src/gromacs/legacyheaders/gmxfio.h

   1 /*
   2  *
   3  *                This source code is part of
   4  *
   5  *                 G   R   O   M   A   C   S
   6  *
   7  *          GROningen MAchine for Chemical Simulations
   8  *
   9  *                        VERSION 3.2.0
  10  * Written by David van der Spoel, Erik Lindahl, Berk Hess, and others.
  11  * Copyright (c) 1991-2000, University of Groningen, The Netherlands.
  12  * Copyright (c) 2001-2004, The GROMACS development team,
  13  * check out http://www.gromacs.org for more information.
  14
  15  * This program is free software; you can redistribute it and/or
  16  * modify it under the terms of the GNU General Public License
  17  * as published by the Free Software Foundation; either version 2
  18  * of the License, or (at your option) any later version.
  19  *
  20  * If you want to redistribute modifications, please consider that
  21  * scientific software is very special. Version control is crucial -
  22  * bugs must be traceable. We will be happy to consider code for
  23  * inclusion in the official distribution, but derived work must not
  24  * be called official GROMACS. Details are found in the README & COPYING
  25  * files - if they are missing, get the official version at www.gromacs.org.
  26  *
  27  * To help us fund GROMACS development, we humbly ask that you cite
  28  * the papers on the package - you can find them in the top README file.
  29  *
  30  * For more info, check our website at http://www.gromacs.org
  31  *
  32  * And Hey:
  33  * Gromacs Runs On Most of All Computer Systems
  34  */
  35
  36 #ifndef _gmxfio_h
  37 #define _gmxfio_h
  38
  39 #include <stdio.h>
  40 #include "sysstuff.h"
  41 #include "typedefs.h"
  42 #include "xdrf.h"
  43 #include "futil.h"
  44
  45 #ifdef __cplusplus
  46 extern "C" {
  47 #endif
  48 /* types */
  49
  50
  51 /* Enumerated for different items in files */
  52 enum { eitemHEADER, eitemIR, eitemBOX,
  53        eitemTOP, eitemX, eitemV, eitemF, eitemNR };
  54
  55 /* Enumerated for data types in files */
  56 enum { eioREAL, eioFLOAT, eioDOUBLE, eioINT, eioGMX_LARGE_INT,
  57        eioUCHAR, eioNUCHAR, eioUSHORT,
  58        eioRVEC, eioNRVEC, eioIVEC, eioSTRING, eioNR };
  59
  60 typedef struct t_fileio t_fileio;
  61
  62 extern const char *itemstr[eitemNR];
  63 extern const char *comment_str[eitemNR];
  64
  65 /* NOTE ABOUT THREAD SAFETY:
  66
  67    The functions are all thread-safe, provided that two threads don't
  68    do something silly like closing the same file, or one thread
  69    accesses a file that has been closed by another.
  70    */
  71
  72 /********************************************************
  73  * Open and Close
  74  ********************************************************/
  75
  76 t_fileio *gmx_fio_open(const char *fn,const char *mode);
  77 /* Open a new file for reading or writing.
  78  * The file type will be deduced from the file name.
  79  * If fn is NULL, stdin / stdout will be used for Ascii I/O (TPA type)
  80  * mode may be "r", "w", or "a". You should append a "b" to the mode
  81  * if you are writing a binary file, but the routine will also
  82  * doublecheck it and try to do it if you forgot. This has no effect on
  83  * unix, but is important on windows.
  84  */
  85
  86 int gmx_fio_close(t_fileio *fp);
  87 /* Close the file corresponding to fp (if not stdio)
  88  * The routine will exit when an invalid fio is handled.
  89  * Returns 0 on success.
  90  */
  91
  92 int gmx_fio_fp_close(t_fileio *fp);
  93 /* Close the file corresponding to fp without closing the FIO entry
  94  * Needed e.g. for trxio because the FIO entries are used to store
  95  * additional data.
  96  * NOTE that the fp still needs to be properly closed with gmx_fio_close().
  97  * The routine will exit when an invalid fio is handled.
  98  * Returns 0 on success.
  99  */
 100
 101
 102 /* Open a file, return a stream, record the entry in internal FIO object */
 103 FILE* gmx_fio_fopen(const char *fn,const char *mode);
 104
 105 /* Close a file previously opened with gmx_fio_fopen.
 106  * Do not mix these calls with standard fopen/fclose ones!
 107  * Returns 0 on success.  */
 108 int gmx_fio_fclose(FILE *fp);
 109
 110
 111
 112 /********************************************************
 113  * Change properties of the open file
 114  ********************************************************/
 115
 116 void gmx_fio_setprecision(t_fileio *fio,gmx_bool bDouble);
 117 /* Select the floating point precision for reading and writing files */
 118
 119 char *gmx_fio_getname(t_fileio *fio);
 120 /* Return the filename corresponding to the fio index */
 121
 122 int gmx_fio_getftp(t_fileio *fio);
 123 /* Return the filetype corresponding to the fio index.
 124     There is as of now no corresponding setftp function because the file
 125     was opened as a specific file type and changing that midway is most
 126     likely an evil hack. */
 127
 128 void gmx_fio_setdebug(t_fileio *fio,gmx_bool bDebug);
 129 /* Set the debug mode */
 130
 131 gmx_bool gmx_fio_getdebug(t_fileio *fio);
 132 /* Return  whether debug mode is on in fio  */
 133
 134 gmx_bool gmx_fio_getread(t_fileio *fio);
 135 /* Return  whether read mode is on in fio  */
 136
 137
 138 void gmx_fio_checktype(t_fileio *fio);
 139 /* Check whether the fio is of a sane type */
 140
 141 /***************************************************
 142  * FILE Operations
 143  ***************************************************/
 144
 145 void gmx_fio_rewind(t_fileio *fio);
 146 /* Rewind the tpa file in fio */
 147
 148 int gmx_fio_flush(t_fileio *fio);
 149 /* Flush the fio, returns 0 on success */
 150
 151 int gmx_fio_fsync(t_fileio *fio);
 152 /* fsync the fio, returns 0 on success.
 153    NOTE: don't use fsync function unless you're absolutely sure you need it
 154    because it deliberately interferes with the OS's caching mechanisms and
 155    can cause dramatically slowed down IO performance. Some OSes (Linux,
 156    for example), may implement fsync as a full sync() point. */
 157
 158 gmx_off_t gmx_fio_ftell(t_fileio *fio);
 159 /* Return file position if possible */
 160
 161 int gmx_fio_seek(t_fileio *fio,gmx_off_t fpos);
 162 /* Set file position if possible, quit otherwise */
 163
 164 FILE *gmx_fio_getfp(t_fileio *fio);
 165 /* Return the file pointer itself */
 166
 167 XDR *gmx_fio_getxdr(t_fileio *fio);
 168 /* Return the file pointer itself */
 169
 170
 171
 172
 173
 174 /* Element with information about position in a currently open file.
 175  * gmx_off_t should be defined by autoconf if your system does not have it.
 176  * If you do not have it on some other platform you do not have largefile
 177  * support at all, and you can define it to int (or better, find out how to
 178  * enable large files).  */
 179 typedef struct
 180 {
 181         char      filename[STRLEN];
 182         gmx_off_t offset;
 183         unsigned char chksum[16];
 184         int       chksum_size;
 185 }
 186 gmx_file_position_t;
 187
 188
 189 int gmx_fio_check_file_position(t_fileio *fio);
 190 /* Check if the file position is out of the range of off_t.
 191  * The result is stored along with the other file data of fio.
 192  */
 193
 194 int gmx_fio_get_output_file_positions(gmx_file_position_t ** outputfiles,
 195                                       int *nfiles );
 196 /* Return the name and file pointer positions for all currently open
 197  * output files. This is used for saving in the checkpoint files, so we
 198  * can truncate output files upon restart-with-appending.
 199  *
 200  * For the first argument you should use a pointer, which will be set to
 201  * point to a list of open files.
 202  */
 203
 204 t_fileio *gmx_fio_all_output_fsync(void);
 205 /* fsync all open output files. This is used for checkpointing, where
 206    we need to ensure that all output is actually written out to
 207    disk.
 208    This is most important in the case of some networked file systems,
 209    where data is not synced with the file server until close() or
 210    fsync(), so data could remain in cache for days.
 211    Note the caveats reported with gmx_fio_fsync().
 212
 213     returns: NULL if no error occurred, or a pointer to the first file that
 214              failed if an error occurred
 215 */
 216
 217
 218 int gmx_fio_get_file_md5(t_fileio *fio, gmx_off_t offset,
 219                          unsigned char digest[]);
 220
 221
 222 int xtc_seek_frame(t_fileio *fio, int frame, int natoms);
 223
 224 int xtc_seek_time(t_fileio *fio, real time, int natoms);
 225
 226
 227 /* Add this to the comment string for debugging */
 228 void gmx_fio_set_comment(t_fileio *fio, const char *comment);
 229
 230 /* Remove previously set comment */
 231 void gmx_fio_unset_comment(t_fileio *fio);
 232
 233
 234
 235
 236 /********************************************************
 237  * Read and write
 238  ********************************************************/
 239
 240
 241 /* basic reading & writing */
 242 gmx_bool gmx_fio_reade_real(t_fileio *fio, real *item,
 243                         const char *desc, const char *srcfile, int line);
 244 gmx_bool gmx_fio_reade_float(t_fileio *fio, float *item,
 245                           const char *desc, const char *srcfile, int line);
 246 gmx_bool gmx_fio_reade_double(t_fileio *fio, double *item,
 247                           const char *desc, const char *srcfile, int line);
 248 gmx_bool gmx_fio_reade_int(t_fileio *fio, int *item,
 249                        const char *desc, const char *srcfile, int line);
 250 gmx_bool gmx_fio_reade_gmx_large_int(t_fileio *fio, gmx_large_int_t *item,
 251                                  const char *desc, const char *srcfile, int line);
 252 gmx_bool gmx_fio_reade_uchar(t_fileio *fio, unsigned char *item,
 253                          const char *desc, const char *srcfile, int line);
 254 gmx_bool gmx_fio_reade_ushort(t_fileio *fio, unsigned short *item,
 255                          const char *desc, const char *srcfile, int line);
 256 gmx_bool gmx_fio_reade_rvec(t_fileio *fio, rvec *item,
 257                         const char *desc, const char *srcfile, int line);
 258 gmx_bool gmx_fio_reade_ivec(t_fileio *fio, ivec *item,
 259                         const char *desc, const char *srcfile, int line);
 260 gmx_bool gmx_fio_reade_string(t_fileio *fio, char *item,
 261                           const char *desc, const char *srcfile, int line);
 262
 263 gmx_bool gmx_fio_writee_real(t_fileio *fio, real item,
 264                          const char *desc, const char *srcfile, int line);
 265 gmx_bool gmx_fio_writee_float(t_fileio *fio, float item,
 266                            const char *desc, const char *srcfile, int line);
 267 gmx_bool gmx_fio_writee_double(t_fileio *fio, double item,
 268                            const char *desc, const char *srcfile, int line);
 269 gmx_bool gmx_fio_writee_int(t_fileio *fio, int item,
 270                         const char *desc, const char *srcfile, int line);
 271 gmx_bool gmx_fio_writee_gmx_large_int(t_fileio *fio, gmx_large_int_t item,
 272                                   const char *desc, const char *srcfile, int line);
 273 gmx_bool gmx_fio_writee_uchar(t_fileio *fio, unsigned char item,
 274                           const char *desc, const char *srcfile, int line);
 275 gmx_bool gmx_fio_writee_ushort(t_fileio *fio, unsigned short item,
 276                           const char *desc, const char *srcfile, int line);
 277 gmx_bool gmx_fio_writee_rvec(t_fileio *fio, rvec *item,
 278                          const char *desc, const char *srcfile, int line);
 279 gmx_bool gmx_fio_writee_ivec(t_fileio *fio, ivec *item,
 280                          const char *desc, const char *srcfile, int line);
 281 gmx_bool gmx_fio_writee_string(t_fileio *fio, const char *item,
 282                            const char *desc, const char *srcfile, int line);
 283
 284 /* reading or writing, depending on the file's opening mode string */
 285 gmx_bool gmx_fio_doe_real(t_fileio *fio, real *item,
 286                       const char *desc, const char *srcfile, int line);
 287 gmx_bool gmx_fio_doe_float(t_fileio *fio, float *item,
 288                        const char *desc, const char *srcfile, int line);
 289 gmx_bool gmx_fio_doe_double(t_fileio *fio, double *item,
 290                         const char *desc, const char *srcfile, int line);
 291 gmx_bool gmx_fio_doe_gmx_bool(t_fileio *fio, gmx_bool *item,
 292                      const char *desc, const char *srcfile, int line);
 293 gmx_bool gmx_fio_doe_int(t_fileio *fio, int *item,
 294                      const char *desc, const char *srcfile, int line);
 295 gmx_bool gmx_fio_doe_gmx_large_int(t_fileio *fio, gmx_large_int_t *item,
 296                                const char *desc, const char *srcfile, int line);
 297 gmx_bool gmx_fio_doe_uchar(t_fileio *fio, unsigned char *item,
 298                        const char *desc, const char *srcfile, int line);
 299 gmx_bool gmx_fio_doe_ushort(t_fileio *fio, unsigned short *item,
 300                        const char *desc, const char *srcfile, int line);
 301 gmx_bool gmx_fio_doe_rvec(t_fileio *fio, rvec *item,
 302                       const char *desc, const char *srcfile, int line);
 303 gmx_bool gmx_fio_doe_ivec(t_fileio *fio, ivec *item,
 304                       const char *desc, const char *srcfile, int line);
 305 gmx_bool gmx_fio_doe_string(t_fileio *fio, char *item,
 306                         const char *desc, const char *srcfile, int line);
 307
 308
 309
 310
 311 /* array reading & writing */
 312 gmx_bool gmx_fio_nreade_real(t_fileio *fio, real *item, int n,
 313                          const char *desc, const char *srcfile, int line);
 314 gmx_bool gmx_fio_nreade_float(t_fileio *fio, float *item, int n,
 315                           const char *desc, const char *srcfile, int line);
 316 gmx_bool gmx_fio_nreade_double(t_fileio *fio, double *item, int n,
 317                            const char *desc, const char *srcfile, int line);
 318 gmx_bool gmx_fio_nreade_int(t_fileio *fio, int *item, int n,
 319                         const char *desc, const char *srcfile, int line);
 320 gmx_bool gmx_fio_nreade_gmx_large_int(t_fileio *fio, gmx_large_int_t *item, int n,
 321                                   const char *desc, const char *srcfile,
 322                                   int line);
 323 gmx_bool gmx_fio_nreade_uchar(t_fileio *fio, unsigned char *item, int n,
 324                           const char *desc, const char *srcfile, int line);
 325 gmx_bool gmx_fio_nreade_ushort(t_fileio *fio, unsigned short *item, int n,
 326                           const char *desc, const char *srcfile, int line);
 327 gmx_bool gmx_fio_nreade_rvec(t_fileio *fio, rvec *item, int n,
 328                          const char *desc, const char *srcfile, int line);
 329 gmx_bool gmx_fio_nreade_ivec(t_fileio *fio, ivec *item, int n,
 330                          const char *desc, const char *srcfile, int line);
 331 gmx_bool gmx_fio_nreade_string(t_fileio *fio, char *item[], int n,
 332                            const char *desc, const char *srcfile, int line);
 333
 334 gmx_bool gmx_fio_nwritee_real(t_fileio *fio, const real *item, int n,
 335                           const char *desc, const char *srcfile, int line);
 336 gmx_bool gmx_fio_nwritee_float(t_fileio *fio, const float *item, int n,
 337                            const char *desc, const char *srcfile, int line);
 338 gmx_bool gmx_fio_nwritee_double(t_fileio *fio, const double *item, int n,
 339                             const char *desc, const char *srcfile, int line);
 340 gmx_bool gmx_fio_nwritee_int(t_fileio *fio, const int *item, int n,
 341                          const char *desc, const char *srcfile, int line);
 342 gmx_bool gmx_fio_nwritee_gmx_large_int(t_fileio *fio,
 343                                    const gmx_large_int_t *item, int n,
 344                                    const char *desc, const char *srcfile,
 345                                    int line);
 346 gmx_bool gmx_fio_nwritee_uchar(t_fileio *fio, const unsigned char *item, int n,
 347                            const char *desc, const char *srcfile, int line);
 348 gmx_bool gmx_fio_nwritee_ushort(t_fileio *fio, const unsigned short *item, int n,
 349                            const char *desc, const char *srcfile, int line);
 350 gmx_bool gmx_fio_nwritee_rvec(t_fileio *fio, const rvec *item, int n,
 351                           const char *desc, const char *srcfile, int line);
 352 gmx_bool gmx_fio_nwritee_ivec(t_fileio *fio, const ivec *item, int n,
 353                           const char *desc, const char *srcfile, int line);
 354 gmx_bool gmx_fio_nwritee_string(t_fileio *fio, const char *item[], int n,
 355                             const char *desc, const char *srcfile, int line);
 356
 357 gmx_bool gmx_fio_ndoe_real(t_fileio *fio, real *item, int n,
 358                        const char *desc, const char *srcfile, int line);
 359 gmx_bool gmx_fio_ndoe_float(t_fileio *fio, float *item, int n,
 360                          const char *desc, const char *srcfile, int line);
 361 gmx_bool gmx_fio_ndoe_double(t_fileio *fio, double *item, int n,
 362                          const char *desc, const char *srcfile, int line);
 363 gmx_bool gmx_fio_ndoe_gmx_bool(t_fileio *fio, gmx_bool *item, int n,
 364                       const char *desc, const char *srcfile, int line);
 365 gmx_bool gmx_fio_ndoe_int(t_fileio *fio, int *item, int n,
 366                       const char *desc, const char *srcfile, int line);
 367 gmx_bool gmx_fio_ndoe_gmx_large_int(t_fileio *fio, gmx_large_int_t *item, int n,
 368                                 const char *desc, const char *srcfile,
 369                                 int line);
 370 gmx_bool gmx_fio_ndoe_uchar(t_fileio *fio, unsigned char *item, int n,
 371                         const char *desc, const char *srcfile, int line);
 372 gmx_bool gmx_fio_ndoe_ushort(t_fileio *fio, unsigned short *item, int n,
 373                         const char *desc, const char *srcfile, int line);
 374 gmx_bool gmx_fio_ndoe_rvec(t_fileio *fio, rvec *item, int n,
 375                        const char *desc, const char *srcfile, int line);
 376 gmx_bool gmx_fio_ndoe_ivec(t_fileio *fio, ivec *item, int n,
 377                        const char *desc, const char *srcfile, int line);
 378 gmx_bool gmx_fio_ndoe_string(t_fileio *fio, char *item[], int n,
 379                          const char *desc, const char *srcfile, int line);
 380
 381
 382
 383 /* convenience macros */
 384 #define gmx_fio_read_real(fio, item)           gmx_fio_reade_real(fio, &item, (#item), __FILE__, __LINE__)
 385 #define gmx_fio_read_float(fio, item)          gmx_fio_reade_float(fio, &item, (#item), __FILE__, __LINE__)
 386 #define gmx_fio_read_double(fio, item)         gmx_fio_reade_double(fio, &item, (#item), __FILE__, __LINE__)
 387 #define gmx_fio_read_int(fio, item)            gmx_fio_reade_int(fio, &item, (#item), __FILE__, __LINE__)
 388 #define gmx_fio_read_gmx_large_int(fio, item)  gmx_fio_reade_gmx_large_int(fio, &item, (#item), __FILE__, __LINE__)
 389 #define gmx_fio_read_uchar(fio, item)          gmx_fio_reade_uchar(fio, &item, (#item), __FILE__, __LINE__)
 390 #define gmx_fio_read_ushort(fio, item)         gmx_fio_reade_ushort(fio, &item, (#item), __FILE__, __LINE__)
 391 #define gmx_fio_read_rvec(fio, item)           gmx_fio_reade_rvec(fio, item, (#item), __FILE__, __LINE__)
 392 #define gmx_fio_read_ivec(fio, item)           gmx_fio_reade_ivec(fio, item, (#item), __FILE__, __LINE__)
 393 #define gmx_fio_read_string(fio, item)         gmx_fio_reade_string(fio, item, (#item), __FILE__, __LINE__)
 394
 395 #define gmx_fio_write_real(fio, item)           gmx_fio_writee_real(fio, item, (#item), __FILE__, __LINE__)
 396 #define gmx_fio_write_float(fio, item)          gmx_fio_writee_float(fio, item, (#item), __FILE__, __LINE__)
 397 #define gmx_fio_write_double(fio, item)         gmx_fio_writee_double(fio, item, (#item), __FILE__, __LINE__)
 398 #define gmx_fio_write_int(fio, item)            gmx_fio_writee_int(fio, item, (#item), __FILE__, __LINE__)
 399 #define gmx_fio_write_gmx_large_int(fio, item)  gmx_fio_writee_gmx_large_int(fio, item, (#item), __FILE__, __LINE__)
 400 #define gmx_fio_write_uchar(fio, item)          gmx_fio_writee_uchar(fio, item, (#item), __FILE__, __LINE__)
 401 #define gmx_fio_write_ushort(fio, item)         gmx_fio_writee_ushort(fio, item, (#item), __FILE__, __LINE__)
 402 #define gmx_fio_write_rvec(fio, item)           gmx_fio_writee_rvec(fio, item, (#item), __FILE__, __LINE__)
 403 #define gmx_fio_write_ivec(fio, item)           gmx_fio_writee_ivec(fio, item, (#item), __FILE__, __LINE__)
 404 #define gmx_fio_write_string(fio, item)         gmx_fio_writee_string(fio, item, (#item), __FILE__, __LINE__)
 405
 406 #define gmx_fio_do_real(fio, item)              gmx_fio_doe_real(fio, &item, (#item), __FILE__, __LINE__)
 407 #define gmx_fio_do_float(fio, item)             gmx_fio_doe_float(fio, &item, (#item), __FILE__, __LINE__)
 408 #define gmx_fio_do_double(fio, item)            gmx_fio_doe_double(fio, &item, (#item), __FILE__, __LINE__)
 409 #define gmx_fio_do_gmx_bool(fio, item)              gmx_fio_doe_gmx_bool(fio, &item, (#item), __FILE__, __LINE__)
 410 #define gmx_fio_do_int(fio, item)               gmx_fio_doe_int(fio, &item, (#item), __FILE__, __LINE__)
 411 #define gmx_fio_do_gmx_large_int(fio, item)     gmx_fio_doe_gmx_large_int(fio, &item, (#item), __FILE__, __LINE__)
 412 #define gmx_fio_do_uchar(fio, item)             gmx_fio_doe_uchar(fio, &item, (#item), __FILE__, __LINE__)
 413 #define gmx_fio_do_ushort(fio, item)            gmx_fio_doe_ushort(fio, &item, (#item), __FILE__, __LINE__)
 414 #define gmx_fio_do_rvec(fio, item)              gmx_fio_doe_rvec(fio, &item, (#item), __FILE__, __LINE__)
 415 #define gmx_fio_do_ivec(fio, item)              gmx_fio_doe_ivec(fio, &item, (#item), __FILE__, __LINE__)
 416 #define gmx_fio_do_string(fio, item)            gmx_fio_doe_string(fio, item, (#item), __FILE__, __LINE__)
 417
 418
 419
 420
 421 #define gmx_fio_nread_real(fio, item, n)            gmx_fio_nreade_real(fio, item, n, (#item), __FILE__, __LINE__)
 422 #define gmx_fio_nread_float(fio, item, n)           gmx_fio_nreade_float(fio, item, n, (#item), __FILE__, __LINE__)
 423 #define gmx_fio_nread_double(fio, item, n)          gmx_fio_nreade_double(fio, item, n, (#item), __FILE__, __LINE__)
 424 #define gmx_fio_nread_int(fio, item, n)             gmx_fio_nreade_int(fio, item, n, (#item), __FILE__, __LINE__)
 425 #define gmx_fio_nread_gmx_large_int(fio, item, n)   gmx_fio_nreade_gmx_large_int(fio, item, n, (#item), __FILE__, __LINE__)
 426 #define gmx_fio_nread_uchar(fio, item, n)           gmx_fio_nreade_uchar(fio, item, n, (#item), __FILE__, __LINE__)
 427 #define gmx_fio_nread_ushort(fio, item, n)          gmx_fio_nreade_ushort(fio, item, n, (#item), __FILE__, __LINE__)
 428 #define gmx_fio_nread_rvec(fio, item, n)            gmx_fio_nreade_rvec(fio, item, n, (#item), __FILE__, __LINE__)
 429 #define gmx_fio_nread_ivec(fio, item, n)            gmx_fio_nreade_ivec(fio, item, n, (#item), __FILE__, __LINE__)
 430 #define gmx_fio_nread_string(fio, item, n)          gmx_fio_nreade_string(fio, item, n, (#item), __FILE__, __LINE__)
 431
 432 #define gmx_fio_nwrite_real(fio, item, n)           gmx_fio_nwritee_real(fio, item, n, (#item), __FILE__, __LINE__)
 433 #define gmx_fio_nwrite_float(fio, item, n)          gmx_fio_nwritee_float(fio, item, n, (#item), __FILE__, __LINE__)
 434 #define gmx_fio_nwrite_double(fio, item, n)         gmx_fio_nwritee_double(fio, item, n, (#item), __FILE__, __LINE__)
 435 #define gmx_fio_nwrite_int(fio, item, n)            gmx_fio_nwritee_int(fio, item, n, (#item), __FILE__, __LINE__)
 436 #define gmx_fio_nwrite_gmx_large_int(fio, item, n)  gmx_fio_nwritee_gmx_large_int(fio, item, n, (#item), __FILE__, __LINE__)
 437 #define gmx_fio_nwrite_uchar(fio, item, n)          gmx_fio_nwritee_uchar(fio, item, n, (#item), __FILE__, __LINE__)
 438 #define gmx_fio_nwrite_ushort(fio, item, n)         gmx_fio_nwritee_ushort(fio, item, n, (#item), __FILE__, __LINE__)
 439 #define gmx_fio_nwrite_rvec(fio, item, n)           gmx_fio_nwritee_rvec(fio, item, n, (#item), __FILE__, __LINE__)
 440 #define gmx_fio_nwrite_ivec(fio, item, n)           gmx_fio_nwritee_ivec(fio, item, n, (#item), __FILE__, __LINE__)
 441 #define gmx_fio_nwrite_string(fio, item, n)         gmx_fio_nwritee_string(fio, item, n, (#item), __FILE__, __LINE__)
 442
 443 #define gmx_fio_ndo_real(fio, item, n)              gmx_fio_ndoe_real(fio, item, n, (#item), __FILE__, __LINE__)
 444 #define gmx_fio_ndo_float(fio, item, n)             gmx_fio_ndoe_float(fio, item, n, (#item), __FILE__, __LINE__)
 445 #define gmx_fio_ndo_double(fio, item, n)            gmx_fio_ndoe_double(fio, item, n, (#item), __FILE__, __LINE__)
 446 #define gmx_fio_ndo_gmx_bool(fio, item, n)              gmx_fio_ndoe_gmx_bool(fio, item, n, (#item), __FILE__, __LINE__)
 447 #define gmx_fio_ndo_int(fio, item, n)               gmx_fio_ndoe_int(fio, item, n, (#item), __FILE__, __LINE__)
 448 #define gmx_fio_ndo_gmx_large_int(fio, item, n)     gmx_fio_ndoe_gmx_large_int(fio, item, n, (#item), __FILE__, __LINE__)
 449 #define gmx_fio_ndo_uchar(fio, item, n)             gmx_fio_ndoe_uchar(fio, item, n, (#item), __FILE__, __LINE__)
 450 #define gmx_fio_ndo_ushort(fio, item, n)            gmx_fio_ndoe_ushort(fio, item, n, (#item), __FILE__, __LINE__)
 451 #define gmx_fio_ndo_rvec(fio, item, n)              gmx_fio_ndoe_rvec(fio, item, n, (#item), __FILE__, __LINE__)
 452 #define gmx_fio_ndo_ivec(fio, item, n)              gmx_fio_ndoe_ivec(fio, item, n, (#item), __FILE__, __LINE__)
 453 #define gmx_fio_ndo_string(fio, item, n)            gmx_fio_ndoe_string(fio, item, n, (#item), __FILE__, __LINE__)
 454
 455 #ifdef __cplusplus
 456 }
 457 #endif
 458
 459 #endif