src/gromacs/gpu_utils/gpu_utils.cu

   1 /*
   2  * This file is part of the GROMACS molecular simulation package.
   3  *
   4  * Copyright (c) 2010,2011,2012,2013,2014,2015,2016, The GROMACS development team.
   5  * Copyright (c) 2017,2018,2019,2020, by the GROMACS development team, led by
   6  * Mark Abraham, David van der Spoel, Berk Hess, and Erik Lindahl,
   7  * and including many others, as listed in the AUTHORS file in the
   8  * top-level source directory and at http://www.gromacs.org.
   9  *
  10  * GROMACS is free software; you can redistribute it and/or
  11  * modify it under the terms of the GNU Lesser General Public License
  12  * as published by the Free Software Foundation; either version 2.1
  13  * of the License, or (at your option) any later version.
  14  *
  15  * GROMACS is distributed in the hope that it will be useful,
  16  * but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
  17  * MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the GNU
  18  * Lesser General Public License for more details.
  19  *
  20  * You should have received a copy of the GNU Lesser General Public
  21  * License along with GROMACS; if not, see
  22  * http://www.gnu.org/licenses, or write to the Free Software Foundation,
  23  * Inc., 51 Franklin Street, Fifth Floor, Boston, MA  02110-1301  USA.
  24  *
  25  * If you want to redistribute modifications to GROMACS, please
  26  * consider that scientific software is very special. Version
  27  * control is crucial - bugs must be traceable. We will be happy to
  28  * consider code for inclusion in the official distribution, but
  29  * derived work must not be called official GROMACS. Details are found
  30  * in the README & COPYING files - if they are missing, get the
  31  * official version at http://www.gromacs.org.
  32  *
  33  * To help us fund GROMACS development, we humbly ask that you cite
  34  * the research papers on the package. Check out http://www.gromacs.org.
  35  */
  36 /*! \file
  37  *  \brief Define functions for detection and initialization for CUDA devices.
  38  *
  39  *  \author Szilard Pall <pall.szilard@gmail.com>
  40  */
  41
  42 #include "gmxpre.h"
  43
  44 #include "gpu_utils.h"
  45
  46 #include <assert.h>
  47 #include <stdio.h>
  48 #include <stdlib.h>
  49
  50 #include <cuda_profiler_api.h>
  51
  52 #include "gromacs/gpu_utils/cudautils.cuh"
  53 #include "gromacs/gpu_utils/device_context.h"
  54 #include "gromacs/gpu_utils/device_stream.h"
  55 #include "gromacs/gpu_utils/pmalloc_cuda.h"
  56 #include "gromacs/hardware/device_information.h"
  57 #include "gromacs/hardware/device_management.h"
  58 #include "gromacs/utility/basedefinitions.h"
  59 #include "gromacs/utility/cstringutil.h"
  60 #include "gromacs/utility/exceptions.h"
  61 #include "gromacs/utility/fatalerror.h"
  62 #include "gromacs/utility/gmxassert.h"
  63 #include "gromacs/utility/logger.h"
  64 #include "gromacs/utility/programcontext.h"
  65 #include "gromacs/utility/smalloc.h"
  66 #include "gromacs/utility/snprintf.h"
  67 #include "gromacs/utility/stringutil.h"
  68
  69 static bool cudaProfilerRun = ((getenv("NVPROF_ID") != nullptr));
  70
  71 bool isHostMemoryPinned(const void* h_ptr)
  72 {
  73     cudaPointerAttributes memoryAttributes;
  74     cudaError_t           stat = cudaPointerGetAttributes(&memoryAttributes, h_ptr);
  75
  76     bool isPinned = false;
  77     switch (stat)
  78     {
  79         case cudaSuccess:
  80             // In CUDA 11.0, the field called memoryType in
  81             // cudaPointerAttributes was replaced by a field called
  82             // type, along with a documented change of behavior when the
  83             // pointer passed to cudaPointerGetAttributes is to
  84             // non-registered host memory. That change means that this
  85             // code needs conditional compilation and different
  86             // execution paths to function with all supported versions.
  87 #if CUDART_VERSION < 11 * 1000
  88             isPinned = true;
  89 #else
  90             isPinned = (memoryAttributes.type == cudaMemoryTypeHost);
  91 #endif
  92             break;
  93
  94         case cudaErrorInvalidValue:
  95             // If the buffer was not pinned, then it will not be recognized by CUDA at all
  96             isPinned = false;
  97             // Reset the last error status
  98             cudaGetLastError();
  99             break;
 100
 101         default: CU_RET_ERR(stat, "Unexpected CUDA error");
 102     }
 103     return isPinned;
 104 }
 105
 106 void startGpuProfiler(void)
 107 {
 108     /* The NVPROF_ID environment variable is set by nvprof and indicates that
 109        mdrun is executed in the CUDA profiler.
 110        If nvprof was run is with "--profile-from-start off", the profiler will
 111        be started here. This way we can avoid tracing the CUDA events from the
 112        first part of the run. Starting the profiler again does nothing.
 113      */
 114     if (cudaProfilerRun)
 115     {
 116         cudaError_t stat;
 117         stat = cudaProfilerStart();
 118         CU_RET_ERR(stat, "cudaProfilerStart failed");
 119     }
 120 }
 121
 122 void stopGpuProfiler(void)
 123 {
 124     /* Stopping the nvidia here allows us to eliminate the subsequent
 125        API calls from the trace, e.g. uninitialization and cleanup. */
 126     if (cudaProfilerRun)
 127     {
 128         cudaError_t stat;
 129         stat = cudaProfilerStop();
 130         CU_RET_ERR(stat, "cudaProfilerStop failed");
 131     }
 132 }
 133
 134 void resetGpuProfiler(void)
 135 {
 136     /* With CUDA <=7.5 the profiler can't be properly reset; we can only start
 137      *  the profiling here (can't stop it) which will achieve the desired effect if
 138      *  the run was started with the profiling disabled.
 139      *
 140      * TODO: add a stop (or replace it with reset) when this will work correctly in CUDA.
 141      * stopGpuProfiler();
 142      */
 143     if (cudaProfilerRun)
 144     {
 145         startGpuProfiler();
 146     }
 147 }
 148
 149 /*! \brief Check status returned from peer access CUDA call, and error out or warn appropriately
 150  * \param[in] stat           CUDA call return status
 151  * \param[in] gpuA           ID for GPU initiating peer access call
 152  * \param[in] gpuB           ID for remote GPU
 153  * \param[in] mdlog          Logger object
 154  * \param[in] cudaCallName   name of CUDA peer access call
 155  */
 156 static void peerAccessCheckStat(const cudaError_t    stat,
 157                                 const int            gpuA,
 158                                 const int            gpuB,
 159                                 const gmx::MDLogger& mdlog,
 160                                 const char*          cudaCallName)
 161 {
 162     if ((stat == cudaErrorInvalidDevice) || (stat == cudaErrorInvalidValue))
 163     {
 164         std::string errorString =
 165                 gmx::formatString("%s from GPU %d to GPU %d failed", cudaCallName, gpuA, gpuB);
 166         CU_RET_ERR(stat, errorString.c_str());
 167     }
 168     if (stat != cudaSuccess)
 169     {
 170         GMX_LOG(mdlog.warning)
 171                 .asParagraph()
 172                 .appendTextFormatted(
 173                         "GPU peer access not enabled between GPUs %d and %d due to unexpected "
 174                         "return value from %s. %s",
 175                         gpuA, gpuB, cudaCallName, gmx::getDeviceErrorString(stat).c_str());
 176     }
 177 }
 178
 179 void setupGpuDevicePeerAccess(const std::vector<int>& gpuIdsToUse, const gmx::MDLogger& mdlog)
 180 {
 181     cudaError_t stat;
 182
 183     // take a note of currently-set GPU
 184     int currentGpu;
 185     stat = cudaGetDevice(&currentGpu);
 186     CU_RET_ERR(stat, "cudaGetDevice in setupGpuDevicePeerAccess failed");
 187
 188     std::string message = gmx::formatString(
 189             "Note: Peer access enabled between the following GPU pairs in the node:\n ");
 190     bool peerAccessEnabled = false;
 191
 192     for (unsigned int i = 0; i < gpuIdsToUse.size(); i++)
 193     {
 194         int gpuA = gpuIdsToUse[i];
 195         stat     = cudaSetDevice(gpuA);
 196         if (stat != cudaSuccess)
 197         {
 198             GMX_LOG(mdlog.warning)
 199                     .asParagraph()
 200                     .appendTextFormatted(
 201                             "GPU peer access not enabled due to unexpected return value from "
 202                             "cudaSetDevice(%d). %s",
 203                             gpuA, gmx::getDeviceErrorString(stat).c_str());
 204             return;
 205         }
 206         for (unsigned int j = 0; j < gpuIdsToUse.size(); j++)
 207         {
 208             if (j != i)
 209             {
 210                 int gpuB          = gpuIdsToUse[j];
 211                 int canAccessPeer = 0;
 212                 stat              = cudaDeviceCanAccessPeer(&canAccessPeer, gpuA, gpuB);
 213                 peerAccessCheckStat(stat, gpuA, gpuB, mdlog, "cudaDeviceCanAccessPeer");
 214
 215                 if (canAccessPeer)
 216                 {
 217                     stat = cudaDeviceEnablePeerAccess(gpuB, 0);
 218                     peerAccessCheckStat(stat, gpuA, gpuB, mdlog, "cudaDeviceEnablePeerAccess");
 219
 220                     message           = gmx::formatString("%s%d->%d ", message.c_str(), gpuA, gpuB);
 221                     peerAccessEnabled = true;
 222                 }
 223             }
 224         }
 225     }
 226
 227     // re-set GPU to that originally set
 228     stat = cudaSetDevice(currentGpu);
 229     if (stat != cudaSuccess)
 230     {
 231         CU_RET_ERR(stat, "cudaSetDevice in setupGpuDevicePeerAccess failed");
 232         return;
 233     }
 234
 235     if (peerAccessEnabled)
 236     {
 237         GMX_LOG(mdlog.info).asParagraph().appendTextFormatted("%s", message.c_str());
 238     }
 239 }