src/gromacs/fileio/xtcio.h

   1 /*
   2  * This file is part of the GROMACS molecular simulation package.
   3  *
   4  * Copyright (c) 1991-2000, University of Groningen, The Netherlands.
   5  * Copyright (c) 2001-2004, The GROMACS development team.
   6  * Copyright (c) 2013,2014,2015, by the GROMACS development team, led by
   7  * Mark Abraham, David van der Spoel, Berk Hess, and Erik Lindahl,
   8  * and including many others, as listed in the AUTHORS file in the
   9  * top-level source directory and at http://www.gromacs.org.
  10  *
  11  * GROMACS is free software; you can redistribute it and/or
  12  * modify it under the terms of the GNU Lesser General Public License
  13  * as published by the Free Software Foundation; either version 2.1
  14  * of the License, or (at your option) any later version.
  15  *
  16  * GROMACS is distributed in the hope that it will be useful,
  17  * but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
  18  * MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the GNU
  19  * Lesser General Public License for more details.
  20  *
  21  * You should have received a copy of the GNU Lesser General Public
  22  * License along with GROMACS; if not, see
  23  * http://www.gnu.org/licenses, or write to the Free Software Foundation,
  24  * Inc., 51 Franklin Street, Fifth Floor, Boston, MA  02110-1301  USA.
  25  *
  26  * If you want to redistribute modifications to GROMACS, please
  27  * consider that scientific software is very special. Version
  28  * control is crucial - bugs must be traceable. We will be happy to
  29  * consider code for inclusion in the official distribution, but
  30  * derived work must not be called official GROMACS. Details are found
  31  * in the README & COPYING files - if they are missing, get the
  32  * official version at http://www.gromacs.org.
  33  *
  34  * To help us fund GROMACS development, we humbly ask that you cite
  35  * the research papers on the package. Check out http://www.gromacs.org.
  36  */
  37
  38 #ifndef GMX_FILEIO_XTCIO_H
  39 #define GMX_FILEIO_XTCIO_H
  40
  41 #include "gromacs/math/vectypes.h"
  42 #include "gromacs/utility/basedefinitions.h"
  43 #include "gromacs/utility/real.h"
  44
  45 #ifdef __cplusplus
  46 extern "C" {
  47 #endif
  48
  49 struct t_fileio;
  50
  51 /* All functions return 1 if successful, 0 otherwise
  52  * bOK tells if a frame is not corrupted
  53  */
  54
  55 struct t_fileio *open_xtc(const char *filename, const char *mode);
  56 /* Open a file for xdr I/O */
  57
  58 void close_xtc(struct t_fileio *fio);
  59 /* Close the file for xdr I/O */
  60
  61 int read_first_xtc(struct t_fileio *fio,
  62                    int *natoms, int *step, real *time,
  63                    matrix box, rvec **x, real *prec, gmx_bool *bOK);
  64 /* Open xtc file, read xtc file first time, allocate memory for x */
  65
  66 int read_next_xtc(struct t_fileio *fio,
  67                   int natoms, int *step, real *time,
  68                   matrix box, rvec *x, real *prec, gmx_bool *bOK);
  69 /* Read subsequent frames */
  70
  71 int write_xtc(struct t_fileio *fio,
  72               int natoms, int step, real time,
  73               matrix box, rvec *x, real prec);
  74 /* Write a frame to xtc file */
  75
  76 #ifdef __cplusplus
  77 }
  78 #endif
  79
  80 #endif