src/gromacs/coordinateio/tests/builder.cpp

   1 /*
   2  * This file is part of the GROMACS molecular simulation package.
   3  *
   4  * Copyright (c) 2019, by the GROMACS development team, led by
   5  * Mark Abraham, David van der Spoel, Berk Hess, and Erik Lindahl,
   6  * and including many others, as listed in the AUTHORS file in the
   7  * top-level source directory and at http://www.gromacs.org.
   8  *
   9  * GROMACS is free software; you can redistribute it and/or
  10  * modify it under the terms of the GNU Lesser General Public License
  11  * as published by the Free Software Foundation; either version 2.1
  12  * of the License, or (at your option) any later version.
  13  *
  14  * GROMACS is distributed in the hope that it will be useful,
  15  * but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
  16  * MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the GNU
  17  * Lesser General Public License for more details.
  18  *
  19  * You should have received a copy of the GNU Lesser General Public
  20  * License along with GROMACS; if not, see
  21  * http://www.gnu.org/licenses, or write to the Free Software Foundation,
  22  * Inc., 51 Franklin Street, Fifth Floor, Boston, MA  02110-1301  USA.
  23  *
  24  * If you want to redistribute modifications to GROMACS, please
  25  * consider that scientific software is very special. Version
  26  * control is crucial - bugs must be traceable. We will be happy to
  27  * consider code for inclusion in the official distribution, but
  28  * derived work must not be called official GROMACS. Details are found
  29  * in the README & COPYING files - if they are missing, get the
  30  * official version at http://www.gromacs.org.
  31  *
  32  * To help us fund GROMACS development, we humbly ask that you cite
  33  * the research papers on the package. Check out http://www.gromacs.org.
  34  */
  35 /*!\internal
  36  * \file
  37  * \brief
  38  * Tests for outputmanager
  39  *
  40  * \author Paul Bauer <paul.bauer.q@gmail.com>
  41  * \ingroup module_coordinateio
  42  */
  43
  44
  45 #include "gmxpre.h"
  46
  47 #include "config.h"
  48
  49 #include <utility>
  50
  51 #include "gromacs/coordinateio/coordinatefile.h"
  52
  53 #include "gromacs/coordinateio/tests/coordinate_test.h"
  54
  55 namespace gmx
  56 {
  57
  58 namespace test
  59 {
  60
  61 /*!\brief
  62  * Test fixture to test different file types are supported by the CoordinateFile.
  63  */
  64 class TrajectoryFrameWriterTest : public ModuleTest
  65 {
  66 public:
  67     /*! \brief
  68      * Test basic behaviour without special requirements.
  69      *
  70      * \param[in] filename Name for output file.
  71      */
  72     void basicTest(const char* filename)
  73     {
  74         addTopology();
  75
  76         OutputRequirements requirements;
  77
  78         runTest(filename, requirements);
  79     }
  80     /*! \brief
  81      * Test with extra requirements.
  82      *
  83      * \param[in] filename Name for output file.
  84      * \param[in] requirements Specify extra reqs for output.
  85      */
  86     void testWithRequirements(const char* filename, const OutputRequirements& requirements)
  87     {
  88         addTopology();
  89         runTest(filename, requirements);
  90     }
  91 };
  92
  93 TEST_P(TrajectoryFrameWriterTest, WorksWithFormats)
  94 {
  95     EXPECT_NO_THROW(basicTest(GetParam()));
  96 }
  97
  98 TEST_F(TrajectoryFrameWriterTest, RejectsWrongFiletype)
  99 {
 100     EXPECT_THROW(basicTest("test.xvg"), InvalidInputError);
 101 }
 102
 103 TEST_F(TrajectoryFrameWriterTest, BuilderFailsWithPdbAndNoAtoms)
 104 {
 105     OutputRequirements requirements;
 106     requirements.atoms = ChangeAtomsType::Never;
 107     EXPECT_THROW(testWithRequirements("test.pdb", requirements), InconsistentInputError);
 108 }
 109
 110 TEST_F(TrajectoryFrameWriterTest, BuilderFailsWithGroAndNoAtoms)
 111 {
 112     OutputRequirements requirements;
 113     requirements.atoms = ChangeAtomsType::Never;
 114     EXPECT_THROW(testWithRequirements("test.gro", requirements), InconsistentInputError);
 115 }
 116
 117 TEST_F(TrajectoryFrameWriterTest, BuilderImplictlyAddsAtoms)
 118 {
 119     OutputRequirements requirements;
 120     requirements.atoms = ChangeAtomsType::PreservedIfPresent;
 121     {
 122         EXPECT_NO_THROW(testWithRequirements("test.pdb", requirements));
 123     }
 124     {
 125         EXPECT_NO_THROW(testWithRequirements("test.gro", requirements));
 126     }
 127 }
 128
 129 #if GMX_USE_TNG
 130 TEST_F(TrajectoryFrameWriterTest, TNGOutputWorks)
 131 {
 132     OutputRequirements requirements;
 133     runTest("test.tng", requirements);
 134 }
 135 #endif
 136
 137 /*!\brief
 138  * Character array of different file names to test.
 139  */
 140 const char* const trajectoryFileNames[] = { "spc2-traj.trr",
 141 #if GMX_USE_TNG
 142                                             "spc2-traj.tng",
 143 #endif
 144                                             "spc2-traj.xtc", "spc2-traj.pdb",
 145                                             "spc2-traj.gro", "spc2-traj.g96" };
 146
 147 INSTANTIATE_TEST_CASE_P(CoordinateFileFileFormats,
 148                         TrajectoryFrameWriterTest,
 149                         ::testing::ValuesIn(trajectoryFileNames));
 150
 151 } // namespace test
 152
 153 } // namespace gmx