src/gromacs/gpu_utils/devicebuffer_sycl.h

   1 /*
   2  * This file is part of the GROMACS molecular simulation package.
   3  *
   4  * Copyright (c) 2020,2021, by the GROMACS development team, led by
   5  * Mark Abraham, David van der Spoel, Berk Hess, and Erik Lindahl,
   6  * and including many others, as listed in the AUTHORS file in the
   7  * top-level source directory and at http://www.gromacs.org.
   8  *
   9  * GROMACS is free software; you can redistribute it and/or
  10  * modify it under the terms of the GNU Lesser General Public License
  11  * as published by the Free Software Foundation; either version 2.1
  12  * of the License, or (at your option) any later version.
  13  *
  14  * GROMACS is distributed in the hope that it will be useful,
  15  * but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
  16  * MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the GNU
  17  * Lesser General Public License for more details.
  18  *
  19  * You should have received a copy of the GNU Lesser General Public
  20  * License along with GROMACS; if not, see
  21  * http://www.gnu.org/licenses, or write to the Free Software Foundation,
  22  * Inc., 51 Franklin Street, Fifth Floor, Boston, MA  02110-1301  USA.
  23  *
  24  * If you want to redistribute modifications to GROMACS, please
  25  * consider that scientific software is very special. Version
  26  * control is crucial - bugs must be traceable. We will be happy to
  27  * consider code for inclusion in the official distribution, but
  28  * derived work must not be called official GROMACS. Details are found
  29  * in the README & COPYING files - if they are missing, get the
  30  * official version at http://www.gromacs.org.
  31  *
  32  * To help us fund GROMACS development, we humbly ask that you cite
  33  * the research papers on the package. Check out http://www.gromacs.org.
  34  */
  35 #ifndef GMX_GPU_UTILS_DEVICEBUFFER_SYCL_H
  36 #define GMX_GPU_UTILS_DEVICEBUFFER_SYCL_H
  37
  38 /*! \libinternal \file
  39  *  \brief Implements the DeviceBuffer type and routines for SYCL.
  40  *  Should only be included directly by the main DeviceBuffer file devicebuffer.h.
  41  *  TODO: the intent is for DeviceBuffer to become a class.
  42  *
  43  *  \author Artem Zhmurov <zhmurov@gmail.com>
  44  *  \author Erik Lindahl <erik.lindahl@gmail.com>
  45  *  \author Andrey Alekseenko <al42and@gmail.com>
  46  *
  47  *  \inlibraryapi
  48  */
  49
  50 #include <utility>
  51
  52 #include "gromacs/gpu_utils/device_context.h"
  53 #include "gromacs/gpu_utils/device_stream.h"
  54 #include "gromacs/gpu_utils/devicebuffer_datatype.h"
  55 #include "gromacs/gpu_utils/gmxsycl.h"
  56 #include "gromacs/gpu_utils/gpu_utils.h" //only for GpuApiCallBehavior
  57 #include "gromacs/gpu_utils/gputraits_sycl.h"
  58 #include "gromacs/utility/fatalerror.h"
  59 #include "gromacs/utility/gmxassert.h"
  60 #include "gromacs/utility/stringutil.h"
  61
  62 #ifndef DOXYGEN
  63 template<typename T>
  64 class DeviceBuffer<T>::ClSyclBufferWrapper : public cl::sycl::buffer<T, 1>
  65 {
  66     using cl::sycl::buffer<T, 1>::buffer; // Get all the constructors
  67 };
  68
  69 template<typename T>
  70 using ClSyclBufferWrapper = typename DeviceBuffer<T>::ClSyclBufferWrapper;
  71
  72 //! Constructor.
  73 template<typename T>
  74 DeviceBuffer<T>::DeviceBuffer() : buffer_(nullptr)
  75 {
  76 }
  77
  78 //! Destructor.
  79 template<typename T>
  80 DeviceBuffer<T>::~DeviceBuffer() = default;
  81
  82 //! Copy constructor (references the same underlying SYCL buffer).
  83 template<typename T>
  84 DeviceBuffer<T>::DeviceBuffer(DeviceBuffer<T> const& src) :
  85     buffer_(new ClSyclBufferWrapper(*src.buffer_))
  86 {
  87 }
  88
  89 //! Move constructor.
  90 template<typename T>
  91 DeviceBuffer<T>::DeviceBuffer(DeviceBuffer<T>&& src) noexcept = default;
  92
  93 //! Copy assignment (references the same underlying SYCL buffer).
  94 template<typename T>
  95 DeviceBuffer<T>& DeviceBuffer<T>::operator=(DeviceBuffer<T> const& src)
  96 {
  97     buffer_.reset(new ClSyclBufferWrapper(*src.buffer_));
  98     return *this;
  99 }
 100
 101 //! Move assignment.
 102 template<typename T>
 103 DeviceBuffer<T>& DeviceBuffer<T>::operator=(DeviceBuffer<T>&& src) noexcept = default;
 104
 105 /*! \brief Dummy assignment operator to allow compilation of some cross-platform code.
 106  *
 107  * A hacky way to make SYCL implementation of DeviceBuffer compatible with details of CUDA and
 108  * OpenCL implementations.
 109  *
 110  * \todo Should be removed after DeviceBuffer refactoring.
 111  *
 112  * \tparam T Type of buffer content.
 113  * \param nullPtr \c std::nullptr. Not possible to assign any other pointers.
 114  */
 115 template<typename T>
 116 DeviceBuffer<T>& DeviceBuffer<T>::operator=(std::nullptr_t nullPtr)
 117 {
 118     buffer_.reset(nullPtr);
 119     return *this;
 120 }
 121
 122
 123 namespace gmx::internal
 124 {
 125 //! Shorthand alias to create a placeholder SYCL accessor with chosen data type and access mode.
 126 template<class T, enum cl::sycl::access::mode mode>
 127 using PlaceholderAccessor =
 128         cl::sycl::accessor<T, 1, mode, cl::sycl::access::target::global_buffer, cl::sycl::access::placeholder::true_t>;
 129 } // namespace gmx::internal
 130
 131 /** \brief
 132  * Thin wrapper around placeholder accessor that allows implicit construction from \c DeviceBuffer.
 133  *
 134  * "Placeholder accessor" is an indicator of the intent to create an accessor for certain buffer
 135  * of a certain type, that is not yet bound to a specific command group handler (device). Such
 136  * accessors can be created outside SYCL kernels, which is helpful if we want to pass them as
 137  * function arguments.
 138  *
 139  * \tparam T Type of buffer content.
 140  * \tparam mode Access mode.
 141  */
 142 template<class T, enum cl::sycl::access::mode mode>
 143 class DeviceAccessor : public gmx::internal::PlaceholderAccessor<T, mode>
 144 {
 145 public:
 146     // Inherit all the constructors
 147     using gmx::internal::PlaceholderAccessor<T, mode>::PlaceholderAccessor;
 148     //! Construct Accessor from DeviceBuffer (must be initialized)
 149     DeviceAccessor(DeviceBuffer<T>& buffer) :
 150         gmx::internal::PlaceholderAccessor<T, mode>(getSyclBuffer(buffer))
 151     {
 152     }
 153
 154 private:
 155     //! Helper function to get sycl:buffer object from DeviceBuffer wrapper, with a sanity check.
 156     static inline cl::sycl::buffer<T, 1>& getSyclBuffer(DeviceBuffer<T>& buffer)
 157     {
 158         GMX_ASSERT(bool(buffer), "Trying to construct accessor from an uninitialized buffer");
 159         return *buffer.buffer_;
 160     }
 161 };
 162
 163 namespace gmx::internal
 164 {
 165 //! A "blackhole" class to be used when we want to ignore an argument to a function.
 166 struct EmptyClassThatIgnoresConstructorArguments
 167 {
 168     template<class... Args>
 169     [[maybe_unused]] EmptyClassThatIgnoresConstructorArguments(Args&&... /*args*/)
 170     {
 171     }
 172 };
 173 } // namespace gmx::internal
 174
 175 /** \brief
 176  * Helper class to be used as function argument. Will either correspond to a device accessor, or an empty class.
 177  *
 178  * Example usage:
 179  * \code
 180     template <bool doFoo>
 181     void getBarKernel(handler& cgh, OptionalAccessor<float, mode::read, doFoo> a_fooPrms)
 182     {
 183         if constexpr (doFoo)
 184             cgh.require(a_fooPrms);
 185         // Can only use a_fooPrms if doFoo == true
 186     }
 187
 188     template <bool doFoo>
 189     void callBar(DeviceBuffer<float> b_fooPrms)
 190     {
 191         // If doFoo is false, b_fooPrms will be ignored (can be not initialized).
 192         // Otherwise, an accessor will be built (b_fooPrms must be a valid buffer).
 193         auto kernel = getBarKernel<doFoo>(b_fooPrms);
 194         // If the accessor in not enabled, anything can be passed as its ctor argument.
 195         auto kernel2 = getBarKernel<false>(nullptr_t);
 196     }
 197  * \endcode
 198  *
 199  * \tparam T Data type of the underlying buffer
 200  * \tparam mode Access mode of the accessor
 201  * \tparam enabled Compile-time flag indicating whether we want to actually create an accessor.
 202  */
 203 template<class T, enum cl::sycl::access::mode mode, bool enabled>
 204 using OptionalAccessor =
 205         std::conditional_t<enabled, DeviceAccessor<T, mode>, gmx::internal::EmptyClassThatIgnoresConstructorArguments>;
 206
 207 #endif // #ifndef DOXYGEN
 208
 209 /*! \brief Check the validity of the device buffer.
 210  *
 211  * Checks if the buffer is valid and if its allocation is big enough.
 212  *
 213  * \param[in] buffer        Device buffer to be checked.
 214  * \param[in] requiredSize  Number of elements that the buffer will have to accommodate.
 215  *
 216  * \returns Whether the device buffer exists and has enough capacity.
 217  */
 218 template<typename T>
 219 static gmx_unused bool checkDeviceBuffer(const DeviceBuffer<T>& buffer, int requiredSize)
 220 {
 221     return buffer.buffer_ && (static_cast<int>(buffer.buffer_->get_count()) >= requiredSize);
 222 }
 223
 224 /*! \libinternal \brief
 225  * Allocates a device-side buffer.
 226  * It is currently a caller's responsibility to call it only on not-yet allocated buffers.
 227  *
 228  * \tparam        ValueType            Raw value type of the \p buffer.
 229  * \param[in,out] buffer               Pointer to the device-side buffer.
 230  * \param[in]     numValues            Number of values to accommodate.
 231  * \param[in]     deviceContext        The buffer's device context-to-be.
 232  */
 233 template<typename ValueType>
 234 void allocateDeviceBuffer(DeviceBuffer<ValueType>* buffer, size_t numValues, const DeviceContext& deviceContext)
 235 {
 236     /* SYCL does not require binding buffer to a specific context or device. The ::context_bound
 237      * property only enforces the use of only given context, and possibly offers some optimizations */
 238     const cl::sycl::property_list bufferProperties{ cl::sycl::property::buffer::context_bound(
 239             deviceContext.context()) };
 240     buffer->buffer_.reset(
 241             new ClSyclBufferWrapper<ValueType>(cl::sycl::range<1>(numValues), bufferProperties));
 242 }
 243
 244 /*! \brief
 245  * Frees a device-side buffer.
 246  * This does not reset separately stored size/capacity integers,
 247  * as this is planned to be a destructor of DeviceBuffer as a proper class,
 248  * and no calls on \p buffer should be made afterwards.
 249  *
 250  * \param[in] buffer  Pointer to the buffer to free.
 251  */
 252 template<typename ValueType>
 253 void freeDeviceBuffer(DeviceBuffer<ValueType>* buffer)
 254 {
 255     buffer->buffer_.reset(nullptr);
 256 }
 257
 258 /*! \brief
 259  * Performs the host-to-device data copy, synchronous or asynchronously on request.
 260  *
 261  * Unlike in CUDA and OpenCL, synchronous call does not guarantee that all previously
 262  * submitted operations are complete, only the ones that are required for \p buffer consistency.
 263  *
 264  * \tparam        ValueType            Raw value type of the \p buffer.
 265  * \param[in,out] buffer               Pointer to the device-side buffer.
 266  * \param[in]     hostBuffer           Pointer to the raw host-side memory, also typed \p ValueType.
 267  * \param[in]     startingOffset       Offset (in values) at the device-side buffer to copy into.
 268  * \param[in]     numValues            Number of values to copy.
 269  * \param[in]     deviceStream         GPU stream to perform asynchronous copy in.
 270  * \param[in]     transferKind         Copy type: synchronous or asynchronous.
 271  * \param[out]    timingEvent          A pointer to the H2D copy timing event to be filled in.
 272  *                                     Ignored in SYCL.
 273  */
 274 template<typename ValueType>
 275 void copyToDeviceBuffer(DeviceBuffer<ValueType>* buffer,
 276                         const ValueType*         hostBuffer,
 277                         size_t                   startingOffset,
 278                         size_t                   numValues,
 279                         const DeviceStream&      deviceStream,
 280                         GpuApiCallBehavior       transferKind,
 281                         CommandEvent* gmx_unused timingEvent)
 282 {
 283     if (numValues == 0)
 284     {
 285         return; // such calls are actually made with empty domains
 286     }
 287     GMX_ASSERT(buffer, "needs a buffer pointer");
 288     GMX_ASSERT(hostBuffer, "needs a host buffer pointer");
 289
 290     GMX_ASSERT(checkDeviceBuffer(*buffer, startingOffset + numValues),
 291                "buffer too small or not initialized");
 292
 293     cl::sycl::buffer<ValueType>& syclBuffer = *buffer->buffer_;
 294
 295     cl::sycl::event ev = deviceStream.stream().submit([&](cl::sycl::handler& cgh) {
 296         /* Here and elsewhere in this file, accessor constructor is user instead of a more common
 297          * buffer::get_access, since the compiler (icpx 2021.1-beta09) occasionally gets confused
 298          * by all the overloads */
 299         auto d_bufferAccessor = cl::sycl::accessor<ValueType, 1, cl::sycl::access::mode::discard_write>{
 300             syclBuffer, cgh, cl::sycl::range(numValues), cl::sycl::id(startingOffset)
 301         };
 302         cgh.copy(hostBuffer, d_bufferAccessor);
 303     });
 304     if (transferKind == GpuApiCallBehavior::Sync)
 305     {
 306         ev.wait_and_throw();
 307     }
 308 }
 309
 310 /*! \brief
 311  * Performs the device-to-host data copy, synchronous or asynchronously on request.
 312  *
 313  * Unlike in CUDA and OpenCL, synchronous call does not guarantee that all previously
 314  * submitted operations are complete, only the ones that are required for \p buffer consistency.
 315  *
 316  * \tparam        ValueType            Raw value type of the \p buffer.
 317  * \param[in,out] hostBuffer           Pointer to the raw host-side memory, also typed \p ValueType
 318  * \param[in]     buffer               Pointer to the device-side buffer.
 319  * \param[in]     startingOffset       Offset (in values) at the device-side buffer to copy from.
 320  * \param[in]     numValues            Number of values to copy.
 321  * \param[in]     deviceStream         GPU stream to perform asynchronous copy in.
 322  * \param[in]     transferKind         Copy type: synchronous or asynchronous.
 323  * \param[out]    timingEvent          A pointer to the H2D copy timing event to be filled in.
 324  *                                     Ignored in SYCL.
 325  */
 326 template<typename ValueType>
 327 void copyFromDeviceBuffer(ValueType*               hostBuffer,
 328                           DeviceBuffer<ValueType>* buffer,
 329                           size_t                   startingOffset,
 330                           size_t                   numValues,
 331                           const DeviceStream&      deviceStream,
 332                           GpuApiCallBehavior       transferKind,
 333                           CommandEvent* gmx_unused timingEvent)
 334 {
 335     if (numValues == 0)
 336     {
 337         return; // such calls are actually made with empty domains
 338     }
 339     GMX_ASSERT(buffer, "needs a buffer pointer");
 340     GMX_ASSERT(hostBuffer, "needs a host buffer pointer");
 341
 342     GMX_ASSERT(checkDeviceBuffer(*buffer, startingOffset + numValues),
 343                "buffer too small or not initialized");
 344
 345     cl::sycl::buffer<ValueType>& syclBuffer = *buffer->buffer_;
 346
 347     cl::sycl::event ev = deviceStream.stream().submit([&](cl::sycl::handler& cgh) {
 348         const auto d_bufferAccessor = cl::sycl::accessor<ValueType, 1, cl::sycl::access::mode::read>{
 349             syclBuffer, cgh, cl::sycl::range(numValues), cl::sycl::id(startingOffset)
 350         };
 351         cgh.copy(d_bufferAccessor, hostBuffer);
 352     });
 353     if (transferKind == GpuApiCallBehavior::Sync)
 354     {
 355         ev.wait_and_throw();
 356     }
 357 }
 358
 359 /*! \brief
 360  * Performs the device-to-device data copy, synchronous or asynchronously on request.
 361  *
 362  * \tparam        ValueType                Raw value type of the \p buffer.
 363  */
 364 template<typename ValueType>
 365 void copyBetweenDeviceBuffers(DeviceBuffer<ValueType>* /* destinationDeviceBuffer */,
 366                               DeviceBuffer<ValueType>* /* sourceDeviceBuffer */,
 367                               size_t /* numValues */,
 368                               const DeviceStream& /* deviceStream */,
 369                               GpuApiCallBehavior /* transferKind */,
 370                               CommandEvent* /*timingEvent*/)
 371 {
 372     // SYCL-TODO
 373     gmx_fatal(FARGS, "D2D copy stub was called. Not yet implemented in SYCL.");
 374 }
 375
 376
 377 namespace gmx::internal
 378 {
 379 /*! \brief Helper function to clear device buffer.
 380  *
 381  * Not applicable to GROMACS's float3 (a.k.a. gmx::RVec) and other custom types.
 382  * From SYCL specs: "T must be a scalar value or a SYCL vector type."
 383  */
 384 template<typename ValueType>
 385 cl::sycl::event fillSyclBufferWithNull(cl::sycl::buffer<ValueType, 1>& buffer,
 386                                        size_t                          startingOffset,
 387                                        size_t                          numValues,
 388                                        cl::sycl::queue                 queue)
 389 {
 390     using cl::sycl::access::mode;
 391     const cl::sycl::range<1> range(numValues);
 392     const cl::sycl::id<1>    offset(startingOffset);
 393     const ValueType pattern = ValueType(0); // SYCL vectors support initialization by scalar
 394
 395     return queue.submit([&](cl::sycl::handler& cgh) {
 396         auto d_bufferAccessor =
 397                 cl::sycl::accessor<ValueType, 1, mode::discard_write>{ buffer, cgh, range, offset };
 398         cgh.fill(d_bufferAccessor, pattern);
 399     });
 400 }
 401
 402 //! \brief Helper function to clear device buffer of type float3.
 403 template<>
 404 inline cl::sycl::event fillSyclBufferWithNull(cl::sycl::buffer<Float3, 1>& buffer,
 405                                               size_t                       startingOffset,
 406                                               size_t                       numValues,
 407                                               cl::sycl::queue              queue)
 408 {
 409     cl::sycl::buffer<float, 1> bufferAsFloat = buffer.reinterpret<float, 1>(buffer.get_count() * DIM);
 410     return fillSyclBufferWithNull<float>(
 411             bufferAsFloat, startingOffset * DIM, numValues * DIM, std::move(queue));
 412 }
 413 } // namespace gmx::internal
 414
 415 /*! \brief
 416  * Clears the device buffer asynchronously.
 417  *
 418  * \tparam        ValueType       Raw value type of the \p buffer.
 419  * \param[in,out] buffer          Pointer to the device-side buffer.
 420  * \param[in]     startingOffset  Offset (in values) at the device-side buffer to start clearing at.
 421  * \param[in]     numValues       Number of values to clear.
 422  * \param[in]     deviceStream    GPU stream.
 423  */
 424 template<typename ValueType>
 425 void clearDeviceBufferAsync(DeviceBuffer<ValueType>* buffer,
 426                             size_t                   startingOffset,
 427                             size_t                   numValues,
 428                             const DeviceStream&      deviceStream)
 429 {
 430     if (numValues == 0)
 431     {
 432         return;
 433     }
 434     GMX_ASSERT(buffer, "needs a buffer pointer");
 435
 436     GMX_ASSERT(checkDeviceBuffer(*buffer, startingOffset + numValues),
 437                "buffer too small or not initialized");
 438
 439     cl::sycl::buffer<ValueType>& syclBuffer = *(buffer->buffer_);
 440
 441     gmx::internal::fillSyclBufferWithNull<ValueType>(
 442             syclBuffer, startingOffset, numValues, deviceStream.stream());
 443 }
 444
 445 /*! \brief Create a texture object for an array of type ValueType.
 446  *
 447  * Creates the device buffer and copies read-only data for an array of type ValueType.
 448  * Like OpenCL, does not really do anything with textures, simply creates a buffer
 449  * and initializes it.
 450  *
 451  * \tparam      ValueType      Raw data type.
 452  *
 453  * \param[out]  deviceBuffer   Device buffer to store data in.
 454  * \param[in]   hostBuffer     Host buffer to get date from.
 455  * \param[in]   numValues      Number of elements in the buffer.
 456  * \param[in]   deviceContext  GPU device context.
 457  */
 458 template<typename ValueType>
 459 void initParamLookupTable(DeviceBuffer<ValueType>* deviceBuffer,
 460                           DeviceTexture* /* deviceTexture */,
 461                           const ValueType*     hostBuffer,
 462                           int                  numValues,
 463                           const DeviceContext& deviceContext)
 464 {
 465     GMX_ASSERT(hostBuffer, "Host buffer should be specified.");
 466     GMX_ASSERT(deviceBuffer, "Device buffer should be specified.");
 467
 468     /* Constructing buffer with cl::sycl::buffer(T* data, size_t size) will take ownership
 469      * of this memory region making it unusable, which might lead to side-effects.
 470      * On the other hand, cl::sycl::buffer(InputIterator<T> begin, InputIterator<T> end) will
 471      * initialize the buffer without affecting ownership of the memory, although
 472      * it will consume extra memory on host. */
 473     const cl::sycl::property_list bufferProperties{ cl::sycl::property::buffer::context_bound(
 474             deviceContext.context()) };
 475     deviceBuffer->buffer_.reset(new ClSyclBufferWrapper<ValueType>(
 476             hostBuffer, hostBuffer + numValues, bufferProperties));
 477 }
 478
 479 /*! \brief Release the OpenCL device buffer.
 480  *
 481  * \tparam        ValueType     Raw data type.
 482  *
 483  * \param[in,out] deviceBuffer  Device buffer to store data in.
 484  */
 485 template<typename ValueType>
 486 void destroyParamLookupTable(DeviceBuffer<ValueType>* deviceBuffer, DeviceTexture& /* deviceTexture */)
 487 {
 488     deviceBuffer->buffer_.reset(nullptr);
 489 }
 490
 491 #endif // GMX_GPU_UTILS_DEVICEBUFFER_SYCL_H