src/gromacs/listed_forces/disre.cpp

   1 /*
   2  * This file is part of the GROMACS molecular simulation package.
   3  *
   4  * Copyright (c) 1991-2000, University of Groningen, The Netherlands.
   5  * Copyright (c) 2001-2004, The GROMACS development team.
   6  * Copyright (c) 2013,2014,2015,2016,2017,2018,2019, by the GROMACS development team, led by
   7  * Mark Abraham, David van der Spoel, Berk Hess, and Erik Lindahl,
   8  * and including many others, as listed in the AUTHORS file in the
   9  * top-level source directory and at http://www.gromacs.org.
  10  *
  11  * GROMACS is free software; you can redistribute it and/or
  12  * modify it under the terms of the GNU Lesser General Public License
  13  * as published by the Free Software Foundation; either version 2.1
  14  * of the License, or (at your option) any later version.
  15  *
  16  * GROMACS is distributed in the hope that it will be useful,
  17  * but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
  18  * MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the GNU
  19  * Lesser General Public License for more details.
  20  *
  21  * You should have received a copy of the GNU Lesser General Public
  22  * License along with GROMACS; if not, see
  23  * http://www.gnu.org/licenses, or write to the Free Software Foundation,
  24  * Inc., 51 Franklin Street, Fifth Floor, Boston, MA  02110-1301  USA.
  25  *
  26  * If you want to redistribute modifications to GROMACS, please
  27  * consider that scientific software is very special. Version
  28  * control is crucial - bugs must be traceable. We will be happy to
  29  * consider code for inclusion in the official distribution, but
  30  * derived work must not be called official GROMACS. Details are found
  31  * in the README & COPYING files - if they are missing, get the
  32  * official version at http://www.gromacs.org.
  33  *
  34  * To help us fund GROMACS development, we humbly ask that you cite
  35  * the research papers on the package. Check out http://www.gromacs.org.
  36  */
  37 /* This file is completely threadsafe - keep it that way! */
  38 #include "gmxpre.h"
  39
  40 #include "disre.h"
  41
  42 #include "config.h"
  43
  44 #include <cmath>
  45 #include <cstdlib>
  46 #include <cstring>
  47
  48 #include <algorithm>
  49
  50 #include "gromacs/gmxlib/network.h"
  51 #include "gromacs/math/functions.h"
  52 #include "gromacs/math/vec.h"
  53 #include "gromacs/mdrunutility/multisim.h"
  54 #include "gromacs/mdtypes/commrec.h"
  55 #include "gromacs/mdtypes/fcdata.h"
  56 #include "gromacs/mdtypes/inputrec.h"
  57 #include "gromacs/mdtypes/md_enums.h"
  58 #include "gromacs/mdtypes/state.h"
  59 #include "gromacs/pbcutil/ishift.h"
  60 #include "gromacs/pbcutil/mshift.h"
  61 #include "gromacs/pbcutil/pbc.h"
  62 #include "gromacs/topology/mtop_util.h"
  63 #include "gromacs/topology/topology.h"
  64 #include "gromacs/utility/fatalerror.h"
  65 #include "gromacs/utility/futil.h"
  66 #include "gromacs/utility/gmxassert.h"
  67 #include "gromacs/utility/pleasecite.h"
  68 #include "gromacs/utility/smalloc.h"
  69
  70 void init_disres(FILE*                 fplog,
  71                  const gmx_mtop_t*     mtop,
  72                  t_inputrec*           ir,
  73                  const t_commrec*      cr,
  74                  const gmx_multisim_t* ms,
  75                  t_fcdata*             fcd,
  76                  t_state*              state,
  77                  gmx_bool              bIsREMD)
  78 {
  79     int                  fa, nmol, npair, np;
  80     t_disresdata*        dd;
  81     history_t*           hist;
  82     gmx_mtop_ilistloop_t iloop;
  83     char*                ptr;
  84     int                  type_min, type_max;
  85
  86     dd = &(fcd->disres);
  87
  88     if (gmx_mtop_ftype_count(mtop, F_DISRES) == 0)
  89     {
  90         dd->nres = 0;
  91
  92         return;
  93     }
  94
  95     if (fplog)
  96     {
  97         fprintf(fplog, "Initializing the distance restraints\n");
  98     }
  99
 100     dd->dr_weighting = ir->eDisreWeighting;
 101     dd->dr_fc        = ir->dr_fc;
 102     if (EI_DYNAMICS(ir->eI))
 103     {
 104         dd->dr_tau = ir->dr_tau;
 105     }
 106     else
 107     {
 108         dd->dr_tau = 0.0;
 109     }
 110     if (dd->dr_tau == 0.0)
 111     {
 112         dd->dr_bMixed = FALSE;
 113         dd->ETerm     = 0.0;
 114     }
 115     else
 116     {
 117         /* We store the r^-6 time averages in an array that is indexed
 118          * with the local disres iatom index, so this doesn't work with DD.
 119          * Note that DD is not initialized yet here, so we check for PAR(cr),
 120          * but there are probably also issues with e.g. NM MPI parallelization.
 121          */
 122         if (cr && PAR(cr))
 123         {
 124             gmx_fatal(FARGS,
 125                       "Time-averaged distance restraints are not supported with MPI "
 126                       "parallelization. You can use OpenMP parallelization on a single node.");
 127         }
 128
 129         dd->dr_bMixed = ir->bDisreMixed;
 130         dd->ETerm     = std::exp(-(ir->delta_t / ir->dr_tau));
 131     }
 132     dd->ETerm1 = 1.0 - dd->ETerm;
 133
 134     dd->nres  = 0;
 135     dd->npair = 0;
 136     type_min  = INT_MAX;
 137     type_max  = 0;
 138     iloop     = gmx_mtop_ilistloop_init(mtop);
 139     while (const InteractionLists* il = gmx_mtop_ilistloop_next(iloop, &nmol))
 140     {
 141         if (nmol > 1 && (*il)[F_DISRES].size() > 0 && ir->eDisre != edrEnsemble)
 142         {
 143             gmx_fatal(FARGS,
 144                       "NMR distance restraints with multiple copies of the same molecule are "
 145                       "currently only supported with ensemble averaging. If you just want to "
 146                       "restrain distances between atom pairs using a flat-bottomed potential, use "
 147                       "a restraint potential (bonds type 10) instead.");
 148         }
 149
 150         np = 0;
 151         for (fa = 0; fa < (*il)[F_DISRES].size(); fa += 3)
 152         {
 153             int type;
 154
 155             type = (*il)[F_DISRES].iatoms[fa];
 156
 157             np++;
 158             npair = mtop->ffparams.iparams[type].disres.npair;
 159             if (np == npair)
 160             {
 161                 dd->nres += (ir->eDisre == edrEnsemble ? 1 : nmol);
 162                 dd->npair += nmol * npair;
 163                 np = 0;
 164
 165                 type_min = std::min(type_min, type);
 166                 type_max = std::max(type_max, type);
 167             }
 168         }
 169     }
 170
 171     if (cr && PAR(cr) && ir->nstdisreout > 0)
 172     {
 173         /* With DD we currently only have local pair information available */
 174         gmx_fatal(FARGS,
 175                   "With MPI parallelization distance-restraint pair output is not supported. Use "
 176                   "nstdisreout=0 or use OpenMP parallelization on a single node.");
 177     }
 178
 179     /* For communicating and/or reducing (sums of) r^-6 for pairs over threads
 180      * we use multiple arrays in t_disresdata. We need to have unique indices
 181      * for each restraint that work over threads and MPI ranks. To this end
 182      * we use the type index. These should all be in one block and there should
 183      * be dd->nres types, but we check for this here.
 184      * This setup currently does not allow for multiple copies of the same
 185      * molecule without ensemble averaging, this is check for above.
 186      */
 187     GMX_RELEASE_ASSERT(
 188             type_max - type_min + 1 == dd->nres,
 189             "All distance restraint parameter entries in the topology should be consecutive");
 190
 191     dd->type_min = type_min;
 192
 193     snew(dd->rt, dd->npair);
 194
 195     if (dd->dr_tau != 0.0)
 196     {
 197         GMX_RELEASE_ASSERT(state != nullptr,
 198                            "We need a valid state when using time-averaged distance restraints");
 199
 200         hist = &state->hist;
 201         /* Set the "history lack" factor to 1 */
 202         state->flags |= (1 << estDISRE_INITF);
 203         hist->disre_initf = 1.0;
 204         /* Allocate space for the r^-3 time averages */
 205         state->flags |= (1 << estDISRE_RM3TAV);
 206         hist->ndisrepairs = dd->npair;
 207         snew(hist->disre_rm3tav, hist->ndisrepairs);
 208     }
 209     /* Allocate space for a copy of rm3tav,
 210      * so we can call do_force without modifying the state.
 211      */
 212     snew(dd->rm3tav, dd->npair);
 213
 214     /* Allocate Rt_6 and Rtav_6 consecutively in memory so they can be
 215      * averaged over the processors in one call (in calc_disre_R_6)
 216      */
 217     snew(dd->Rt_6, 2 * dd->nres);
 218     dd->Rtav_6 = &(dd->Rt_6[dd->nres]);
 219
 220     ptr = getenv("GMX_DISRE_ENSEMBLE_SIZE");
 221     if (cr && ms != nullptr && ptr != nullptr && !bIsREMD)
 222     {
 223 #if GMX_MPI
 224         dd->nsystems = 0;
 225         sscanf(ptr, "%d", &dd->nsystems);
 226         if (fplog)
 227         {
 228             fprintf(fplog, "Found GMX_DISRE_ENSEMBLE_SIZE set to %d systems per ensemble\n", dd->nsystems);
 229         }
 230         /* This check is only valid on MASTER(cr), so probably
 231          * ensemble-averaged distance restraints are broken on more
 232          * than one processor per simulation system. */
 233         if (MASTER(cr))
 234         {
 235             check_multi_int(fplog, ms, dd->nsystems, "the number of systems per ensemble", FALSE);
 236         }
 237         gmx_bcast_sim(sizeof(int), &dd->nsystems, cr);
 238
 239         /* We use to allow any value of nsystems which was a divisor
 240          * of ms->nsim. But this required an extra communicator which
 241          * was stored in t_fcdata. This pulled in mpi.h in nearly all C files.
 242          */
 243         if (!(ms->nsim == 1 || ms->nsim == dd->nsystems))
 244         {
 245             gmx_fatal(FARGS,
 246                       "GMX_DISRE_ENSEMBLE_SIZE (%d) is not equal to 1 or the number of systems "
 247                       "(option -multidir) %d",
 248                       dd->nsystems, ms->nsim);
 249         }
 250         if (fplog)
 251         {
 252             fprintf(fplog, "Our ensemble consists of systems:");
 253             for (int i = 0; i < dd->nsystems; i++)
 254             {
 255                 fprintf(fplog, " %d", (ms->sim / dd->nsystems) * dd->nsystems + i);
 256             }
 257             fprintf(fplog, "\n");
 258         }
 259 #endif
 260     }
 261     else
 262     {
 263         dd->nsystems = 1;
 264     }
 265
 266     if (dd->nsystems == 1)
 267     {
 268         dd->Rtl_6 = dd->Rt_6;
 269     }
 270     else
 271     {
 272         snew(dd->Rtl_6, dd->nres);
 273     }
 274
 275     if (dd->npair > 0)
 276     {
 277         if (fplog)
 278         {
 279             fprintf(fplog, "There are %d distance restraints involving %d atom pairs\n", dd->nres,
 280                     dd->npair);
 281         }
 282         /* Have to avoid g_disre de-referencing cr blindly, mdrun not
 283          * doing consistency checks for ensemble-averaged distance
 284          * restraints when that's not happening, and only doing those
 285          * checks from appropriate processes (since check_multi_int is
 286          * too broken to check whether the communication will
 287          * succeed...) */
 288         if (cr && ms && dd->nsystems > 1 && MASTER(cr))
 289         {
 290             check_multi_int(fplog, ms, fcd->disres.nres, "the number of distance restraints", FALSE);
 291         }
 292         please_cite(fplog, "Tropp80a");
 293         please_cite(fplog, "Torda89a");
 294     }
 295 }
 296
 297 void calc_disres_R_6(const t_commrec*      cr,
 298                      const gmx_multisim_t* ms,
 299                      int                   nfa,
 300                      const t_iatom         forceatoms[],
 301                      const rvec            x[],
 302                      const t_pbc*          pbc,
 303                      t_fcdata*             fcd,
 304                      history_t*            hist)
 305 {
 306     rvec          dx;
 307     real *        rt, *rm3tav, *Rtl_6, *Rt_6, *Rtav_6;
 308     t_disresdata* dd;
 309     real          ETerm, ETerm1, cf1 = 0, cf2 = 0;
 310     gmx_bool      bTav;
 311
 312     dd     = &(fcd->disres);
 313     bTav   = (dd->dr_tau != 0);
 314     ETerm  = dd->ETerm;
 315     ETerm1 = dd->ETerm1;
 316     rt     = dd->rt;
 317     rm3tav = dd->rm3tav;
 318     Rtl_6  = dd->Rtl_6;
 319     Rt_6   = dd->Rt_6;
 320     Rtav_6 = dd->Rtav_6;
 321
 322     if (bTav)
 323     {
 324         /* scaling factor to smoothly turn on the restraint forces *
 325          * when using time averaging                               */
 326         dd->exp_min_t_tau = hist->disre_initf * ETerm;
 327
 328         cf1 = dd->exp_min_t_tau;
 329         cf2 = 1.0 / (1.0 - dd->exp_min_t_tau);
 330     }
 331
 332     for (int res = 0; res < dd->nres; res++)
 333     {
 334         Rtav_6[res] = 0.0;
 335         Rt_6[res]   = 0.0;
 336     }
 337
 338     /* 'loop' over all atom pairs (pair_nr=fa/3) involved in restraints, *
 339      * the total number of atoms pairs is nfa/3                          */
 340     for (int fa = 0; fa < nfa; fa += 3)
 341     {
 342         int type = forceatoms[fa];
 343         int res  = type - dd->type_min;
 344         int pair = fa / 3;
 345         int ai   = forceatoms[fa + 1];
 346         int aj   = forceatoms[fa + 2];
 347
 348         if (pbc)
 349         {
 350             pbc_dx_aiuc(pbc, x[ai], x[aj], dx);
 351         }
 352         else
 353         {
 354             rvec_sub(x[ai], x[aj], dx);
 355         }
 356         real rt2  = iprod(dx, dx);
 357         real rt_1 = gmx::invsqrt(rt2);
 358         real rt_3 = rt_1 * rt_1 * rt_1;
 359
 360         rt[pair] = rt2 * rt_1;
 361         if (bTav)
 362         {
 363             /* Here we update rm3tav in t_fcdata using the data
 364              * in history_t.
 365              * Thus the results stay correct when this routine
 366              * is called multiple times.
 367              */
 368             rm3tav[pair] = cf2 * ((ETerm - cf1) * hist->disre_rm3tav[pair] + ETerm1 * rt_3);
 369         }
 370         else
 371         {
 372             rm3tav[pair] = rt_3;
 373         }
 374
 375         /* Currently divide_bondeds_over_threads() ensures that pairs within
 376          * the same restraint get assigned to the same thread, so we could
 377          * run this loop thread-parallel.
 378          */
 379         Rt_6[res] += rt_3 * rt_3;
 380         Rtav_6[res] += rm3tav[pair] * rm3tav[pair];
 381     }
 382
 383     /* NOTE: Rt_6 and Rtav_6 are stored consecutively in memory */
 384     if (cr && DOMAINDECOMP(cr))
 385     {
 386         gmx_sum(2 * dd->nres, dd->Rt_6, cr);
 387     }
 388
 389     if (fcd->disres.nsystems > 1)
 390     {
 391         real invn = 1.0 / dd->nsystems;
 392
 393         for (int res = 0; res < dd->nres; res++)
 394         {
 395             Rtl_6[res] = Rt_6[res];
 396             Rt_6[res] *= invn;
 397             Rtav_6[res] *= invn;
 398         }
 399
 400         GMX_ASSERT(cr != nullptr && ms != nullptr, "We need multisim with nsystems>1");
 401         gmx_sum_sim(2 * dd->nres, dd->Rt_6, ms);
 402
 403         if (DOMAINDECOMP(cr))
 404         {
 405             gmx_bcast(2 * dd->nres, dd->Rt_6, cr);
 406         }
 407     }
 408
 409     /* Store the base forceatoms pointer, so we can re-calculate the pair
 410      * index in ta_disres() for indexing pair data in t_disresdata when
 411      * using thread parallelization.
 412      */
 413     dd->forceatomsStart = forceatoms;
 414
 415     dd->sumviol = 0;
 416 }
 417
 418 real ta_disres(int             nfa,
 419                const t_iatom   forceatoms[],
 420                const t_iparams ip[],
 421                const rvec      x[],
 422                rvec4           f[],
 423                rvec            fshift[],
 424                const t_pbc*    pbc,
 425                const t_graph*  g,
 426                real gmx_unused lambda,
 427                real gmx_unused* dvdlambda,
 428                const t_mdatoms gmx_unused* md,
 429                t_fcdata*                   fcd,
 430                int gmx_unused* global_atom_index)
 431 {
 432     const real seven_three = 7.0 / 3.0;
 433
 434     rvec          dx;
 435     real          weight_rt_1;
 436     real          smooth_fc, Rt, Rtav, rt2, *Rtl_6, *Rt_6, *Rtav_6;
 437     real          k0, f_scal = 0, fmax_scal, fk_scal, fij;
 438     real          tav_viol, instant_viol, mixed_viol, violtot, vtot;
 439     real          tav_viol_Rtav7, instant_viol_Rtav7;
 440     real          up1, up2, low;
 441     gmx_bool      bConservative, bMixed, bViolation;
 442     ivec          dt;
 443     t_disresdata* dd;
 444     int           dr_weighting;
 445     gmx_bool      dr_bMixed;
 446
 447     dd           = &(fcd->disres);
 448     dr_weighting = dd->dr_weighting;
 449     dr_bMixed    = dd->dr_bMixed;
 450     Rtl_6        = dd->Rtl_6;
 451     Rt_6         = dd->Rt_6;
 452     Rtav_6       = dd->Rtav_6;
 453
 454     tav_viol = instant_viol = mixed_viol = tav_viol_Rtav7 = instant_viol_Rtav7 = 0;
 455
 456     smooth_fc = dd->dr_fc;
 457     if (dd->dr_tau != 0)
 458     {
 459         /* scaling factor to smoothly turn on the restraint forces *
 460          * when using time averaging                               */
 461         smooth_fc *= (1.0 - dd->exp_min_t_tau);
 462     }
 463
 464     violtot = 0;
 465     vtot    = 0;
 466
 467     /* 'loop' over all atom pairs (pair_nr=fa/3) involved in restraints, *
 468      * the total number of atoms pairs is nfa/3                          */
 469     int faOffset = static_cast<int>(forceatoms - dd->forceatomsStart);
 470     for (int fa = 0; fa < nfa; fa += 3)
 471     {
 472         int type  = forceatoms[fa];
 473         int npair = ip[type].disres.npair;
 474         up1       = ip[type].disres.up1;
 475         up2       = ip[type].disres.up2;
 476         low       = ip[type].disres.low;
 477         k0        = smooth_fc * ip[type].disres.kfac;
 478
 479         int res = type - dd->type_min;
 480
 481         /* save some flops when there is only one pair */
 482         if (ip[type].disres.type != 2)
 483         {
 484             bConservative = (dr_weighting == edrwConservative) && (npair > 1);
 485             bMixed        = dr_bMixed;
 486             Rt            = gmx::invsixthroot(Rt_6[res]);
 487             Rtav          = gmx::invsixthroot(Rtav_6[res]);
 488         }
 489         else
 490         {
 491             /* When rtype=2 use instantaneous not ensemble averaged distance */
 492             bConservative = (npair > 1);
 493             bMixed        = FALSE;
 494             Rt            = gmx::invsixthroot(Rtl_6[res]);
 495             Rtav          = Rt;
 496         }
 497
 498         if (Rtav > up1)
 499         {
 500             bViolation = TRUE;
 501             tav_viol   = Rtav - up1;
 502         }
 503         else if (Rtav < low)
 504         {
 505             bViolation = TRUE;
 506             tav_viol   = Rtav - low;
 507         }
 508         else
 509         {
 510             bViolation = FALSE;
 511         }
 512
 513         if (bViolation)
 514         {
 515             /* Add 1/npair energy and violation for each of the npair pairs */
 516             real pairFac = 1 / static_cast<real>(npair);
 517
 518             /* NOTE:
 519              * there is no real potential when time averaging is applied
 520              */
 521             vtot += 0.5 * k0 * gmx::square(tav_viol) * pairFac;
 522             if (!bMixed)
 523             {
 524                 f_scal = -k0 * tav_viol;
 525                 violtot += fabs(tav_viol) * pairFac;
 526             }
 527             else
 528             {
 529                 if (Rt > up1)
 530                 {
 531                     if (tav_viol > 0)
 532                     {
 533                         instant_viol = Rt - up1;
 534                     }
 535                     else
 536                     {
 537                         bViolation = FALSE;
 538                     }
 539                 }
 540                 else if (Rt < low)
 541                 {
 542                     if (tav_viol < 0)
 543                     {
 544                         instant_viol = Rt - low;
 545                     }
 546                     else
 547                     {
 548                         bViolation = FALSE;
 549                     }
 550                 }
 551                 else
 552                 {
 553                     bViolation = FALSE;
 554                 }
 555                 if (bViolation)
 556                 {
 557                     mixed_viol = std::sqrt(tav_viol * instant_viol);
 558                     f_scal     = -k0 * mixed_viol;
 559                     violtot += mixed_viol * pairFac;
 560                 }
 561             }
 562         }
 563
 564         if (bViolation)
 565         {
 566             fmax_scal = -k0 * (up2 - up1);
 567             /* Correct the force for the number of restraints */
 568             if (bConservative)
 569             {
 570                 f_scal = std::max(f_scal, fmax_scal);
 571                 if (!bMixed)
 572                 {
 573                     f_scal *= Rtav / Rtav_6[res];
 574                 }
 575                 else
 576                 {
 577                     f_scal /= 2 * mixed_viol;
 578                     tav_viol_Rtav7     = tav_viol * Rtav / Rtav_6[res];
 579                     instant_viol_Rtav7 = instant_viol * Rt / Rt_6[res];
 580                 }
 581             }
 582             else
 583             {
 584                 f_scal /= npair;
 585                 f_scal = std::max(f_scal, fmax_scal);
 586             }
 587
 588             /* Exert the force ... */
 589
 590             int pair = (faOffset + fa) / 3;
 591             int ai   = forceatoms[fa + 1];
 592             int aj   = forceatoms[fa + 2];
 593             int ki   = CENTRAL;
 594             if (pbc)
 595             {
 596                 ki = pbc_dx_aiuc(pbc, x[ai], x[aj], dx);
 597             }
 598             else
 599             {
 600                 rvec_sub(x[ai], x[aj], dx);
 601             }
 602             rt2 = iprod(dx, dx);
 603
 604             weight_rt_1 = gmx::invsqrt(rt2);
 605
 606             if (bConservative)
 607             {
 608                 if (!dr_bMixed)
 609                 {
 610                     weight_rt_1 *= std::pow(dd->rm3tav[pair], seven_three);
 611                 }
 612                 else
 613                 {
 614                     weight_rt_1 *= tav_viol_Rtav7 * std::pow(dd->rm3tav[pair], seven_three)
 615                                    + instant_viol_Rtav7 / (dd->rt[pair] * gmx::power6(dd->rt[pair]));
 616                 }
 617             }
 618
 619             fk_scal = f_scal * weight_rt_1;
 620
 621             if (g)
 622             {
 623                 ivec_sub(SHIFT_IVEC(g, ai), SHIFT_IVEC(g, aj), dt);
 624                 ki = IVEC2IS(dt);
 625             }
 626
 627             for (int m = 0; m < DIM; m++)
 628             {
 629                 fij = fk_scal * dx[m];
 630
 631                 f[ai][m] += fij;
 632                 f[aj][m] -= fij;
 633                 if (fshift)
 634                 {
 635                     fshift[ki][m] += fij;
 636                     fshift[CENTRAL][m] -= fij;
 637                 }
 638             }
 639         }
 640     }
 641
 642 #pragma omp atomic
 643     dd->sumviol += violtot;
 644
 645     /* Return energy */
 646     return vtot;
 647 }
 648
 649 void update_disres_history(const t_fcdata* fcd, history_t* hist)
 650 {
 651     const t_disresdata* dd;
 652     int                 pair;
 653
 654     dd = &(fcd->disres);
 655     if (dd->dr_tau != 0)
 656     {
 657         /* Copy the new time averages that have been calculated
 658          * in calc_disres_R_6.
 659          */
 660         hist->disre_initf = dd->exp_min_t_tau;
 661         for (pair = 0; pair < dd->npair; pair++)
 662         {
 663             hist->disre_rm3tav[pair] = dd->rm3tav[pair];
 664         }
 665     }
 666 }