src/gromacs/gmxlib/nonbonded/nonbonded.h

   1 /*
   2  * This file is part of the GROMACS molecular simulation package.
   3  *
   4  * Copyright (c) 1991-2000, University of Groningen, The Netherlands.
   5  * Copyright (c) 2001-2004, The GROMACS development team.
   6  * Copyright (c) 2013,2014,2015,2018, by the GROMACS development team, led by
   7  * Mark Abraham, David van der Spoel, Berk Hess, and Erik Lindahl,
   8  * and including many others, as listed in the AUTHORS file in the
   9  * top-level source directory and at http://www.gromacs.org.
  10  *
  11  * GROMACS is free software; you can redistribute it and/or
  12  * modify it under the terms of the GNU Lesser General Public License
  13  * as published by the Free Software Foundation; either version 2.1
  14  * of the License, or (at your option) any later version.
  15  *
  16  * GROMACS is distributed in the hope that it will be useful,
  17  * but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
  18  * MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the GNU
  19  * Lesser General Public License for more details.
  20  *
  21  * You should have received a copy of the GNU Lesser General Public
  22  * License along with GROMACS; if not, see
  23  * http://www.gnu.org/licenses, or write to the Free Software Foundation,
  24  * Inc., 51 Franklin Street, Fifth Floor, Boston, MA  02110-1301  USA.
  25  *
  26  * If you want to redistribute modifications to GROMACS, please
  27  * consider that scientific software is very special. Version
  28  * control is crucial - bugs must be traceable. We will be happy to
  29  * consider code for inclusion in the official distribution, but
  30  * derived work must not be called official GROMACS. Details are found
  31  * in the README & COPYING files - if they are missing, get the
  32  * official version at http://www.gromacs.org.
  33  *
  34  * To help us fund GROMACS development, we humbly ask that you cite
  35  * the research papers on the package. Check out http://www.gromacs.org.
  36  */
  37 #ifndef GMX_GMXLIB_NONBONDED_NONBONDED_H
  38 #define GMX_GMXLIB_NONBONDED_NONBONDED_H
  39
  40 #include <stdio.h>
  41
  42 #include "gromacs/gmxlib/nrnb.h"
  43 #include "gromacs/math/vectypes.h"
  44 #include "gromacs/mdtypes/mdatom.h"
  45 #include "gromacs/mdtypes/nblist.h"
  46 #include "gromacs/topology/block.h"
  47 #include "gromacs/utility/basedefinitions.h"
  48
  49 struct gmx_grppairener_t;
  50 struct t_forcerec;
  51
  52 void
  53 gmx_nonbonded_setup(t_forcerec *fr,
  54                     gmx_bool    bGenericKernelOnly);
  55
  56
  57
  58
  59
  60 void
  61 gmx_nonbonded_set_kernel_pointers(FILE *       fplog,
  62                                   t_nblist *   nl,
  63                                   gmx_bool     bElecAndVdwSwitchDiffers);
  64
  65
  66
  67 #define GMX_NONBONDED_DO_FORCE          (1<<1)
  68 #define GMX_NONBONDED_DO_SHIFTFORCE     (1<<2)
  69 #define GMX_NONBONDED_DO_FOREIGNLAMBDA  (1<<3)
  70 #define GMX_NONBONDED_DO_POTENTIAL      (1<<4)
  71 #define GMX_NONBONDED_DO_SR             (1<<5)
  72
  73 void
  74 do_nonbonded(const t_forcerec  *fr,
  75              rvec               x[],
  76              rvec               f_shortrange[],
  77              const t_mdatoms   *md,
  78              const t_blocka    *excl,
  79              gmx_grppairener_t *grppener,
  80              t_nrnb            *nrnb,
  81              real              *lambda,
  82              real               dvdlambda[],
  83              int                nls,
  84              int                eNL,
  85              int                flags);
  86
  87 #endif