src/config.h.cmakein

   1 /*
   2  * This file is part of the GROMACS molecular simulation package.
   3  *
   4  * Copyright (c) 2012, by the GROMACS development team, led by
   5  * David van der Spoel, Berk Hess, Erik Lindahl, and including many
   6  * others, as listed in the AUTHORS file in the top-level source
   7  * directory and at http://www.gromacs.org.
   8  *
   9  * GROMACS is free software; you can redistribute it and/or
  10  * modify it under the terms of the GNU Lesser General Public License
  11  * as published by the Free Software Foundation; either version 2.1
  12  * of the License, or (at your option) any later version.
  13  *
  14  * GROMACS is distributed in the hope that it will be useful,
  15  * but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
  16  * MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the GNU
  17  * Lesser General Public License for more details.
  18  *
  19  * You should have received a copy of the GNU Lesser General Public
  20  * License along with GROMACS; if not, see
  21  * http://www.gnu.org/licenses, or write to the Free Software Foundation,
  22  * Inc., 51 Franklin Street, Fifth Floor, Boston, MA  02110-1301  USA.
  23  *
  24  * If you want to redistribute modifications to GROMACS, please
  25  * consider that scientific software is very special. Version
  26  * control is crucial - bugs must be traceable. We will be happy to
  27  * consider code for inclusion in the official distribution, but
  28  * derived work must not be called official GROMACS. Details are found
  29  * in the README & COPYING files - if they are missing, get the
  30  * official version at http://www.gromacs.org.
  31  *
  32  * To help us fund GROMACS development, we humbly ask that you cite
  33  * the research papers on the package. Check out http://www.gromacs.org.
  34  */
  35 /* Manually created from config.h.in to work with cmake */
  36
  37 /* Disable warnings about double-to-float conversion accuracy loss on MSVC */
  38 #ifdef _MSC_VER
  39 #pragma warning (disable : 4305)
  40 #pragma warning (disable : 4244)
  41 #pragma warning (disable : 4101)
  42 #pragma warning (disable : 4996)
  43 #pragma warning (disable : 4267)
  44 #pragma warning (disable : 4090)
  45 #endif
  46
  47 /* Name of package (translate from cmake to autoconf macro name) */
  48 #define PACKAGE  "@PROJECT_NAME@"
  49
  50 /* Version number of package (translate from cmake to autoconf macro name) */
  51 #define VERSION  "@PROJECT_VERSION@"
  52
  53 /* Use the version string from generated version.h */
  54 #cmakedefine USE_VERSION_H
  55
  56 /* Default location of data files */
  57 #define GMXLIBDIR "@GMXLIBDIR@"
  58
  59 /* Turn off water-water neighborlist optimization only - not used right now */
  60 #cmakedefine DISABLE_WATERWATER_NLIST
  61
  62 /* Turn off all water neighborlist optimization - not used right now */
  63 #cmakedefine DISABLE_WATER_NLIST
  64
  65 /* IEEE754 floating-point format. Memory layout is defined by macros
  66  * GMX_IEEE754_BIG_ENDIAN_BYTE_ORDER and GMX_IEEE754_BIG_ENDIAN_WORD_ORDER.
  67  */
  68 #cmakedefine GMX_FLOAT_FORMAT_IEEE754
  69
  70 /* Work around broken calloc() */
  71 #cmakedefine GMX_BROKEN_CALLOC
  72
  73 /* Enable special hacks for Cray XT3 */
  74 #cmakedefine GMX_CRAY_XT3
  75
  76 /* Do not optimize FFTW setups (not needed with SSE FFT kernels) */
  77 #cmakedefine GMX_DISABLE_FFTW_MEASURE
  78
  79 /* Compile in double precision */
  80 #cmakedefine GMX_DOUBLE
  81
  82 /* Use Built-in FFTPACK FFT library */
  83 #cmakedefine GMX_FFT_FFTPACK
  84
  85 /* Use FFTW3 FFT library */
  86 #cmakedefine GMX_FFT_FFTW3
  87
  88 /* Use Intel MKL FFT library */
  89 #cmakedefine GMX_FFT_MKL
  90
  91 /* Use AMD core math library */
  92 #cmakedefine GMX_FFT_ACML
  93
  94 /* SSE2 instructions available */
  95 #cmakedefine GMX_X86_SSE2
  96
  97 /* SSE4.1 instructions available */
  98 #cmakedefine GMX_X86_SSE4_1
  99
 100 /* AVX 128-bit FMA instructions available */
 101 #cmakedefine GMX_X86_AVX_128_FMA
 102
 103 /* AVX 256-bit instructions available */
 104 #cmakedefine GMX_X86_AVX_256
 105
 106 /* GCC bug in AVX maskload/maskstore arguments - worked around internally */
 107 #cmakedefine GMX_X86_AVX_GCC_MASKLOAD_BUG
 108
 109 /* SSE2 was selected as CPU acceleration level */
 110 #cmakedefine GMX_CPU_ACCELERATION_X86_SSE2
 111
 112 /* SSE4.1 was selected as CPU acceleration level */
 113 #cmakedefine GMX_CPU_ACCELERATION_X86_SSE4_1
 114
 115 /* AVX 128-bit FMA was selected as CPU acceleration level */
 116 #cmakedefine GMX_CPU_ACCELERATION_X86_AVX_128_FMA
 117
 118 /* AVX 256-bit was selected as CPU acceleration level */
 119 #cmakedefine GMX_CPU_ACCELERATION_X86_AVX_256
 120
 121 /* IBM QPX was selected as CPU acceleration type (e.g. BlueGene/Q) */
 122 #cmakedefine GMX_CPU_ACCELERATION_IBM_QPX
 123
 124 /* String for CPU acceleration choice (for writing to log files and stdout) */
 125 #define GMX_CPU_ACCELERATION_STRING "@GMX_CPU_ACCELERATION@"
 126
 127 /* Integer byte order is big endian. */
 128 #cmakedefine GMX_INTEGER_BIG_ENDIAN
 129
 130 /* Use our own instead of system XDR libraries */
 131 #cmakedefine GMX_INTERNAL_XDR
 132
 133 /* Use MPI (with mpicc) for parallelization */
 134 #cmakedefine GMX_LIB_MPI
 135
 136 /* MPI_IN_PLACE exists for collective operations */
 137 #cmakedefine MPI_IN_PLACE_EXISTS
 138
 139 /* Make a parallel version of GROMACS using message passing
 140    (MPI or thread_mpi) */
 141 #cmakedefine GMX_MPI
 142
 143 /* Use threads_mpi for parallelization */
 144 #cmakedefine GMX_THREAD_MPI
 145
 146 /* Use OpenMP multithreading */
 147 #cmakedefine GMX_OPENMP
 148
 149 /* Ignore calls to nice(3) */
 150 #cmakedefine GMX_NO_NICE
 151
 152 /* Ignore calls to system(3) */
 153 #cmakedefine GMX_NO_SYSTEM
 154
 155 /* Use (modified) Gamess-UK for QM-MM calculations */
 156 #cmakedefine GMX_QMMM_GAMESS
 157
 158 /* Use (modified) Gaussian0x for QM-MM calculations */
 159 #cmakedefine GMX_QMMM_GAUSSIAN
 160
 161 /* Use (modified) Mopac 7 for QM-MM calculations */
 162 #cmakedefine GMX_QMMM_MOPAC
 163
 164 /* Use the GROMACS software 1/sqrt(x) */
 165 #cmakedefine GMX_SOFTWARE_INVSQRT
 166
 167 /* Use sub-counters */
 168 #cmakedefine GMX_CYCLE_SUBCOUNTERS
 169
 170 /* Compile with plugin support */
 171 #cmakedefine GMX_USE_PLUGINS
 172
 173 /* Fallback path for VMD plug-ins */
 174 #define GMX_VMD_PLUGIN_PATH "@GMX_VMD_PLUGIN_PATH@"
 175
 176 /* Define when pthreads are used */
 177 #cmakedefine THREAD_PTHREADS
 178
 179 /* Define when Windows threads are used */
 180 #cmakedefine THREAD_WINDOWS
 181
 182 /* Define when thread-MPI atomic operations are available */
 183 #cmakedefine TMPI_ATOMICS
 184
 185 /* Define for busy wait option  */
 186 #cmakedefine TMPI_WAIT_FOR_NO_ONE
 187
 188 /* Define for copy buffer option */
 189 #cmakedefine TMPI_COPY_BUFFER
 190
 191 /* Define for profiling option */
 192 #cmakedefine TMPI_PROFILE
 193
 194 /* Define for Linux pthread_setaffinity */
 195 #cmakedefine HAVE_PTHREAD_SETAFFINITY
 196
 197 /* Define for Windows NUMA-aware allocator functions*/
 198 #cmakedefine TMPI_WINDOWS_NUMA_API
 199
 200 /* Define for sysconf() */
 201 #cmakedefine HAVE_SYSCONF
 202
 203 /* Define for GetSystemInfo() */
 204 #cmakedefine HAVE_SYSTEM_INFO
 205
 206 /* Enable x86 gcc inline assembly */
 207 #cmakedefine GMX_X86_GCC_INLINE_ASM
 208
 209 /* Use GPU native acceleration */
 210 #cmakedefine GMX_GPU
 211
 212 /* Define to 1 if the system has the type gmx_bool. */
 213 #cmakedefine HAVE_BOOL
 214
 215 /* Define to 1 if fseeko (and presumably ftello) exists and is declared. */
 216 #cmakedefine HAVE_FSEEKO
 217
 218 /* Define to 1 if _fseeki64 (and presumably _fseeki64) exists and is declared. */
 219 #cmakedefine HAVE__FSEEKI64
 220
 221 /* Define to 1 if you have the m library (-lm). */
 222 #cmakedefine HAVE_LIBM
 223
 224 /* Define to 1 if you have the mkl library (-lmkl). */
 225 #cmakedefine HAVE_LIBMKL
 226
 227 /* Define to 1 if you have the gsl library (-lgsl). */
 228 #cmakedefine HAVE_LIBGSL
 229
 230 /* Define to 1 if you have the dl library (-ldl). */
 231 #cmakedefine HAVE_LIBDL
 232
 233 /* Have io.h (windows)*/
 234 #cmakedefine HAVE_IO_H
 235
 236 /* Define to 1 if you have the strcasecmp() function. */
 237 #cmakedefine HAVE_STRCASECMP
 238
 239 /* Define to 1 if you have the strdup() function. */
 240 #cmakedefine HAVE_STRDUP
 241
 242 /* Define to 1 if you have the vfprintf() function. */
 243 #cmakedefine HAVE_VFPRINTF
 244
 245 /* Define to 1 if you have the memcmp() function. */
 246 #cmakedefine HAVE_MEMCMP
 247
 248 /* Define to 1 if you have the posix_memalign() function. */
 249 #cmakedefine HAVE_POSIX_MEMALIGN
 250
 251 /* Define to 1 if you have the memalign() function. */
 252 #cmakedefine HAVE_MEMALIGN
 253
 254 /* Define to 1 if you have the MSVC _aligned_malloc() function. */
 255 #cmakedefine HAVE__ALIGNED_MALLOC
 256
 257 /* Define to 1 if you have the gettimeofday() function. */
 258 #cmakedefine HAVE_GETTIMEOFDAY
 259
 260 /* Define to 1 if you have the cbrt() function. */
 261 #cmakedefine HAVE_CBRT
 262
 263 /* Define to 1 if you have the isnan() function. */
 264 #cmakedefine HAVE_ISNAN
 265
 266 /* Define to 1 if you have the _isnan() function. */
 267 #cmakedefine HAVE__ISNAN
 268
 269 /* Define to 1 if you have the isfinite() function. */
 270 #cmakedefine HAVE_ISFINITE
 271
 272 /* Define to 1 if you have the _isfinite() function. */
 273 #cmakedefine HAVE__ISFINITE
 274
 275 /* Define to 1 if you have the _finite() function. */
 276 #cmakedefine HAVE__FINITE
 277
 278 /* Define to 1 if you have the fsync() function. */
 279 #cmakedefine HAVE_FSYNC
 280
 281 /* Define to 1 if you have the Windows _commit() function. */
 282 #cmakedefine HAVE__COMMIT
 283
 284 /* Define to 1 if you have the fileno() function. */
 285 #cmakedefine HAVE_FILENO
 286
 287 /* Define to 1 if you have the _fileno() function. */
 288 #cmakedefine HAVE__FILENO
 289
 290 /* Define to 1 if you have the sigaction() function. */
 291 #cmakedefine HAVE_SIGACTION
 292
 293 /* Define to 1 if you have the rsqrt() function. */
 294 #cmakedefine HAVE_RSQRT
 295
 296 /* Define to 1 if you have the rsqrtf() function. */
 297 #cmakedefine HAVE_RSQRTF
 298
 299 /* Define to 1 if you have the sqrtf() function. */
 300 #cmakedefine HAVE_SQRTF
 301
 302 /* Define to 1 if you have the <string.h> header file. */
 303 #cmakedefine HAVE_STRING_H
 304
 305 /* Define to 1 if yo have the <math.h> header file. */
 306 #cmakedefine HAVE_MATH_H
 307
 308 /* Define to 1 if yo have the <limits.h> header file. */
 309 #cmakedefine HAVE_LIMITS_H
 310
 311 /* Define to 1 if yo have the <memory.h> header file. */
 312 #cmakedefine HAVE_MEMORY_H
 313
 314 /* Define to 1 if yo have the <unistd.h> header file. */
 315 #cmakedefine HAVE_UNISTD_H
 316
 317 /* Define to 1 if yo have the <direct.h> header file. */
 318 #cmakedefine HAVE_DIRECT_H
 319
 320 /* Define to 1 if yo have the <pwd.h> header file. */
 321 #cmakedefine HAVE_PWD_H
 322
 323 /* Define to 1 if yo have the <stdint.h> header file. */
 324 #cmakedefine HAVE_STDINT_H
 325
 326 /* Define to 1 if yo have the <stdlib.h> header file. */
 327 #cmakedefine HAVE_STDLIB_H
 328
 329 /* Define to 1 if yo have the <pthread.h> header file. */
 330 #cmakedefine HAVE_PTHREAD_H
 331
 332 /* Define to 1 if yo have the <dirent.h> header file. */
 333 #cmakedefine HAVE_DIRENT_H
 334
 335 /* Define to 1 if yo have the <inttypes.h> header file. */
 336 #cmakedefine HAVE_INTTYPES_H
 337
 338 /* Define to 1 if yo have the <regex.h> header file. */
 339 #cmakedefine HAVE_REGEX_H
 340
 341 /* Define to 1 if you have the <sys/types.h> header file. */
 342 #cmakedefine HAVE_SYS_TYPES_H
 343
 344 /* Define to 1 if you have the <sys/stat.h> header file. */
 345 #cmakedefine HAVE_SYS_STAT_H
 346
 347 /* Define to 1 if you have the <sys/time.h> header file. */
 348 #cmakedefine HAVE_SYS_TIME_H
 349
 350 /* Define to 1 if you have the <rpc/rpc.h> header file. */
 351 #cmakedefine HAVE_RPC_RPC_H
 352
 353 /* Define to 1 if you have the <rpc/xdr.h> header file. */
 354 #cmakedefine HAVE_RPC_XDR_H
 355
 356 /* Define to 1 if you have the <x86intrin.h> header file */
 357 #cmakedefine HAVE_X86INTRIN_H
 358
 359 /* Define to 1 if you have the <intrin.h> header file */
 360 #cmakedefine HAVE_INTRIN_H
 361
 362 /* Define to 1 if you have the <sched.h> header */
 363 #cmakedefine HAVE_SCHED_H
 364
 365 /* Define to 1 if you have the vprintf() function. */
 366 #cmakedefine HAVE_VPRINTF
 367
 368 /* Define to 1 if you have the sysconf() function */
 369 #cmakedefine HAVE_SYSCONF
 370
 371 /* Define to 1 if you have the sched_getaffinity() function */
 372 #cmakedefine HAVE_SCHED_GETAFFINITY
 373
 374 /* Define to 1 if you have the sched_setaffinity() function */
 375 #cmakedefine HAVE_SCHED_SETAFFINITY
 376
 377 /* Bytes in IEEE fp word are in big-endian order if set, little-endian if not.
 378    Only relevant when FLOAT_FORMAT_IEEE754 is defined. */
 379 #cmakedefine GMX_IEEE754_BIG_ENDIAN_BYTE_ORDER
 380
 381 /* The two words in a double precision variable are in b ig-endian order if
 382    set, little-endian if not. Do NOT assume this is the same as the byte
 383    order! Only relevant when FLOAT_FORMAT_IEEE754 is defined. */
 384 #cmakedefine GMX_IEEE754_BIG_ENDIAN_WORD_ORDER
 385
 386 /* Define if SIGUSR1 is present */
 387 #cmakedefine HAVE_SIGUSR1
 388
 389 /* The size of int, as computed by sizeof. */
 390 #cmakedefine SIZEOF_INT @SIZEOF_INT@
 391
 392 /* The size of long int, as computed by sizeof. */
 393 #cmakedefine SIZEOF_LONG_INT @SIZEOF_LONG_INT@
 394
 395 /* The size of long long int, as computed by sizeof. */
 396 #cmakedefine SIZEOF_LONG_LONG_INT @SIZEOF_LONG_LONG_INT@
 397
 398 /* The size of off_t, as computed by sizeof. */
 399 #cmakedefine SIZEOF_OFF_T @SIZEOF_OFF_T@
 400
 401 /* The size of void*, as computed by sizeof. */
 402 #cmakedefine SIZEOF_VOIDP @SIZEOF_VOIDP@
 403
 404 /* Define to 1 to make fseeko visible on some hosts (e.g. glibc 2.2). */
 405 #cmakedefine _LARGEFILE_SOURCE
 406
 407 /* Define for large files, on AIX-style hosts. */
 408 #cmakedefine _LARGE_FILES
 409
 410 /* Some systems requires this to be set to 64 for large file support */
 411 #cmakedefine _FILE_OFFSET_BITS @_FILE_OFFSET_BITS@
 412
 413 /* Gromacs shortcut define for fseeko & ftello being present with 64-bit support */
 414 #cmakedefine GMX_LARGEFILES
 415
 416 /* Define to int if <sys/types.h> does not define. */
 417 #cmakedefine gid_t int
 418
 419 /* Define to __inline__ or __inline if that is what the C compiler
 420    calls it, or to nothing if inline is not supported under any name.
 421    Please do NOT remove the gmx_inline keyword from here. The classical
 422    C++ inline keyword is merely a recommendation to the compiler, and
 423    many compilers support stronger alternatives (e.g. __forceinline)
 424    that we might want to use. */
 425 #define gmx_inline ${INLINE_KEYWORD}
 426 #ifndef __cplusplus
 427 #define inline ${INLINE_KEYWORD}
 428 #endif
 429
 430 /* Define to __restrict__ or __restrict if that is what the C compiler
 431    calls it, unless we are on C99 when it is simply called restrict.
 432    Since restrict is a reserved key word in C99 we are not allowed to
 433    redefine the word itself, so call this gmx_restrict to avoid having
 434    to identify the language standard level. If it is not supported, it
 435    is still defined to an empty string here. */
 436 #define gmx_restrict ${RESTRICT_KEYWORD}
 437
 438 #ifndef CPLUSPLUS
 439 #ifdef __cplusplus
 440 #define CPLUSPLUS
 441 #endif
 442 #endif
 443
 444 /* Define to long int if <sys/types.h> does not define. */
 445 #cmakedefine off_t int
 446
 447 /* Define to unsigned int if <sys/types.h> does not define. */
 448 #cmakedefine size_t int
 449
 450 /* Define to int if <sys/types.h> does not define. */
 451 #cmakedefine uid_t int
 452
 453 /* Build special-purpose mdrun library */
 454 #cmakedefine GMX_FAHCORE
 455
 456 /* Enable gromacs quotes */
 457 #cmakedefine GMX_COOL_QUOTES
 458
 459 #ifdef GMX_FAHCORE
 460 #define FULLINDIRECT 1
 461 #define USE_FAH_XDR  1
 462 #include "swindirect.h"
 463 #endif
 464
 465 /* Define if we have pipes */
 466 #cmakedefine HAVE_PIPES
 467
 468
 469 /* Catch stupid CMake problems on OS X */
 470 #ifdef __APPLE__
 471 #  if ((defined(__LP64__) && __LP64__ && defined(SIZEOF_VOIDP) && SIZEOF_VOIDP<8) || ( (!defined(__LP64__) || __LP64__==0) && (defined(SIZEOF_VOIDP) && SIZEOF_VOIDP>4)))
 472 #    error "Inconsistency between current OS X architecture and the one used to generate original"
 473 #    error "CMake configuration. This is probably caused by starting CMake with the default value"
 474 #    error "for CMAKE_OSX_ARCHITECTURES (blank), and then changing it. In this case all the tests"
 475 #    error "will have been performed with the original (now incorrect) architecture."
 476 #    error "To fix this, set CMAKE_OSX_ARCHITECTURES on the _command_line_ before starting CMake,"
 477 #    error "or create a new such entry with your choice in the GUI _before_ hitting 'configure'."
 478 #  endif
 479 #endif