src/gromacs/gmxpreprocess/add_par.h

   1 /*
   2  *
   3  *                This source code is part of
   4  *
   5  *                 G   R   O   M   A   C   S
   6  *
   7  *          GROningen MAchine for Chemical Simulations
   8  *
   9  *                        VERSION 3.2.0
  10  * Written by David van der Spoel, Erik Lindahl, Berk Hess, and others.
  11  * Copyright (c) 1991-2000, University of Groningen, The Netherlands.
  12  * Copyright (c) 2001-2004, The GROMACS development team,
  13  * check out http://www.gromacs.org for more information.
  14
  15  * This program is free software; you can redistribute it and/or
  16  * modify it under the terms of the GNU General Public License
  17  * as published by the Free Software Foundation; either version 2
  18  * of the License, or (at your option) any later version.
  19  *
  20  * If you want to redistribute modifications, please consider that
  21  * scientific software is very special. Version control is crucial -
  22  * bugs must be traceable. We will be happy to consider code for
  23  * inclusion in the official distribution, but derived work must not
  24  * be called official GROMACS. Details are found in the README & COPYING
  25  * files - if they are missing, get the official version at www.gromacs.org.
  26  *
  27  * To help us fund GROMACS development, we humbly ask that you cite
  28  * the papers on the package - you can find them in the top README file.
  29  *
  30  * For more info, check our website at http://www.gromacs.org
  31  *
  32  * And Hey:
  33  * Gallium Rubidium Oxygen Manganese Argon Carbon Silicon
  34  */
  35
  36 #ifndef _add_par_h
  37 #define _add_par_h
  38
  39 #include "typedefs.h"
  40 #include "pdb2top.h"
  41
  42 #ifdef __cplusplus
  43 extern "C"
  44 {
  45 #endif
  46
  47 extern void add_param(t_params *ps, int ai, int aj, real *c, char *s);
  48
  49 extern void add_imp_param(t_params *ps, int ai, int aj, int ak, int al,
  50                           real c0, real c1, char *s);
  51
  52 extern void add_dih_param(t_params *ps, int ai, int aj, int ak, int al,
  53                           real c0, real c1, real c2, char *s);
  54
  55 extern void add_cmap_param(t_params *ps, int ai, int aj, int ak, int al, int am,
  56                            char *s);
  57
  58 extern void add_vsite2_atoms(t_params *ps, int ai, int aj, int ak);
  59
  60 extern void add_vsite3_atoms(t_params *ps, int ai, int aj, int ak, int al,
  61                              gmx_bool bSwapParity);
  62
  63 extern void add_vsite2_param(t_params *ps, int ai, int aj, int ak, real c0);
  64
  65 extern void add_vsite3_param(t_params *ps, int ai, int aj, int ak, int al,
  66                              real c0, real c1);
  67
  68 extern void add_vsite4_atoms(t_params *ps, int ai, int aj, int ak, int al,
  69                              int am);
  70
  71 extern int search_jtype(t_restp *rp, char *name, gmx_bool bFirstRes);
  72
  73 #ifdef __cplusplus
  74 }
  75 #endif
  76
  77 #endif  /* _add_par_h */