src/gromacs/gmxana/gmx_ana.h

   1 /*
   2  * This file is part of the GROMACS molecular simulation package.
   3  *
   4  * Copyright (c) 1991-2000, University of Groningen, The Netherlands.
   5  * Copyright (c) 2001-2008, The GROMACS development team.
   6  * Copyright (c) 2013,2014,2015,2016,2017,2018,2019, by the GROMACS development team, led by
   7  * Mark Abraham, David van der Spoel, Berk Hess, and Erik Lindahl,
   8  * and including many others, as listed in the AUTHORS file in the
   9  * top-level source directory and at http://www.gromacs.org.
  10  *
  11  * GROMACS is free software; you can redistribute it and/or
  12  * modify it under the terms of the GNU Lesser General Public License
  13  * as published by the Free Software Foundation; either version 2.1
  14  * of the License, or (at your option) any later version.
  15  *
  16  * GROMACS is distributed in the hope that it will be useful,
  17  * but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
  18  * MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the GNU
  19  * Lesser General Public License for more details.
  20  *
  21  * You should have received a copy of the GNU Lesser General Public
  22  * License along with GROMACS; if not, see
  23  * http://www.gnu.org/licenses, or write to the Free Software Foundation,
  24  * Inc., 51 Franklin Street, Fifth Floor, Boston, MA  02110-1301  USA.
  25  *
  26  * If you want to redistribute modifications to GROMACS, please
  27  * consider that scientific software is very special. Version
  28  * control is crucial - bugs must be traceable. We will be happy to
  29  * consider code for inclusion in the official distribution, but
  30  * derived work must not be called official GROMACS. Details are found
  31  * in the README & COPYING files - if they are missing, get the
  32  * official version at http://www.gromacs.org.
  33  *
  34  * To help us fund GROMACS development, we humbly ask that you cite
  35  * the research papers on the package. Check out http://www.gromacs.org.
  36  */
  37
  38 #ifndef _gmx_ana_h
  39 #    define _gmx_ana_h
  40
  41 int gmx_analyze(int argc, char* argv[]);
  42
  43 int gmx_anaeig(int argc, char* argv[]);
  44
  45 int gmx_awh(int argc, char* argv[]);
  46
  47 int gmx_g_angle(int argc, char* argv[]);
  48
  49 int gmx_bar(int argc, char* argv[]);
  50
  51 int gmx_bundle(int argc, char* argv[]);
  52
  53 int gmx_chi(int argc, char* argv[]);
  54
  55 int gmx_cluster(int argc, char* argv[]);
  56
  57 int gmx_confrms(int argc, char* argv[]);
  58
  59 int gmx_covar(int argc, char* argv[]);
  60
  61 int gmx_current(int argc, char* argv[]);
  62
  63 int gmx_density(int argc, char* argv[]);
  64
  65 int gmx_densmap(int argc, char* argv[]);
  66
  67 int gmx_densorder(int argc, char* argv[]);
  68
  69 int gmx_dielectric(int argc, char* argv[]);
  70
  71 int gmx_dipoles(int argc, char* argv[]);
  72
  73 int gmx_disre(int argc, char* argv[]);
  74
  75 int gmx_do_dssp(int argc, char* argv[]);
  76
  77 int gmx_dos(int argc, char* argv[]);
  78
  79 int gmx_dyecoupl(int argc, char* argv[]);
  80
  81 int gmx_enemat(int argc, char* argv[]);
  82
  83 int gmx_energy(int argc, char* argv[]);
  84
  85 int gmx_lie(int argc, char* argv[]);
  86
  87 int gmx_filter(int argc, char* argv[]);
  88
  89 int gmx_gyrate(int argc, char* argv[]);
  90
  91 int gmx_h2order(int argc, char* argv[]);
  92
  93 int gmx_hbond(int argc, char* argv[]);
  94
  95 int gmx_helix(int argc, char* argv[]);
  96
  97 int gmx_helixorient(int argc, char* argv[]);
  98
  99 int gmx_hydorder(int argc, char* argv[]);
 100
 101 int gmx_make_edi(int argc, char* argv[]);
 102
 103 int gmx_mindist(int argc, char* argv[]);
 104
 105 int gmx_msd(int argc, char* argv[]);
 106
 107 int gmx_nmeig(int argc, char* argv[]);
 108
 109 int gmx_nmens(int argc, char* argv[]);
 110
 111 int gmx_nmr(int argc, char* argv[]);
 112
 113 int gmx_nmtraj(int argc, char* argv[]);
 114
 115 int gmx_order(int argc, char* argv[]);
 116
 117 int gmx_polystat(int argc, char* argv[]);
 118
 119 int gmx_potential(int argc, char* argv[]);
 120
 121 int gmx_principal(int argc, char* argv[]);
 122
 123 int gmx_rama(int argc, char* argv[]);
 124
 125 int gmx_rotmat(int argc, char* argv[]);
 126
 127 int gmx_rms(int argc, char* argv[]);
 128
 129 int gmx_rmsdist(int argc, char* argv[]);
 130
 131 int gmx_rmsf(int argc, char* argv[]);
 132
 133 int gmx_rotacf(int argc, char* argv[]);
 134
 135 int gmx_saltbr(int argc, char* argv[]);
 136
 137 int gmx_sham(int argc, char* argv[]);
 138
 139 int gmx_sigeps(int argc, char* argv[]);
 140
 141 int gmx_sorient(int argc, char* argv[]);
 142
 143 int gmx_spol(int argc, char* argv[]);
 144
 145 int gmx_spatial(int argc, char* argv[]);
 146
 147 int gmx_tcaf(int argc, char* argv[]);
 148
 149 int gmx_traj(int argc, char* argv[]);
 150
 151 int gmx_trjorder(int argc, char* argv[]);
 152
 153 int gmx_velacc(int argc, char* argv[]);
 154
 155 int gmx_clustsize(int argc, char* argv[]);
 156
 157 int gmx_mdmat(int argc, char* argv[]);
 158
 159 int gmx_vanhove(int argc, char* argv[]);
 160
 161 int gmx_wham(int argc, char* argv[]);
 162
 163 int gmx_wheel(int argc, char* argv[]);
 164
 165 int gmx_xpm2ps(int argc, char* argv[]);
 166
 167 int gmx_membed(int argc, char* argv[]);
 168
 169 int gmx_sans(int argc, char* argv[]);
 170
 171 int gmx_saxs(int argc, char* argv[]);
 172
 173 #endif
 174 /* _gmx_ana_h */