, history_t* hist)
 643 {
 644     if (dd.dr_tau != 0)
 645     {
 646         /* Copy the new time averages that have been calculated
 647          * in calc_disres_R_6.
 648          */
 649         hist->disre_initf = dd.exp_min_t_tau;
 650         for (int pair = 0; pair < dd.npair; pair++)
 651         {
 652             hist->disre_rm3tav[pair] = dd.rm3tav[pair];
 653         }
 654     }
 655 }