src/config.h.cmakein

   1 /*
   2  * This file is part of the GROMACS molecular simulation package.
   3  *
   4  * Copyright (c) 2012, by the GROMACS development team, led by
   5  * David van der Spoel, Berk Hess, Erik Lindahl, and including many
   6  * others, as listed in the AUTHORS file in the top-level source
   7  * directory and at http://www.gromacs.org.
   8  *
   9  * GROMACS is free software; you can redistribute it and/or
  10  * modify it under the terms of the GNU Lesser General Public License
  11  * as published by the Free Software Foundation; either version 2.1
  12  * of the License, or (at your option) any later version.
  13  *
  14  * GROMACS is distributed in the hope that it will be useful,
  15  * but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
  16  * MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the GNU
  17  * Lesser General Public License for more details.
  18  *
  19  * You should have received a copy of the GNU Lesser General Public
  20  * License along with GROMACS; if not, see
  21  * http://www.gnu.org/licenses, or write to the Free Software Foundation,
  22  * Inc., 51 Franklin Street, Fifth Floor, Boston, MA  02110-1301  USA.
  23  *
  24  * If you want to redistribute modifications to GROMACS, please
  25  * consider that scientific software is very special. Version
  26  * control is crucial - bugs must be traceable. We will be happy to
  27  * consider code for inclusion in the official distribution, but
  28  * derived work must not be called official GROMACS. Details are found
  29  * in the README & COPYING files - if they are missing, get the
  30  * official version at http://www.gromacs.org.
  31  *
  32  * To help us fund GROMACS development, we humbly ask that you cite
  33  * the research papers on the package. Check out http://www.gromacs.org.
  34  */
  35 /* Manually created from config.h.in to work with cmake */
  36
  37 /* Disable warnings about double-to-float conversion accuracy loss on MSVC */
  38 #ifdef _MSC_VER
  39 #pragma warning (disable : 4305)
  40 #pragma warning (disable : 4244)
  41 #pragma warning (disable : 4101)
  42 #pragma warning (disable : 4996)
  43 #pragma warning (disable : 4267)
  44 #pragma warning (disable : 4090)
  45 #endif
  46
  47 /* Name of package (translate from cmake to autoconf macro name) */
  48 #define PACKAGE  "@PROJECT_NAME@"
  49
  50 /* Version number of package (translate from cmake to autoconf macro name) */
  51 #define VERSION  "@PROJECT_VERSION@"
  52
  53 /* Use the version string from generated version.h */
  54 #cmakedefine USE_VERSION_H
  55
  56 /* Default location of data files */
  57 #define GMXLIBDIR "@GMXLIBDIR@"
  58
  59 /* Turn off water-water neighborlist optimization only - not used right now */
  60 #cmakedefine DISABLE_WATERWATER_NLIST
  61
  62 /* Turn off all water neighborlist optimization - not used right now */
  63 #cmakedefine DISABLE_WATER_NLIST
  64
  65 /* Fortran support */
  66 #cmakedefine GMX_FORTRAN
  67
  68 /* Define to a macro mangling the given C identifier (in lower and upper
  69    case), which must not contain underscores, for linking with Fortran. */
  70 #define F77_FUNC(name,NAME)     @F77_FUNCDEF@
  71
  72 /* As F77_FUNC, but for C identifiers containing underscores. */
  73 #define F77_FUNC_(name,NAME)    @F77_FUNCDEF_@
  74
  75 /* IEEE754 floating-point format. Memory layout is defined by macros
  76  * GMX_IEEE754_BIG_ENDIAN_BYTE_ORDER and GMX_IEEE754_BIG_ENDIAN_WORD_ORDER.
  77  */
  78 #cmakedefine GMX_FLOAT_FORMAT_IEEE754
  79
  80 /* Use assembly intrinsics kernels for BlueGene */
  81 #cmakedefine GMX_BLUEGENE
  82
  83 /* Power6 acceleration */
  84 #cmakedefine GMX_POWER6
  85
  86 /* Work around broken calloc() */
  87 #cmakedefine GMX_BROKEN_CALLOC
  88
  89 /* Enable special hacks for Cray XT3 */
  90 #cmakedefine GMX_CRAY_XT3
  91
  92 /* Do not optimize FFTW setups (not needed with SSE FFT kernels) */
  93 #cmakedefine GMX_DISABLE_FFTW_MEASURE
  94
  95 /* Compile in double precision */
  96 #cmakedefine GMX_DOUBLE
  97
  98 /* Use Built-in FFTPACK FFT library */
  99 #cmakedefine GMX_FFT_FFTPACK
 100
 101 /* Use FFTW3 FFT library */
 102 #cmakedefine GMX_FFT_FFTW3
 103
 104 /* Use Intel MKL FFT library */
 105 #cmakedefine GMX_FFT_MKL
 106
 107 /* Use AMD core math library */
 108 #cmakedefine GMX_FFT_ACML
 109
 110 /* SSE2 instructions available */
 111 #cmakedefine GMX_X86_SSE2
 112
 113 /* SSE4.1 instructions available */
 114 #cmakedefine GMX_X86_SSE4_1
 115
 116 /* AVX 128-bit FMA instructions available */
 117 #cmakedefine GMX_X86_AVX_128_FMA
 118
 119 /* AVX 256-bit instructions available */
 120 #cmakedefine GMX_X86_AVX_256
 121
 122 /* SSE2 was selected as CPU acceleration level */
 123 #cmakedefine GMX_CPU_ACCELERATION_X86_SSE2
 124
 125 /* SSE4.1 was selected as CPU acceleration level */
 126 #cmakedefine GMX_CPU_ACCELERATION_X86_SSE4_1
 127
 128 /* AVX 128-bit FMA was selected as CPU acceleration level */
 129 #cmakedefine GMX_CPU_ACCELERATION_X86_AVX_128_FMA
 130
 131 /* AVX 256-bit was selected as CPU acceleration level */
 132 #cmakedefine GMX_CPU_ACCELERATION_X86_AVX_256
 133
 134 /* String for CPU acceleration choice (for writing to log files and stdout) */
 135 #define GMX_CPU_ACCELERATION_STRING "@GMX_CPU_ACCELERATION@"
 136
 137 /* Integer byte order is big endian. */
 138 #cmakedefine GMX_INTEGER_BIG_ENDIAN
 139
 140 /* Use our own instead of system XDR libraries */
 141 #cmakedefine GMX_INTERNAL_XDR
 142
 143 /* Use MPI (with mpicc) for parallelization */
 144 #cmakedefine GMX_LIB_MPI
 145
 146 /* MPI_IN_PLACE exists for collective operations */
 147 #cmakedefine MPI_IN_PLACE_EXISTS
 148
 149 /* Make a parallel version of GROMACS using message passing
 150    (MPI or thread_mpi) */
 151 #cmakedefine GMX_MPI
 152
 153 /* Use threads_mpi for parallelization */
 154 #cmakedefine GMX_THREAD_MPI
 155
 156 /* Use OpenMP multithreading */
 157 #cmakedefine GMX_OPENMP
 158
 159 /* Ignore calls to nice(3) */
 160 #cmakedefine GMX_NO_NICE
 161
 162 /* Ignore calls to system(3) */
 163 #cmakedefine GMX_NO_SYSTEM
 164
 165 /* Use (modified) Gamess-UK for QM-MM calculations */
 166 #cmakedefine GMX_QMMM_GAMESS
 167
 168 /* Use (modified) Gaussian0x for QM-MM calculations */
 169 #cmakedefine GMX_QMMM_GAUSSIAN
 170
 171 /* Use (modified) Mopac 7 for QM-MM calculations */
 172 #cmakedefine GMX_QMMM_MOPAC
 173
 174 /* Use the GROMACS software 1/sqrt(x) */
 175 #cmakedefine GMX_SOFTWARE_INVSQRT
 176
 177 /* Use the PowerPC hardware 1/sqrt(x) */
 178 #cmakedefine GMX_POWERPC_INVSQRT
 179
 180 /* Use sub-counters */
 181 #cmakedefine GMX_CYCLE_SUBCOUNTERS
 182
 183 /* Compile with plugin support */
 184 #cmakedefine GMX_USE_PLUGINS
 185
 186 /* Fallback path for VMD plug-ins */
 187 #define GMX_VMD_PLUGIN_PATH "@GMX_VMD_PLUGIN_PATH@"
 188
 189 /* Define when pthreads are used */
 190 #cmakedefine THREAD_PTHREADS
 191
 192 /* Define when Windows threads are used */
 193 #cmakedefine THREAD_WINDOWS
 194
 195 /* Define when thread-MPI atomic operations are available */
 196 #cmakedefine TMPI_ATOMICS
 197
 198 /* Define for busy wait option  */
 199 #cmakedefine TMPI_WAIT_FOR_NO_ONE
 200
 201 /* Define for copy buffer option */
 202 #cmakedefine TMPI_COPY_BUFFER
 203
 204 /* Define for profiling option */
 205 #cmakedefine TMPI_PROFILE
 206
 207 /* Define for Linux pthread_setaffinity */
 208 #cmakedefine HAVE_PTHREAD_SETAFFINITY
 209
 210 /* Define for Windows NUMA-aware allocator functions*/
 211 #cmakedefine TMPI_WINDOWS_NUMA_API
 212
 213 /* Define for sysconf() */
 214 #cmakedefine HAVE_SYSCONF
 215
 216 /* Define for GetSystemInfo() */
 217 #cmakedefine HAVE_SYSTEM_INFO
 218
 219 /* Enable x86 gcc inline assembly */
 220 #cmakedefine GMX_X86_GCC_INLINE_ASM
 221
 222 /* Use GPU native acceleration */
 223 #cmakedefine GMX_GPU
 224
 225 /* Define to 1 if the system has the type gmx_bool. */
 226 #cmakedefine HAVE_BOOL
 227
 228 /* Define to 1 if fseeko (and presumably ftello) exists and is declared. */
 229 #cmakedefine HAVE_FSEEKO
 230
 231 /* Define to 1 if _fseeki64 (and presumably _fseeki64) exists and is declared. */
 232 #cmakedefine HAVE__FSEEKI64
 233
 234 /* Define to 1 if you have the m library (-lm). */
 235 #cmakedefine HAVE_LIBM
 236
 237 /* Define to 1 if you have the mkl library (-lmkl). */
 238 #cmakedefine HAVE_LIBMKL
 239
 240 /* Define to 1 if you have the gsl library (-lgsl). */
 241 #cmakedefine HAVE_LIBGSL
 242
 243 /* Define to 1 if you have the dl library (-ldl). */
 244 #cmakedefine HAVE_LIBDL
 245
 246 /* Have io.h (windows)*/
 247 #cmakedefine HAVE_IO_H
 248
 249 /* Define to 1 if you have the strcasecmp() function. */
 250 #cmakedefine HAVE_STRCASECMP
 251
 252 /* Define to 1 if you have the strdup() function. */
 253 #cmakedefine HAVE_STRDUP
 254
 255 /* Define to 1 if you have the vfprintf() function. */
 256 #cmakedefine HAVE_VFPRINTF
 257
 258 /* Define to 1 if you have the memcmp() function. */
 259 #cmakedefine HAVE_MEMCMP
 260
 261 /* Define to 1 if you have the posix_memalign() function. */
 262 #cmakedefine HAVE_POSIX_MEMALIGN
 263
 264 /* Define to 1 if you have the memalign() function. */
 265 #cmakedefine HAVE_MEMALIGN
 266
 267 /* Define to 1 if you have the MSVC _aligned_malloc() function. */
 268 #cmakedefine HAVE__ALIGNED_MALLOC
 269
 270 /* Define to 1 if you have the gettimeofday() function. */
 271 #cmakedefine HAVE_GETTIMEOFDAY
 272
 273 /* Define to 1 if you have the cbrt() function. */
 274 #cmakedefine HAVE_CBRT
 275
 276 /* Define to 1 if you have the isnan() function. */
 277 #cmakedefine HAVE_ISNAN
 278
 279 /* Define to 1 if you have the _isnan() function. */
 280 #cmakedefine HAVE__ISNAN
 281
 282 /* Define to 1 if you have the isfinite() function. */
 283 #cmakedefine HAVE_ISFINITE
 284
 285 /* Define to 1 if you have the _isfinite() function. */
 286 #cmakedefine HAVE__ISFINITE
 287
 288 /* Define to 1 if you have the _finite() function. */
 289 #cmakedefine HAVE__FINITE
 290
 291 /* Define to 1 if you have the fsync() function. */
 292 #cmakedefine HAVE_FSYNC
 293
 294 /* Define to 1 if you have the Windows _commit() function. */
 295 #cmakedefine HAVE__COMMIT
 296
 297 /* Define to 1 if you have the fileno() function. */
 298 #cmakedefine HAVE_FILENO
 299
 300 /* Define to 1 if you have the _fileno() function. */
 301 #cmakedefine HAVE__FILENO
 302
 303 /* Define to 1 if you have the sigaction() function. */
 304 #cmakedefine HAVE_SIGACTION
 305
 306 /* Define to 1 if you have the rsqrt() function. */
 307 #cmakedefine HAVE_RSQRT
 308
 309 /* Define to 1 if you have the rsqrtf() function. */
 310 #cmakedefine HAVE_RSQRTF
 311
 312 /* Define to 1 if you have the sqrtf() function. */
 313 #cmakedefine HAVE_SQRTF
 314
 315 /* Define to 1 if you have the <string.h> header file. */
 316 #cmakedefine HAVE_STRING_H
 317
 318 /* Define to 1 if yo have the <math.h> header file. */
 319 #cmakedefine HAVE_MATH_H
 320
 321 /* Define to 1 if yo have the <limits.h> header file. */
 322 #cmakedefine HAVE_LIMITS_H
 323
 324 /* Define to 1 if yo have the <memory.h> header file. */
 325 #cmakedefine HAVE_MEMORY_H
 326
 327 /* Define to 1 if yo have the <unistd.h> header file. */
 328 #cmakedefine HAVE_UNISTD_H
 329
 330 /* Define to 1 if yo have the <direct.h> header file. */
 331 #cmakedefine HAVE_DIRECT_H
 332
 333 /* Define to 1 if yo have the <pwd.h> header file. */
 334 #cmakedefine HAVE_PWD_H
 335
 336 /* Define to 1 if yo have the <stdint.h> header file. */
 337 #cmakedefine HAVE_STDINT_H
 338
 339 /* Define to 1 if yo have the <stdlib.h> header file. */
 340 #cmakedefine HAVE_STDLIB_H
 341
 342 /* Define to 1 if yo have the <pthread.h> header file. */
 343 #cmakedefine HAVE_PTHREAD_H
 344
 345 /* Define to 1 if yo have the <dirent.h> header file. */
 346 #cmakedefine HAVE_DIRENT_H
 347
 348 /* Define to 1 if yo have the <inttypes.h> header file. */
 349 #cmakedefine HAVE_INTTYPES_H
 350
 351 /* Define to 1 if yo have the <regex.h> header file. */
 352 #cmakedefine HAVE_REGEX_H
 353
 354 /* Define to 1 if you have the <sys/types.h> header file. */
 355 #cmakedefine HAVE_SYS_TYPES_H
 356
 357 /* Define to 1 if you have the <sys/stat.h> header file. */
 358 #cmakedefine HAVE_SYS_STAT_H
 359
 360 /* Define to 1 if you have the <sys/time.h> header file. */
 361 #cmakedefine HAVE_SYS_TIME_H
 362
 363 /* Define to 1 if you have the <rpc/rpc.h> header file. */
 364 #cmakedefine HAVE_RPC_RPC_H
 365
 366 /* Define to 1 if you have the <rpc/xdr.h> header file. */
 367 #cmakedefine HAVE_RPC_XDR_H
 368
 369 /* Define to 1 if you have the <x86intrin.h> header file */
 370 #cmakedefine HAVE_X86INTRIN_H
 371
 372 /* Define to 1 if you have the <intrin.h> header file */
 373 #cmakedefine HAVE_INTRIN_H
 374
 375 /* Define to 1 if you have the <sched.h> header */
 376 #cmakedefine HAVE_SCHED_H
 377
 378 /* Define to 1 if you have the vprintf() function. */
 379 #cmakedefine HAVE_VPRINTF
 380
 381 /* Define to 1 if you have the sysconf() function */
 382 #cmakedefine HAVE_SYSCONF
 383
 384 /* Define to 1 if you have the sched_getaffinity() function */
 385 #cmakedefine HAVE_SCHED_GETAFFINITY
 386
 387 /* Define to 1 if you have the sched_setaffinity() function */
 388 #cmakedefine HAVE_SCHED_SETAFFINITY
 389
 390 /* Bytes in IEEE fp word are in big-endian order if set, little-endian if not.
 391    Only relevant when FLOAT_FORMAT_IEEE754 is defined. */
 392 #cmakedefine GMX_IEEE754_BIG_ENDIAN_BYTE_ORDER
 393
 394 /* The two words in a double precision variable are in b ig-endian order if
 395    set, little-endian if not. Do NOT assume this is the same as the byte
 396    order! Only relevant when FLOAT_FORMAT_IEEE754 is defined. */
 397 #cmakedefine GMX_IEEE754_BIG_ENDIAN_WORD_ORDER
 398
 399 /* Define if SIGUSR1 is present */
 400 #cmakedefine HAVE_SIGUSR1
 401
 402 /* The size of int, as computed by sizeof. */
 403 #cmakedefine SIZEOF_INT @SIZEOF_INT@
 404
 405 /* The size of long int, as computed by sizeof. */
 406 #cmakedefine SIZEOF_LONG_INT @SIZEOF_LONG_INT@
 407
 408 /* The size of long long int, as computed by sizeof. */
 409 #cmakedefine SIZEOF_LONG_LONG_INT @SIZEOF_LONG_LONG_INT@
 410
 411 /* The size of off_t, as computed by sizeof. */
 412 #cmakedefine SIZEOF_OFF_T @SIZEOF_OFF_T@
 413
 414 /* The size of void*, as computed by sizeof. */
 415 #cmakedefine SIZEOF_VOIDP @SIZEOF_VOIDP@
 416
 417 /* Define to 1 to make fseeko visible on some hosts (e.g. glibc 2.2). */
 418 #cmakedefine _LARGEFILE_SOURCE
 419
 420 /* Define for large files, on AIX-style hosts. */
 421 #cmakedefine _LARGE_FILES
 422
 423 /* Some systems requires this to be set to 64 for large file support */
 424 #cmakedefine _FILE_OFFSET_BITS @_FILE_OFFSET_BITS@
 425
 426 /* Gromacs shortcut define for fseeko & ftello being present with 64-bit support */
 427 #cmakedefine GMX_LARGEFILES
 428
 429 /* Define to int if <sys/types.h> does not define. */
 430 #cmakedefine gid_t int
 431
 432 /* Define to __inline__ or __inline if that is what the C compiler
 433    calls it, or to nothing if inline is not supported under any name.
 434    Please do NOT remove the gmx_inline keyword from here. The classical
 435    C++ inline keyword is merely a recommendation to the compiler, and
 436    many compilers support stronger alternatives (e.g. __forceinline)
 437    that we might want to use. */
 438 #define gmx_inline ${INLINE_KEYWORD}
 439 #ifndef __cplusplus
 440 #define inline ${INLINE_KEYWORD}
 441 #endif
 442
 443 /* Define to __restrict__ or __restrict if that is what the C compiler
 444    calls it, unless we are on C99 when it is simply called restrict.
 445    Since restrict is a reserved key word in C99 we are not allowed to
 446    redefine the word itself, so call this gmx_restrict to avoid having
 447    to identify the language standard level. If it is not supported, it
 448    is still defined to an empty string here. */
 449 #define gmx_restrict ${RESTRICT_KEYWORD}
 450
 451 #ifndef CPLUSPLUS
 452 #ifdef __cplusplus
 453 #define CPLUSPLUS
 454 #endif
 455 #endif
 456
 457 /* Define to long int if <sys/types.h> does not define. */
 458 #cmakedefine off_t int
 459
 460 /* Define to unsigned int if <sys/types.h> does not define. */
 461 #cmakedefine size_t int
 462
 463 /* Define to int if <sys/types.h> does not define. */
 464 #cmakedefine uid_t int
 465
 466 /* Build special-purpose mdrun library */
 467 #cmakedefine GMX_FAHCORE
 468
 469 #ifdef GMX_FAHCORE
 470 #define FULLINDIRECT 1
 471 #define USE_FAH_XDR  1
 472 #include "swindirect.h"
 473 #endif
 474
 475 /* Define if we have pipes */
 476 #cmakedefine HAVE_PIPES
 477
 478
 479 /* Catch stupid CMake problems on OS X */
 480 #ifdef __APPLE__
 481 #  if ((defined(__LP64__) && __LP64__ && defined(SIZEOF_VOIDP) && SIZEOF_VOIDP<8) || ( (!defined(__LP64__) || __LP64__==0) && (defined(SIZEOF_VOIDP) && SIZEOF_VOIDP>4)))
 482 #    error "Inconsistency between current OS X architecture and the one used to generate original"
 483 #    error "CMake configuration. This is probably caused by starting CMake with the default value"
 484 #    error "for CMAKE_OSX_ARCHITECTURES (blank), and then changing it. In this case all the tests"
 485 #    error "will have been performed with the original (now incorrect) architecture."
 486 #    error "To fix this, set CMAKE_OSX_ARCHITECTURES on the _command_line_ before starting CMake,"
 487 #    error "or create a new such entry with your choice in the GUI _before_ hitting 'configure'."
 488 #  endif
 489 #endif