Added QMMMOptions class for managing mdp and KVT I/O
[alexxy/gromacs.git] / src / gromacs / applied_forces / qmmm / tests / refdata / QMMMOptionsTest_CP2KInputProcessing.xml
1 <?xml version="1.0"?>
2 <?xml-stylesheet type="text/xsl" href="referencedata.xsl"?>
3 <ReferenceData>
4   <String Name="CP2K input">&amp;GLOBAL
5   PRINT_LEVEL LOW
6   PROJECT GROMACS
7   RUN_TYPE ENERGY_FORCE
8 &amp;END GLOBAL
9 &amp;FORCE_EVAL
10   METHOD QMMM
11   &amp;DFT
12     ChArGe 2    !Some comment
13     MuLtIpLiCiTy   3  !Another comment
14     BASIS_SET_FILE_NAME  BASIS_MOLOPT
15     POTENTIAL_FILE_NAME  POTENTIAL
16     &amp;MGRID
17       NGRIDS 5
18       CUTOFF 450
19       REL_CUTOFF 50
20       COMMENSURATE
21     &amp;END MGRID
22     &amp;SCF
23       SCF_GUESS RESTART
24       EPS_SCF 5.0E-8
25       MAX_SCF 20
26       &amp;OT  T
27         MINIMIZER  DIIS
28         STEPSIZE   0.15
29         PRECONDITIONER FULL_ALL
30       &amp;END OT
31       &amp;OUTER_SCF  T
32         MAX_SCF 20
33         EPS_SCF 5.0E-8
34       &amp;END OUTER_SCF
35     &amp;END SCF
36     &amp;XC
37       DENSITY_CUTOFF     1.0E-12
38       GRADIENT_CUTOFF    1.0E-12
39       TAU_CUTOFF         1.0E-12
40       &amp;XC_FUNCTIONAL PBE
41       &amp;END XC_FUNCTIONAL
42     &amp;END XC
43     &amp;QS
44      METHOD GPW
45      EPS_DEFAULT 1.0E-10
46      EXTRAPOLATION ASPC
47      EXTRAPOLATION_ORDER  4
48     &amp;END QS
49   &amp;END DFT
50   &amp;QMMM
51     &amp;CELL
52       A 16.180 0.000 0.000
53       B 0.000 10.000 0.000
54       C 0.000 0.000 17.680
55       PERIODIC XYZ
56     &amp;END CELL
57     CENTER EVERY_STEP
58     CENTER_TYPE PBC_AWARE_MAX_MINUS_MIN
59     ECOUPL GAUSS
60     USE_GEEP_LIB 12
61     &amp;PERIODIC
62       GMAX     1.0E+00
63       &amp;MULTIPOLE ON
64          RCUT     1.0E+01
65          EWALD_PRECISION     1.0E-06
66       &amp;END
67     &amp;END PERIODIC
68     &amp;QM_KIND H  
69       MM_INDEX 2 4 6 9 11 13 15 18 20 22 24 26
70     &amp;END QM_KIND
71     &amp;QM_KIND C  
72       MM_INDEX 1 3 5 7 8 10 12 14 16 17 19 21 23 25
73     &amp;END QM_KIND
74   &amp;END QMMM
75   &amp;MM
76     &amp;FORCEFIELD
77       DO_NONBONDED FALSE
78     &amp;END FORCEFIELD
79     &amp;POISSON
80       &amp;EWALD
81         EWALD_TYPE NONE
82       &amp;END EWALD
83     &amp;END POISSON
84   &amp;END MM
85   &amp;SUBSYS
86     &amp;CELL
87       A 200.000 0.000 0.000
88       B 0.000 200.000 0.000
89       C 0.000 0.000 200.000
90       PERIODIC XYZ
91     &amp;END CELL
92     &amp;TOPOLOGY
93       COORD_FILE_NAME %s !one more comment
94       COORD_FILE_FORMAT PDB
95       CHARGE_EXTENDED TRUE
96       CONNECTIVITY OFF
97       &amp;GENERATE
98          &amp;ISOLATED_ATOMS
99             LIST 1..26
100          &amp;END
101       &amp;END GENERATE
102     &amp;END TOPOLOGY
103     &amp;KIND H  
104       ELEMENT H  
105       BASIS_SET DZVP-MOLOPT-GTH
106       POTENTIAL GTH-PBE
107     &amp;END KIND
108     &amp;KIND C  
109       ELEMENT C  
110       BASIS_SET DZVP-MOLOPT-GTH
111       POTENTIAL GTH-PBE
112     &amp;END KIND
113     &amp;KIND X
114       ELEMENT H
115     &amp;END KIND
116   &amp;END SUBSYS
117 &amp;END FORCE_EVAL
118 </String>
119   <Int Name="QM charge">2</Int>
120   <Int Name="QM multiplicity">3</Int>
121 </ReferenceData>