src/gromacs/linearalgebra/gmx_blas.h

   1 /*
   2  *
   3  *                This source code is part of
   4  *
   5  *                 G   R   O   M   A   C   S
   6  *
   7  *          GROningen MAchine for Chemical Simulations
   8  *
   9  * Written by David van der Spoel, Erik Lindahl, Berk Hess, and others.
  10  * Copyright (c) 1991-2000, University of Groningen, The Netherlands.
  11  * Copyright (c) 2001-2008, The GROMACS development team,
  12  * check out http://www.gromacs.org for more information.
  13
  14  * This program is free software; you can redistribute it and/or
  15  * modify it under the terms of the GNU General Public License
  16  * as published by the Free Software Foundation; either version 2
  17  * of the License, or (at your option) any later version.
  18  *
  19  * If you want to redistribute modifications, please consider that
  20  * scientific software is very special. Version control is crucial -
  21  * bugs must be traceable. We will be happy to consider code for
  22  * inclusion in the official distribution, but derived work must not
  23  * be called official GROMACS. Details are found in the README & COPYING
  24  * files - if they are missing, get the official version at www.gromacs.org.
  25  *
  26  * To help us fund GROMACS development, we humbly ask that you cite
  27  * the papers on the package - you can find them in the top README file.
  28  *
  29  * For more info, check our website at http://www.gromacs.org
  30  *
  31  * And Hey:
  32  * Gallium Rubidium Oxygen Manganese Argon Carbon Silicon
  33  */
  34 /*! \internal \file
  35  * \brief
  36  * Header definitions for the standard BLAS library.
  37  *
  38  * This is the subset of BLAS routines used for the
  39  * linear algebra operations in Gromacs.
  40  * Do NOT use this for other purposes - we only provide this as a
  41  * simple fallback/reference implementation when no optimized BLAS
  42  * is present. If you need an implementation for your own code
  43  * there are several much faster versions out there.
  44  *
  45  * All routines are compatible with the BLAS reference implementation,
  46  * meaning they assume fortran-style matrix row/column organization.
  47  *
  48  * There is plenty of documentation for these routines available
  49  * at http://www.netlib.org/blas , so there is no point in repeating
  50  * it here.
  51  */
  52 #ifndef GMX_BLAS_H
  53 #define GMX_BLAS_H
  54
  55 /*! \cond */
  56
  57 #ifdef HAVE_CONFIG_H
  58 #include "config.h"
  59 #endif
  60
  61 /* Suppress Cygwin compiler warnings from using newlib version of
  62  * ctype.h */
  63 #ifdef GMX_CYGWIN
  64 #undef toupper
  65 #endif
  66
  67 #ifdef __cplusplus
  68 extern "C" {
  69 #endif
  70 #if 0
  71 }
  72 #endif
  73
  74 /* Double precision versions */
  75 double
  76 F77_FUNC(dasum,DASUM)(int *n, double *dx, int *incx);
  77
  78 void
  79 F77_FUNC(daxpy,DAXPY)(int *n, double *da, double *dx, int *incx, double *dy, int *incy);
  80
  81 void
  82 F77_FUNC(dcopy,DCOPY)(int *n, double *dx, int *incx, double *dy, int *incy);
  83
  84 double
  85 F77_FUNC(ddot,DDOT)(int *n, double *dx, int *incx, double *dy, int *incy);
  86
  87 void
  88 F77_FUNC(dgemm,DGEMM)(const char *transa, const char *transb, int *m, int *n, int *k,
  89        double *alpha, double *a, int *lda, double *b, int *ldb,
  90        double *beta, double *c, int *ldc);
  91
  92 void
  93 F77_FUNC(dgemv,DGEMV)(const char *trans, int *m, int *n, double *alpha, double *a, int *lda,
  94        double *x, int *incx, double *beta, double *y, int *incy);
  95
  96 void
  97 F77_FUNC(dger,DGER)(int *m, int *n, double *alpha, double *x, int *incx,
  98       double *y, int *incy, double *a, int *lda);
  99
 100 double
 101 F77_FUNC(dnrm2,DNRM2)(int  *n, double *x, int *incx);
 102
 103 void
 104 F77_FUNC(drot,DROT)(int *n, double *dx, int *incx,
 105       double *dy, int *incy, double *c, double *s);
 106
 107 void
 108 F77_FUNC(dscal,DSCAL)(int *n, double *fact, double *dx, int *incx);
 109
 110 void
 111 F77_FUNC(dswap,DSWAP)(int *n, double *dx, int *incx, double *dy, int *incy);
 112
 113 void
 114 F77_FUNC(dsymv,DSYMV)(const char *uplo, int *n, double *alpha, double *a, int *lda,
 115        double *x, int *incx, double *beta, double *y, int *incy);
 116
 117 void
 118 F77_FUNC(dsyr2,DSYR2)(const char *uplo, int *n, double *alpha, double *x, int *incx,
 119        double *y, int *incy, double *a, int *lda);
 120
 121 void
 122 F77_FUNC(dsyr2k,DSYR2K)(const char *uplo, const char *trans, int *n, int *k, double *alpha, double *a,
 123         int *lda, double *b, int *ldb, double *beta, double *c, int *ldc);
 124
 125 void
 126 F77_FUNC(dtrmm,DTRMM)(const char *side, const char *uplo, const char *transa, const char *diag, int *m, int *n,
 127        double *alpha, double *a, int *lda, double *b, int *ldb);
 128
 129 void
 130 F77_FUNC(dtrmv,DTRMV)(const char *uplo, const char *trans, const char *diag, int *n,
 131        double *a, int *lda, double *x, int *incx);
 132
 133 void
 134 F77_FUNC(dtrsm,DTRSM)(const char *side, const char *uplo, const char *transa, const char *diag, int *m, int *n,
 135        double *alpha, double *a,int *lda, double *b, int *ldb);
 136
 137 int
 138 F77_FUNC(idamax,IDAMAX)(int *n, double *dx, int *incx);
 139
 140
 141
 142 /* Single precision versions */
 143 float
 144 F77_FUNC(sasum,SASUM)(int *n, float *dx, int *incx);
 145
 146 void
 147 F77_FUNC(saxpy,SAXPY)(int *n, float *da, float *dx, int *incx, float *dy, int *incy);
 148
 149 void
 150 F77_FUNC(scopy,SCOPY)(int *n, float *dx, int *incx, float *dy, int *incy);
 151
 152 float
 153 F77_FUNC(sdot,SDOT)(int *n, float *dx, int *incx, float *dy, int *incy);
 154
 155 void
 156 F77_FUNC(sgemm,SGEMM)(const char *transa, const char *transb, int *m, int *n, int *k,
 157        float *alpha, float *a, int *lda, float *b, int *ldb,
 158        float *beta, float *c, int *ldc);
 159
 160 void
 161 F77_FUNC(sgemv,SGEMV)(const char *trans, int *m, int *n, float *alpha, float *a, int *lda,
 162        float *x, int *incx, float *beta, float *y, int *incy);
 163
 164 void
 165 F77_FUNC(sger,SGER)(int *m, int *n, float *alpha, float *x, int *incx,
 166       float *y, int *incy, float *a, int *lda);
 167
 168 float
 169 F77_FUNC(snrm2,SNRM2)(int  *n, float *x, int *incx);
 170
 171 void
 172 F77_FUNC(srot,SROT)(int *n, float *dx, int *incx,
 173       float *dy, int *incy, float *c, float *s);
 174
 175 void
 176 F77_FUNC(sscal,SSCAL)(int *n, float *fact, float *dx, int *incx);
 177
 178 void
 179 F77_FUNC(sswap,SSWAP)(int *n, float *dx, int *incx, float *dy, int *incy);
 180
 181 void
 182 F77_FUNC(ssymv,SSYMV)(const char *uplo, int *n, float *alpha, float *a, int *lda,
 183        float *x, int *incx, float *beta, float *y, int *incy);
 184
 185 void
 186 F77_FUNC(ssyr2,SSYR2)(const char *uplo, int *n, float *alpha, float *x, int *incx,
 187        float *y, int *incy, float *a, int *lda);
 188
 189 void
 190 F77_FUNC(ssyr2k,SSYR2K)(const char *uplo, const char *trans, int *n, int *k, float *alpha, float *a,
 191         int *lda, float *b, int *ldb, float *beta, float *c, int *ldc);
 192
 193 void
 194 F77_FUNC(strmm,STRMM)(const char *side, const char *uplo, const char *transa, const char *diag, int *m, int *n,
 195        float *alpha, float *a, int *lda, float *b, int *ldb);
 196
 197 void
 198 F77_FUNC(strmv,STRMV)(const char *uplo, const char *trans, const char *diag, int *n,
 199        float *a, int *lda, float *x, int *incx);
 200
 201 void
 202 F77_FUNC(strsm,STRSM)(const char *side, const char *uplo, const char *transa, const char *diag, int *m, int *n,
 203        float *alpha, float *a,int *lda, float *b, int *ldb);
 204
 205 int
 206 F77_FUNC(isamax,ISAMAX)(int *n, float *dx, int *incx);
 207
 208
 209 #ifdef __cplusplus
 210 }
 211 #endif
 212
 213 /*! \endcond */
 214
 215 #endif /* GMX_BLAS_H */