src/gromacs/gmxpreprocess/tests/genconf.cpp

   1 /*
   2  * This file is part of the GROMACS molecular simulation package.
   3  *
   4  * Copyright (c) 2015,2016,2018, by the GROMACS development team, led by
   5  * Mark Abraham, David van der Spoel, Berk Hess, and Erik Lindahl,
   6  * and including many others, as listed in the AUTHORS file in the
   7  * top-level source directory and at http://www.gromacs.org.
   8  *
   9  * GROMACS is free software; you can redistribute it and/or
  10  * modify it under the terms of the GNU Lesser General Public License
  11  * as published by the Free Software Foundation; either version 2.1
  12  * of the License, or (at your option) any later version.
  13  *
  14  * GROMACS is distributed in the hope that it will be useful,
  15  * but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
  16  * MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the GNU
  17  * Lesser General Public License for more details.
  18  *
  19  * You should have received a copy of the GNU Lesser General Public
  20  * License along with GROMACS; if not, see
  21  * http://www.gnu.org/licenses, or write to the Free Software Foundation,
  22  * Inc., 51 Franklin Street, Fifth Floor, Boston, MA  02110-1301  USA.
  23  *
  24  * If you want to redistribute modifications to GROMACS, please
  25  * consider that scientific software is very special. Version
  26  * control is crucial - bugs must be traceable. We will be happy to
  27  * consider code for inclusion in the official distribution, but
  28  * derived work must not be called official GROMACS. Details are found
  29  * in the README & COPYING files - if they are missing, get the
  30  * official version at http://www.gromacs.org.
  31  *
  32  * To help us fund GROMACS development, we humbly ask that you cite
  33  * the research papers on the package. Check out http://www.gromacs.org.
  34  */
  35 /*! \internal \file
  36  * \brief
  37  * Tests for genconf.
  38  *
  39  * \author Mark Abraham <mark.j.abraham@gmail.com>
  40  */
  41
  42 #include "gmxpre.h"
  43
  44 #include "gromacs/gmxpreprocess/genconf.h"
  45
  46 #include "testutils/cmdlinetest.h"
  47 #include "testutils/refdata.h"
  48 #include "testutils/testfilemanager.h"
  49 #include "testutils/textblockmatchers.h"
  50
  51 namespace
  52 {
  53
  54 using gmx::test::CommandLine;
  55 using gmx::test::ExactTextMatch;
  56
  57 class GenconfTest : public gmx::test::CommandLineTestBase
  58 {
  59     public:
  60         GenconfTest()
  61         {
  62             std::string confFileName = gmx::test::TestFileManager::getInputFilePath("spc-and-methanol.gro");
  63             commandLine().addOption("-f", confFileName);
  64             commandLine().addOption("-seed", "1993"); // make random operations reproducible
  65             setOutputFile("-o", "out.gro", ExactTextMatch());
  66         }
  67
  68         void runTest(const CommandLine &args)
  69         {
  70             CommandLine &cmdline = commandLine();
  71             cmdline.merge(args);
  72
  73             gmx::test::TestReferenceChecker rootChecker(this->rootChecker());
  74             rootChecker.checkString(args.toString(), "CommandLine");
  75
  76             ASSERT_EQ(0, gmx_genconf(cmdline.argc(), cmdline.argv()));
  77
  78             checkOutputFiles();
  79         }
  80 };
  81
  82 TEST_F(GenconfTest, nbox_Works)
  83 {
  84     const char *const cmdline[] = {
  85         "genconf", "-nbox", "2", "1", "1"
  86     };
  87     runTest(CommandLine(cmdline));
  88 }
  89
  90 TEST_F(GenconfTest, nbox_norenumber_Works)
  91 {
  92     const char *const cmdline[] = {
  93         "genconf", "-nbox", "2", "1", "1", "-norenumber"
  94     };
  95     runTest(CommandLine(cmdline));
  96 }
  97
  98 TEST_F(GenconfTest, nbox_dist_Works)
  99 {
 100     const char *const cmdline[] = {
 101         "genconf", "-nbox", "2", "2", "3", "-dist", "0.1"
 102     };
 103     runTest(CommandLine(cmdline));
 104 }
 105
 106 TEST_F(GenconfTest, nbox_rot_Works)
 107 {
 108     const char *const cmdline[] = {
 109         "genconf", "-nbox", "2", "2", "3", "-rot"
 110     };
 111     runTest(CommandLine(cmdline));
 112 }
 113
 114 } // namespace