src/gromacs/gmxpreprocess/tests/gpp_atomtype.cpp

   1 /*
   2  * This file is part of the GROMACS molecular simulation package.
   3  *
   4  * Copyright (c) 2019, by the GROMACS development team, led by
   5  * Mark Abraham, David van der Spoel, Berk Hess, and Erik Lindahl,
   6  * and including many others, as listed in the AUTHORS file in the
   7  * top-level source directory and at http://www.gromacs.org.
   8  *
   9  * GROMACS is free software; you can redistribute it and/or
  10  * modify it under the terms of the GNU Lesser General Public License
  11  * as published by the Free Software Foundation; either version 2.1
  12  * of the License, or (at your option) any later version.
  13  *
  14  * GROMACS is distributed in the hope that it will be useful,
  15  * but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
  16  * MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the GNU
  17  * Lesser General Public License for more details.
  18  *
  19  * You should have received a copy of the GNU Lesser General Public
  20  * License along with GROMACS; if not, see
  21  * http://www.gnu.org/licenses, or write to the Free Software Foundation,
  22  * Inc., 51 Franklin Street, Fifth Floor, Boston, MA  02110-1301  USA.
  23  *
  24  * If you want to redistribute modifications to GROMACS, please
  25  * consider that scientific software is very special. Version
  26  * control is crucial - bugs must be traceable. We will be happy to
  27  * consider code for inclusion in the official distribution, but
  28  * derived work must not be called official GROMACS. Details are found
  29  * in the README & COPYING files - if they are missing, get the
  30  * official version at http://www.gromacs.org.
  31  *
  32  * To help us fund GROMACS development, we humbly ask that you cite
  33  * the research papers on the package. Check out http://www.gromacs.org.
  34  */
  35 /*! \internal \file
  36  * \brief
  37  * Test routines that handle check handling of atom types during preprocessing.
  38  *
  39  * \author Paul Bauer <paul.bauer.q@gmail.com>
  40  */
  41 #include "gmxpre.h"
  42
  43 #include "gromacs/gmxpreprocess/gpp_atomtype.h"
  44
  45 #include <gtest/gtest.h>
  46
  47 #include "gromacs/gmxpreprocess/grompp_impl.h"
  48 #include "gromacs/gmxpreprocess/notset.h"
  49 #include "gromacs/topology/atoms.h"
  50 #include "gromacs/topology/symtab.h"
  51 #include "gromacs/utility/enumerationhelpers.h"
  52
  53 namespace gmx
  54 {
  55 namespace
  56 {
  57
  58 class PreprocessingAtomTypesTest : public ::testing::Test
  59 {
  60 public:
  61     PreprocessingAtomTypesTest() : nb_({}, {}) { open_symtab(&symtab_); }
  62
  63     int addType(const char* name, int bondAtomType, int atomNumber)
  64     {
  65         return atypes_.addType(&symtab_, atom_, name, nb_, bondAtomType, atomNumber);
  66     }
  67
  68     ~PreprocessingAtomTypesTest() override { done_symtab(&symtab_); }
  69
  70 protected:
  71     PreprocessingAtomTypes atypes_;
  72     t_symtab               symtab_;
  73     t_atom                 atom_;
  74     InteractionOfType      nb_;
  75 };
  76
  77 TEST_F(PreprocessingAtomTypesTest, EmptyOnCreate)
  78 {
  79     EXPECT_EQ(atypes_.size(), 0);
  80 }
  81
  82 TEST_F(PreprocessingAtomTypesTest, IndexOutOfRangeInvalid)
  83 {
  84     EXPECT_FALSE(atypes_.isSet(-1));
  85     EXPECT_FALSE(atypes_.isSet(0));
  86 }
  87
  88 TEST_F(PreprocessingAtomTypesTest, AddTypeWorks)
  89 {
  90     EXPECT_EQ(addType("Foo", 1, 2), 0);
  91     EXPECT_TRUE(atypes_.isSet(0));
  92     EXPECT_EQ(atypes_.size(), 1);
  93 }
  94
  95 TEST_F(PreprocessingAtomTypesTest, AddMultipleTypesWorks)
  96 {
  97     EXPECT_EQ(addType("Foo", 1, 2), 0);
  98     EXPECT_TRUE(atypes_.isSet(0));
  99     EXPECT_EQ(atypes_.size(), 1);
 100     EXPECT_EQ(addType("Bar", 3, 4), 1);
 101     EXPECT_TRUE(atypes_.isSet(1));
 102     EXPECT_EQ(atypes_.size(), 2);
 103 }
 104
 105 TEST_F(PreprocessingAtomTypesTest, CannotAddDuplicateEntry)
 106 {
 107     EXPECT_EQ(addType("Foo", 1, 2), 0);
 108     EXPECT_TRUE(atypes_.isSet(0));
 109     EXPECT_EQ(atypes_.size(), 1);
 110     EXPECT_EQ(addType("Bar", 3, 4), 1);
 111     EXPECT_TRUE(atypes_.isSet(1));
 112     EXPECT_EQ(atypes_.size(), 2);
 113     EXPECT_EQ(addType("Foo", 1, 2), 0);
 114     EXPECT_FALSE(atypes_.isSet(3));
 115     EXPECT_EQ(atypes_.size(), 2);
 116 }
 117
 118 TEST_F(PreprocessingAtomTypesTest, CorrectNameFound)
 119 {
 120     EXPECT_EQ(addType("Foo", 1, 2), 0);
 121     EXPECT_EQ(atypes_.atomTypeFromName("Foo"), 0);
 122 }
 123
 124 TEST_F(PreprocessingAtomTypesTest, WrongNameNotFound)
 125 {
 126     EXPECT_EQ(addType("Foo", 1, 2), 0);
 127     EXPECT_EQ(atypes_.atomTypeFromName("Bar"), NOTSET);
 128 }
 129
 130 TEST_F(PreprocessingAtomTypesTest, CorrectNameFromTypeNumber)
 131 {
 132     EXPECT_EQ(addType("Foo", 1, 2), 0);
 133     EXPECT_EQ(addType("Bar", 3, 4), 1);
 134     EXPECT_STREQ(atypes_.atomNameFromAtomType(0), "Foo");
 135     EXPECT_STREQ(atypes_.atomNameFromAtomType(1), "Bar");
 136 }
 137
 138 TEST_F(PreprocessingAtomTypesTest, NoNameFromIncorrectTypeNumber)
 139 {
 140     EXPECT_EQ(atypes_.atomNameFromAtomType(-1), nullptr);
 141 }
 142
 143 } // namespace
 144 } // namespace gmx