src/gromacs/commandline/tests/pargs.cpp

   1 /*
   2  * This file is part of the GROMACS molecular simulation package.
   3  *
   4  * Copyright (c) 2013,2014,2015,2016,2017,2018,2019, by the GROMACS development team, led by
   5  * Mark Abraham, David van der Spoel, Berk Hess, and Erik Lindahl,
   6  * and including many others, as listed in the AUTHORS file in the
   7  * top-level source directory and at http://www.gromacs.org.
   8  *
   9  * GROMACS is free software; you can redistribute it and/or
  10  * modify it under the terms of the GNU Lesser General Public License
  11  * as published by the Free Software Foundation; either version 2.1
  12  * of the License, or (at your option) any later version.
  13  *
  14  * GROMACS is distributed in the hope that it will be useful,
  15  * but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
  16  * MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the GNU
  17  * Lesser General Public License for more details.
  18  *
  19  * You should have received a copy of the GNU Lesser General Public
  20  * License along with GROMACS; if not, see
  21  * http://www.gnu.org/licenses, or write to the Free Software Foundation,
  22  * Inc., 51 Franklin Street, Fifth Floor, Boston, MA  02110-1301  USA.
  23  *
  24  * If you want to redistribute modifications to GROMACS, please
  25  * consider that scientific software is very special. Version
  26  * control is crucial - bugs must be traceable. We will be happy to
  27  * consider code for inclusion in the official distribution, but
  28  * derived work must not be called official GROMACS. Details are found
  29  * in the README & COPYING files - if they are missing, get the
  30  * official version at http://www.gromacs.org.
  31  *
  32  * To help us fund GROMACS development, we humbly ask that you cite
  33  * the research papers on the package. Check out http://www.gromacs.org.
  34  */
  35 /*! \internal \file
  36  * \brief
  37  * Tests parse_common_args().
  38  *
  39  * Currently, negative tests are not possible, because those trigger
  40  * gmx_fatal() and terminate the whole test binary.
  41  *
  42  * \author Teemu Murtola <teemu.murtola@gmail.com>
  43  * \ingroup module_commandline
  44  */
  45 #include "gmxpre.h"
  46
  47 #include "gromacs/commandline/pargs.h"
  48
  49 #include <string>
  50
  51 #include <gtest/gtest.h>
  52
  53 #include "gromacs/utility/arrayref.h"
  54 #include "gromacs/utility/path.h"
  55 #include "gromacs/utility/stringutil.h"
  56 #include "gromacs/utility/textwriter.h"
  57
  58 #include "testutils/cmdlinetest.h"
  59 #include "testutils/testasserts.h"
  60 #include "testutils/testfilemanager.h"
  61
  62 namespace
  63 {
  64
  65 using gmx::test::CommandLine;
  66
  67 class ParseCommonArgsTest : public ::testing::Test
  68 {
  69 public:
  70     enum FileArgumentType
  71     {
  72         efFull,
  73         efNoExtension,
  74         efEmptyValue
  75     };
  76
  77     ParseCommonArgsTest() : oenv_(nullptr), fileCount_(0) {}
  78     ~ParseCommonArgsTest() override { output_env_done(oenv_); }
  79
  80     int nfile() const { return fileCount_; }
  81
  82     void parseFromArgs(unsigned long flags, gmx::ArrayRef<t_filenm> fnm, gmx::ArrayRef<t_pargs> pa)
  83     {
  84         fileCount_ = fnm.size();
  85         bool bOk   = parse_common_args(&args_.argc(), args_.argv(), flags, fnm.size(), fnm.data(),
  86                                      pa.size(), pa.data(), 0, nullptr, 0, nullptr, &oenv_);
  87         EXPECT_TRUE(bOk);
  88     }
  89     void parseFromArray(gmx::ArrayRef<const char* const> cmdline,
  90                         unsigned long                    flags,
  91                         gmx::ArrayRef<t_filenm>          fnm,
  92                         gmx::ArrayRef<t_pargs>           pa)
  93     {
  94         args_.initFromArray(cmdline);
  95         parseFromArgs(flags, fnm, pa);
  96     }
  97     std::string addFileArg(const char* name, const char* extension, FileArgumentType type)
  98     {
  99         std::string filename(tempFiles_.getTemporaryFilePath(extension));
 100         gmx::TextWriter::writeFileFromString(filename, "Dummy file");
 101         if (name != nullptr)
 102         {
 103             args_.append(name);
 104             switch (type)
 105             {
 106                 case efFull: args_.append(filename); break;
 107                 case efNoExtension: args_.append(gmx::Path::stripExtension(filename)); break;
 108                 case efEmptyValue: break;
 109             }
 110         }
 111         return filename;
 112     }
 113
 114     // This must be a member that persists until the end of the test,
 115     // because string arguments are not duplicated in the output.
 116     CommandLine args_;
 117
 118 private:
 119     gmx_output_env_t*          oenv_;
 120     size_t                     fileCount_;
 121     gmx::test::TestFileManager tempFiles_;
 122 };
 123
 124 /********************************************************************
 125  * Tests for different types of options
 126  */
 127
 128 TEST_F(ParseCommonArgsTest, ParsesIntegerArgs)
 129 {
 130     int               value1 = 0, value2 = 0, value3 = 3;
 131     t_pargs           pa[]      = { { "-i1", FALSE, etINT, { &value1 }, "Description" },
 132                      { "-i2", FALSE, etINT, { &value2 }, "Description" },
 133                      { "-i3", FALSE, etINT, { &value3 }, "Description" } };
 134     const char* const cmdline[] = { "test", "-i1", "2", "-i2", "-3" };
 135     parseFromArray(cmdline, 0, {}, pa);
 136     EXPECT_EQ(2, value1);
 137     EXPECT_EQ(-3, value2);
 138     EXPECT_EQ(3, value3);
 139 }
 140
 141 TEST_F(ParseCommonArgsTest, ParsesInt64Args)
 142 {
 143     int64_t           value1 = 0, value2 = 0, value3 = 3;
 144     t_pargs           pa[]      = { { "-i1", FALSE, etINT64, { &value1 }, "Description" },
 145                      { "-i2", FALSE, etINT64, { &value2 }, "Description" },
 146                      { "-i3", FALSE, etINT64, { &value3 }, "Description" } };
 147     const char* const cmdline[] = { "test", "-i1", "2", "-i2", "-3" };
 148     parseFromArray(cmdline, 0, {}, pa);
 149     EXPECT_EQ(2, value1);
 150     EXPECT_EQ(-3, value2);
 151     EXPECT_EQ(3, value3);
 152 }
 153
 154 TEST_F(ParseCommonArgsTest, ParsesRealArgs)
 155 {
 156     real              value1 = 0.0, value2 = 0.0, value3 = 2.5;
 157     t_pargs           pa[]      = { { "-r1", FALSE, etREAL, { &value1 }, "Description" },
 158                      { "-r2", FALSE, etREAL, { &value2 }, "Description" },
 159                      { "-r3", FALSE, etREAL, { &value3 }, "Description" } };
 160     const char* const cmdline[] = { "test", "-r1", "2", "-r2", "-.5" };
 161     parseFromArray(cmdline, 0, {}, pa);
 162     EXPECT_EQ(2.0, value1);
 163     EXPECT_EQ(-0.5, value2);
 164     EXPECT_EQ(2.5, value3);
 165 }
 166
 167 TEST_F(ParseCommonArgsTest, ParsesStringArgs)
 168 {
 169     const char *      value1 = "def", *value2 = "", *value3 = "default";
 170     t_pargs           pa[]      = { { "-s1", FALSE, etSTR, { &value1 }, "Description" },
 171                      { "-s2", FALSE, etSTR, { &value2 }, "Description" },
 172                      { "-s3", FALSE, etSTR, { &value3 }, "Description" } };
 173     const char* const cmdline[] = { "test", "-s1", "", "-s2", "test" };
 174     parseFromArray(cmdline, 0, {}, pa);
 175     EXPECT_STREQ("", value1);
 176     EXPECT_STREQ("test", value2);
 177     EXPECT_STREQ("default", value3);
 178 }
 179
 180 TEST_F(ParseCommonArgsTest, ParsesBooleanArgs)
 181 {
 182     gmx_bool          value1 = TRUE, value2 = FALSE, value3 = TRUE;
 183     t_pargs           pa[]      = { { "-b1", FALSE, etBOOL, { &value1 }, "Description" },
 184                      { "-b2", FALSE, etBOOL, { &value2 }, "Description" },
 185                      { "-b3", FALSE, etBOOL, { &value3 }, "Description" } };
 186     const char* const cmdline[] = { "test", "-nob1", "-b2" };
 187     parseFromArray(cmdline, 0, {}, pa);
 188     EXPECT_FALSE(value1);
 189     EXPECT_TRUE(value2);
 190     EXPECT_TRUE(value3);
 191 }
 192
 193 TEST_F(ParseCommonArgsTest, ParsesVectorArgs)
 194 {
 195     rvec              value1 = { 0, 0, 0 }, value2 = { 0, 0, 0 }, value3 = { 1, 2, 3 };
 196     t_pargs           pa[]      = { { "-v1", FALSE, etRVEC, { &value1 }, "Description" },
 197                      { "-v2", FALSE, etRVEC, { &value2 }, "Description" },
 198                      { "-v3", FALSE, etRVEC, { &value3 }, "Description" } };
 199     const char* const cmdline[] = { "test", "-v1", "2", "1", "3", "-v2", "1" };
 200     parseFromArray(cmdline, 0, {}, pa);
 201     EXPECT_EQ(2.0, value1[XX]);
 202     EXPECT_EQ(1.0, value1[YY]);
 203     EXPECT_EQ(3.0, value1[ZZ]);
 204     EXPECT_EQ(1.0, value2[XX]);
 205     EXPECT_EQ(1.0, value2[YY]);
 206     EXPECT_EQ(1.0, value2[ZZ]);
 207     EXPECT_EQ(1.0, value3[XX]);
 208     EXPECT_EQ(2.0, value3[YY]);
 209     EXPECT_EQ(3.0, value3[ZZ]);
 210 }
 211
 212 TEST_F(ParseCommonArgsTest, ParsesTimeArgs)
 213 {
 214     real              value1 = 1.0, value2 = 2.0, value3 = 2.5;
 215     t_pargs           pa[]      = { { "-t1", FALSE, etTIME, { &value1 }, "Description" },
 216                      { "-t2", FALSE, etTIME, { &value2 }, "Description" },
 217                      { "-t3", FALSE, etTIME, { &value3 }, "Description" } };
 218     const char* const cmdline[] = { "test", "-t1", "2", "-t2", "-.5" };
 219     parseFromArray(cmdline, 0, {}, pa);
 220     EXPECT_EQ(2.0, value1);
 221     EXPECT_EQ(-0.5, value2);
 222     EXPECT_EQ(2.5, value3);
 223 }
 224
 225 TEST_F(ParseCommonArgsTest, ParsesTimeArgsWithTimeUnit)
 226 {
 227     real              value1 = 1.0, value2 = 2.0, value3 = 2.5;
 228     t_pargs           pa[]      = { { "-t1", FALSE, etTIME, { &value1 }, "Description" },
 229                      { "-t2", FALSE, etTIME, { &value2 }, "Description" },
 230                      { "-t3", FALSE, etTIME, { &value3 }, "Description" } };
 231     const char* const cmdline[] = { "test", "-t1", "2", "-t2", "-.5", "-tu", "ns" };
 232     parseFromArray(cmdline, PCA_TIME_UNIT, {}, pa);
 233     EXPECT_EQ(2000.0, value1);
 234     EXPECT_EQ(-500.0, value2);
 235     EXPECT_EQ(2.5, value3);
 236 }
 237
 238 TEST_F(ParseCommonArgsTest, ParsesEnumArgs)
 239 {
 240     const char*       value1[]  = { nullptr, "none", "on", "off", nullptr };
 241     const char*       value2[]  = { nullptr, "def", "value", "value_other", nullptr };
 242     const char*       value3[]  = { nullptr, "default", "value", nullptr };
 243     t_pargs           pa[]      = { { "-s1", FALSE, etENUM, { value1 }, "Description" },
 244                      { "-s2", FALSE, etENUM, { value2 }, "Description" },
 245                      { "-s3", FALSE, etENUM, { value3 }, "Description" } };
 246     const char* const cmdline[] = { "test", "-s1", "off", "-s2", "val" };
 247     parseFromArray(cmdline, 0, {}, pa);
 248     EXPECT_STREQ("off", value1[0]);
 249     EXPECT_STREQ("value", value2[0]);
 250     EXPECT_STREQ("default", value3[0]);
 251     EXPECT_EQ(value1[nenum(value1)], value1[0]);
 252     EXPECT_EQ(value2[nenum(value2)], value2[0]);
 253     EXPECT_EQ(value3[nenum(value3)], value3[0]);
 254 }
 255
 256 /********************************************************************
 257  * Tests for file name options (output files, not dependent on file system)
 258  */
 259
 260 TEST_F(ParseCommonArgsTest, ParsesFileArgs)
 261 {
 262     t_filenm          fnm[]     = { { efXVG, "-o1", "out1", ffOPTWR },
 263                        { efXVG, "-o2", "out2", ffOPTWR },
 264                        { efXVG, "-om", "outm", ffWRMULT },
 265                        { efXVG, "-om2", "outm2", ffWRMULT } };
 266     const char* const cmdline[] = { "test", "-o1",   "-o2",       "test",
 267                                     "-om",  "test1", "test2.xvg", "-om2" };
 268     parseFromArray(cmdline, 0, fnm, {});
 269     EXPECT_STREQ("out1.xvg", opt2fn_null("-o1", nfile(), fnm));
 270     EXPECT_STREQ("test.xvg", opt2fn_null("-o2", nfile(), fnm));
 271     gmx::ArrayRef<const std::string> files = opt2fns("-om", nfile(), fnm);
 272     EXPECT_EQ(2, files.size());
 273     if (files.size() != 2)
 274     {
 275         EXPECT_STREQ("test1.xvg", files[0].c_str());
 276         EXPECT_STREQ("test2.xvg", files[1].c_str());
 277     }
 278     EXPECT_STREQ("outm2.xvg", opt2fn("-om2", nfile(), fnm));
 279 }
 280
 281 TEST_F(ParseCommonArgsTest, ParsesFileArgsWithDefaults)
 282 {
 283     t_filenm          fnm[]     = { { efTPS, nullptr, nullptr, ffWRITE },
 284                        { efTRX, "-f2", nullptr, ffOPTWR },
 285                        { efTRX, "-f3", "trj3", ffWRITE },
 286                        { efXVG, "-o", "out", ffWRITE },
 287                        { efXVG, "-om", "outm", ffWRMULT } };
 288     const char* const cmdline[] = { "test" };
 289     parseFromArray(cmdline, 0, fnm, {});
 290     EXPECT_STREQ("topol.tpr", ftp2fn(efTPS, nfile(), fnm));
 291     EXPECT_STREQ("traj.xtc", opt2fn("-f2", nfile(), fnm));
 292     EXPECT_EQ(nullptr, opt2fn_null("-f2", nfile(), fnm));
 293     EXPECT_STREQ("trj3.xtc", opt2fn("-f3", nfile(), fnm));
 294     EXPECT_STREQ("out.xvg", opt2fn("-o", nfile(), fnm));
 295     EXPECT_STREQ("outm.xvg", opt2fn("-om", nfile(), fnm));
 296 }
 297
 298 TEST_F(ParseCommonArgsTest, ParsesFileArgsWithDefaultFileName)
 299 {
 300     t_filenm          fnm[]     = { { efTPS, "-s", nullptr, ffWRITE },
 301                        { efTRX, "-f2", nullptr, ffWRITE },
 302                        { efTRX, "-f3", "trj3", ffWRITE },
 303                        { efXVG, "-o", "out", ffWRITE },
 304                        { efXVG, "-om", "outm", ffWRMULT } };
 305     const char* const cmdline[] = { "test", "-deffnm", "def", "-f2", "other", "-o" };
 306     parseFromArray(cmdline, PCA_CAN_SET_DEFFNM, fnm, {});
 307     EXPECT_STREQ("def.tpr", ftp2fn(efTPS, nfile(), fnm));
 308     EXPECT_STREQ("other.xtc", opt2fn("-f2", nfile(), fnm));
 309     EXPECT_STREQ("def.xtc", opt2fn("-f3", nfile(), fnm));
 310     EXPECT_STREQ("def.xvg", opt2fn("-o", nfile(), fnm));
 311     EXPECT_STREQ("def.xvg", opt2fn("-om", nfile(), fnm));
 312 }
 313
 314 TEST_F(ParseCommonArgsTest, ParseFileArgsWithCustomDefaultExtension)
 315 {
 316     t_filenm          fnm[]     = { { efTRX, "-o1", "conf1.gro", ffWRITE },
 317                        { efTRX, "-o2", "conf2.pdb", ffWRITE },
 318                        { efTRX, "-o3", "conf3.gro", ffWRITE } };
 319     const char* const cmdline[] = { "test", "-o2", "-o3", "test" };
 320     parseFromArray(cmdline, PCA_CAN_SET_DEFFNM, fnm, {});
 321     EXPECT_STREQ("conf1.gro", opt2fn("-o1", nfile(), fnm));
 322     EXPECT_STREQ("conf2.pdb", opt2fn("-o2", nfile(), fnm));
 323     EXPECT_STREQ("test.gro", opt2fn("-o3", nfile(), fnm));
 324 }
 325
 326 /********************************************************************
 327  * Tests for file name options (input files, dependent on file system contents)
 328  */
 329
 330 TEST_F(ParseCommonArgsTest, HandlesNonExistentInputFiles)
 331 {
 332     t_filenm          fnm[] = { { efTPS, "-s", nullptr, ffREAD }, { efTRX, "-f", "trj", ffREAD },
 333                        { efTRX, "-f2", "trj2", ffREAD }, { efTRX, "-f3", "trj3", ffREAD },
 334                        { efTRX, "-f4", "trj4", ffREAD }, { efGRO, "-g", "cnf", ffREAD },
 335                        { efGRO, "-g2", "cnf2", ffREAD } };
 336     const char* const cmdline[] = { "test", "-f2", "-f3", "other", "-f4", "trj.gro", "-g2", "foo" };
 337     parseFromArray(cmdline, PCA_DISABLE_INPUT_FILE_CHECKING, fnm, {});
 338     EXPECT_STREQ("topol.tpr", ftp2fn(efTPS, nfile(), fnm));
 339     EXPECT_STREQ("trj.xtc", opt2fn("-f", nfile(), fnm));
 340     EXPECT_STREQ("trj2.xtc", opt2fn("-f2", nfile(), fnm));
 341     EXPECT_STREQ("other.xtc", opt2fn("-f3", nfile(), fnm));
 342     EXPECT_STREQ("trj.gro", opt2fn("-f4", nfile(), fnm));
 343     EXPECT_STREQ("cnf.gro", opt2fn("-g", nfile(), fnm));
 344     EXPECT_STREQ("foo.gro", opt2fn("-g2", nfile(), fnm));
 345 }
 346
 347 TEST_F(ParseCommonArgsTest, HandlesNonExistentOptionalInputFiles)
 348 {
 349     t_filenm fnm[] = { { efTPS, "-s", nullptr, ffOPTRD }, { efTRX, "-f", "trj", ffOPTRD } };
 350     const char* const cmdline[] = { "test" };
 351     parseFromArray(cmdline, 0, fnm, {});
 352     EXPECT_STREQ("topol.tpr", ftp2fn(efTPS, nfile(), fnm));
 353     EXPECT_STREQ("trj.xtc", opt2fn("-f", nfile(), fnm));
 354 }
 355
 356 TEST_F(ParseCommonArgsTest, AcceptsNonExistentInputFilesIfSpecified)
 357 {
 358     t_filenm          fnm[]     = { { efCPT, "-c", "file1", ffOPTRD | ffALLOW_MISSING },
 359                        { efCPT, "-c2", "file2", ffOPTRD | ffALLOW_MISSING },
 360                        { efCPT, "-c3", "file3", ffOPTRD | ffALLOW_MISSING },
 361                        { efCPT, "-c4", "file4", ffOPTRD | ffALLOW_MISSING },
 362                        { efTRX, "-f", "trj", ffOPTRD | ffALLOW_MISSING } };
 363     const char* const cmdline[] = { "test",        "-c2",        "-c3",
 364                                     "nonexistent", "-c4",        "nonexistent.cpt",
 365                                     "-f",          "nonexistent" };
 366     parseFromArray(cmdline, 0, fnm, {});
 367     EXPECT_STREQ("file1.cpt", opt2fn("-c", nfile(), fnm));
 368     EXPECT_STREQ("file2.cpt", opt2fn("-c2", nfile(), fnm));
 369     EXPECT_STREQ("nonexistent.cpt", opt2fn("-c3", nfile(), fnm));
 370     EXPECT_STREQ("nonexistent.cpt", opt2fn("-c4", nfile(), fnm));
 371     EXPECT_STREQ("nonexistent.xtc", opt2fn("-f", nfile(), fnm));
 372 }
 373
 374 TEST_F(ParseCommonArgsTest, HandlesCompressedFiles)
 375 {
 376     t_filenm fnm[] = { { efTRX, "-f", nullptr, ffREAD }, { efGRO, "-g", nullptr, ffREAD } };
 377     args_.append("test");
 378     std::string expectedF = addFileArg("-f", ".pdb.gz", efFull);
 379     std::string expectedG = addFileArg("-g", ".gro.Z", efFull);
 380     expectedF             = gmx::Path::stripExtension(expectedF);
 381     expectedG             = gmx::Path::stripExtension(expectedG);
 382     parseFromArgs(0, fnm, {});
 383     EXPECT_EQ(expectedF, opt2fn("-f", nfile(), fnm));
 384     EXPECT_EQ(expectedG, opt2fn("-g", nfile(), fnm));
 385 }
 386
 387 TEST_F(ParseCommonArgsTest, AcceptsUnknownTrajectoryExtension)
 388 {
 389     t_filenm fnm[] = { { efTRX, "-f", nullptr, ffREAD } };
 390     args_.append("test");
 391     std::string expected = addFileArg("-f", ".foo", efFull);
 392     parseFromArgs(0, fnm, {});
 393     EXPECT_EQ(expected, opt2fn("-f", nfile(), fnm));
 394 }
 395
 396 TEST_F(ParseCommonArgsTest, CompletesExtensionFromExistingFile)
 397 {
 398     args_.append("test");
 399     std::string expected1 = addFileArg("-f1", "1.xtc", efNoExtension);
 400     std::string expected2 = addFileArg("-f2", "2.gro", efNoExtension);
 401     std::string expected3 = addFileArg("-f3", "3.tng", efNoExtension);
 402     std::string expected4 = addFileArg("-f4", ".gro", efEmptyValue);
 403     std::string def4      = gmx::Path::stripExtension(expected4);
 404     t_filenm    fnm[]     = { { efTRX, "-f1", nullptr, ffREAD },
 405                        { efTRX, "-f2", nullptr, ffREAD },
 406                        { efTRX, "-f3", nullptr, ffREAD },
 407                        { efTRX, "-f4", def4.c_str(), ffREAD } };
 408     parseFromArgs(0, fnm, {});
 409     EXPECT_EQ(expected1, opt2fn("-f1", nfile(), fnm));
 410     EXPECT_EQ(expected2, opt2fn("-f2", nfile(), fnm));
 411     EXPECT_EQ(expected3, opt2fn("-f3", nfile(), fnm));
 412     EXPECT_EQ(expected4, opt2fn("-f4", nfile(), fnm));
 413 }
 414
 415 TEST_F(ParseCommonArgsTest, CompletesExtensionFromExistingFileWithDefaultFileName)
 416 {
 417     t_filenm fnm[] = { { efTRX, "-f1", nullptr, ffREAD },
 418                        { efSTO, "-f2", "foo", ffREAD },
 419                        { efTRX, "-f3", nullptr, ffREAD },
 420                        { efSTX, "-f4", nullptr, ffREAD } };
 421     args_.append("test");
 422     std::string expected1 = addFileArg("-f1", "1.trr", efNoExtension);
 423     std::string expected2 = addFileArg("-f2", ".pdb", efEmptyValue);
 424     std::string expected3 = addFileArg("-f3", ".trr", efEmptyValue);
 425     std::string expected4 = addFileArg(nullptr, ".pdb", efEmptyValue);
 426     std::string deffnm    = gmx::Path::stripExtension(expected3);
 427     args_.append("-deffnm");
 428     args_.append(deffnm);
 429     parseFromArgs(PCA_CAN_SET_DEFFNM, fnm, {});
 430     EXPECT_EQ(expected1, opt2fn("-f1", nfile(), fnm));
 431     EXPECT_EQ(expected2, opt2fn("-f2", nfile(), fnm));
 432     EXPECT_EQ(expected3, opt2fn("-f3", nfile(), fnm));
 433     EXPECT_EQ(expected4, opt2fn("-f4", nfile(), fnm));
 434 }
 435
 436 // This is needed e.g. for tune_pme, which passes unknown arguments on
 437 // to child mdrun processes that it spawns.
 438 TEST_F(ParseCommonArgsTest, CanKeepUnknownArgs)
 439 {
 440     int      ivalue = 0;
 441     gmx_bool bvalue = FALSE;
 442     t_pargs  pa[]   = {
 443         { "-i", FALSE, etINT, { &ivalue }, "Description" },
 444         { "-b", FALSE, etBOOL, { &bvalue }, "Description" },
 445     };
 446     t_filenm fnm[] = { { efXVG, "-o1", "out1", ffOPTWR }, { efXVG, "-o2", "out2", ffOPTWR } };
 447     const char* const cmdline[] = { "test", "foo", "-unk", "-o1",   "-unk2", "-o2",
 448                                     "test", "-i",  "2",    "-unk3", "-b",    "-unk4" };
 449     parseFromArray(cmdline, PCA_NOEXIT_ON_ARGS, fnm, pa);
 450     EXPECT_EQ(2, ivalue);
 451     EXPECT_TRUE(bvalue);
 452     EXPECT_STREQ("out1.xvg", opt2fn_null("-o1", nfile(), fnm));
 453     EXPECT_STREQ("test.xvg", opt2fn_null("-o2", nfile(), fnm));
 454     EXPECT_EQ(6, args_.argc());
 455     EXPECT_STREQ(cmdline[0], args_.arg(0));
 456     EXPECT_STREQ(cmdline[1], args_.arg(1));
 457     EXPECT_STREQ(cmdline[2], args_.arg(2));
 458     EXPECT_STREQ(cmdline[4], args_.arg(3));
 459     EXPECT_STREQ(cmdline[9], args_.arg(4));
 460     EXPECT_STREQ(cmdline[11], args_.arg(5));
 461 }
 462
 463 } // namespace