src/gromacs/gmxpreprocess/gpp_bond_atomtype.c

   1 /*
   2  *
   3  *                This source code is part of
   4  *
   5  *                 G   R   O   M   A   C   S
   6  *
   7  *          GROningen MAchine for Chemical Simulations
   8  *
   9  *                        VERSION 3.2.0
  10  * Written by David van der Spoel, Erik Lindahl, Berk Hess, and others.
  11  * Copyright (c) 1991-2000, University of Groningen, The Netherlands.
  12  * Copyright (c) 2001-2004, The GROMACS development team,
  13  * check out http://www.gromacs.org for more information.
  14
  15  * This program is free software; you can redistribute it and/or
  16  * modify it under the terms of the GNU General Public License
  17  * as published by the Free Software Foundation; either version 2
  18  * of the License, or (at your option) any later version.
  19  *
  20  * If you want to redistribute modifications, please consider that
  21  * scientific software is very special. Version control is crucial -
  22  * bugs must be traceable. We will be happy to consider code for
  23  * inclusion in the official distribution, but derived work must not
  24  * be called official GROMACS. Details are found in the README & COPYING
  25  * files - if they are missing, get the official version at www.gromacs.org.
  26  *
  27  * To help us fund GROMACS development, we humbly ask that you cite
  28  * the papers on the package - you can find them in the top README file.
  29  *
  30  * For more info, check our website at http://www.gromacs.org
  31  *
  32  * And Hey:
  33  * Gallium Rubidium Oxygen Manganese Argon Carbon Silicon
  34  */
  35 #ifdef HAVE_CONFIG_H
  36 #include <config.h>
  37 #endif
  38
  39 #include "smalloc.h"
  40 #include "sysstuff.h"
  41 #include "macros.h"
  42 #include "symtab.h"
  43 #include "string2.h"
  44 #include "gpp_bond_atomtype.h"
  45
  46 typedef struct {
  47   int           nr;             /* The number of atomtypes              */
  48   char          ***atomname;    /* Names of the atomtypes               */
  49 } gpp_bond_atomtype;
  50
  51 int get_bond_atomtype_type(char *str,t_bond_atomtype at)
  52 {
  53   gpp_bond_atomtype *ga = (gpp_bond_atomtype *) at;
  54
  55   int i;
  56
  57   for (i=0; (i<ga->nr); i++)
  58     if (gmx_strcasecmp(str,*(ga->atomname[i])) == 0)
  59       return i;
  60
  61   return NOTSET;
  62 }
  63
  64 char *get_bond_atomtype_name(int nt, t_bond_atomtype at)
  65 {
  66   gpp_bond_atomtype *ga = (gpp_bond_atomtype *) at;
  67
  68   if ((nt < 0) || (nt >= ga->nr))
  69     return NULL;
  70
  71   return *(ga->atomname[nt]);
  72 }
  73
  74 t_bond_atomtype init_bond_atomtype(void)
  75 {
  76   gpp_bond_atomtype *ga;
  77
  78   snew(ga,1);
  79
  80   return (t_bond_atomtype ) ga;
  81 }
  82
  83 void add_bond_atomtype(t_bond_atomtype at,t_symtab *tab,
  84                        char *name)
  85 {
  86   gpp_bond_atomtype *ga = (gpp_bond_atomtype *) at;
  87
  88   ga->nr++;
  89   srenew(ga->atomname,ga->nr);
  90   ga->atomname[ga->nr-1] = put_symtab(tab,name);
  91 }
  92
  93 void done_bond_atomtype(t_bond_atomtype *at)
  94 {
  95   gpp_bond_atomtype *ga = (gpp_bond_atomtype *) *at;
  96
  97   sfree(ga->atomname);
  98   ga->nr = 0;
  99   sfree(ga);
 100
 101   *at = NULL;
 102 }