src/gromacs/commandline/tests/pargs.cpp

   1 /*
   2  * This file is part of the GROMACS molecular simulation package.
   3  *
   4  * Copyright (c) 2013,2014, by the GROMACS development team, led by
   5  * Mark Abraham, David van der Spoel, Berk Hess, and Erik Lindahl,
   6  * and including many others, as listed in the AUTHORS file in the
   7  * top-level source directory and at http://www.gromacs.org.
   8  *
   9  * GROMACS is free software; you can redistribute it and/or
  10  * modify it under the terms of the GNU Lesser General Public License
  11  * as published by the Free Software Foundation; either version 2.1
  12  * of the License, or (at your option) any later version.
  13  *
  14  * GROMACS is distributed in the hope that it will be useful,
  15  * but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
  16  * MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the GNU
  17  * Lesser General Public License for more details.
  18  *
  19  * You should have received a copy of the GNU Lesser General Public
  20  * License along with GROMACS; if not, see
  21  * http://www.gnu.org/licenses, or write to the Free Software Foundation,
  22  * Inc., 51 Franklin Street, Fifth Floor, Boston, MA  02110-1301  USA.
  23  *
  24  * If you want to redistribute modifications to GROMACS, please
  25  * consider that scientific software is very special. Version
  26  * control is crucial - bugs must be traceable. We will be happy to
  27  * consider code for inclusion in the official distribution, but
  28  * derived work must not be called official GROMACS. Details are found
  29  * in the README & COPYING files - if they are missing, get the
  30  * official version at http://www.gromacs.org.
  31  *
  32  * To help us fund GROMACS development, we humbly ask that you cite
  33  * the research papers on the package. Check out http://www.gromacs.org.
  34  */
  35 /*! \internal \file
  36  * \brief
  37  * Tests parse_common_args().
  38  *
  39  * Currently, negative tests are not possible, because those trigger
  40  * gmx_fatal() and terminate the whole test binary.
  41  *
  42  * \author Teemu Murtola <teemu.murtola@gmail.com>
  43  * \ingroup module_commandline
  44  */
  45 #include "gromacs/commandline/pargs.h"
  46
  47 #include <string>
  48
  49 #include <gtest/gtest.h>
  50
  51 #include "gromacs/utility/arrayref.h"
  52 #include "gromacs/utility/file.h"
  53 #include "gromacs/utility/path.h"
  54 #include "gromacs/utility/stringutil.h"
  55
  56 #include "testutils/cmdlinetest.h"
  57 #include "testutils/testasserts.h"
  58 #include "testutils/testfilemanager.h"
  59
  60 namespace
  61 {
  62
  63 using gmx::test::CommandLine;
  64
  65 class ParseCommonArgsTest : public ::testing::Test
  66 {
  67     public:
  68         enum FileArgumentType
  69         {
  70             efFull,
  71             efNoExtension,
  72             efEmptyValue
  73         };
  74
  75         ParseCommonArgsTest()
  76             : oenv_(NULL), fileCount_(0)
  77         {
  78         }
  79         virtual ~ParseCommonArgsTest()
  80         {
  81             output_env_done(oenv_);
  82         }
  83
  84         int nfile() const { return fileCount_; }
  85
  86         void parseFromArgs(unsigned long           flags,
  87                            gmx::ArrayRef<t_filenm> fnm,
  88                            gmx::ArrayRef<t_pargs>  pa)
  89         {
  90             fileCount_ = fnm.size();
  91             bool bOk = parse_common_args(&args_.argc(), args_.argv(), flags,
  92                                          fnm.size(), fnm.data(),
  93                                          pa.size(), pa.data(),
  94                                          0, NULL, 0, NULL, &oenv_);
  95             EXPECT_TRUE(bOk);
  96         }
  97         void parseFromArray(gmx::ConstArrayRef<const char *> cmdline,
  98                             unsigned long                    flags,
  99                             gmx::ArrayRef<t_filenm>          fnm,
 100                             gmx::ArrayRef<t_pargs>           pa)
 101         {
 102             args_.initFromArray(cmdline);
 103             parseFromArgs(flags, fnm, pa);
 104         }
 105         std::string addFileArg(const char *name, const char *extension,
 106                                FileArgumentType type)
 107         {
 108             std::string filename(tempFiles_.getTemporaryFilePath(extension));
 109             gmx::File::writeFileFromString(filename, "Dummy file");
 110             if (name != NULL)
 111             {
 112                 args_.append(name);
 113                 switch (type)
 114                 {
 115                     case efFull:
 116                         args_.append(filename);
 117                         break;
 118                     case efNoExtension:
 119                         args_.append(gmx::Path::stripExtension(filename));
 120                         break;
 121                     case efEmptyValue:
 122                         break;
 123                 }
 124             }
 125             return filename;
 126         }
 127
 128         // This must be a member that persists until the end of the test,
 129         // because string arguments are not duplicated in the output.
 130         CommandLine                 args_;
 131
 132     private:
 133         output_env_t                oenv_;
 134         size_t                      fileCount_;
 135         gmx::test::TestFileManager  tempFiles_;
 136 };
 137
 138 /********************************************************************
 139  * Tests for different types of options
 140  */
 141
 142 TEST_F(ParseCommonArgsTest, ParsesIntegerArgs)
 143 {
 144     int               value1 = 0, value2 = 0, value3 = 3;
 145     t_pargs           pa[]   = {
 146         { "-i1", FALSE, etINT, {&value1}, "Description" },
 147         { "-i2", FALSE, etINT, {&value2}, "Description" },
 148         { "-i3", FALSE, etINT, {&value3}, "Description" }
 149     };
 150     const char *const cmdline[] = {
 151         "test", "-i1", "2", "-i2", "-3"
 152     };
 153     parseFromArray(cmdline, 0, gmx::EmptyArrayRef(), pa);
 154     EXPECT_EQ( 2, value1);
 155     EXPECT_EQ(-3, value2);
 156     EXPECT_EQ( 3, value3);
 157 }
 158
 159 TEST_F(ParseCommonArgsTest, ParsesInt64Args)
 160 {
 161     gmx_int64_t       value1 = 0, value2 = 0, value3 = 3;
 162     t_pargs           pa[]   = {
 163         { "-i1", FALSE, etINT64, {&value1}, "Description" },
 164         { "-i2", FALSE, etINT64, {&value2}, "Description" },
 165         { "-i3", FALSE, etINT64, {&value3}, "Description" }
 166     };
 167     const char *const cmdline[] = {
 168         "test", "-i1", "2", "-i2", "-3"
 169     };
 170     parseFromArray(cmdline, 0, gmx::EmptyArrayRef(), pa);
 171     EXPECT_EQ( 2, value1);
 172     EXPECT_EQ(-3, value2);
 173     EXPECT_EQ( 3, value3);
 174 }
 175
 176 TEST_F(ParseCommonArgsTest, ParsesRealArgs)
 177 {
 178     real              value1 = 0.0, value2 = 0.0, value3 = 2.5;
 179     t_pargs           pa[]   = {
 180         { "-r1", FALSE, etREAL, {&value1}, "Description" },
 181         { "-r2", FALSE, etREAL, {&value2}, "Description" },
 182         { "-r3", FALSE, etREAL, {&value3}, "Description" }
 183     };
 184     const char *const cmdline[] = {
 185         "test", "-r1", "2", "-r2", "-.5"
 186     };
 187     parseFromArray(cmdline, 0, gmx::EmptyArrayRef(), pa);
 188     EXPECT_EQ( 2.0, value1);
 189     EXPECT_EQ(-0.5, value2);
 190     EXPECT_EQ( 2.5, value3);
 191 }
 192
 193 TEST_F(ParseCommonArgsTest, ParsesStringArgs)
 194 {
 195     const char       *value1 = "def", *value2 = "", *value3 = "default";
 196     t_pargs           pa[]   = {
 197         { "-s1", FALSE, etSTR, {&value1}, "Description" },
 198         { "-s2", FALSE, etSTR, {&value2}, "Description" },
 199         { "-s3", FALSE, etSTR, {&value3}, "Description" }
 200     };
 201     const char *const cmdline[] = {
 202         "test", "-s1", "", "-s2", "test"
 203     };
 204     parseFromArray(cmdline, 0, gmx::EmptyArrayRef(), pa);
 205     EXPECT_STREQ("", value1);
 206     EXPECT_STREQ("test", value2);
 207     EXPECT_STREQ("default", value3);
 208 }
 209
 210 TEST_F(ParseCommonArgsTest, ParsesBooleanArgs)
 211 {
 212     gmx_bool          value1 = TRUE, value2 = FALSE, value3 = TRUE;
 213     t_pargs           pa[]   = {
 214         { "-b1", FALSE, etBOOL, {&value1}, "Description" },
 215         { "-b2", FALSE, etBOOL, {&value2}, "Description" },
 216         { "-b3", FALSE, etBOOL, {&value3}, "Description" }
 217     };
 218     const char *const cmdline[] = {
 219         "test", "-nob1", "-b2"
 220     };
 221     parseFromArray(cmdline, 0, gmx::EmptyArrayRef(), pa);
 222     EXPECT_FALSE(value1);
 223     EXPECT_TRUE(value2);
 224     EXPECT_TRUE(value3);
 225 }
 226
 227 TEST_F(ParseCommonArgsTest, ParsesVectorArgs)
 228 {
 229     rvec              value1 = {0, 0, 0}, value2 = {0, 0, 0}, value3 = {1, 2, 3};
 230     t_pargs           pa[]   = {
 231         { "-v1", FALSE, etRVEC, {&value1}, "Description" },
 232         { "-v2", FALSE, etRVEC, {&value2}, "Description" },
 233         { "-v3", FALSE, etRVEC, {&value3}, "Description" }
 234     };
 235     const char *const cmdline[] = {
 236         "test", "-v1", "2", "1", "3", "-v2", "1"
 237     };
 238     parseFromArray(cmdline, 0, gmx::EmptyArrayRef(), pa);
 239     EXPECT_EQ(2.0, value1[XX]);
 240     EXPECT_EQ(1.0, value1[YY]);
 241     EXPECT_EQ(3.0, value1[ZZ]);
 242     EXPECT_EQ(1.0, value2[XX]);
 243     EXPECT_EQ(1.0, value2[YY]);
 244     EXPECT_EQ(1.0, value2[ZZ]);
 245     EXPECT_EQ(1.0, value3[XX]);
 246     EXPECT_EQ(2.0, value3[YY]);
 247     EXPECT_EQ(3.0, value3[ZZ]);
 248 }
 249
 250 TEST_F(ParseCommonArgsTest, ParsesTimeArgs)
 251 {
 252     real              value1 = 1.0, value2 = 2.0, value3 = 2.5;
 253     t_pargs           pa[]   = {
 254         { "-t1", FALSE, etTIME, {&value1}, "Description" },
 255         { "-t2", FALSE, etTIME, {&value2}, "Description" },
 256         { "-t3", FALSE, etTIME, {&value3}, "Description" }
 257     };
 258     const char *const cmdline[] = {
 259         "test", "-t1", "2", "-t2", "-.5"
 260     };
 261     parseFromArray(cmdline, 0, gmx::EmptyArrayRef(), pa);
 262     EXPECT_EQ( 2.0, value1);
 263     EXPECT_EQ(-0.5, value2);
 264     EXPECT_EQ( 2.5, value3);
 265 }
 266
 267 TEST_F(ParseCommonArgsTest, ParsesTimeArgsWithTimeUnit)
 268 {
 269     real              value1 = 1.0, value2 = 2.0, value3 = 2.5;
 270     t_pargs           pa[]   = {
 271         { "-t1", FALSE, etTIME, {&value1}, "Description" },
 272         { "-t2", FALSE, etTIME, {&value2}, "Description" },
 273         { "-t3", FALSE, etTIME, {&value3}, "Description" }
 274     };
 275     const char *const cmdline[] = {
 276         "test", "-t1", "2", "-t2", "-.5", "-tu", "ns"
 277     };
 278     parseFromArray(cmdline, PCA_TIME_UNIT, gmx::EmptyArrayRef(), pa);
 279     EXPECT_EQ( 2000.0, value1);
 280     EXPECT_EQ(-500.0, value2);
 281     EXPECT_EQ( 2.5, value3);
 282 }
 283
 284 TEST_F(ParseCommonArgsTest, ParsesEnumArgs)
 285 {
 286     const char       *value1[] = {NULL, "none", "on", "off", NULL };
 287     const char       *value2[] = {NULL, "def", "value", "value_other", NULL };
 288     const char       *value3[] = {NULL, "default", "value", NULL };
 289     t_pargs           pa[]     = {
 290         { "-s1", FALSE, etENUM, {value1}, "Description" },
 291         { "-s2", FALSE, etENUM, {value2}, "Description" },
 292         { "-s3", FALSE, etENUM, {value3}, "Description" }
 293     };
 294     const char *const cmdline[] = {
 295         "test", "-s1", "off", "-s2", "val"
 296     };
 297     parseFromArray(cmdline, 0, gmx::EmptyArrayRef(), pa);
 298     EXPECT_STREQ("off", value1[0]);
 299     EXPECT_STREQ("value", value2[0]);
 300     EXPECT_STREQ("default", value3[0]);
 301     EXPECT_EQ(value1[nenum(value1)], value1[0]);
 302     EXPECT_EQ(value2[nenum(value2)], value2[0]);
 303     EXPECT_EQ(value3[nenum(value3)], value3[0]);
 304 }
 305
 306 /********************************************************************
 307  * Tests for file name options (output files, not dependent on file system)
 308  */
 309
 310 TEST_F(ParseCommonArgsTest, ParsesFileArgs)
 311 {
 312     t_filenm          fnm[] = {
 313         { efXVG, "-o1", "out1", ffOPTWR },
 314         { efXVG, "-o2", "out2", ffOPTWR },
 315         { efXVG, "-om", "outm", ffWRMULT },
 316         { efXVG, "-om2", "outm2", ffWRMULT }
 317     };
 318     const char *const cmdline[] = {
 319         "test", "-o1", "-o2", "test", "-om", "test1", "test2.xvg", "-om2"
 320     };
 321     parseFromArray(cmdline, 0, fnm, gmx::EmptyArrayRef());
 322     EXPECT_STREQ("out1.xvg", opt2fn_null("-o1", nfile(), fnm));
 323     EXPECT_STREQ("test.xvg", opt2fn_null("-o2", nfile(), fnm));
 324     char **files;
 325     EXPECT_EQ(2, opt2fns(&files, "-om", nfile(), fnm));
 326     EXPECT_STREQ("test1.xvg", files[0]);
 327     EXPECT_STREQ("test2.xvg", files[1]);
 328     EXPECT_STREQ("outm2.xvg", opt2fn("-om2", nfile(), fnm));
 329     done_filenms(nfile(), fnm);
 330 }
 331
 332 TEST_F(ParseCommonArgsTest, ParsesFileArgsWithDefaults)
 333 {
 334     t_filenm          fnm[] = {
 335         { efTPS, NULL,  NULL,   ffWRITE },
 336         { efTRX, "-f2", NULL,   ffOPTWR },
 337         { efTRX, "-f3", "trj3", ffWRITE },
 338         { efXVG, "-o",  "out",  ffWRITE },
 339         { efXVG, "-om", "outm", ffWRMULT }
 340     };
 341     const char *const cmdline[] = {
 342         "test"
 343     };
 344     parseFromArray(cmdline, 0, fnm, gmx::EmptyArrayRef());
 345     EXPECT_STREQ("topol.tpr", ftp2fn(efTPS, nfile(), fnm));
 346     EXPECT_STREQ("traj.xtc", opt2fn("-f2", nfile(), fnm));
 347     EXPECT_NULL(opt2fn_null("-f2", nfile(), fnm));
 348     EXPECT_STREQ("trj3.xtc", opt2fn("-f3", nfile(), fnm));
 349     EXPECT_STREQ("out.xvg", opt2fn("-o", nfile(), fnm));
 350     EXPECT_STREQ("outm.xvg", opt2fn("-om", nfile(), fnm));
 351     done_filenms(nfile(), fnm);
 352 }
 353
 354 TEST_F(ParseCommonArgsTest, ParsesFileArgsWithDefaultFileName)
 355 {
 356     t_filenm          fnm[] = {
 357         { efTPS, "-s",  NULL,   ffWRITE },
 358         { efTRX, "-f2", NULL,   ffWRITE },
 359         { efTRX, "-f3", "trj3", ffWRITE },
 360         { efXVG, "-o",  "out",  ffWRITE },
 361         { efXVG, "-om", "outm", ffWRMULT }
 362     };
 363     const char *const cmdline[] = {
 364         "test", "-deffnm", "def", "-f2", "other", "-o"
 365     };
 366     parseFromArray(cmdline, PCA_CAN_SET_DEFFNM, fnm, gmx::EmptyArrayRef());
 367     EXPECT_STREQ("def.tpr", ftp2fn(efTPS, nfile(), fnm));
 368     EXPECT_STREQ("other.xtc", opt2fn("-f2", nfile(), fnm));
 369     EXPECT_STREQ("def.xtc", opt2fn("-f3", nfile(), fnm));
 370     EXPECT_STREQ("def.xvg", opt2fn("-o", nfile(), fnm));
 371     EXPECT_STREQ("def.xvg", opt2fn("-om", nfile(), fnm));
 372     done_filenms(nfile(), fnm);
 373 }
 374
 375 /********************************************************************
 376  * Tests for file name options (input files, dependent on file system contents)
 377  */
 378
 379 TEST_F(ParseCommonArgsTest, HandlesNonExistentInputFiles)
 380 {
 381     t_filenm          fnm[] = {
 382         { efTPS, "-s",  NULL,   ffREAD },
 383         { efTRX, "-f",  "trj",  ffREAD },
 384         { efTRX, "-f2", "trj2", ffREAD },
 385         { efTRX, "-f3", "trj3", ffREAD },
 386         { efTRX, "-f4", "trj4", ffREAD },
 387         { efGRO, "-g",  "cnf",  ffREAD },
 388         { efGRO, "-g2", "cnf2", ffREAD }
 389     };
 390     const char *const cmdline[] = {
 391         "test", "-f2", "-f3", "other", "-f4", "trj.gro", "-g2", "foo"
 392     };
 393     parseFromArray(cmdline, 0, fnm, gmx::EmptyArrayRef());
 394     EXPECT_STREQ("topol.tpr", ftp2fn(efTPS, nfile(), fnm));
 395     EXPECT_STREQ("trj.xtc", opt2fn("-f", nfile(), fnm));
 396     EXPECT_STREQ("trj2.xtc", opt2fn("-f2", nfile(), fnm));
 397     EXPECT_STREQ("other.xtc", opt2fn("-f3", nfile(), fnm));
 398     EXPECT_STREQ("trj.gro", opt2fn("-f4", nfile(), fnm));
 399     EXPECT_STREQ("cnf.gro", opt2fn("-g", nfile(), fnm));
 400     EXPECT_STREQ("foo.gro", opt2fn("-g2", nfile(), fnm));
 401     done_filenms(nfile(), fnm);
 402 }
 403
 404 TEST_F(ParseCommonArgsTest, HandlesCompressedFiles)
 405 {
 406     t_filenm          fnm[] = {
 407         { efTRX, "-f", NULL, ffREAD },
 408         { efGRO, "-g", NULL, ffREAD }
 409     };
 410     args_.append("test");
 411     std::string       expectedF = addFileArg("-f", ".pdb.gz", efFull);
 412     std::string       expectedG = addFileArg("-g", ".gro.Z", efFull);
 413     expectedF = gmx::Path::stripExtension(expectedF);
 414     expectedG = gmx::Path::stripExtension(expectedG);
 415     parseFromArgs(0, fnm, gmx::EmptyArrayRef());
 416     EXPECT_EQ(expectedF, opt2fn("-f", nfile(), fnm));
 417     EXPECT_EQ(expectedG, opt2fn("-g", nfile(), fnm));
 418     done_filenms(nfile(), fnm);
 419 }
 420
 421 TEST_F(ParseCommonArgsTest, AcceptsUnknownTrajectoryExtension)
 422 {
 423     t_filenm          fnm[] = {
 424         { efTRX, "-f", NULL, ffREAD }
 425     };
 426     args_.append("test");
 427     std::string       expected = addFileArg("-f", ".foo", efFull);
 428     parseFromArgs(0, fnm, gmx::EmptyArrayRef());
 429     EXPECT_EQ(expected, opt2fn("-f", nfile(), fnm));
 430     done_filenms(nfile(), fnm);
 431 }
 432
 433 TEST_F(ParseCommonArgsTest, CompletesExtensionFromExistingFile)
 434 {
 435     t_filenm          fnm[] = {
 436         { efTRX, "-f1", NULL, ffREAD },
 437         { efTRX, "-f2", NULL, ffREAD },
 438         { efTRX, "-f3", NULL, ffREAD },
 439         { efTRX, "-f4", NULL, ffREAD }
 440     };
 441     args_.append("test");
 442     std::string       expected1 = addFileArg("-f1", "1.xtc", efNoExtension);
 443     std::string       expected2 = addFileArg("-f2", "2.gro", efNoExtension);
 444     std::string       expected3 = addFileArg("-f3", "3.tng", efNoExtension);
 445     std::string       expected4 = addFileArg("-f4", ".gro", efEmptyValue);
 446     std::string       def4      = gmx::Path::stripExtension(expected4);
 447     fnm[3].fn = def4.c_str();
 448     parseFromArgs(0, fnm, gmx::EmptyArrayRef());
 449     EXPECT_EQ(expected1, opt2fn("-f1", nfile(), fnm));
 450     EXPECT_EQ(expected2, opt2fn("-f2", nfile(), fnm));
 451     EXPECT_EQ(expected3, opt2fn("-f3", nfile(), fnm));
 452     EXPECT_EQ(expected4, opt2fn("-f4", nfile(), fnm));
 453     done_filenms(nfile(), fnm);
 454 }
 455
 456 TEST_F(ParseCommonArgsTest, CompletesExtensionFromExistingFileWithDefaultFileName)
 457 {
 458     t_filenm          fnm[] = {
 459         { efTRX, "-f1", NULL,  ffREAD },
 460         { efTPX, "-f2", "foo", ffREAD },
 461         { efTRX, "-f3", NULL,  ffREAD },
 462         { efSTX, "-f4", NULL,  ffREAD }
 463     };
 464     args_.append("test");
 465     std::string       expected1 = addFileArg("-f1", "1.trr", efNoExtension);
 466     std::string       expected2 = addFileArg("-f2", ".tpa", efEmptyValue);
 467     std::string       expected3 = addFileArg("-f3", ".trr", efEmptyValue);
 468     std::string       expected4 = addFileArg(NULL, ".pdb", efEmptyValue);
 469     std::string       deffnm    = gmx::Path::stripExtension(expected3);
 470     args_.append("-deffnm");
 471     args_.append(deffnm);
 472     parseFromArgs(PCA_CAN_SET_DEFFNM, fnm, gmx::EmptyArrayRef());
 473     EXPECT_EQ(expected1, opt2fn("-f1", nfile(), fnm));
 474     EXPECT_EQ(expected2, opt2fn("-f2", nfile(), fnm));
 475     EXPECT_EQ(expected3, opt2fn("-f3", nfile(), fnm));
 476     EXPECT_EQ(expected4, opt2fn("-f4", nfile(), fnm));
 477     done_filenms(nfile(), fnm);
 478 }
 479
 480 /********************************************************************
 481  * Tests for general behavior
 482  */
 483
 484 TEST_F(ParseCommonArgsTest, HandlesNonReadNode)
 485 {
 486     t_filenm          fnm[] = {
 487         { efTPS, "-s",  NULL,  ffREAD },
 488         { efTRX, "-f",  NULL,  ffREAD },
 489         { efTRX, "-f2", NULL,  ffREAD }
 490     };
 491     const char *const cmdline[] = {
 492         "test", "-f", "-f2", "other"
 493     };
 494     parseFromArray(cmdline, PCA_NOT_READ_NODE, fnm, gmx::EmptyArrayRef());
 495     EXPECT_NULL(fnm[0].fns);
 496     EXPECT_NULL(fnm[1].fns);
 497     EXPECT_NULL(fnm[2].fns);
 498     done_filenms(nfile(), fnm);
 499 }
 500
 501 TEST_F(ParseCommonArgsTest, HandlesNonReadNodeWithDefaultFileName)
 502 {
 503     t_filenm          fnm[] = {
 504         { efTPS, "-s",  NULL,  ffREAD },
 505         { efTRX, "-f",  NULL,  ffREAD },
 506         { efTRX, "-f2", NULL,  ffREAD }
 507     };
 508     const char *const cmdline[] = {
 509         "test", "-deffnm", "def", "-f", "-f2", "other"
 510     };
 511     parseFromArray(cmdline, PCA_CAN_SET_DEFFNM | PCA_NOT_READ_NODE, fnm, gmx::EmptyArrayRef());
 512     EXPECT_NULL(fnm[0].fns);
 513     EXPECT_NULL(fnm[1].fns);
 514     EXPECT_NULL(fnm[2].fns);
 515     done_filenms(nfile(), fnm);
 516 }
 517
 518 TEST_F(ParseCommonArgsTest, CanKeepUnknownArgs)
 519 {
 520     int               ivalue = 0;
 521     gmx_bool          bvalue = FALSE;
 522     t_pargs           pa[]   = {
 523         { "-i", FALSE, etINT, {&ivalue}, "Description" },
 524         { "-b", FALSE, etBOOL, {&bvalue}, "Description" },
 525     };
 526     t_filenm          fnm[] = {
 527         { efXVG, "-o1", "out1", ffOPTWR },
 528         { efXVG, "-o2", "out2", ffOPTWR }
 529     };
 530     const char *const cmdline[] = {
 531         "test", "foo", "-unk", "-o1", "-unk2", "-o2", "test",
 532         "-i", "2", "-unk3", "-b", "-unk4"
 533     };
 534     parseFromArray(cmdline, PCA_NOEXIT_ON_ARGS, fnm, pa);
 535     EXPECT_EQ(2, ivalue);
 536     EXPECT_TRUE(bvalue);
 537     EXPECT_STREQ("out1.xvg", opt2fn_null("-o1", nfile(), fnm));
 538     EXPECT_STREQ("test.xvg", opt2fn_null("-o2", nfile(), fnm));
 539     EXPECT_EQ(6, args_.argc());
 540     EXPECT_STREQ(cmdline[0],  args_.arg(0));
 541     EXPECT_STREQ(cmdline[1],  args_.arg(1));
 542     EXPECT_STREQ(cmdline[2],  args_.arg(2));
 543     EXPECT_STREQ(cmdline[4],  args_.arg(3));
 544     EXPECT_STREQ(cmdline[9],  args_.arg(4));
 545     EXPECT_STREQ(cmdline[11], args_.arg(5));
 546     done_filenms(nfile(), fnm);
 547 }
 548
 549 } // namespace