src/gromacs/ewald/ewald.h

   1 /*
   2  * This file is part of the GROMACS molecular simulation package.
   3  *
   4  * Copyright (c) 1991-2000, University of Groningen, The Netherlands.
   5  * Copyright (c) 2001-2004, The GROMACS development team.
   6  * Copyright (c) 2013,2014,2015,2017,2018,2019, by the GROMACS development team, led by
   7  * Mark Abraham, David van der Spoel, Berk Hess, and Erik Lindahl,
   8  * and including many others, as listed in the AUTHORS file in the
   9  * top-level source directory and at http://www.gromacs.org.
  10  *
  11  * GROMACS is free software; you can redistribute it and/or
  12  * modify it under the terms of the GNU Lesser General Public License
  13  * as published by the Free Software Foundation; either version 2.1
  14  * of the License, or (at your option) any later version.
  15  *
  16  * GROMACS is distributed in the hope that it will be useful,
  17  * but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
  18  * MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the GNU
  19  * Lesser General Public License for more details.
  20  *
  21  * You should have received a copy of the GNU Lesser General Public
  22  * License along with GROMACS; if not, see
  23  * http://www.gnu.org/licenses, or write to the Free Software Foundation,
  24  * Inc., 51 Franklin Street, Fifth Floor, Boston, MA  02110-1301  USA.
  25  *
  26  * If you want to redistribute modifications to GROMACS, please
  27  * consider that scientific software is very special. Version
  28  * control is crucial - bugs must be traceable. We will be happy to
  29  * consider code for inclusion in the official distribution, but
  30  * derived work must not be called official GROMACS. Details are found
  31  * in the README & COPYING files - if they are missing, get the
  32  * official version at http://www.gromacs.org.
  33  *
  34  * To help us fund GROMACS development, we humbly ask that you cite
  35  * the research papers on the package. Check out http://www.gromacs.org.
  36  */
  37 /*! \libinternal \defgroup module_ewald Ewald-family treatments of long-ranged forces
  38  * \ingroup group_mdrun
  39  *
  40  * \brief Computes energies and forces for long-ranged interactions
  41  * using the Ewald decomposition. Includes plain Ewald, PME, P3M for
  42  * Coulomb, PME for Lennard-Jones, load-balancing for PME, and
  43  * supporting code.
  44  *
  45  * \author Berk Hess <hess@kth.se>
  46  * \author Erik Lindahl <erik@kth.se>
  47  * \author Roland Schulz <roland@rschulz.eu>
  48  * \author Mark Abraham <mark.j.abraham@gmail.com>
  49  * \author Christan Wennberg <cwennberg@kth.se>
  50  */
  51
  52 /*! \libinternal \file
  53  *
  54  * \brief This file contains function declarations necessary for
  55  * computing energies and forces for the plain-Ewald long-ranged part,
  56  * and the correction for overall system charge for all Ewald-family
  57  * methods.
  58  *
  59  * \author David van der Spoel <david.vanderspoel@icm.uu.se>
  60  * \author Mark Abraham <mark.j.abraham@gmail.com>
  61  * \inlibraryapi
  62  * \ingroup module_ewald
  63  */
  64
  65 #ifndef GMX_EWALD_EWALD_H
  66 #define GMX_EWALD_EWALD_H
  67
  68 #include <stdio.h>
  69
  70 #include "gromacs/math/vectypes.h"
  71 #include "gromacs/utility/real.h"
  72
  73 struct t_commrec;
  74 struct t_forcerec;
  75 struct t_inputrec;
  76
  77 /* Forward declaration of type for managing Ewald tables */
  78 struct gmx_ewald_tab_t;
  79
  80 /*! \brief Initialize the tables used in the Ewald long-ranged part */
  81 void init_ewald_tab(struct gmx_ewald_tab_t** et, const t_inputrec* ir, FILE* fp);
  82
  83 /*! \brief Do the long-ranged part of an Ewald calculation */
  84 real do_ewald(const t_inputrec* ir,
  85               const rvec        x[],
  86               rvec              f[],
  87               const real        chargeA[],
  88               const real        chargeB[],
  89               const matrix      box,
  90               const t_commrec*  cr,
  91               int               natoms,
  92               matrix            lrvir,
  93               real              ewaldcoeff,
  94               real              lambda,
  95               real*             dvdlambda,
  96               gmx_ewald_tab_t*  et);
  97
  98 /*! \brief Calculate the correction to the Ewald sum, due to a net system
  99  * charge.
 100  *
 101  * Should only be called on one thread. */
 102 real ewald_charge_correction(const t_commrec*  cr,
 103                              const t_forcerec* fr,
 104                              real              lambda,
 105                              const matrix      box,
 106                              real*             dvdlambda,
 107                              tensor            vir);
 108
 109 #endif