src/gromacs/applied_forces/tests/densityfittingoptions.cpp

   1 /*
   2  * This file is part of the GROMACS molecular simulation package.
   3  *
   4  * Copyright (c) 2019, by the GROMACS development team, led by
   5  * Mark Abraham, David van der Spoel, Berk Hess, and Erik Lindahl,
   6  * and including many others, as listed in the AUTHORS file in the
   7  * top-level source directory and at http://www.gromacs.org.
   8  *
   9  * GROMACS is free software; you can redistribute it and/or
  10  * modify it under the terms of the GNU Lesser General Public License
  11  * as published by the Free Software Foundation; either version 2.1
  12  * of the License, or (at your option) any later version.
  13  *
  14  * GROMACS is distributed in the hope that it will be useful,
  15  * but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
  16  * MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the GNU
  17  * Lesser General Public License for more details.
  18  *
  19  * You should have received a copy of the GNU Lesser General Public
  20  * License along with GROMACS; if not, see
  21  * http://www.gnu.org/licenses, or write to the Free Software Foundation,
  22  * Inc., 51 Franklin Street, Fifth Floor, Boston, MA  02110-1301  USA.
  23  *
  24  * If you want to redistribute modifications to GROMACS, please
  25  * consider that scientific software is very special. Version
  26  * control is crucial - bugs must be traceable. We will be happy to
  27  * consider code for inclusion in the official distribution, but
  28  * derived work must not be called official GROMACS. Details are found
  29  * in the README & COPYING files - if they are missing, get the
  30  * official version at http://www.gromacs.org.
  31  *
  32  * To help us fund GROMACS development, we humbly ask that you cite
  33  * the research papers on the package. Check out http://www.gromacs.org.
  34  */
  35 /*! \internal \file
  36  * \brief
  37  * Tests for density fitting module options.
  38  *
  39  * \author Christian Blau <blau@kth.se>
  40  * \ingroup module_applied_forces
  41  */
  42 #include "gmxpre.h"
  43
  44 #include "gromacs/applied_forces/densityfittingoptions.h"
  45
  46 #include <gtest/gtest.h>
  47
  48 #include "gromacs/options/options.h"
  49 #include "gromacs/options/treesupport.h"
  50 #include "gromacs/utility/keyvaluetreebuilder.h"
  51 #include "gromacs/utility/keyvaluetreemdpwriter.h"
  52 #include "gromacs/utility/keyvaluetreetransform.h"
  53 #include "gromacs/utility/stringcompare.h"
  54 #include "gromacs/utility/stringstream.h"
  55 #include "gromacs/utility/textwriter.h"
  56
  57 #include "testutils/testasserts.h"
  58 #include "testutils/testmatchers.h"
  59
  60
  61 namespace gmx
  62 {
  63
  64 namespace
  65 {
  66
  67 TEST(DensityFittingOptionsTest, DefaultParameters)
  68 {
  69     DensityFittingOptions densityFittingOptions;
  70     EXPECT_FALSE(densityFittingOptions.buildParameters().active_);
  71 }
  72
  73 TEST(DensityFittingOptionsTest, OptionSetsActive)
  74 {
  75     DensityFittingOptions densityFittingOptions;
  76     EXPECT_FALSE(densityFittingOptions.buildParameters().active_);
  77
  78     // Prepare MDP inputs
  79     KeyValueTreeBuilder mdpValueBuilder;
  80     mdpValueBuilder.rootObject().addValue("density-guided-simulation-active",
  81                                           std::string("yes"));
  82     KeyValueTreeObject  densityFittingMdpValues = mdpValueBuilder.build();
  83
  84     // set up options
  85     Options densityFittingModuleOptions;
  86     densityFittingOptions.initMdpOptions(&densityFittingModuleOptions);
  87
  88     // Add rules to transform mdp inputs to densityFittingModule data
  89     KeyValueTreeTransformer transform;
  90     transform.rules()->addRule().keyMatchType("/", StringCompareType::CaseAndDashInsensitive);
  91
  92     densityFittingOptions.initMdpTransform(transform.rules());
  93
  94     // Execute the transform on the mdpValues
  95     auto transformedMdpValues = transform.transform(densityFittingMdpValues, nullptr);
  96     assignOptionsFromKeyValueTree(&densityFittingModuleOptions, transformedMdpValues.object(), nullptr);
  97
  98     EXPECT_TRUE(densityFittingOptions.buildParameters().active_);
  99 }
 100
 101 TEST(DensityFittingOptionsTest, OutputDefaultValues)
 102 {
 103     // Transform module data into a flat key-value tree for output.
 104
 105     StringOutputStream        stream;
 106     KeyValueTreeBuilder       builder;
 107     KeyValueTreeObjectBuilder builderObject = builder.rootObject();
 108
 109     DensityFittingOptions     densityFittingOptions;
 110     densityFittingOptions.buildMdpOutput(&builderObject);
 111
 112     {
 113         TextWriter writer(&stream);
 114         writeKeyValueTreeAsMdp(&writer, builder.build());
 115     }
 116     stream.close();
 117
 118     EXPECT_EQ(stream.toString(), std::string("density-guided-simulation-active = false\n"));
 119 }
 120
 121 } // namespace
 122
 123 } // namespace gmx