src/gromacs/gmxpreprocess/tests/gpp_atomtype.cpp

   1 /*
   2  * This file is part of the GROMACS molecular simulation package.
   3  *
   4  * Copyright (c) 2019, by the GROMACS development team, led by
   5  * Mark Abraham, David van der Spoel, Berk Hess, and Erik Lindahl,
   6  * and including many others, as listed in the AUTHORS file in the
   7  * top-level source directory and at http://www.gromacs.org.
   8  *
   9  * GROMACS is free software; you can redistribute it and/or
  10  * modify it under the terms of the GNU Lesser General Public License
  11  * as published by the Free Software Foundation; either version 2.1
  12  * of the License, or (at your option) any later version.
  13  *
  14  * GROMACS is distributed in the hope that it will be useful,
  15  * but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
  16  * MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the GNU
  17  * Lesser General Public License for more details.
  18  *
  19  * You should have received a copy of the GNU Lesser General Public
  20  * License along with GROMACS; if not, see
  21  * http://www.gnu.org/licenses, or write to the Free Software Foundation,
  22  * Inc., 51 Franklin Street, Fifth Floor, Boston, MA  02110-1301  USA.
  23  *
  24  * If you want to redistribute modifications to GROMACS, please
  25  * consider that scientific software is very special. Version
  26  * control is crucial - bugs must be traceable. We will be happy to
  27  * consider code for inclusion in the official distribution, but
  28  * derived work must not be called official GROMACS. Details are found
  29  * in the README & COPYING files - if they are missing, get the
  30  * official version at http://www.gromacs.org.
  31  *
  32  * To help us fund GROMACS development, we humbly ask that you cite
  33  * the research papers on the package. Check out http://www.gromacs.org.
  34  */
  35 /*! \internal \file
  36  * \brief
  37  * Test routines that handle check handling of atom types during preprocessing.
  38  *
  39  * \author Paul Bauer <paul.bauer.q@gmail.com>
  40  */
  41 #include "gmxpre.h"
  42
  43 #include "gromacs/gmxpreprocess/gpp_atomtype.h"
  44
  45 #include <gtest/gtest.h>
  46
  47 #include "gromacs/gmxpreprocess/grompp_impl.h"
  48 #include "gromacs/gmxpreprocess/notset.h"
  49 #include "gromacs/topology/atoms.h"
  50 #include "gromacs/topology/symtab.h"
  51 #include "gromacs/utility/enumerationhelpers.h"
  52
  53 namespace gmx
  54 {
  55 namespace
  56 {
  57
  58 class PreprocessingAtomTypesTest : public ::testing::Test
  59 {
  60     public:
  61         PreprocessingAtomTypesTest() :
  62             nb_({}, {})
  63         {
  64             open_symtab(&symtab_);
  65         }
  66
  67         int addType(const char *name,
  68                     int         bondAtomType,
  69                     int         atomNumber)
  70         {
  71             return atypes_.addType(&symtab_,
  72                                    atom_,
  73                                    name,
  74                                    nb_,
  75                                    bondAtomType,
  76                                    atomNumber);
  77         }
  78
  79         ~PreprocessingAtomTypesTest() override
  80         {
  81             done_symtab(&symtab_);
  82         }
  83     protected:
  84         PreprocessingAtomTypes   atypes_;
  85         t_symtab                 symtab_;
  86         t_atom                   atom_;
  87         InteractionOfType        nb_;
  88 };
  89
  90 TEST_F(PreprocessingAtomTypesTest, EmptyOnCreate)
  91 {
  92     EXPECT_EQ(atypes_.size(), 0);
  93 }
  94
  95 TEST_F(PreprocessingAtomTypesTest, IndexOutOfRangeInvalid)
  96 {
  97     EXPECT_FALSE(atypes_.isSet(-1));
  98     EXPECT_FALSE(atypes_.isSet(0));
  99 }
 100
 101 TEST_F(PreprocessingAtomTypesTest, AddTypeWorks)
 102 {
 103     EXPECT_EQ(addType("Foo", 1, 2), 0);
 104     EXPECT_TRUE(atypes_.isSet(0));
 105     EXPECT_EQ(atypes_.size(), 1);
 106 }
 107
 108 TEST_F(PreprocessingAtomTypesTest, AddMultipleTypesWorks)
 109 {
 110     EXPECT_EQ(addType("Foo", 1, 2), 0);
 111     EXPECT_TRUE(atypes_.isSet(0));
 112     EXPECT_EQ(atypes_.size(), 1);
 113     EXPECT_EQ(addType("Bar", 3, 4), 1);
 114     EXPECT_TRUE(atypes_.isSet(1));
 115     EXPECT_EQ(atypes_.size(), 2);
 116 }
 117
 118 TEST_F(PreprocessingAtomTypesTest, CannotAddDuplicateEntry)
 119 {
 120     EXPECT_EQ(addType("Foo", 1, 2), 0);
 121     EXPECT_TRUE(atypes_.isSet(0));
 122     EXPECT_EQ(atypes_.size(), 1);
 123     EXPECT_EQ(addType("Bar", 3, 4), 1);
 124     EXPECT_TRUE(atypes_.isSet(1));
 125     EXPECT_EQ(atypes_.size(), 2);
 126     EXPECT_EQ(addType("Foo", 1, 2), 0);
 127     EXPECT_FALSE(atypes_.isSet(3));
 128     EXPECT_EQ(atypes_.size(), 2);
 129 }
 130
 131 TEST_F(PreprocessingAtomTypesTest, CorrectNameFound)
 132 {
 133     EXPECT_EQ(addType("Foo", 1, 2), 0);
 134     EXPECT_EQ(atypes_.atomTypeFromName("Foo"), 0);
 135 }
 136
 137 TEST_F(PreprocessingAtomTypesTest, WrongNameNotFound)
 138 {
 139     EXPECT_EQ(addType("Foo", 1, 2), 0);
 140     EXPECT_EQ(atypes_.atomTypeFromName("Bar"), NOTSET);
 141 }
 142
 143 TEST_F(PreprocessingAtomTypesTest, CorrectNameFromTypeNumber)
 144 {
 145     EXPECT_EQ(addType("Foo", 1, 2), 0);
 146     EXPECT_EQ(addType("Bar", 3, 4), 1);
 147     EXPECT_STREQ(atypes_.atomNameFromAtomType(0), "Foo");
 148     EXPECT_STREQ(atypes_.atomNameFromAtomType(1), "Bar");
 149 }
 150
 151 TEST_F(PreprocessingAtomTypesTest, NoNameFromIncorrectTypeNumber)
 152 {
 153     EXPECT_EQ(atypes_.atomNameFromAtomType(-1), nullptr);
 154 }
 155
 156 } // namespace
 157 } // namespace gmx