Remove sysstuff.h
[alexxy/gromacs.git] / src / gromacs / gmxpreprocess / gpp_bond_atomtype.c
1 /*
2  * This file is part of the GROMACS molecular simulation package.
3  *
4  * Copyright (c) 1991-2000, University of Groningen, The Netherlands.
5  * Copyright (c) 2001-2004, The GROMACS development team.
6  * Copyright (c) 2011,2014, by the GROMACS development team, led by
7  * Mark Abraham, David van der Spoel, Berk Hess, and Erik Lindahl,
8  * and including many others, as listed in the AUTHORS file in the
9  * top-level source directory and at http://www.gromacs.org.
10  *
11  * GROMACS is free software; you can redistribute it and/or
12  * modify it under the terms of the GNU Lesser General Public License
13  * as published by the Free Software Foundation; either version 2.1
14  * of the License, or (at your option) any later version.
15  *
16  * GROMACS is distributed in the hope that it will be useful,
17  * but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
18  * MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the GNU
19  * Lesser General Public License for more details.
20  *
21  * You should have received a copy of the GNU Lesser General Public
22  * License along with GROMACS; if not, see
23  * http://www.gnu.org/licenses, or write to the Free Software Foundation,
24  * Inc., 51 Franklin Street, Fifth Floor, Boston, MA  02110-1301  USA.
25  *
26  * If you want to redistribute modifications to GROMACS, please
27  * consider that scientific software is very special. Version
28  * control is crucial - bugs must be traceable. We will be happy to
29  * consider code for inclusion in the official distribution, but
30  * derived work must not be called official GROMACS. Details are found
31  * in the README & COPYING files - if they are missing, get the
32  * official version at http://www.gromacs.org.
33  *
34  * To help us fund GROMACS development, we humbly ask that you cite
35  * the research papers on the package. Check out http://www.gromacs.org.
36  */
37 #ifdef HAVE_CONFIG_H
38 #include <config.h>
39 #endif
40
41 #include "gromacs/utility/smalloc.h"
42 #include "macros.h"
43 #include "symtab.h"
44 #include "gromacs/utility/cstringutil.h"
45 #include "gpp_bond_atomtype.h"
46
47 typedef struct {
48     int              nr;       /* The number of atomtypes               */
49     char          ***atomname; /* Names of the atomtypes                */
50 } gpp_bond_atomtype;
51
52 int get_bond_atomtype_type(char *str, t_bond_atomtype at)
53 {
54     gpp_bond_atomtype *ga = (gpp_bond_atomtype *) at;
55
56     int                i;
57
58     for (i = 0; (i < ga->nr); i++)
59     {
60         if (gmx_strcasecmp(str, *(ga->atomname[i])) == 0)
61         {
62             return i;
63         }
64     }
65
66     return NOTSET;
67 }
68
69 char *get_bond_atomtype_name(int nt, t_bond_atomtype at)
70 {
71     gpp_bond_atomtype *ga = (gpp_bond_atomtype *) at;
72
73     if ((nt < 0) || (nt >= ga->nr))
74     {
75         return NULL;
76     }
77
78     return *(ga->atomname[nt]);
79 }
80
81 t_bond_atomtype init_bond_atomtype(void)
82 {
83     gpp_bond_atomtype *ga;
84
85     snew(ga, 1);
86
87     return (t_bond_atomtype ) ga;
88 }
89
90 void add_bond_atomtype(t_bond_atomtype at, t_symtab *tab,
91                        char *name)
92 {
93     gpp_bond_atomtype *ga = (gpp_bond_atomtype *) at;
94
95     ga->nr++;
96     srenew(ga->atomname, ga->nr);
97     ga->atomname[ga->nr-1] = put_symtab(tab, name);
98 }
99
100 void done_bond_atomtype(t_bond_atomtype *at)
101 {
102     gpp_bond_atomtype *ga = (gpp_bond_atomtype *) *at;
103
104     sfree(ga->atomname);
105     ga->nr = 0;
106     sfree(ga);
107
108     *at = NULL;
109 }