src/gromacs/applied_forces/qmmm/tests/sample_cp2k_input.inp

   1 &GLOBAL
   2   PRINT_LEVEL LOW
   3   PROJECT GROMACS
   4   RUN_TYPE ENERGY_FORCE
   5 &END GLOBAL
   6 &FORCE_EVAL
   7   METHOD QMMM
   8   &DFT
   9     ChArGe 2    !Some comment
  10     MuLtIpLiCiTy   3  !Another comment
  11     BASIS_SET_FILE_NAME  BASIS_MOLOPT
  12     POTENTIAL_FILE_NAME  POTENTIAL
  13     &MGRID
  14       NGRIDS 5
  15       CUTOFF 450
  16       REL_CUTOFF 50
  17       COMMENSURATE
  18     &END MGRID
  19     &SCF
  20       SCF_GUESS RESTART
  21       EPS_SCF 5.0E-8
  22       MAX_SCF 20
  23       &OT  T
  24         MINIMIZER  DIIS
  25         STEPSIZE   0.15
  26         PRECONDITIONER FULL_ALL
  27       &END OT
  28       &OUTER_SCF  T
  29         MAX_SCF 20
  30         EPS_SCF 5.0E-8
  31       &END OUTER_SCF
  32     &END SCF
  33     &XC
  34       DENSITY_CUTOFF     1.0E-12
  35       GRADIENT_CUTOFF    1.0E-12
  36       TAU_CUTOFF         1.0E-12
  37       &XC_FUNCTIONAL PBE
  38       &END XC_FUNCTIONAL
  39     &END XC
  40     &QS
  41      METHOD GPW
  42      EPS_DEFAULT 1.0E-10
  43      EXTRAPOLATION ASPC
  44      EXTRAPOLATION_ORDER  4
  45     &END QS
  46   &END DFT
  47   &QMMM
  48     &CELL
  49       A 16.180 0.000 0.000
  50       B 0.000 10.000 0.000
  51       C 0.000 0.000 17.680
  52       PERIODIC XYZ
  53     &END CELL
  54     CENTER EVERY_STEP
  55     CENTER_TYPE PBC_AWARE_MAX_MINUS_MIN
  56     ECOUPL GAUSS
  57     USE_GEEP_LIB 12
  58     &PERIODIC
  59       GMAX     1.0E+00
  60       &MULTIPOLE ON
  61          RCUT     1.0E+01
  62          EWALD_PRECISION     1.0E-06
  63       &END
  64     &END PERIODIC
  65     &QM_KIND H
  66       MM_INDEX 2 4 6 9 11 13 15 18 20 22 24 26
  67     &END QM_KIND
  68     &QM_KIND C
  69       MM_INDEX 1 3 5 7 8 10 12 14 16 17 19 21 23 25
  70     &END QM_KIND
  71   &END QMMM
  72   &MM
  73     &FORCEFIELD
  74       DO_NONBONDED FALSE
  75     &END FORCEFIELD
  76     &POISSON
  77       &EWALD
  78         EWALD_TYPE NONE
  79       &END EWALD
  80     &END POISSON
  81   &END MM
  82   &SUBSYS
  83     &CELL
  84       A 200.000 0.000 0.000
  85       B 0.000 200.000 0.000
  86       C 0.000 0.000 200.000
  87       PERIODIC XYZ
  88     &END CELL
  89     &TOPOLOGY
  90       COORD_FILE_NAME path/to/some_generic.pdb !one more comment
  91       COORD_FILE_FORMAT PDB
  92       CHARGE_EXTENDED TRUE
  93       CONNECTIVITY OFF
  94       &GENERATE
  95          &ISOLATED_ATOMS
  96             LIST 1..26
  97          &END
  98       &END GENERATE
  99     &END TOPOLOGY
 100     &KIND H
 101       ELEMENT H
 102       BASIS_SET DZVP-MOLOPT-GTH
 103       POTENTIAL GTH-PBE
 104     &END KIND
 105     &KIND C
 106       ELEMENT C
 107       BASIS_SET DZVP-MOLOPT-GTH
 108       POTENTIAL GTH-PBE
 109     &END KIND
 110     &KIND X
 111       ELEMENT H
 112     &END KIND
 113   &END SUBSYS
 114 &END FORCE_EVAL