src/gromacs/fileio/xdrd.c

   1 /*
   2  * This file is part of the GROMACS molecular simulation package.
   3  *
   4  * Copyright (c) 1991-2000, University of Groningen, The Netherlands.
   5  * Copyright (c) 2001-2004, The GROMACS development team,
   6  * Copyright (c) 2013, by the GROMACS development team, led by
   7  * Mark Abraham, David van der Spoel, Berk Hess, and Erik Lindahl,
   8  * and including many others, as listed in the AUTHORS file in the
   9  * top-level source directory and at http://www.gromacs.org.
  10  *
  11  * GROMACS is free software; you can redistribute it and/or
  12  * modify it under the terms of the GNU Lesser General Public License
  13  * as published by the Free Software Foundation; either version 2.1
  14  * of the License, or (at your option) any later version.
  15  *
  16  * GROMACS is distributed in the hope that it will be useful,
  17  * but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
  18  * MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the GNU
  19  * Lesser General Public License for more details.
  20  *
  21  * You should have received a copy of the GNU Lesser General Public
  22  * License along with GROMACS; if not, see
  23  * http://www.gnu.org/licenses, or write to the Free Software Foundation,
  24  * Inc., 51 Franklin Street, Fifth Floor, Boston, MA  02110-1301  USA.
  25  *
  26  * If you want to redistribute modifications to GROMACS, please
  27  * consider that scientific software is very special. Version
  28  * control is crucial - bugs must be traceable. We will be happy to
  29  * consider code for inclusion in the official distribution, but
  30  * derived work must not be called official GROMACS. Details are found
  31  * in the README & COPYING files - if they are missing, get the
  32  * official version at http://www.gromacs.org.
  33  *
  34  * To help us fund GROMACS development, we humbly ask that you cite
  35  * the research papers on the package. Check out http://www.gromacs.org.
  36  */
  37 #ifdef HAVE_CONFIG_H
  38 #include <config.h>
  39 #endif
  40
  41 #include "typedefs.h"
  42 #include "xdrf.h"
  43 #include "gmx_fatal.h"
  44 #include "smalloc.h"
  45
  46 int xdr_real(XDR *xdrs, real *r)
  47 {
  48 #ifdef GMX_DOUBLE
  49     float f;
  50     int   ret;
  51
  52     f   = *r;
  53     ret = xdr_float(xdrs, &f);
  54     *r  = f;
  55
  56     return ret;
  57 #else
  58     return xdr_float(xdrs, (float *)r);
  59 #endif
  60 }
  61
  62 int xdr3drcoord(XDR *xdrs, real *fp, int *size, real *precision)
  63 {
  64 #ifdef GMX_DOUBLE
  65     float *ffp;
  66     float  fprec;
  67     int    i, ret, isize;
  68
  69     isize = *size*DIM;
  70     if (isize <= 0)
  71     {
  72         gmx_fatal(FARGS, "Don't know what to malloc for ffp, isize = %d", isize);
  73     }
  74
  75     snew(ffp, isize);
  76
  77     for (i = 0; (i < isize); i++)
  78     {
  79         ffp[i] = fp[i];
  80     }
  81     fprec = *precision;
  82     ret   = xdr3dfcoord(xdrs, ffp, size, &fprec);
  83
  84     *precision = fprec;
  85     for (i = 0; (i < isize); i++)
  86     {
  87         fp[i] = ffp[i];
  88     }
  89
  90     sfree(ffp);
  91     return ret;
  92 #else
  93     return xdr3dfcoord(xdrs, (float *)fp, size, (float *)precision);
  94 #endif
  95 }
  96
  97 int xdr_gmx_large_int(XDR *xdrs, gmx_large_int_t *i)
  98 {
  99     /* This routine stores values compatible with xdr_int64_t */
 100
 101     int imaj, imin;
 102     int ret;
 103
 104 #if ((defined SIZEOF_GMX_LARGE_INT) && SIZEOF_GMX_LARGE_INT == 8)
 105     static const gmx_large_int_t two_p32_m1 = 0xFFFFFFFF;
 106     gmx_large_int_t              imaj64, imin64;
 107
 108     imaj64 = ((*i)>>32) & two_p32_m1;
 109     imin64 = (*i) & two_p32_m1;
 110     imaj   = (int)imaj64;
 111     imin   = (int)imin64;
 112 #else
 113     /* Our code has 4 bytes, but we should make sure that this value
 114      * will be correctly read by 8 byte code.
 115      */
 116     if (*i >= 0)
 117     {
 118         imaj = 0;
 119     }
 120     else
 121     {
 122         imaj = -1;
 123     }
 124     imin = *i;
 125 #endif
 126     ret = xdr_int(xdrs, &imaj);
 127     ret = xdr_int(xdrs, &imin);
 128
 129 #if ((defined SIZEOF_GMX_LARGE_INT) && SIZEOF_GMX_LARGE_INT == 8)
 130     *i = (((gmx_large_int_t)imaj << 32) | ((gmx_large_int_t)imin & two_p32_m1));
 131 #else
 132     *i = imin;
 133
 134     if (warn != NULL && (imaj < -1 || imaj > 0))
 135     {
 136         fprintf(stderr, "\nWARNING during %s:\n", warn);
 137         fprintf(stderr, "a step value written by code supporting 64bit integers is read by code that only supports 32bit integers, out of range step value has been converted to %d\n\n", *i);
 138     }
 139 #endif
 140
 141     return ret;
 142 }