src/gromacs/fileio/oenv.h

   1 /*
   2  * This file is part of the GROMACS molecular simulation package.
   3  *
   4  * Copyright (c) 1991-2000, University of Groningen, The Netherlands.
   5  * Copyright (c) 2001-2004, The GROMACS development team.
   6  * Copyright (c) 2012,2014,2015,2017, by the GROMACS development team, led by
   7  * Mark Abraham, David van der Spoel, Berk Hess, and Erik Lindahl,
   8  * and including many others, as listed in the AUTHORS file in the
   9  * top-level source directory and at http://www.gromacs.org.
  10  *
  11  * GROMACS is free software; you can redistribute it and/or
  12  * modify it under the terms of the GNU Lesser General Public License
  13  * as published by the Free Software Foundation; either version 2.1
  14  * of the License, or (at your option) any later version.
  15  *
  16  * GROMACS is distributed in the hope that it will be useful,
  17  * but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
  18  * MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the GNU
  19  * Lesser General Public License for more details.
  20  *
  21  * You should have received a copy of the GNU Lesser General Public
  22  * License along with GROMACS; if not, see
  23  * http://www.gnu.org/licenses, or write to the Free Software Foundation,
  24  * Inc., 51 Franklin Street, Fifth Floor, Boston, MA  02110-1301  USA.
  25  *
  26  * If you want to redistribute modifications to GROMACS, please
  27  * consider that scientific software is very special. Version
  28  * control is crucial - bugs must be traceable. We will be happy to
  29  * consider code for inclusion in the official distribution, but
  30  * derived work must not be called official GROMACS. Details are found
  31  * in the README & COPYING files - if they are missing, get the
  32  * official version at http://www.gromacs.org.
  33  *
  34  * To help us fund GROMACS development, we humbly ask that you cite
  35  * the research papers on the package. Check out http://www.gromacs.org.
  36  */
  37 #ifndef GMX_FILEIO_OENV_H
  38 #define GMX_FILEIO_OENV_H
  39
  40 #include <string>
  41
  42 #include "gromacs/utility/basedefinitions.h"
  43 #include "gromacs/utility/real.h"
  44
  45 struct gmx_output_env_t;
  46
  47 /* output_env member functions */
  48
  49 /* The output_env structure holds information about program name, cmd line,
  50    default times, etc.
  51
  52    There are still legacy functions for the program name, and the command
  53    line, but the output_env versions are now preferred.*/
  54
  55 typedef enum
  56 {
  57     timeNULL, time_fs, time_ps, time_ns, time_us, time_ms, time_s
  58 } time_unit_t;
  59 /* the time units. For the time being, ps means no conversion. */
  60
  61 typedef enum {
  62     exvgNULL, exvgXMGRACE, exvgXMGR, exvgNONE
  63 } xvg_format_t;
  64 /* the xvg output formattings */
  65
  66
  67 void output_env_init_default(gmx_output_env_t **oenvp);
  68 /* initialize an output_env structure, with reasonable default settings.
  69     (the time unit is set to time_ps, which means no conversion).  */
  70
  71 void output_env_done(gmx_output_env_t *oenv);
  72 /* free memory allocated for an output_env structure. */
  73
  74
  75 int output_env_get_verbosity(const gmx_output_env_t *oenv);
  76 /* return the verbosity */
  77
  78 std::string output_env_get_time_unit(const gmx_output_env_t *oenv);
  79 /* return time unit (e.g. ps or ns) */
  80
  81 std::string output_env_get_time_label(const gmx_output_env_t *oenv);
  82 /* return time unit label (e.g. "Time (ps)") */
  83
  84 std::string output_env_get_xvgr_tlabel(const gmx_output_env_t *oenv);
  85 /* return x-axis time label for xmgr */
  86
  87 real output_env_get_time_factor(const gmx_output_env_t *oenv);
  88 /* return time conversion factor from ps (i.e. 1e-3 for ps->ns) */
  89
  90 real output_env_get_time_invfactor(const gmx_output_env_t *oenv);
  91 /* return inverse time conversion factor to ps (i.e. 1e3 for ns->ps) */
  92
  93 real output_env_conv_time(const gmx_output_env_t *oenv, real time);
  94 /* return converted time */
  95
  96 void output_env_conv_times(const gmx_output_env_t *oenv, int n, real *time);
  97 /* convert array of times */
  98
  99 gmx_bool output_env_get_view(const gmx_output_env_t *oenv);
 100 /* Return TRUE when user requested viewing of the file */
 101
 102 xvg_format_t output_env_get_xvg_format(const gmx_output_env_t *oenv);
 103 /* Returns enum (see above) for xvg output formatting */
 104
 105 /*! \brief
 106  * Returns display name for the currently running program.
 107  */
 108 const char *output_env_get_program_display_name(const gmx_output_env_t *oenv);
 109
 110 namespace gmx
 111 {
 112 class IProgramContext;
 113 } // namespace gmx
 114
 115 void output_env_init(gmx_output_env_t **oenvp,
 116                      const gmx::IProgramContext &context,
 117                      time_unit_t tmu, gmx_bool view, xvg_format_t xvg_format,
 118                      int verbosity);
 119 /* initialize an output_env structure, setting the command line,
 120    the default time value a gmx_boolean view that is set to TRUE when the
 121    user requests direct viewing of graphs,
 122    the graph formatting type, the verbosity, and debug level */
 123
 124 /*! \brief
 125  * Returns gmx::IProgramContext from an output_env structure.
 126  */
 127 const gmx::IProgramContext &
 128 output_env_get_program_context(const gmx_output_env_t *oenv);
 129
 130 #endif