src/gromacs/gmxpreprocess/calch.h

   1 /*
   2  * This file is part of the GROMACS molecular simulation package.
   3  *
   4  * Copyright (c) 1991-2000, University of Groningen, The Netherlands.
   5  * Copyright (c) 2001-2004, The GROMACS development team.
   6  * Copyright (c) 2010,2014, by the GROMACS development team, led by
   7  * Mark Abraham, David van der Spoel, Berk Hess, and Erik Lindahl,
   8  * and including many others, as listed in the AUTHORS file in the
   9  * top-level source directory and at http://www.gromacs.org.
  10  *
  11  * GROMACS is free software; you can redistribute it and/or
  12  * modify it under the terms of the GNU Lesser General Public License
  13  * as published by the Free Software Foundation; either version 2.1
  14  * of the License, or (at your option) any later version.
  15  *
  16  * GROMACS is distributed in the hope that it will be useful,
  17  * but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
  18  * MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the GNU
  19  * Lesser General Public License for more details.
  20  *
  21  * You should have received a copy of the GNU Lesser General Public
  22  * License along with GROMACS; if not, see
  23  * http://www.gnu.org/licenses, or write to the Free Software Foundation,
  24  * Inc., 51 Franklin Street, Fifth Floor, Boston, MA  02110-1301  USA.
  25  *
  26  * If you want to redistribute modifications to GROMACS, please
  27  * consider that scientific software is very special. Version
  28  * control is crucial - bugs must be traceable. We will be happy to
  29  * consider code for inclusion in the official distribution, but
  30  * derived work must not be called official GROMACS. Details are found
  31  * in the README & COPYING files - if they are missing, get the
  32  * official version at http://www.gromacs.org.
  33  *
  34  * To help us fund GROMACS development, we humbly ask that you cite
  35  * the research papers on the package. Check out http://www.gromacs.org.
  36  */
  37 #ifndef GMX_PREPROCESS_CALCH_H
  38 #define GMX_PREPROCESS_CALCH_H
  39
  40 #include "gromacs/legacyheaders/typedefs.h"
  41
  42 #ifdef __cplusplus
  43 extern "C" {
  44 #endif
  45
  46 void calc_h_pos(int nht, rvec xa[], rvec xh[], int *l);
  47 /*
  48  *    w.f. van gunsteren, groningen, july 1981
  49  *
  50  *    translated to c d. van der spoel groningen jun 1993
  51  *    added option 5 jan 95
  52  *
  53  *    subroutine genh (nht,nh,na,d,alfa,x)
  54  *
  55  *    genh generates cartesian coordinates for hydrogen atoms
  56  *    using the coordinates of neighbour atoms.
  57  *
  58  *    nht      : type of hydrogen attachment (see manual)
  59  *    xh(1.. ) : atomic positions of the hydrogen atoms that are to be
  60  *               generated
  61  *    xa(1..4) : atomic positions of the control atoms i, j and k and l
  62  *    default bond lengths and angles are defined internally
  63  *
  64  *    l : dynamically changed index
  65  */
  66
  67 #ifdef __cplusplus
  68 }
  69 #endif
  70
  71 #endif