src/gromacs/coordinateio/outputadaptercontainer.h

   1 /*
   2  * This file is part of the GROMACS molecular simulation package.
   3  *
   4  * Copyright (c) 2019, by the GROMACS development team, led by
   5  * Mark Abraham, David van der Spoel, Berk Hess, and Erik Lindahl,
   6  * and including many others, as listed in the AUTHORS file in the
   7  * top-level source directory and at http://www.gromacs.org.
   8  *
   9  * GROMACS is free software; you can redistribute it and/or
  10  * modify it under the terms of the GNU Lesser General Public License
  11  * as published by the Free Software Foundation; either version 2.1
  12  * of the License, or (at your option) any later version.
  13  *
  14  * GROMACS is distributed in the hope that it will be useful,
  15  * but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
  16  * MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the GNU
  17  * Lesser General Public License for more details.
  18  *
  19  * You should have received a copy of the GNU Lesser General Public
  20  * License along with GROMACS; if not, see
  21  * http://www.gnu.org/licenses, or write to the Free Software Foundation,
  22  * Inc., 51 Franklin Street, Fifth Floor, Boston, MA  02110-1301  USA.
  23  *
  24  * If you want to redistribute modifications to GROMACS, please
  25  * consider that scientific software is very special. Version
  26  * control is crucial - bugs must be traceable. We will be happy to
  27  * consider code for inclusion in the official distribution, but
  28  * derived work must not be called official GROMACS. Details are found
  29  * in the README & COPYING files - if they are missing, get the
  30  * official version at http://www.gromacs.org.
  31  *
  32  * To help us fund GROMACS development, we humbly ask that you cite
  33  * the research papers on the package. Check out http://www.gromacs.org.
  34  */
  35 /*! \file
  36  * \brief
  37  * Declares gmx::OutputAdapterContainer, a storage object for
  38  * multiple outputadapters derived from the IOutputadaper interface.
  39  *
  40  * \author Paul Bauer <paul.bauer.q@gmail.com>
  41  * \inlibraryapi
  42  * \ingroup module_coordinateio
  43  */
  44 #ifndef GMX_COORDINATEIO_OUTPUTADAPTERCONTAINER_H
  45 #define GMX_COORDINATEIO_OUTPUTADAPTERCONTAINER_H
  46
  47 #include <memory>
  48 #include <vector>
  49
  50 #include "gromacs/coordinateio/ioutputadapter.h"
  51 #include "gromacs/utility/arrayref.h"
  52 #include "gromacs/utility/classhelpers.h"
  53 #include "gromacs/utility/enumerationhelpers.h"
  54
  55 namespace gmx
  56 {
  57
  58 /*! \libinternal \brief
  59  * Storage for output adapters that modify the state of a t_trxframe object.
  60  *
  61  * The OutputAdapterContainer is responsible for storing the number of
  62  * OutputAdapters, as well as the bitmask representing the current requirements
  63  * for constructing an CoordinateFile object with the modules registered. It is responsible
  64  * for ensuring that no module can be registered multiple times, and that the
  65  * correct order for some modifications is observed (e.g. we can not reduce the
  66  * number of coordinates written to a file before we have set all the other flags).
  67  * Any other behaviour indicates a programming error and triggers an assertion.
  68  *
  69  * The abilities that need to be cross checked for the container are usually constrained
  70  * by the file format the coordinate data will be written to. When declaring new abilities,
  71  * these must match the file type for the output.
  72  *
  73  * \todo Keeping track of those abilities has to be the responsibility of an object
  74  *       implementing and interface that declares it capabilities and will execute the
  75  *       the function of writing to a file.
  76  * \todo This could be changed to instead construct the container with a pointer to an
  77  *       ICoordinateOutputWriter that can be passed to the IOutputAdapter modules to check
  78  *       their cross-dependencies.
  79  */
  80 class OutputAdapterContainer
  81 {
  82 public:
  83     //! Only allow constructing the container with defined output abilities.
  84     explicit OutputAdapterContainer(unsigned long abilities) : abilities_(abilities) {}
  85     //! Allow abilities to be also defined using the enum class.
  86     explicit OutputAdapterContainer(CoordinateFileFlags abilities) :
  87         abilities_(convertFlag(abilities))
  88     {
  89     }
  90
  91     /*! \brief
  92      * Add an adapter of a type not previously added.
  93      *
  94      * Only one adapter of each type can be registered, and the order of adapters
  95      * is predefined in the underlying storage object.
  96      * Calls internal checks to make sure that the new adapter does not violate
  97      * any of the preconditions set to make an CoordinateFile object containing
  98      * the registered modules.
  99      *
 100      * \param[in] adapter unique_ptr to adapter, with container taking ownership here.
 101      * \param[in] type What kind of adapter is being added.
 102      * \throws InternalError When registering an adapter of a type already registered .
 103      * \throws InconsistentInputError When incompatible modules are added.
 104      */
 105     void addAdapter(OutputAdapterPointer adapter, CoordinateFileFlags type);
 106
 107     //! Get vector of all registered adapters.
 108     ArrayRef<const OutputAdapterPointer> getAdapters() { return outputAdapters_; }
 109     //! Get info if we have any registered adapters.
 110     bool isEmpty() const;
 111
 112 private:
 113     //! Array of registered modules.
 114     EnumerationArray<CoordinateFileFlags, OutputAdapterPointer> outputAdapters_;
 115     //! Construction time bitmask declaring what the OutputManager can do.
 116     unsigned long abilities_ = convertFlag(CoordinateFileFlags::Base);
 117 };
 118
 119 } // namespace gmx
 120
 121 #endif