Remove utility -> fileio dependencies
[alexxy/gromacs.git] / src / gromacs / gmxpreprocess / tests / insert-molecules.cpp
1 /*
2  * This file is part of the GROMACS molecular simulation package.
3  *
4  * Copyright (c) 2013,2014, by the GROMACS development team, led by
5  * Mark Abraham, David van der Spoel, Berk Hess, and Erik Lindahl,
6  * and including many others, as listed in the AUTHORS file in the
7  * top-level source directory and at http://www.gromacs.org.
8  *
9  * GROMACS is free software; you can redistribute it and/or
10  * modify it under the terms of the GNU Lesser General Public License
11  * as published by the Free Software Foundation; either version 2.1
12  * of the License, or (at your option) any later version.
13  *
14  * GROMACS is distributed in the hope that it will be useful,
15  * but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
16  * MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the GNU
17  * Lesser General Public License for more details.
18  *
19  * You should have received a copy of the GNU Lesser General Public
20  * License along with GROMACS; if not, see
21  * http://www.gnu.org/licenses, or write to the Free Software Foundation,
22  * Inc., 51 Franklin Street, Fifth Floor, Boston, MA  02110-1301  USA.
23  *
24  * If you want to redistribute modifications to GROMACS, please
25  * consider that scientific software is very special. Version
26  * control is crucial - bugs must be traceable. We will be happy to
27  * consider code for inclusion in the official distribution, but
28  * derived work must not be called official GROMACS. Details are found
29  * in the README & COPYING files - if they are missing, get the
30  * official version at http://www.gromacs.org.
31  *
32  * To help us fund GROMACS development, we humbly ask that you cite
33  * the research papers on the package. Check out http://www.gromacs.org.
34  */
35 /*! \internal \file
36  * \brief
37  * Tests for insertion of molecules.
38  *
39  * \author Mark Abraham <mark.j.abraham@gmail.com>
40  */
41
42 #include "../insert-molecules.h"
43 #include "testutils/integrationtests.h"
44 #include "testutils/cmdlinetest.h"
45 #include "gromacs/utility/futil.h"
46
47 namespace
48 {
49
50 //! Helper typedef
51 typedef int (*CMainFunction)(int argc, char *argv[]);
52
53 //! Test fixture for insert-molecules
54 class InsertMoleculesTest : public gmx::test::IntegrationTestFixture
55 {
56     public:
57         //! Constructor
58         InsertMoleculesTest()
59             : ciFileName(fileManager_.getInputFilePath("x.gro")),
60               outputFileName(fileManager_.getTemporaryFilePath("out.gro")),
61               theFunction(gmx_insert_molecules)
62         {
63             caller.append("insert-molecules");
64             caller.addOption("-o", outputFileName);
65         }
66
67     public:
68         //! Name of file to use for -ci
69         std::string            ciFileName;
70         //! Name of output file to use for -o
71         std::string            outputFileName;
72         //! Helper object for managing the call to gmx_insert_molecules
73         gmx::test::CommandLine caller;
74         //! Points to the function to be tested
75         CMainFunction          theFunction;
76 };
77
78 TEST_F(InsertMoleculesTest, f_ci_Works)
79 {
80     caller.addOption("-f", fileManager_.getInputFilePath("spc-and-methanol.gro"));
81     caller.addOption("-nmol", "1");
82     caller.addOption("-ci", ciFileName);
83
84     ASSERT_EQ(0, theFunction(caller.argc(), caller.argv()));
85 }
86
87 TEST_F(InsertMoleculesTest, box_ci_Works)
88 {
89     caller.addOption("-box", "4");
90     caller.addOption("-nmol", "5");
91     caller.addOption("-ci", ciFileName);
92
93     ASSERT_EQ(0, theFunction(caller.argc(), caller.argv()));
94 }
95
96 TEST_F(InsertMoleculesTest, f_box_ci_Works)
97 {
98     caller.addOption("-f", fileManager_.getInputFilePath("spc-and-methanol.gro"));
99     caller.addOption("-box", "4");
100     caller.addOption("-nmol", "2");
101     caller.addOption("-ci", ciFileName);
102
103     ASSERT_EQ(0, theFunction(caller.argc(), caller.argv()));
104 }
105
106 // TODO Someone who knows what -ip is good for should write something
107 // to test it
108
109 } // namespace