src/gromacs/fileio/gmxfio.h

   1 /*
   2  * This file is part of the GROMACS molecular simulation package.
   3  *
   4  * Copyright (c) 1991-2000, University of Groningen, The Netherlands.
   5  * Copyright (c) 2001-2004, The GROMACS development team.
   6  * Copyright (c) 2013,2014, by the GROMACS development team, led by
   7  * Mark Abraham, David van der Spoel, Berk Hess, and Erik Lindahl,
   8  * and including many others, as listed in the AUTHORS file in the
   9  * top-level source directory and at http://www.gromacs.org.
  10  *
  11  * GROMACS is free software; you can redistribute it and/or
  12  * modify it under the terms of the GNU Lesser General Public License
  13  * as published by the Free Software Foundation; either version 2.1
  14  * of the License, or (at your option) any later version.
  15  *
  16  * GROMACS is distributed in the hope that it will be useful,
  17  * but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
  18  * MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the GNU
  19  * Lesser General Public License for more details.
  20  *
  21  * You should have received a copy of the GNU Lesser General Public
  22  * License along with GROMACS; if not, see
  23  * http://www.gnu.org/licenses, or write to the Free Software Foundation,
  24  * Inc., 51 Franklin Street, Fifth Floor, Boston, MA  02110-1301  USA.
  25  *
  26  * If you want to redistribute modifications to GROMACS, please
  27  * consider that scientific software is very special. Version
  28  * control is crucial - bugs must be traceable. We will be happy to
  29  * consider code for inclusion in the official distribution, but
  30  * derived work must not be called official GROMACS. Details are found
  31  * in the README & COPYING files - if they are missing, get the
  32  * official version at http://www.gromacs.org.
  33  *
  34  * To help us fund GROMACS development, we humbly ask that you cite
  35  * the research papers on the package. Check out http://www.gromacs.org.
  36  */
  37
  38 #ifndef GMX_FILEIO_GMXFIO_H
  39 #define GMX_FILEIO_GMXFIO_H
  40
  41 #include <stdio.h>
  42
  43 #include "../legacyheaders/typedefs.h"
  44 #include "../utility/cstringutil.h"
  45 #include "futil.h"
  46
  47 #ifdef __cplusplus
  48 extern "C" {
  49 #endif
  50 /* types */
  51
  52
  53 /* Enumerated for different items in files */
  54 enum {
  55     eitemHEADER, eitemIR, eitemBOX,
  56     eitemTOP, eitemX, eitemV, eitemF, eitemNR
  57 };
  58
  59 /* Enumerated for data types in files */
  60 enum {
  61     eioREAL, eioFLOAT, eioDOUBLE, eioINT, eioINT64,
  62     eioUCHAR, eioNUCHAR, eioUSHORT,
  63     eioRVEC, eioNRVEC, eioIVEC, eioSTRING, eioNR
  64 };
  65
  66 typedef struct t_fileio t_fileio;
  67
  68 extern const char *itemstr[eitemNR];
  69 extern const char *comment_str[eitemNR];
  70
  71 /* NOTE ABOUT THREAD SAFETY:
  72
  73    The functions are all thread-safe, provided that two threads don't
  74    do something silly like closing the same file, or one thread
  75    accesses a file that has been closed by another.
  76  */
  77
  78 /********************************************************
  79  * Open and Close
  80  ********************************************************/
  81
  82 t_fileio *gmx_fio_open(const char *fn, const char *mode);
  83 /* Open a new file for reading or writing.
  84  * The file type will be deduced from the file name.
  85  * If fn is NULL, stdin / stdout will be used for Ascii I/O (TPA type)
  86  * mode may be "r", "w", or "a". You should append a "b" to the mode
  87  * if you are writing a binary file, but the routine will also
  88  * doublecheck it and try to do it if you forgot. This has no effect on
  89  * unix, but is important on windows.
  90  */
  91
  92 int gmx_fio_close(t_fileio *fp);
  93 /* Close the file corresponding to fp (if not stdio)
  94  * The routine will exit when an invalid fio is handled.
  95  * Returns 0 on success.
  96  */
  97
  98 int gmx_fio_fp_close(t_fileio *fp);
  99 /* Close the file corresponding to fp without closing the FIO entry
 100  * Needed e.g. for trxio because the FIO entries are used to store
 101  * additional data.
 102  * NOTE that the fp still needs to be properly closed with gmx_fio_close().
 103  * The routine will exit when an invalid fio is handled.
 104  * Returns 0 on success.
 105  */
 106
 107
 108 /* Open a file, return a stream, record the entry in internal FIO object */
 109 FILE* gmx_fio_fopen(const char *fn, const char *mode);
 110
 111 /* Close a file previously opened with gmx_fio_fopen.
 112  * Do not mix these calls with standard fopen/fclose ones!
 113  * Returns 0 on success.  */
 114 int gmx_fio_fclose(FILE *fp);
 115
 116
 117
 118 /********************************************************
 119  * Change properties of the open file
 120  ********************************************************/
 121
 122 void gmx_fio_setprecision(t_fileio *fio, gmx_bool bDouble);
 123 /* Select the floating point precision for reading and writing files */
 124
 125 char *gmx_fio_getname(t_fileio *fio);
 126 /* Return the filename corresponding to the fio index */
 127
 128 int gmx_fio_getftp(t_fileio *fio);
 129 /* Return the filetype corresponding to the fio index.
 130     There is as of now no corresponding setftp function because the file
 131     was opened as a specific file type and changing that midway is most
 132     likely an evil hack. */
 133
 134 void gmx_fio_setdebug(t_fileio *fio, gmx_bool bDebug);
 135 /* Set the debug mode */
 136
 137 gmx_bool gmx_fio_getdebug(t_fileio *fio);
 138 /* Return  whether debug mode is on in fio  */
 139
 140 gmx_bool gmx_fio_getread(t_fileio *fio);
 141 /* Return  whether read mode is on in fio  */
 142
 143
 144 void gmx_fio_checktype(t_fileio *fio);
 145 /* Check whether the fio is of a sane type */
 146
 147 /***************************************************
 148  * FILE Operations
 149  ***************************************************/
 150
 151 void gmx_fio_rewind(t_fileio *fio);
 152 /* Rewind the tpa file in fio */
 153
 154 int gmx_fio_flush(t_fileio *fio);
 155 /* Flush the fio, returns 0 on success */
 156
 157 int gmx_fio_fsync(t_fileio *fio);
 158 /* fsync the fio, returns 0 on success.
 159    NOTE: don't use fsync function unless you're absolutely sure you need it
 160    because it deliberately interferes with the OS's caching mechanisms and
 161    can cause dramatically slowed down IO performance. Some OSes (Linux,
 162    for example), may implement fsync as a full sync() point. */
 163
 164 gmx_off_t gmx_fio_ftell(t_fileio *fio);
 165 /* Return file position if possible */
 166
 167 int gmx_fio_seek(t_fileio *fio, gmx_off_t fpos);
 168 /* Set file position if possible, quit otherwise */
 169
 170 FILE *gmx_fio_getfp(t_fileio *fio);
 171 /* Return the file pointer itself */
 172
 173
 174 /* Element with information about position in a currently open file.
 175  * gmx_off_t should be defined by autoconf if your system does not have it.
 176  * If you do not have it on some other platform you do not have largefile
 177  * support at all, and you can define it to int (or better, find out how to
 178  * enable large files).  */
 179 typedef struct
 180 {
 181     char          filename[STRLEN];
 182     gmx_off_t     offset;
 183     unsigned char chksum[16];
 184     int           chksum_size;
 185 }
 186 gmx_file_position_t;
 187
 188 int gmx_fio_get_output_file_positions(gmx_file_position_t ** outputfiles,
 189                                       int                   *nfiles );
 190 /* Return the name and file pointer positions for all currently open
 191  * output files. This is used for saving in the checkpoint files, so we
 192  * can truncate output files upon restart-with-appending.
 193  *
 194  * For the first argument you should use a pointer, which will be set to
 195  * point to a list of open files.
 196  */
 197
 198 t_fileio *gmx_fio_all_output_fsync(void);
 199 /* fsync all open output files. This is used for checkpointing, where
 200    we need to ensure that all output is actually written out to
 201    disk.
 202    This is most important in the case of some networked file systems,
 203    where data is not synced with the file server until close() or
 204    fsync(), so data could remain in cache for days.
 205    Note the caveats reported with gmx_fio_fsync().
 206
 207     returns: NULL if no error occurred, or a pointer to the first file that
 208              failed if an error occurred
 209  */
 210
 211
 212 int gmx_fio_get_file_md5(t_fileio *fio, gmx_off_t offset,
 213                          unsigned char digest[]);
 214
 215
 216 int xtc_seek_frame(t_fileio *fio, int frame, int natoms);
 217
 218 int xtc_seek_time(t_fileio *fio, real time, int natoms, gmx_bool bSeekForwardOnly);
 219
 220
 221 /* Add this to the comment string for debugging */
 222 void gmx_fio_set_comment(t_fileio *fio, const char *comment);
 223
 224 /* Remove previously set comment */
 225 void gmx_fio_unset_comment(t_fileio *fio);
 226
 227
 228
 229
 230 /********************************************************
 231  * Read and write
 232  ********************************************************/
 233
 234
 235 /* basic reading & writing */
 236 gmx_bool gmx_fio_reade_real(t_fileio *fio, real *item,
 237                             const char *desc, const char *srcfile, int line);
 238 gmx_bool gmx_fio_reade_float(t_fileio *fio, float *item,
 239                              const char *desc, const char *srcfile, int line);
 240 gmx_bool gmx_fio_reade_double(t_fileio *fio, double *item,
 241                               const char *desc, const char *srcfile, int line);
 242 gmx_bool gmx_fio_reade_int(t_fileio *fio, int *item,
 243                            const char *desc, const char *srcfile, int line);
 244 gmx_bool gmx_fio_reade_int64(t_fileio *fio, gmx_int64_t *item,
 245                              const char *desc, const char *srcfile, int line);
 246 gmx_bool gmx_fio_reade_uchar(t_fileio *fio, unsigned char *item,
 247                              const char *desc, const char *srcfile, int line);
 248 gmx_bool gmx_fio_reade_ushort(t_fileio *fio, unsigned short *item,
 249                               const char *desc, const char *srcfile, int line);
 250 gmx_bool gmx_fio_reade_rvec(t_fileio *fio, rvec *item,
 251                             const char *desc, const char *srcfile, int line);
 252 gmx_bool gmx_fio_reade_ivec(t_fileio *fio, ivec *item,
 253                             const char *desc, const char *srcfile, int line);
 254 gmx_bool gmx_fio_reade_string(t_fileio *fio, char *item,
 255                               const char *desc, const char *srcfile, int line);
 256
 257 gmx_bool gmx_fio_writee_real(t_fileio *fio, real item,
 258                              const char *desc, const char *srcfile, int line);
 259 gmx_bool gmx_fio_writee_float(t_fileio *fio, float item,
 260                               const char *desc, const char *srcfile, int line);
 261 gmx_bool gmx_fio_writee_double(t_fileio *fio, double item,
 262                                const char *desc, const char *srcfile, int line);
 263 gmx_bool gmx_fio_writee_int(t_fileio *fio, int item,
 264                             const char *desc, const char *srcfile, int line);
 265 gmx_bool gmx_fio_writee_int64(t_fileio *fio, gmx_int64_t item,
 266                               const char *desc, const char *srcfile, int line);
 267 gmx_bool gmx_fio_writee_uchar(t_fileio *fio, unsigned char item,
 268                               const char *desc, const char *srcfile, int line);
 269 gmx_bool gmx_fio_writee_ushort(t_fileio *fio, unsigned short item,
 270                                const char *desc, const char *srcfile, int line);
 271 gmx_bool gmx_fio_writee_rvec(t_fileio *fio, rvec *item,
 272                              const char *desc, const char *srcfile, int line);
 273 gmx_bool gmx_fio_writee_ivec(t_fileio *fio, ivec *item,
 274                              const char *desc, const char *srcfile, int line);
 275 gmx_bool gmx_fio_writee_string(t_fileio *fio, const char *item,
 276                                const char *desc, const char *srcfile, int line);
 277
 278 /* reading or writing, depending on the file's opening mode string */
 279 gmx_bool gmx_fio_doe_real(t_fileio *fio, real *item,
 280                           const char *desc, const char *srcfile, int line);
 281 gmx_bool gmx_fio_doe_float(t_fileio *fio, float *item,
 282                            const char *desc, const char *srcfile, int line);
 283 gmx_bool gmx_fio_doe_double(t_fileio *fio, double *item,
 284                             const char *desc, const char *srcfile, int line);
 285 gmx_bool gmx_fio_doe_gmx_bool(t_fileio *fio, gmx_bool *item,
 286                               const char *desc, const char *srcfile, int line);
 287 gmx_bool gmx_fio_doe_int(t_fileio *fio, int *item,
 288                          const char *desc, const char *srcfile, int line);
 289 gmx_bool gmx_fio_doe_int64(t_fileio *fio, gmx_int64_t *item,
 290                            const char *desc, const char *srcfile, int line);
 291 gmx_bool gmx_fio_doe_uchar(t_fileio *fio, unsigned char *item,
 292                            const char *desc, const char *srcfile, int line);
 293 gmx_bool gmx_fio_doe_ushort(t_fileio *fio, unsigned short *item,
 294                             const char *desc, const char *srcfile, int line);
 295 gmx_bool gmx_fio_doe_rvec(t_fileio *fio, rvec *item,
 296                           const char *desc, const char *srcfile, int line);
 297 gmx_bool gmx_fio_doe_ivec(t_fileio *fio, ivec *item,
 298                           const char *desc, const char *srcfile, int line);
 299 gmx_bool gmx_fio_doe_string(t_fileio *fio, char *item,
 300                             const char *desc, const char *srcfile, int line);
 301
 302
 303
 304
 305 /* array reading & writing */
 306 gmx_bool gmx_fio_nreade_real(t_fileio *fio, real *item, int n,
 307                              const char *desc, const char *srcfile, int line);
 308 gmx_bool gmx_fio_nreade_float(t_fileio *fio, float *item, int n,
 309                               const char *desc, const char *srcfile, int line);
 310 gmx_bool gmx_fio_nreade_double(t_fileio *fio, double *item, int n,
 311                                const char *desc, const char *srcfile, int line);
 312 gmx_bool gmx_fio_nreade_int(t_fileio *fio, int *item, int n,
 313                             const char *desc, const char *srcfile, int line);
 314 gmx_bool gmx_fio_nreade_int64(t_fileio *fio, gmx_int64_t *item, int n,
 315                               const char *desc, const char *srcfile,
 316                               int line);
 317 gmx_bool gmx_fio_nreade_uchar(t_fileio *fio, unsigned char *item, int n,
 318                               const char *desc, const char *srcfile, int line);
 319 gmx_bool gmx_fio_nreade_ushort(t_fileio *fio, unsigned short *item, int n,
 320                                const char *desc, const char *srcfile, int line);
 321 gmx_bool gmx_fio_nreade_rvec(t_fileio *fio, rvec *item, int n,
 322                              const char *desc, const char *srcfile, int line);
 323 gmx_bool gmx_fio_nreade_ivec(t_fileio *fio, ivec *item, int n,
 324                              const char *desc, const char *srcfile, int line);
 325 gmx_bool gmx_fio_nreade_string(t_fileio *fio, char *item[], int n,
 326                                const char *desc, const char *srcfile, int line);
 327
 328 gmx_bool gmx_fio_nwritee_real(t_fileio *fio, const real *item, int n,
 329                               const char *desc, const char *srcfile, int line);
 330 gmx_bool gmx_fio_nwritee_float(t_fileio *fio, const float *item, int n,
 331                                const char *desc, const char *srcfile, int line);
 332 gmx_bool gmx_fio_nwritee_double(t_fileio *fio, const double *item, int n,
 333                                 const char *desc, const char *srcfile, int line);
 334 gmx_bool gmx_fio_nwritee_int(t_fileio *fio, const int *item, int n,
 335                              const char *desc, const char *srcfile, int line);
 336 gmx_bool gmx_fio_nwritee_int64(t_fileio *fio,
 337                                const gmx_int64_t *item, int n,
 338                                const char *desc, const char *srcfile,
 339                                int line);
 340 gmx_bool gmx_fio_nwritee_uchar(t_fileio *fio, const unsigned char *item, int n,
 341                                const char *desc, const char *srcfile, int line);
 342 gmx_bool gmx_fio_nwritee_ushort(t_fileio *fio, const unsigned short *item, int n,
 343                                 const char *desc, const char *srcfile, int line);
 344 gmx_bool gmx_fio_nwritee_rvec(t_fileio *fio, const rvec *item, int n,
 345                               const char *desc, const char *srcfile, int line);
 346 gmx_bool gmx_fio_nwritee_ivec(t_fileio *fio, const ivec *item, int n,
 347                               const char *desc, const char *srcfile, int line);
 348 gmx_bool gmx_fio_nwritee_string(t_fileio *fio, const char *item[], int n,
 349                                 const char *desc, const char *srcfile, int line);
 350
 351 gmx_bool gmx_fio_ndoe_real(t_fileio *fio, real *item, int n,
 352                            const char *desc, const char *srcfile, int line);
 353 gmx_bool gmx_fio_ndoe_float(t_fileio *fio, float *item, int n,
 354                             const char *desc, const char *srcfile, int line);
 355 gmx_bool gmx_fio_ndoe_double(t_fileio *fio, double *item, int n,
 356                              const char *desc, const char *srcfile, int line);
 357 gmx_bool gmx_fio_ndoe_gmx_bool(t_fileio *fio, gmx_bool *item, int n,
 358                                const char *desc, const char *srcfile, int line);
 359 gmx_bool gmx_fio_ndoe_int(t_fileio *fio, int *item, int n,
 360                           const char *desc, const char *srcfile, int line);
 361 gmx_bool gmx_fio_ndoe_int64(t_fileio *fio, gmx_int64_t *item, int n,
 362                             const char *desc, const char *srcfile,
 363                             int line);
 364 gmx_bool gmx_fio_ndoe_uchar(t_fileio *fio, unsigned char *item, int n,
 365                             const char *desc, const char *srcfile, int line);
 366 gmx_bool gmx_fio_ndoe_ushort(t_fileio *fio, unsigned short *item, int n,
 367                              const char *desc, const char *srcfile, int line);
 368 gmx_bool gmx_fio_ndoe_rvec(t_fileio *fio, rvec *item, int n,
 369                            const char *desc, const char *srcfile, int line);
 370 gmx_bool gmx_fio_ndoe_ivec(t_fileio *fio, ivec *item, int n,
 371                            const char *desc, const char *srcfile, int line);
 372 gmx_bool gmx_fio_ndoe_string(t_fileio *fio, char *item[], int n,
 373                              const char *desc, const char *srcfile, int line);
 374
 375
 376
 377 /* convenience macros */
 378 #define gmx_fio_read_real(fio, item)           gmx_fio_reade_real(fio, &item, (#item), __FILE__, __LINE__)
 379 #define gmx_fio_read_float(fio, item)          gmx_fio_reade_float(fio, &item, (#item), __FILE__, __LINE__)
 380 #define gmx_fio_read_double(fio, item)         gmx_fio_reade_double(fio, &item, (#item), __FILE__, __LINE__)
 381 #define gmx_fio_read_int(fio, item)            gmx_fio_reade_int(fio, &item, (#item), __FILE__, __LINE__)
 382 #define gmx_fio_read_int64(fio, item)          gmx_fio_reade_int64(fio, &item, (#item), __FILE__, __LINE__)
 383 #define gmx_fio_read_uchar(fio, item)          gmx_fio_reade_uchar(fio, &item, (#item), __FILE__, __LINE__)
 384 #define gmx_fio_read_ushort(fio, item)         gmx_fio_reade_ushort(fio, &item, (#item), __FILE__, __LINE__)
 385 #define gmx_fio_read_rvec(fio, item)           gmx_fio_reade_rvec(fio, item, (#item), __FILE__, __LINE__)
 386 #define gmx_fio_read_ivec(fio, item)           gmx_fio_reade_ivec(fio, item, (#item), __FILE__, __LINE__)
 387 #define gmx_fio_read_string(fio, item)         gmx_fio_reade_string(fio, item, (#item), __FILE__, __LINE__)
 388
 389 #define gmx_fio_write_real(fio, item)           gmx_fio_writee_real(fio, item, (#item), __FILE__, __LINE__)
 390 #define gmx_fio_write_float(fio, item)          gmx_fio_writee_float(fio, item, (#item), __FILE__, __LINE__)
 391 #define gmx_fio_write_double(fio, item)         gmx_fio_writee_double(fio, item, (#item), __FILE__, __LINE__)
 392 #define gmx_fio_write_int(fio, item)            gmx_fio_writee_int(fio, item, (#item), __FILE__, __LINE__)
 393 #define gmx_fio_write_int64(fio, item)          gmx_fio_writee_int64(fio, item, (#item), __FILE__, __LINE__)
 394 #define gmx_fio_write_uchar(fio, item)          gmx_fio_writee_uchar(fio, item, (#item), __FILE__, __LINE__)
 395 #define gmx_fio_write_ushort(fio, item)         gmx_fio_writee_ushort(fio, item, (#item), __FILE__, __LINE__)
 396 #define gmx_fio_write_rvec(fio, item)           gmx_fio_writee_rvec(fio, item, (#item), __FILE__, __LINE__)
 397 #define gmx_fio_write_ivec(fio, item)           gmx_fio_writee_ivec(fio, item, (#item), __FILE__, __LINE__)
 398 #define gmx_fio_write_string(fio, item)         gmx_fio_writee_string(fio, item, (#item), __FILE__, __LINE__)
 399
 400 #define gmx_fio_do_real(fio, item)              gmx_fio_doe_real(fio, &item, (#item), __FILE__, __LINE__)
 401 #define gmx_fio_do_float(fio, item)             gmx_fio_doe_float(fio, &item, (#item), __FILE__, __LINE__)
 402 #define gmx_fio_do_double(fio, item)            gmx_fio_doe_double(fio, &item, (#item), __FILE__, __LINE__)
 403 #define gmx_fio_do_gmx_bool(fio, item)          gmx_fio_doe_gmx_bool(fio, &item, (#item), __FILE__, __LINE__)
 404 #define gmx_fio_do_int(fio, item)               gmx_fio_doe_int(fio, &item, (#item), __FILE__, __LINE__)
 405 #define gmx_fio_do_int64(fio, item)             gmx_fio_doe_int64(fio, &item, (#item), __FILE__, __LINE__)
 406 #define gmx_fio_do_uchar(fio, item)             gmx_fio_doe_uchar(fio, &item, (#item), __FILE__, __LINE__)
 407 #define gmx_fio_do_ushort(fio, item)            gmx_fio_doe_ushort(fio, &item, (#item), __FILE__, __LINE__)
 408 #define gmx_fio_do_rvec(fio, item)              gmx_fio_doe_rvec(fio, &item, (#item), __FILE__, __LINE__)
 409 #define gmx_fio_do_ivec(fio, item)              gmx_fio_doe_ivec(fio, &item, (#item), __FILE__, __LINE__)
 410 #define gmx_fio_do_string(fio, item)            gmx_fio_doe_string(fio, item, (#item), __FILE__, __LINE__)
 411
 412
 413
 414
 415 #define gmx_fio_nread_real(fio, item, n)            gmx_fio_nreade_real(fio, item, n, (#item), __FILE__, __LINE__)
 416 #define gmx_fio_nread_float(fio, item, n)           gmx_fio_nreade_float(fio, item, n, (#item), __FILE__, __LINE__)
 417 #define gmx_fio_nread_double(fio, item, n)          gmx_fio_nreade_double(fio, item, n, (#item), __FILE__, __LINE__)
 418 #define gmx_fio_nread_int(fio, item, n)             gmx_fio_nreade_int(fio, item, n, (#item), __FILE__, __LINE__)
 419 #define gmx_fio_nread_int64(fio, item, n)           gmx_fio_nreade_int64(fio, item, n, (#item), __FILE__, __LINE__)
 420 #define gmx_fio_nread_uchar(fio, item, n)           gmx_fio_nreade_uchar(fio, item, n, (#item), __FILE__, __LINE__)
 421 #define gmx_fio_nread_ushort(fio, item, n)          gmx_fio_nreade_ushort(fio, item, n, (#item), __FILE__, __LINE__)
 422 #define gmx_fio_nread_rvec(fio, item, n)            gmx_fio_nreade_rvec(fio, item, n, (#item), __FILE__, __LINE__)
 423 #define gmx_fio_nread_ivec(fio, item, n)            gmx_fio_nreade_ivec(fio, item, n, (#item), __FILE__, __LINE__)
 424 #define gmx_fio_nread_string(fio, item, n)          gmx_fio_nreade_string(fio, item, n, (#item), __FILE__, __LINE__)
 425
 426 #define gmx_fio_nwrite_real(fio, item, n)           gmx_fio_nwritee_real(fio, item, n, (#item), __FILE__, __LINE__)
 427 #define gmx_fio_nwrite_float(fio, item, n)          gmx_fio_nwritee_float(fio, item, n, (#item), __FILE__, __LINE__)
 428 #define gmx_fio_nwrite_double(fio, item, n)         gmx_fio_nwritee_double(fio, item, n, (#item), __FILE__, __LINE__)
 429 #define gmx_fio_nwrite_int(fio, item, n)            gmx_fio_nwritee_int(fio, item, n, (#item), __FILE__, __LINE__)
 430 #define gmx_fio_nwrite_int64(fio, item, n)          gmx_fio_nwritee_int64(fio, item, n, (#item), __FILE__, __LINE__)
 431 #define gmx_fio_nwrite_uchar(fio, item, n)          gmx_fio_nwritee_uchar(fio, item, n, (#item), __FILE__, __LINE__)
 432 #define gmx_fio_nwrite_ushort(fio, item, n)         gmx_fio_nwritee_ushort(fio, item, n, (#item), __FILE__, __LINE__)
 433 #define gmx_fio_nwrite_rvec(fio, item, n)           gmx_fio_nwritee_rvec(fio, item, n, (#item), __FILE__, __LINE__)
 434 #define gmx_fio_nwrite_ivec(fio, item, n)           gmx_fio_nwritee_ivec(fio, item, n, (#item), __FILE__, __LINE__)
 435 #define gmx_fio_nwrite_string(fio, item, n)         gmx_fio_nwritee_string(fio, item, n, (#item), __FILE__, __LINE__)
 436
 437 #define gmx_fio_ndo_real(fio, item, n)              gmx_fio_ndoe_real(fio, item, n, (#item), __FILE__, __LINE__)
 438 #define gmx_fio_ndo_float(fio, item, n)             gmx_fio_ndoe_float(fio, item, n, (#item), __FILE__, __LINE__)
 439 #define gmx_fio_ndo_double(fio, item, n)            gmx_fio_ndoe_double(fio, item, n, (#item), __FILE__, __LINE__)
 440 #define gmx_fio_ndo_gmx_bool(fio, item, n)          gmx_fio_ndoe_gmx_bool(fio, item, n, (#item), __FILE__, __LINE__)
 441 #define gmx_fio_ndo_int(fio, item, n)               gmx_fio_ndoe_int(fio, item, n, (#item), __FILE__, __LINE__)
 442 #define gmx_fio_ndo_int64(fio, item, n)             gmx_fio_ndoe_int64(fio, item, n, (#item), __FILE__, __LINE__)
 443 #define gmx_fio_ndo_uchar(fio, item, n)             gmx_fio_ndoe_uchar(fio, item, n, (#item), __FILE__, __LINE__)
 444 #define gmx_fio_ndo_ushort(fio, item, n)            gmx_fio_ndoe_ushort(fio, item, n, (#item), __FILE__, __LINE__)
 445 #define gmx_fio_ndo_rvec(fio, item, n)              gmx_fio_ndoe_rvec(fio, item, n, (#item), __FILE__, __LINE__)
 446 #define gmx_fio_ndo_ivec(fio, item, n)              gmx_fio_ndoe_ivec(fio, item, n, (#item), __FILE__, __LINE__)
 447 #define gmx_fio_ndo_string(fio, item, n)            gmx_fio_ndoe_string(fio, item, n, (#item), __FILE__, __LINE__)
 448
 449 #ifdef __cplusplus
 450 }
 451 #endif
 452
 453 #endif