src/gromacs/gmxpreprocess/gpp_bond_atomtype.c

   1 /*
   2  *
   3  *                This source code is part of
   4  *
   5  *                 G   R   O   M   A   C   S
   6  *
   7  *          GROningen MAchine for Chemical Simulations
   8  *
   9  *                        VERSION 3.2.0
  10  * Written by David van der Spoel, Erik Lindahl, Berk Hess, and others.
  11  * Copyright (c) 1991-2000, University of Groningen, The Netherlands.
  12  * Copyright (c) 2001-2004, The GROMACS development team,
  13  * check out http://www.gromacs.org for more information.
  14
  15  * This program is free software; you can redistribute it and/or
  16  * modify it under the terms of the GNU General Public License
  17  * as published by the Free Software Foundation; either version 2
  18  * of the License, or (at your option) any later version.
  19  *
  20  * If you want to redistribute modifications, please consider that
  21  * scientific software is very special. Version control is crucial -
  22  * bugs must be traceable. We will be happy to consider code for
  23  * inclusion in the official distribution, but derived work must not
  24  * be called official GROMACS. Details are found in the README & COPYING
  25  * files - if they are missing, get the official version at www.gromacs.org.
  26  *
  27  * To help us fund GROMACS development, we humbly ask that you cite
  28  * the papers on the package - you can find them in the top README file.
  29  *
  30  * For more info, check our website at http://www.gromacs.org
  31  *
  32  * And Hey:
  33  * Gallium Rubidium Oxygen Manganese Argon Carbon Silicon
  34  */
  35 #ifdef HAVE_CONFIG_H
  36 #include <config.h>
  37 #endif
  38
  39 #include "smalloc.h"
  40 #include "sysstuff.h"
  41 #include "macros.h"
  42 #include "symtab.h"
  43 #include "string2.h"
  44 #include "gpp_bond_atomtype.h"
  45
  46 typedef struct {
  47     int              nr;       /* The number of atomtypes               */
  48     char          ***atomname; /* Names of the atomtypes                */
  49 } gpp_bond_atomtype;
  50
  51 int get_bond_atomtype_type(char *str, t_bond_atomtype at)
  52 {
  53     gpp_bond_atomtype *ga = (gpp_bond_atomtype *) at;
  54
  55     int                i;
  56
  57     for (i = 0; (i < ga->nr); i++)
  58     {
  59         if (gmx_strcasecmp(str, *(ga->atomname[i])) == 0)
  60         {
  61             return i;
  62         }
  63     }
  64
  65     return NOTSET;
  66 }
  67
  68 char *get_bond_atomtype_name(int nt, t_bond_atomtype at)
  69 {
  70     gpp_bond_atomtype *ga = (gpp_bond_atomtype *) at;
  71
  72     if ((nt < 0) || (nt >= ga->nr))
  73     {
  74         return NULL;
  75     }
  76
  77     return *(ga->atomname[nt]);
  78 }
  79
  80 t_bond_atomtype init_bond_atomtype(void)
  81 {
  82     gpp_bond_atomtype *ga;
  83
  84     snew(ga, 1);
  85
  86     return (t_bond_atomtype ) ga;
  87 }
  88
  89 void add_bond_atomtype(t_bond_atomtype at, t_symtab *tab,
  90                        char *name)
  91 {
  92     gpp_bond_atomtype *ga = (gpp_bond_atomtype *) at;
  93
  94     ga->nr++;
  95     srenew(ga->atomname, ga->nr);
  96     ga->atomname[ga->nr-1] = put_symtab(tab, name);
  97 }
  98
  99 void done_bond_atomtype(t_bond_atomtype *at)
 100 {
 101     gpp_bond_atomtype *ga = (gpp_bond_atomtype *) *at;
 102
 103     sfree(ga->atomname);
 104     ga->nr = 0;
 105     sfree(ga);
 106
 107     *at = NULL;
 108 }