src/gromacs/gpu_utils/devicebuffer.cuh

   1 /*
   2  * This file is part of the GROMACS molecular simulation package.
   3  *
   4  * Copyright (c) 2018,2019, by the GROMACS development team, led by
   5  * Mark Abraham, David van der Spoel, Berk Hess, and Erik Lindahl,
   6  * and including many others, as listed in the AUTHORS file in the
   7  * top-level source directory and at http://www.gromacs.org.
   8  *
   9  * GROMACS is free software; you can redistribute it and/or
  10  * modify it under the terms of the GNU Lesser General Public License
  11  * as published by the Free Software Foundation; either version 2.1
  12  * of the License, or (at your option) any later version.
  13  *
  14  * GROMACS is distributed in the hope that it will be useful,
  15  * but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
  16  * MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the GNU
  17  * Lesser General Public License for more details.
  18  *
  19  * You should have received a copy of the GNU Lesser General Public
  20  * License along with GROMACS; if not, see
  21  * http://www.gnu.org/licenses, or write to the Free Software Foundation,
  22  * Inc., 51 Franklin Street, Fifth Floor, Boston, MA  02110-1301  USA.
  23  *
  24  * If you want to redistribute modifications to GROMACS, please
  25  * consider that scientific software is very special. Version
  26  * control is crucial - bugs must be traceable. We will be happy to
  27  * consider code for inclusion in the official distribution, but
  28  * derived work must not be called official GROMACS. Details are found
  29  * in the README & COPYING files - if they are missing, get the
  30  * official version at http://www.gromacs.org.
  31  *
  32  * To help us fund GROMACS development, we humbly ask that you cite
  33  * the research papers on the package. Check out http://www.gromacs.org.
  34  */
  35 #ifndef GMX_GPU_UTILS_DEVICEBUFFER_CUH
  36 #define GMX_GPU_UTILS_DEVICEBUFFER_CUH
  37
  38 /*! \libinternal \file
  39  *  \brief Implements the DeviceBuffer type and routines for CUDA.
  40  *  Should only be included directly by the main DeviceBuffer file devicebuffer.h.
  41  *  TODO: the intent is for DeviceBuffer to become a class.
  42  *
  43  *  \author Aleksei Iupinov <a.yupinov@gmail.com>
  44  *
  45  *  \inlibraryapi
  46  */
  47
  48 #include "gromacs/gpu_utils/devicebuffer_datatype.h"
  49 #include "gromacs/gpu_utils/gpu_utils.h" //only for GpuApiCallBehavior
  50 #include "gromacs/gpu_utils/gputraits.cuh"
  51 #include "gromacs/utility/gmxassert.h"
  52
  53 /*! \brief
  54  * Allocates a device-side buffer.
  55  * It is currently a caller's responsibility to call it only on not-yet allocated buffers.
  56  *
  57  * \tparam        ValueType            Raw value type of the \p buffer.
  58  * \param[in,out] buffer               Pointer to the device-side buffer.
  59  * \param[in]     numValues            Number of values to accomodate.
  60  * \param[in]     context              The buffer's dummy context - not managed explicitly in CUDA RT.
  61  */
  62 template <typename ValueType>
  63 void allocateDeviceBuffer(DeviceBuffer<ValueType> *buffer,
  64                           size_t                   numValues,
  65                           Context                  /* context */)
  66 {
  67     GMX_ASSERT(buffer, "needs a buffer pointer");
  68     cudaError_t stat = cudaMalloc((void **)buffer, numValues * sizeof(ValueType));
  69     GMX_RELEASE_ASSERT(stat == cudaSuccess, "cudaMalloc failure");
  70 }
  71
  72 /*! \brief
  73  * Frees a device-side buffer.
  74  * This does not reset separately stored size/capacity integers,
  75  * as this is planned to be a destructor of DeviceBuffer as a proper class,
  76  * and no calls on \p buffer should be made afterwards.
  77  *
  78  * \param[in] buffer  Pointer to the buffer to free.
  79  */
  80 template <typename DeviceBuffer>
  81 void freeDeviceBuffer(DeviceBuffer *buffer)
  82 {
  83     GMX_ASSERT(buffer, "needs a buffer pointer");
  84     if (*buffer)
  85     {
  86         GMX_RELEASE_ASSERT(cudaFree(*buffer) == cudaSuccess, "cudaFree failed");
  87     }
  88 }
  89
  90 /*! \brief
  91  * Performs the host-to-device data copy, synchronous or asynchronously on request.
  92  *
  93  * TODO: This is meant to gradually replace cu/ocl_copy_h2d.
  94  *
  95  * \tparam        ValueType            Raw value type of the \p buffer.
  96  * \param[in,out] buffer               Pointer to the device-side buffer
  97  * \param[in]     hostBuffer           Pointer to the raw host-side memory, also typed \p ValueType
  98  * \param[in]     startingOffset       Offset (in values) at the device-side buffer to copy into.
  99  * \param[in]     numValues            Number of values to copy.
 100  * \param[in]     stream               GPU stream to perform asynchronous copy in.
 101  * \param[in]     transferKind         Copy type: synchronous or asynchronous.
 102  * \param[out]    timingEvent          A dummy pointer to the H2D copy timing event to be filled in.
 103  *                                     Not used in CUDA implementation.
 104  */
 105 template <typename ValueType>
 106 void copyToDeviceBuffer(DeviceBuffer<ValueType> *buffer,
 107                         const ValueType         *hostBuffer,
 108                         size_t                   startingOffset,
 109                         size_t                   numValues,
 110                         CommandStream            stream,
 111                         GpuApiCallBehavior       transferKind,
 112                         CommandEvent             */*timingEvent*/)
 113 {
 114     if (numValues == 0)
 115     {
 116         return; // such calls are actually made with empty domains
 117     }
 118     GMX_ASSERT(buffer, "needs a buffer pointer");
 119     GMX_ASSERT(hostBuffer, "needs a host buffer pointer");
 120     cudaError_t  stat;
 121     const size_t bytes = numValues * sizeof(ValueType);
 122
 123     switch (transferKind)
 124     {
 125         case GpuApiCallBehavior::Async:
 126             GMX_ASSERT(isHostMemoryPinned(hostBuffer), "Source host buffer was not pinned for CUDA");
 127             stat = cudaMemcpyAsync(*((ValueType **)buffer) + startingOffset, hostBuffer, bytes, cudaMemcpyHostToDevice, stream);
 128             GMX_RELEASE_ASSERT(stat == cudaSuccess, "Asynchronous H2D copy failed");
 129             break;
 130
 131         case GpuApiCallBehavior::Sync:
 132             stat = cudaMemcpy(*((ValueType **)buffer) + startingOffset, hostBuffer, bytes, cudaMemcpyHostToDevice);
 133             GMX_RELEASE_ASSERT(stat == cudaSuccess, "Synchronous H2D copy failed");
 134             break;
 135
 136         default:
 137             throw;
 138     }
 139 }
 140
 141
 142 /*! \brief
 143  * Performs the device-to-host data copy, synchronous or asynchronously on request.
 144  *
 145  * TODO: This is meant to gradually replace cu/ocl_copy_d2h.
 146  *
 147  * \tparam        ValueType            Raw value type of the \p buffer.
 148  * \param[in,out] hostBuffer           Pointer to the raw host-side memory, also typed \p ValueType
 149  * \param[in]     buffer               Pointer to the device-side buffer
 150  * \param[in]     startingOffset       Offset (in values) at the device-side buffer to copy from.
 151  * \param[in]     numValues            Number of values to copy.
 152  * \param[in]     stream               GPU stream to perform asynchronous copy in.
 153  * \param[in]     transferKind         Copy type: synchronous or asynchronous.
 154  * \param[out]    timingEvent          A dummy pointer to the H2D copy timing event to be filled in.
 155  *                                     Not used in CUDA implementation.
 156  */
 157 template <typename ValueType>
 158 void copyFromDeviceBuffer(ValueType                     *hostBuffer,
 159                           DeviceBuffer<ValueType>       *buffer,
 160                           size_t                         startingOffset,
 161                           size_t                         numValues,
 162                           CommandStream                  stream,
 163                           GpuApiCallBehavior             transferKind,
 164                           CommandEvent                   */*timingEvent*/)
 165 {
 166     GMX_ASSERT(buffer, "needs a buffer pointer");
 167     GMX_ASSERT(hostBuffer, "needs a host buffer pointer");
 168
 169     cudaError_t  stat;
 170     const size_t bytes = numValues * sizeof(ValueType);
 171     switch (transferKind)
 172     {
 173         case GpuApiCallBehavior::Async:
 174             GMX_ASSERT(isHostMemoryPinned(hostBuffer), "Destination host buffer was not pinned for CUDA");
 175             stat = cudaMemcpyAsync(hostBuffer, *((ValueType **)buffer) + startingOffset, bytes, cudaMemcpyDeviceToHost, stream);
 176             GMX_RELEASE_ASSERT(stat == cudaSuccess, "Asynchronous D2H copy failed");
 177             break;
 178
 179         case GpuApiCallBehavior::Sync:
 180             stat = cudaMemcpy(hostBuffer, *((ValueType **)buffer) + startingOffset, bytes, cudaMemcpyDeviceToHost);
 181             GMX_RELEASE_ASSERT(stat == cudaSuccess, "Synchronous D2H copy failed");
 182             break;
 183
 184         default:
 185             throw;
 186     }
 187 }
 188
 189 /*! \brief
 190  * Clears the device buffer asynchronously.
 191  *
 192  * \tparam        ValueType        Raw value type of the \p buffer.
 193  * \param[in,out] buffer           Pointer to the device-side buffer
 194  * \param[in]     startingOffset   Offset (in values) at the device-side buffer to start clearing at.
 195  * \param[in]     numValues        Number of values to clear.
 196  * \param[in]     stream           GPU stream.
 197  */
 198 template <typename ValueType>
 199 void clearDeviceBufferAsync(DeviceBuffer<ValueType> *buffer,
 200                             size_t                   startingOffset,
 201                             size_t                   numValues,
 202                             CommandStream            stream)
 203 {
 204     GMX_ASSERT(buffer, "needs a buffer pointer");
 205     const size_t bytes   = numValues * sizeof(ValueType);
 206     const char   pattern = 0;
 207
 208     cudaError_t  stat = cudaMemsetAsync(*((ValueType **)buffer) + startingOffset, pattern, bytes, stream);
 209     GMX_RELEASE_ASSERT(stat == cudaSuccess, "Couldn't clear the device buffer");
 210 }
 211
 212 #endif