Merge branch 'release-4-6'
[alexxy/gromacs.git] / src / gromacs / legacyheaders / chargegroup.h
1 /*
2  * 
3  *                This source code is part of
4  * 
5  *                 G   R   O   M   A   C   S
6  * 
7  *          GROningen MAchine for Chemical Simulations
8  * 
9  *                        VERSION 3.2.0
10  * Written by David van der Spoel, Erik Lindahl, Berk Hess, and others.
11  * Copyright (c) 1991-2000, University of Groningen, The Netherlands.
12  * Copyright (c) 2001-2004, The GROMACS development team,
13  * check out http://www.gromacs.org for more information.
14
15  * This program is free software; you can redistribute it and/or
16  * modify it under the terms of the GNU General Public License
17  * as published by the Free Software Foundation; either version 2
18  * of the License, or (at your option) any later version.
19  * 
20  * If you want to redistribute modifications, please consider that
21  * scientific software is very special. Version control is crucial -
22  * bugs must be traceable. We will be happy to consider code for
23  * inclusion in the official distribution, but derived work must not
24  * be called official GROMACS. Details are found in the README & COPYING
25  * files - if they are missing, get the official version at www.gromacs.org.
26  * 
27  * To help us fund GROMACS development, we humbly ask that you cite
28  * the papers on the package - you can find them in the top README file.
29  * 
30  * For more info, check our website at http://www.gromacs.org
31  * 
32  * And Hey:
33  * Gromacs Runs On Most of All Computer Systems
34  */
35
36 #ifndef _chargegroup_h
37 #define _chargegroup_h
38
39 #include "sysstuff.h"
40 #include "typedefs.h"
41
42 #ifdef __cplusplus
43 extern "C" { 
44 #endif
45
46   void calc_chargegroup_radii(const gmx_mtop_t *mtop,rvec *x,
47                                      real *rvdw1,real *rvdw2,
48                                      real *rcoul1,real *rcoul2);
49   /* This routine calculates the two largest charge group radii in x,
50    * separately for VdW and Coulomb interactions.
51    */
52
53   void calc_cgcm(FILE *log,int cg0,int cg1,t_block *cgs,
54                         rvec pos[],rvec cg_cm[]);
55   /* Routine to compute centers of geometry of charge groups. No periodicity
56    * is used.
57    */
58   
59   void put_charge_groups_in_box (FILE *log,int cg0,int cg1,
60                                         int ePBC,matrix box,t_block *cgs,
61                                         rvec pos[],
62                                         rvec cg_cm[]);
63   /* This routine puts charge groups in the periodic box, keeping them
64    * together.
65    */
66   
67 #ifdef __cplusplus
68 }
69 #endif
70
71 #endif  /* _chargegroup_h */