src/config.h.cmakein

   1 /*
   2  * This file is part of the GROMACS molecular simulation package.
   3  *
   4  * Copyright (c) 2012, by the GROMACS development team, led by
   5  * David van der Spoel, Berk Hess, Erik Lindahl, and including many
   6  * others, as listed in the AUTHORS file in the top-level source
   7  * directory and at http://www.gromacs.org.
   8  *
   9  * GROMACS is free software; you can redistribute it and/or
  10  * modify it under the terms of the GNU Lesser General Public License
  11  * as published by the Free Software Foundation; either version 2.1
  12  * of the License, or (at your option) any later version.
  13  *
  14  * GROMACS is distributed in the hope that it will be useful,
  15  * but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
  16  * MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the GNU
  17  * Lesser General Public License for more details.
  18  *
  19  * You should have received a copy of the GNU Lesser General Public
  20  * License along with GROMACS; if not, see
  21  * http://www.gnu.org/licenses, or write to the Free Software Foundation,
  22  * Inc., 51 Franklin Street, Fifth Floor, Boston, MA  02110-1301  USA.
  23  *
  24  * If you want to redistribute modifications to GROMACS, please
  25  * consider that scientific software is very special. Version
  26  * control is crucial - bugs must be traceable. We will be happy to
  27  * consider code for inclusion in the official distribution, but
  28  * derived work must not be called official GROMACS. Details are found
  29  * in the README & COPYING files - if they are missing, get the
  30  * official version at http://www.gromacs.org.
  31  *
  32  * To help us fund GROMACS development, we humbly ask that you cite
  33  * the research papers on the package. Check out http://www.gromacs.org.
  34  */
  35 /* Manually created from config.h.in to work with cmake */
  36
  37 /* Disable warnings about double-to-float conversion accuracy loss on MSVC */
  38 #ifdef _MSC_VER
  39 #pragma warning (disable : 4305)
  40 #pragma warning (disable : 4244)
  41 #pragma warning (disable : 4101)
  42 #pragma warning (disable : 4996)
  43 #pragma warning (disable : 4267)
  44 #pragma warning (disable : 4090)
  45 #endif
  46
  47 #include "gmx_header_config.h"
  48
  49 /* Name of package (translate from cmake to autoconf macro name) */
  50 #define PACKAGE  "@PROJECT_NAME@"
  51
  52 /* Version number of package (translate from cmake to autoconf macro name) */
  53 #define VERSION  "@PROJECT_VERSION@"
  54
  55 /* Use the version string from generated version.h */
  56 #cmakedefine USE_VERSION_H
  57
  58 /* Default location of data files */
  59 #define GMXLIBDIR "@GMXLIBDIR@"
  60
  61 /* Turn off water-water neighborlist optimization only - not used right now */
  62 #cmakedefine DISABLE_WATERWATER_NLIST
  63
  64 /* Turn off all water neighborlist optimization - not used right now */
  65 #cmakedefine DISABLE_WATER_NLIST
  66
  67 /* IEEE754 floating-point format. Memory layout is defined by macros
  68  * GMX_IEEE754_BIG_ENDIAN_BYTE_ORDER and GMX_IEEE754_BIG_ENDIAN_WORD_ORDER.
  69  */
  70 #cmakedefine GMX_FLOAT_FORMAT_IEEE754
  71
  72 /* Work around broken calloc() */
  73 #cmakedefine GMX_BROKEN_CALLOC
  74
  75 /* Enable special hacks for Cray XT3 */
  76 #cmakedefine GMX_CRAY_XT3
  77
  78 /* Do not optimize FFTW setups (not needed with SSE FFT kernels) */
  79 #cmakedefine GMX_DISABLE_FFTW_MEASURE
  80
  81 /* Compile in double precision */
  82 #cmakedefine GMX_DOUBLE
  83
  84 /* Use Built-in FFTPACK FFT library */
  85 #cmakedefine GMX_FFT_FFTPACK
  86
  87 /* Use FFTW3 FFT library */
  88 #cmakedefine GMX_FFT_FFTW3
  89
  90 /* Use Intel MKL FFT library */
  91 #cmakedefine GMX_FFT_MKL
  92
  93 /* Use AMD core math library */
  94 #cmakedefine GMX_FFT_ACML
  95
  96 /* SSE2 instructions available */
  97 #cmakedefine GMX_X86_SSE2
  98
  99 /* SSE4.1 instructions available */
 100 #cmakedefine GMX_X86_SSE4_1
 101
 102 /* AVX 128-bit FMA instructions available */
 103 #cmakedefine GMX_X86_AVX_128_FMA
 104
 105 /* AVX 256-bit instructions available */
 106 #cmakedefine GMX_X86_AVX_256
 107
 108 /* GCC bug in AVX maskload/maskstore arguments - worked around internally */
 109 #cmakedefine GMX_X86_AVX_GCC_MASKLOAD_BUG
 110
 111 /* SSE2 was selected as CPU acceleration level */
 112 #cmakedefine GMX_CPU_ACCELERATION_X86_SSE2
 113
 114 /* SSE4.1 was selected as CPU acceleration level */
 115 #cmakedefine GMX_CPU_ACCELERATION_X86_SSE4_1
 116
 117 /* AVX 128-bit FMA was selected as CPU acceleration level */
 118 #cmakedefine GMX_CPU_ACCELERATION_X86_AVX_128_FMA
 119
 120 /* AVX 256-bit was selected as CPU acceleration level */
 121 #cmakedefine GMX_CPU_ACCELERATION_X86_AVX_256
 122
 123 /* IBM QPX was selected as CPU acceleration type (e.g. BlueGene/Q) */
 124 #cmakedefine GMX_CPU_ACCELERATION_IBM_QPX
 125
 126 /* String for CPU acceleration choice (for writing to log files and stdout) */
 127 #define GMX_CPU_ACCELERATION_STRING "@GMX_CPU_ACCELERATION@"
 128
 129 /* Integer byte order is big endian. */
 130 #cmakedefine GMX_INTEGER_BIG_ENDIAN
 131
 132 /* Use our own instead of system XDR libraries */
 133 #cmakedefine GMX_INTERNAL_XDR
 134
 135 /* Use MPI (with mpicc) for parallelization */
 136 #cmakedefine GMX_LIB_MPI
 137
 138 /* MPI_IN_PLACE exists for collective operations */
 139 #cmakedefine MPI_IN_PLACE_EXISTS
 140
 141 /* Make a parallel version of GROMACS using message passing
 142    (MPI or thread_mpi) */
 143 #cmakedefine GMX_MPI
 144
 145 /* Use threads_mpi for parallelization */
 146 #cmakedefine GMX_THREAD_MPI
 147
 148 /* Use OpenMP multithreading */
 149 #cmakedefine GMX_OPENMP
 150
 151 /* Ignore calls to nice(3) */
 152 #cmakedefine GMX_NO_NICE
 153
 154 /* Ignore calls to system(3) */
 155 #cmakedefine GMX_NO_SYSTEM
 156
 157 /* Use (modified) Gamess-UK for QM-MM calculations */
 158 #cmakedefine GMX_QMMM_GAMESS
 159
 160 /* Use (modified) Gaussian0x for QM-MM calculations */
 161 #cmakedefine GMX_QMMM_GAUSSIAN
 162
 163 /* Use (modified) Mopac 7 for QM-MM calculations */
 164 #cmakedefine GMX_QMMM_MOPAC
 165
 166 /* Use the GROMACS software 1/sqrt(x) */
 167 #cmakedefine GMX_SOFTWARE_INVSQRT
 168
 169 /* Use sub-counters */
 170 #cmakedefine GMX_CYCLE_SUBCOUNTERS
 171
 172 /* Compile with plugin support */
 173 #cmakedefine GMX_USE_PLUGINS
 174
 175 /* Fallback path for VMD plug-ins */
 176 #define GMX_VMD_PLUGIN_PATH "@GMX_VMD_PLUGIN_PATH@"
 177
 178 /* Define when pthreads are used */
 179 #cmakedefine THREAD_PTHREADS
 180
 181 /* Define when Windows threads are used */
 182 #cmakedefine THREAD_WINDOWS
 183
 184 /* Define when thread-MPI atomic operations are available */
 185 #cmakedefine TMPI_ATOMICS
 186
 187 /* Define for busy wait option  */
 188 #cmakedefine TMPI_WAIT_FOR_NO_ONE
 189
 190 /* Define for copy buffer option */
 191 #cmakedefine TMPI_COPY_BUFFER
 192
 193 /* Define for profiling option */
 194 #cmakedefine TMPI_PROFILE
 195
 196 /* Define for Linux pthread_setaffinity */
 197 #cmakedefine HAVE_PTHREAD_SETAFFINITY
 198
 199 /* Define for Windows NUMA-aware allocator functions*/
 200 #cmakedefine TMPI_WINDOWS_NUMA_API
 201
 202 /* Define for sysconf() */
 203 #cmakedefine HAVE_SYSCONF
 204
 205 /* Define for GetSystemInfo() */
 206 #cmakedefine HAVE_SYSTEM_INFO
 207
 208 /* Enable x86 gcc inline assembly */
 209 #cmakedefine GMX_X86_GCC_INLINE_ASM
 210
 211 /* Use GPU native acceleration */
 212 #cmakedefine GMX_GPU
 213
 214 /* Define to 1 if the system has the type gmx_bool. */
 215 #cmakedefine HAVE_BOOL
 216
 217 /* Define to 1 if fseeko (and presumably ftello) exists and is declared. */
 218 #cmakedefine HAVE_FSEEKO
 219
 220 /* Define to 1 if _fseeki64 (and presumably _fseeki64) exists and is declared. */
 221 #cmakedefine HAVE__FSEEKI64
 222
 223 /* Define to 1 if you have the m library (-lm). */
 224 #cmakedefine HAVE_LIBM
 225
 226 /* Define to 1 if you have the mkl library (-lmkl). */
 227 #cmakedefine HAVE_LIBMKL
 228
 229 /* Define to 1 if you have the gsl library (-lgsl). */
 230 #cmakedefine HAVE_LIBGSL
 231
 232 /* Define to 1 if you have the dl library (-ldl). */
 233 #cmakedefine HAVE_LIBDL
 234
 235 /* Have io.h (windows)*/
 236 #cmakedefine HAVE_IO_H
 237
 238 /* Define to 1 if you have the strcasecmp() function. */
 239 #cmakedefine HAVE_STRCASECMP
 240
 241 /* Define to 1 if you have the strdup() function. */
 242 #cmakedefine HAVE_STRDUP
 243
 244 /* Define to 1 if you have the vfprintf() function. */
 245 #cmakedefine HAVE_VFPRINTF
 246
 247 /* Define to 1 if you have the memcmp() function. */
 248 #cmakedefine HAVE_MEMCMP
 249
 250 /* Define to 1 if you have the posix_memalign() function. */
 251 #cmakedefine HAVE_POSIX_MEMALIGN
 252
 253 /* Define to 1 if you have the memalign() function. */
 254 #cmakedefine HAVE_MEMALIGN
 255
 256 /* Define to 1 if you have the MSVC _aligned_malloc() function. */
 257 #cmakedefine HAVE__ALIGNED_MALLOC
 258
 259 /* Define to 1 if you have the gettimeofday() function. */
 260 #cmakedefine HAVE_GETTIMEOFDAY
 261
 262 /* Define to 1 if you have the cbrt() function. */
 263 #cmakedefine HAVE_CBRT
 264
 265 /* Define to 1 if you have the isnan() function. */
 266 #cmakedefine HAVE_ISNAN
 267
 268 /* Define to 1 if you have the _isnan() function. */
 269 #cmakedefine HAVE__ISNAN
 270
 271 /* Define to 1 if you have the isfinite() function. */
 272 #cmakedefine HAVE_ISFINITE
 273
 274 /* Define to 1 if you have the _isfinite() function. */
 275 #cmakedefine HAVE__ISFINITE
 276
 277 /* Define to 1 if you have the _finite() function. */
 278 #cmakedefine HAVE__FINITE
 279
 280 /* Define to 1 if you have the fsync() function. */
 281 #cmakedefine HAVE_FSYNC
 282
 283 /* Define to 1 if you have the Windows _commit() function. */
 284 #cmakedefine HAVE__COMMIT
 285
 286 /* Define to 1 if you have the fileno() function. */
 287 #cmakedefine HAVE_FILENO
 288
 289 /* Define to 1 if you have the _fileno() function. */
 290 #cmakedefine HAVE__FILENO
 291
 292 /* Define to 1 if you have the sigaction() function. */
 293 #cmakedefine HAVE_SIGACTION
 294
 295 /* Define to 1 if you have the rsqrt() function. */
 296 #cmakedefine HAVE_RSQRT
 297
 298 /* Define to 1 if you have the rsqrtf() function. */
 299 #cmakedefine HAVE_RSQRTF
 300
 301 /* Define to 1 if you have the sqrtf() function. */
 302 #cmakedefine HAVE_SQRTF
 303
 304 /* Define to 1 if you have the <string.h> header file. */
 305 #cmakedefine HAVE_STRING_H
 306
 307 /* Define to 1 if yo have the <math.h> header file. */
 308 #cmakedefine HAVE_MATH_H
 309
 310 /* Define to 1 if yo have the <limits.h> header file. */
 311 #cmakedefine HAVE_LIMITS_H
 312
 313 /* Define to 1 if yo have the <memory.h> header file. */
 314 #cmakedefine HAVE_MEMORY_H
 315
 316 /* Define to 1 if yo have the <unistd.h> header file. */
 317 #cmakedefine HAVE_UNISTD_H
 318
 319 /* Define to 1 if yo have the <direct.h> header file. */
 320 #cmakedefine HAVE_DIRECT_H
 321
 322 /* Define to 1 if yo have the <pwd.h> header file. */
 323 #cmakedefine HAVE_PWD_H
 324
 325 /* Define to 1 if yo have the <stdint.h> header file. */
 326 #cmakedefine HAVE_STDINT_H
 327
 328 /* Define to 1 if yo have the <stdlib.h> header file. */
 329 #cmakedefine HAVE_STDLIB_H
 330
 331 /* Define to 1 if yo have the <pthread.h> header file. */
 332 #cmakedefine HAVE_PTHREAD_H
 333
 334 /* Define to 1 if yo have the <dirent.h> header file. */
 335 #cmakedefine HAVE_DIRENT_H
 336
 337 /* Define to 1 if yo have the <inttypes.h> header file. */
 338 #cmakedefine HAVE_INTTYPES_H
 339
 340 /* Define to 1 if yo have the <regex.h> header file. */
 341 #cmakedefine HAVE_REGEX_H
 342
 343 /* Define to 1 if you have the <sys/types.h> header file. */
 344 #cmakedefine HAVE_SYS_TYPES_H
 345
 346 /* Define to 1 if you have the <sys/stat.h> header file. */
 347 #cmakedefine HAVE_SYS_STAT_H
 348
 349 /* Define to 1 if you have the <sys/time.h> header file. */
 350 #cmakedefine HAVE_SYS_TIME_H
 351
 352 /* Define to 1 if you have the <rpc/rpc.h> header file. */
 353 #cmakedefine HAVE_RPC_RPC_H
 354
 355 /* Define to 1 if you have the <rpc/xdr.h> header file. */
 356 #cmakedefine HAVE_RPC_XDR_H
 357
 358 /* Define to 1 if you have the <x86intrin.h> header file */
 359 #cmakedefine HAVE_X86INTRIN_H
 360
 361 /* Define to 1 if you have the <intrin.h> header file */
 362 #cmakedefine HAVE_INTRIN_H
 363
 364 /* Define to 1 if you have the <sched.h> header */
 365 #cmakedefine HAVE_SCHED_H
 366
 367 /* Define to 1 if you have the vprintf() function. */
 368 #cmakedefine HAVE_VPRINTF
 369
 370 /* Define to 1 if you have the sysconf() function */
 371 #cmakedefine HAVE_SYSCONF
 372
 373 /* Define to 1 if you have the sched_getaffinity() function */
 374 #cmakedefine HAVE_SCHED_GETAFFINITY
 375
 376 /* Define to 1 if you have the sched_setaffinity() function */
 377 #cmakedefine HAVE_SCHED_SETAFFINITY
 378
 379 /* Bytes in IEEE fp word are in big-endian order if set, little-endian if not.
 380    Only relevant when FLOAT_FORMAT_IEEE754 is defined. */
 381 #cmakedefine GMX_IEEE754_BIG_ENDIAN_BYTE_ORDER
 382
 383 /* The two words in a double precision variable are in b ig-endian order if
 384    set, little-endian if not. Do NOT assume this is the same as the byte
 385    order! Only relevant when FLOAT_FORMAT_IEEE754 is defined. */
 386 #cmakedefine GMX_IEEE754_BIG_ENDIAN_WORD_ORDER
 387
 388 /* Define if SIGUSR1 is present */
 389 #cmakedefine HAVE_SIGUSR1
 390
 391 /* The size of int, as computed by sizeof. */
 392 #cmakedefine SIZEOF_INT @SIZEOF_INT@
 393
 394 /* The size of long int, as computed by sizeof. */
 395 #cmakedefine SIZEOF_LONG_INT @SIZEOF_LONG_INT@
 396
 397 /* The size of long long int, as computed by sizeof. */
 398 #cmakedefine SIZEOF_LONG_LONG_INT @SIZEOF_LONG_LONG_INT@
 399
 400 /* The size of off_t, as computed by sizeof. */
 401 #cmakedefine SIZEOF_OFF_T @SIZEOF_OFF_T@
 402
 403 /* The size of void*, as computed by sizeof. */
 404 #cmakedefine SIZEOF_VOIDP @SIZEOF_VOIDP@
 405
 406 /* Define to 1 to make fseeko visible on some hosts (e.g. glibc 2.2). */
 407 #cmakedefine _LARGEFILE_SOURCE
 408
 409 /* Define for large files, on AIX-style hosts. */
 410 #cmakedefine _LARGE_FILES
 411
 412 /* Some systems requires this to be set to 64 for large file support */
 413 #cmakedefine _FILE_OFFSET_BITS @_FILE_OFFSET_BITS@
 414
 415 /* Gromacs shortcut define for fseeko & ftello being present with 64-bit support */
 416 #cmakedefine GMX_LARGEFILES
 417
 418 /* Define to int if <sys/types.h> does not define. */
 419 #cmakedefine gid_t int
 420
 421 /* Define to __inline__ or __inline if that is what the C compiler
 422    calls it, or to nothing if inline is not supported under any name.
 423    Please do NOT remove the gmx_inline keyword from here. The classical
 424    C++ inline keyword is merely a recommendation to the compiler, and
 425    many compilers support stronger alternatives (e.g. __forceinline)
 426    that we might want to use. */
 427 #define gmx_inline ${INLINE_KEYWORD}
 428 #ifndef __cplusplus
 429 #define inline ${INLINE_KEYWORD}
 430 #endif
 431
 432 /* Define to __restrict__ or __restrict if that is what the C compiler
 433    calls it, unless we are on C99 when it is simply called restrict.
 434    Since restrict is a reserved key word in C99 we are not allowed to
 435    redefine the word itself, so call this gmx_restrict to avoid having
 436    to identify the language standard level. If it is not supported, it
 437    is still defined to an empty string here. */
 438 #define gmx_restrict ${RESTRICT_KEYWORD}
 439
 440 #ifndef CPLUSPLUS
 441 #ifdef __cplusplus
 442 #define CPLUSPLUS
 443 #endif
 444 #endif
 445
 446 /* Define to long int if <sys/types.h> does not define. */
 447 #cmakedefine off_t int
 448
 449 /* Define to unsigned int if <sys/types.h> does not define. */
 450 #cmakedefine size_t int
 451
 452 /* Define to int if <sys/types.h> does not define. */
 453 #cmakedefine uid_t int
 454
 455 /* Build special-purpose mdrun library */
 456 #cmakedefine GMX_FAHCORE
 457
 458 /* Enable gromacs quotes */
 459 #cmakedefine GMX_COOL_QUOTES
 460
 461 #ifdef GMX_FAHCORE
 462 #define FULLINDIRECT 1
 463 #define USE_FAH_XDR  1
 464 #include "swindirect.h"
 465 #endif
 466
 467 /* default name mangling maybe wrong on exotic plattforms */
 468 #define F77_FUNC(name,NAME) name ## _
 469
 470 /* Define if we have pipes */
 471 #cmakedefine HAVE_PIPES
 472
 473
 474 /* Catch stupid CMake problems on OS X */
 475 #ifdef __APPLE__
 476 #  if ((defined(__LP64__) && __LP64__ && defined(SIZEOF_VOIDP) && SIZEOF_VOIDP<8) || ( (!defined(__LP64__) || __LP64__==0) && (defined(SIZEOF_VOIDP) && SIZEOF_VOIDP>4)))
 477 #    error "Inconsistency between current OS X architecture and the one used to generate original"
 478 #    error "CMake configuration. This is probably caused by starting CMake with the default value"
 479 #    error "for CMAKE_OSX_ARCHITECTURES (blank), and then changing it. In this case all the tests"
 480 #    error "will have been performed with the original (now incorrect) architecture."
 481 #    error "To fix this, set CMAKE_OSX_ARCHITECTURES on the _command_line_ before starting CMake,"
 482 #    error "or create a new such entry with your choice in the GUI _before_ hitting 'configure'."
 483 #  endif
 484 #endif