src/contrib/init_sh.h

   1 /*
   2  * $Id$
   3  *
   4  *                This source code is part of
   5  *
   6  *                 G   R   O   M   A   C   S
   7  *
   8  *          GROningen MAchine for Chemical Simulations
   9  *
  10  *                        VERSION 3.0
  11  *
  12  * Copyright (c) 1991-2001
  13  * BIOSON Research Institute, Dept. of Biophysical Chemistry
  14  * University of Groningen, The Netherlands
  15  *
  16  * This program is free software; you can redistribute it and/or
  17  * modify it under the terms of the GNU General Public License
  18  * as published by the Free Software Foundation; either version 2
  19  * of the License, or (at your option) any later version.
  20  *
  21  * If you want to redistribute modifications, please consider that
  22  * scientific software is very special. Version control is crucial -
  23  * bugs must be traceable. We will be happy to consider code for
  24  * inclusion in the official distribution, but derived work must not
  25  * be called official GROMACS. Details are found in the README & COPYING
  26  * files - if they are missing, get the official version at www.gromacs.org.
  27  *
  28  * To help us fund GROMACS development, we humbly ask that you cite
  29  * the papers on the package - you can find them in the top README file.
  30  *
  31  * Do check out http://www.gromacs.org , or mail us at gromacs@gromacs.org .
  32  *
  33  * And Hey:
  34  * Gromacs Runs On Most of All Computer Systems
  35  */
  36
  37 #ifndef _init_sh_h
  38 #define _init_sh_h
  39
  40 static char *SRCID_init_sh_h = "$Id$";
  41 #include <stdio.h>
  42 #include "typedefs.h"
  43
  44 typedef struct {
  45   int     nnucl;
  46   atom_id shell;                /* The shell id                         */
  47   atom_id nucl1,nucl2,nucl3;    /* The nuclei connected to the shell    */
  48   real    k;                    /* force constant                       */
  49   real    k_1;                  /* 1 over force constant                */
  50 } t_shell;
  51
  52 extern t_shell *init_shells(FILE *log,int start,int homenr,
  53                             t_idef *idef,t_mdatoms *md,int *nshell);
  54
  55 extern int relax_shells(FILE *log,t_commrec *cr,bool bVerbose,
  56                         int mdstep,t_parm *parm,bool bDoNS,bool bStopCM,
  57                         t_topology *top,real ener[],
  58                         rvec x[],rvec vold[],rvec v[],rvec vt[],rvec f[],
  59                         rvec buf[],t_mdatoms *md,t_nsborder *nsb,t_nrnb *nrnb,
  60                         t_graph *graph,t_groups *grps,tensor vir_part,
  61                         tensor pme_vir_part,
  62                         int nshell,t_shell shells[],t_forcerec *fr,
  63                         char *traj,real t,real lambda,rvec mu_tot,
  64                         int natoms,matrix box,bool *bConverged);
  65
  66 #endif