src/gromacs/legacyheaders/xvgr.h

   1 /*
   2  * This file is part of the GROMACS molecular simulation package.
   3  *
   4  * Copyright (c) 1991-2000, University of Groningen, The Netherlands.
   5  * Copyright (c) 2001-2004, The GROMACS development team.
   6  * Copyright (c) 2010, by the GROMACS development team, led by
   7  * Mark Abraham, David van der Spoel, Berk Hess, and Erik Lindahl,
   8  * and including many others, as listed in the AUTHORS file in the
   9  * top-level source directory and at http://www.gromacs.org.
  10  *
  11  * GROMACS is free software; you can redistribute it and/or
  12  * modify it under the terms of the GNU Lesser General Public License
  13  * as published by the Free Software Foundation; either version 2.1
  14  * of the License, or (at your option) any later version.
  15  *
  16  * GROMACS is distributed in the hope that it will be useful,
  17  * but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
  18  * MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the GNU
  19  * Lesser General Public License for more details.
  20  *
  21  * You should have received a copy of the GNU Lesser General Public
  22  * License along with GROMACS; if not, see
  23  * http://www.gnu.org/licenses, or write to the Free Software Foundation,
  24  * Inc., 51 Franklin Street, Fifth Floor, Boston, MA  02110-1301  USA.
  25  *
  26  * If you want to redistribute modifications to GROMACS, please
  27  * consider that scientific software is very special. Version
  28  * control is crucial - bugs must be traceable. We will be happy to
  29  * consider code for inclusion in the official distribution, but
  30  * derived work must not be called official GROMACS. Details are found
  31  * in the README & COPYING files - if they are missing, get the
  32  * official version at http://www.gromacs.org.
  33  *
  34  * To help us fund GROMACS development, we humbly ask that you cite
  35  * the research papers on the package. Check out http://www.gromacs.org.
  36  */
  37
  38 #ifndef _xvgr_h
  39 #define _xvgr_h
  40
  41 #include "sysstuff.h"
  42 #include "typedefs.h"
  43 #include "viewit.h"
  44
  45 #ifdef __cplusplus
  46 extern "C" {
  47 #endif
  48
  49 /***************************************************
  50  *            XVGR   DEFINITIONS
  51  ***************************************************/
  52 enum {
  53     elNone, elSolid, elDotted, elDashed,
  54     elLongDashed, elDotDashed, elNR
  55 };
  56 /* xvgr line-styles */
  57
  58 enum {
  59     ecWhite, ecFrank, ecBlack = ecFrank,
  60     ecRed, ecGreen, ecBlue, ecYellow, ecBrown, ecGray,
  61     ecPurple, ecLightBlue, ecViolet, ecHolland, ecLila, ecDarkGray,
  62     ecAquamarine, ecOlive, ecNR
  63 };
  64 /* xvgr line-colors */
  65
  66 enum {
  67     eppNone, eppColor, eppPattern, eppNR
  68 };
  69 /* xvgr pattern type */
  70
  71 enum {
  72     evView, evWorld, evNR
  73 };
  74 /* view type */
  75
  76 /***************************************************
  77  *            XVGR   ROUTINES
  78  ***************************************************/
  79
  80 /* Strings such as titles, lables and legends can contain escape sequences
  81  * for formatting. Currently supported are:
  82  * \s : start subscript
  83  * \S : start superscript
  84  * \N : end sub/superscript
  85  * \symbol : where symbol is the full name of a greek letter
  86  *           (see the xvgrstr function in xvgr.c for the full list)
  87  *           when starting with a capital, a capital symbol will be printed,
  88  *           note that symbol does not need to be followed by a space
  89  * \8 : (deprecated) start symbol font
  90  * \4 : (deprecated) end symbol font
  91  */
  92
  93 gmx_bool output_env_get_print_xvgr_codes(const output_env_t oenv);
  94 /* Returns if we should print xmgrace or xmgr codes */
  95
  96 enum {
  97     exvggtNONE, exvggtXNY, exvggtXYDY, exvggtXYDYDY, exvggtNR
  98 };
  99
 100 void xvgr_header(FILE *fp, const char *title, const char *xaxis,
 101                  const char *yaxis, int exvg_graph_type,
 102                  const output_env_t oenv);
 103 /* In most cases you want to use xvgropen_type, which does the same thing
 104  * but takes a filename and opens it.
 105  */
 106
 107 FILE *xvgropen_type(const char *fn, const char *title, const char *xaxis,
 108                     const char *yaxis, int exvg_graph_type,
 109                     const output_env_t oenv);
 110 /* Open a file, and write a title, and axis-labels in Xvgr format
 111  * or write nothing when oenv specifies so.
 112  * The xvgr graph type enum is defined above.
 113  */
 114
 115 FILE *xvgropen(const char *fn, const char *title, const char *xaxis,
 116                const char *yaxis, const output_env_t oenv);
 117 /* Calls xvgropen_type with graph type xvggtXNY. */
 118
 119 /* Close xvgr file, and clean up internal file buffers correctly */
 120 void xvgrclose(FILE *fp);
 121
 122 void xvgr_subtitle(FILE *out, const char *subtitle,
 123                    const output_env_t oenv);
 124 /* Set the subtitle in xvgr */
 125
 126 void xvgr_view(FILE *out, real xmin, real ymin, real xmax, real ymax,
 127                const output_env_t oenv);
 128 /* Set the view in xvgr */
 129
 130 void xvgr_world(FILE *out, real xmin, real ymin, real xmax, real ymax,
 131                 const output_env_t oenv);
 132 /* Set the world in xvgr */
 133
 134 void xvgr_legend(FILE *out, int nsets, const char** setnames,
 135                  const output_env_t oenv);
 136 /* Make a legend box, and also modifies the view to make room for the legend */
 137
 138
 139 void xvgr_new_dataset(FILE *out,
 140                       int nr_first, int nsets, const char **setnames,
 141                       const output_env_t oenv);
 142 /* End the previous data set(s) and start new one(s).
 143     nr_first = the global set number of the first new set (or 0 if no legend)
 144     nsets = the number of sets (or 0 if no legends)
 145     setnames = the set names (or NULL if no legends)
 146  */
 147
 148 void xvgr_line_props(FILE *out, int NrSet, int LineStyle, int LineColor,
 149                      const output_env_t oenv);
 150 /* Set xvgr line styles and colors */
 151
 152 void xvgr_box(FILE *out,
 153               int LocType,
 154               real xmin, real ymin, real xmax, real ymax,
 155               int LineStyle, int LineWidth, int LineColor,
 156               int BoxFill, int BoxColor, int BoxPattern,
 157               const output_env_t oenv);
 158 /* Make a box */
 159
 160 int read_xvg_legend(const char *fn, double ***y, int *ny,
 161                     char **subtitle, char ***legend);
 162 /* Read an xvg file for post processing. The number of rows is returned
 163  * fn is the filename, y is a pointer to a 2D array (to be allocated by
 164  * the routine) ny is the number of columns (including X if appropriate).
 165  * If subtitle!=NULL, read the subtitle (when present),
 166  * the subtitle string will be NULL when not present.
 167  * If legend!=NULL, read the legends for the sets (when present),
 168  * 0 is the first y legend, the legend string will be NULL when not present.
 169  */
 170
 171 int read_xvg(const char *fn, double ***y, int *ny);
 172 /* As read_xvg_legend, but does not read legends. */
 173
 174 void write_xvg(const char *fn, const char *title, int nx, int ny, real **y,
 175                const char** leg, const output_env_t oenv);
 176 /* Write a two D array (y) of dimensions nx rows times
 177  * ny columns to a file. If leg != NULL it will be written too.
 178  */
 179
 180
 181 /* This function reads ascii (xvg) files and extracts the data sets to a
 182  * two dimensional array which is returned.
 183  */
 184 real **read_xvg_time(const char *fn,
 185                      gmx_bool bHaveT,
 186                      gmx_bool bTB, real tb,
 187                      gmx_bool bTE, real te,
 188                      int nsets_in, int *nset, int *nval,
 189                      real *dt, real **t);
 190 #ifdef __cplusplus
 191 }
 192 #endif
 193
 194 #endif  /* _xvgr_h */