src/config.h.cmakein

   1 /*
   2  * This file is part of the GROMACS molecular simulation package.
   3  *
   4  * Copyright (c) 2009,2010,2011,2012,2013,2014, by the GROMACS development team, led by
   5  * Mark Abraham, David van der Spoel, Berk Hess, and Erik Lindahl,
   6  * and including many others, as listed in the AUTHORS file in the
   7  * top-level source directory and at http://www.gromacs.org.
   8  *
   9  * GROMACS is free software; you can redistribute it and/or
  10  * modify it under the terms of the GNU Lesser General Public License
  11  * as published by the Free Software Foundation; either version 2.1
  12  * of the License, or (at your option) any later version.
  13  *
  14  * GROMACS is distributed in the hope that it will be useful,
  15  * but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
  16  * MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the GNU
  17  * Lesser General Public License for more details.
  18  *
  19  * You should have received a copy of the GNU Lesser General Public
  20  * License along with GROMACS; if not, see
  21  * http://www.gnu.org/licenses, or write to the Free Software Foundation,
  22  * Inc., 51 Franklin Street, Fifth Floor, Boston, MA  02110-1301  USA.
  23  *
  24  * If you want to redistribute modifications to GROMACS, please
  25  * consider that scientific software is very special. Version
  26  * control is crucial - bugs must be traceable. We will be happy to
  27  * consider code for inclusion in the official distribution, but
  28  * derived work must not be called official GROMACS. Details are found
  29  * in the README & COPYING files - if they are missing, get the
  30  * official version at http://www.gromacs.org.
  31  *
  32  * To help us fund GROMACS development, we humbly ask that you cite
  33  * the research papers on the package. Check out http://www.gromacs.org.
  34  */
  35 /*! \libinternal \file
  36  * \brief
  37  * Include file for configuration macros from the build system.
  38  *
  39  * This header is not installed, so headers must not reference macros defined
  40  * here.
  41  *
  42  * \inlibraryapi
  43  */
  44 #include "gromacs/utility/gmx_header_config.h"
  45
  46 /* TODO: For now, disable Doxygen warnings from here */
  47 /*! \cond */
  48
  49 /* Default location of data files */
  50 #define GMXLIB_SEARCH_DIR "@GMXLIB_SEARCH_DIR@"
  51
  52 /* Default location of data files */
  53 #define GMXLIB_FALLBACK "@GMXLIB_FALLBACK@"
  54
  55 /* Binary suffix for the created binaries */
  56 #define GMX_BINARY_SUFFIX "@GMX_BINARY_SUFFIX@"
  57
  58 /* Source directory for the build */
  59 #cmakedefine CMAKE_SOURCE_DIR "@CMAKE_SOURCE_DIR@"
  60
  61 /* Binary directory for the build */
  62 #cmakedefine CMAKE_BINARY_DIR "@CMAKE_BINARY_DIR@"
  63
  64 /* Turn off water-water neighborlist optimization only - not used right now */
  65 #cmakedefine DISABLE_WATERWATER_NLIST
  66
  67 /* Turn off all water neighborlist optimization - not used right now */
  68 #cmakedefine DISABLE_WATER_NLIST
  69
  70 /* IEEE754 floating-point format. Memory layout is defined by macros
  71  * GMX_IEEE754_BIG_ENDIAN_BYTE_ORDER and GMX_IEEE754_BIG_ENDIAN_WORD_ORDER.
  72  */
  73 #cmakedefine GMX_FLOAT_FORMAT_IEEE754
  74
  75 /* Work around broken calloc() */
  76 #cmakedefine GMX_BROKEN_CALLOC
  77
  78 /* Do not optimize FFTW setups (not needed with SSE FFT kernels) */
  79 #cmakedefine GMX_DISABLE_FFTW_MEASURE
  80
  81 /* Use Built-in FFTPACK FFT library */
  82 #cmakedefine GMX_FFT_FFTPACK
  83
  84 /* Use FFTW3 FFT library */
  85 #cmakedefine GMX_FFT_FFTW3
  86
  87 /* Use Intel MKL FFT library */
  88 #cmakedefine GMX_FFT_MKL
  89
  90 /* Target platform is x86 or x86_64 */
  91 #cmakedefine GMX_TARGET_X86
  92
  93 /* Target platform is BlueGene/Q */
  94 #cmakedefine GMX_TARGET_BGQ
  95
  96 /* GCC bug in AVX maskload/maskstore arguments - worked around internally */
  97 #cmakedefine GMX_SIMD_X86_AVX_GCC_MASKLOAD_BUG
  98
  99 /* SSE2 was selected for SIMD instruction set level */
 100 #cmakedefine GMX_SIMD_X86_SSE2
 101
 102 /* SSE4.1 was selected as SIMD instructions */
 103 #cmakedefine GMX_SIMD_X86_SSE4_1
 104
 105 /* AVX 128-bit FMA was selected as SIMD instructions */
 106 #cmakedefine GMX_SIMD_X86_AVX_128_FMA
 107
 108 /* AVX 256-bit was selected as SIMD instructions */
 109 #cmakedefine GMX_SIMD_X86_AVX_256
 110
 111 /* AVX2 256-bit SIMD instruction set level was selected */
 112 #cmakedefine GMX_SIMD_X86_AVX2_256
 113
 114 /* IBM QPX was selected as SIMD instructions (e.g. BlueGene/Q) */
 115 #cmakedefine GMX_SIMD_IBM_QPX
 116
 117 /* Fujitsu Sparc64 HPC-ACE SIMD acceleration */
 118 #cmakedefine GMX_SIMD_SPARC64_HPC_ACE
 119
 120 /* Reference SIMD implementation for testing */
 121 #cmakedefine GMX_SIMD_REFERENCE
 122
 123 /* String for SIMD instruction choice (for writing to log files and stdout) */
 124 #define GMX_SIMD_STRING "@GMX_SIMD@"
 125
 126 /* Calling convention string (if any) for routines with SIMD variable args */
 127 #define gmx_simdcall @GMX_SIMD_CALLING_CONVENTION@
 128
 129 /* Integer byte order is big endian. */
 130 #cmakedefine GMX_INTEGER_BIG_ENDIAN
 131
 132 /* Use our own instead of system XDR libraries */
 133 #cmakedefine GMX_INTERNAL_XDR
 134
 135 /* Compile to use TNG library */
 136 #cmakedefine GMX_USE_TNG
 137
 138 /* Add support for tracing using Extrae */
 139 #cmakedefine HAVE_EXTRAE
 140
 141 /* Use MPI (with mpicc) for parallelization */
 142 #cmakedefine GMX_LIB_MPI
 143
 144 /* MPI_IN_PLACE exists for collective operations */
 145 #cmakedefine MPI_IN_PLACE_EXISTS
 146
 147 /* Make a parallel version of GROMACS using message passing
 148    (MPI or thread_mpi) */
 149 #cmakedefine GMX_MPI
 150
 151 /* Use threads_mpi for parallelization */
 152 #cmakedefine GMX_THREAD_MPI
 153
 154 /* Use OpenMP multithreading */
 155 #cmakedefine GMX_OPENMP
 156
 157 /* Ignore calls to nice(3) */
 158 #cmakedefine GMX_NO_NICE
 159
 160 /* Use if can't rename checkpoints */
 161 #cmakedefine GMX_NO_RENAME
 162
 163 /* Ignore calls to system(3) */
 164 #cmakedefine GMX_NO_SYSTEM
 165
 166 /* Use (modified) Gamess-UK for QM-MM calculations */
 167 #cmakedefine GMX_QMMM_GAMESS
 168
 169 /* Use (modified) Gaussian0x for QM-MM calculations */
 170 #cmakedefine GMX_QMMM_GAUSSIAN
 171
 172 /* Use (modified) Mopac 7 for QM-MM calculations */
 173 #cmakedefine GMX_QMMM_MOPAC
 174
 175 /* Use ORCA for QM-MM calculations */
 176 #cmakedefine GMX_QMMM_ORCA
 177
 178 /* Use the GROMACS software 1/sqrt(x) */
 179 #cmakedefine GMX_SOFTWARE_INVSQRT
 180
 181 /* Use sub-counters */
 182 #cmakedefine GMX_CYCLE_SUBCOUNTERS
 183
 184 /* Compile with plugin support */
 185 #cmakedefine GMX_USE_PLUGINS
 186
 187 /* Fallback path for VMD plug-ins */
 188 #define GMX_VMD_PLUGIN_PATH "@GMX_VMD_PLUGIN_PATH@"
 189
 190 /* Define when pthreads are used */
 191 #cmakedefine THREAD_PTHREADS
 192
 193 /* Define when Windows threads are used */
 194 #cmakedefine THREAD_WINDOWS
 195
 196 /* Define native atomic operations are found */
 197 #cmakedefine TMPI_ATOMICS
 198
 199 /* Define for busy wait option  */
 200 #cmakedefine TMPI_WAIT_FOR_NO_ONE
 201
 202 /* Define for copy buffer option */
 203 #cmakedefine TMPI_COPY_BUFFER
 204
 205 /* Define for tmpi warnings option */
 206 #cmakedefine TMPI_WARNINGS
 207
 208 /* Define for profiling option */
 209 #cmakedefine TMPI_PROFILE
 210
 211 /* Define for Linux pthread_setaffinity_np */
 212 #cmakedefine HAVE_PTHREAD_SETAFFINITY
 213
 214 /* Define for X-Windows */
 215 #cmakedefine GMX_X11
 216
 217 /* Enable x86 gcc inline assembly */
 218 #cmakedefine GMX_X86_GCC_INLINE_ASM
 219
 220 /* Use GPU native acceleration */
 221 #cmakedefine GMX_GPU
 222
 223 /* Define to 1 if fseeko (and presumably ftello) exists and is declared. */
 224 #cmakedefine HAVE_FSEEKO
 225
 226 /* Define to 1 if _fseeki64 (and presumably _fseeki64) exists and is declared. */
 227 #cmakedefine HAVE__FSEEKI64
 228
 229 /* Have io.h (windows)*/
 230 #cmakedefine HAVE_IO_H
 231
 232 /* Define to 1 if you have the posix_memalign() function. */
 233 #cmakedefine HAVE_POSIX_MEMALIGN
 234
 235 /* Define to 1 if you have the memalign() function. */
 236 #cmakedefine HAVE_MEMALIGN
 237
 238 /* Define to 1 if you have the MSVC _aligned_malloc() function. */
 239 #cmakedefine HAVE__ALIGNED_MALLOC
 240
 241 /* Define to 1 if you have the clock_gettime() function. */
 242 #cmakedefine HAVE_CLOCK_GETTIME
 243
 244 /* Define to 1 if you have the gettimeofday() function. */
 245 #cmakedefine HAVE_GETTIMEOFDAY
 246
 247 /* Define to 1 if you have the rdtscp instruction. */
 248 #cmakedefine HAVE_RDTSCP
 249
 250 /* Define to 1 if you have the isfinite() function. */
 251 #cmakedefine HAVE_ISFINITE
 252
 253 /* Define to 1 if you have the _isfinite() function. */
 254 #cmakedefine HAVE__ISFINITE
 255
 256 /* Define to 1 if you have the _finite() function. */
 257 #cmakedefine HAVE__FINITE
 258
 259 /* Define to 1 if you have the fsync() function. */
 260 #cmakedefine HAVE_FSYNC
 261
 262 /* Define to 1 if you have the Windows _commit() function. */
 263 #cmakedefine HAVE__COMMIT
 264
 265 /* Define to 1 if you have the fileno() function. */
 266 #cmakedefine HAVE_FILENO
 267
 268 /* Define to 1 if you have the _fileno() function. */
 269 #cmakedefine HAVE__FILENO
 270
 271 /* Define to 1 if you have the sigaction() function. */
 272 #cmakedefine HAVE_SIGACTION
 273
 274 /* Define to 1 if you have the rsqrt() function. */
 275 #cmakedefine HAVE_RSQRT
 276
 277 /* Define to 1 if you have the rsqrtf() function. */
 278 #cmakedefine HAVE_RSQRTF
 279
 280 /* Define to 1 if you have the sqrtf() function. */
 281 #cmakedefine HAVE_SQRTF
 282
 283 /* Define to 1 if yo have the <unistd.h> header file. */
 284 #cmakedefine HAVE_UNISTD_H
 285
 286 /* Define to 1 if yo have the <pwd.h> header file. */
 287 #cmakedefine HAVE_PWD_H
 288
 289 /* Define to 1 if yo have the <dirent.h> header file. */
 290 #cmakedefine HAVE_DIRENT_H
 291
 292 /* Define to 1 if you have the <sys/time.h> header file. */
 293 #cmakedefine HAVE_SYS_TIME_H
 294
 295 /* Define to 1 if you have the <x86intrin.h> header file */
 296 #cmakedefine HAVE_X86INTRIN_H
 297
 298 /* Define to 1 if you have the <intrin.h> header file */
 299 #cmakedefine HAVE_INTRIN_H
 300
 301 /* Define to 1 if you have the <sched.h> header */
 302 #cmakedefine HAVE_SCHED_H
 303
 304 /* Define to 1 if you have the POSIX <regex.h> header file. */
 305 #cmakedefine HAVE_POSIX_REGEX
 306
 307 /* Define to 1 if you have the C++11 <regex> header file. */
 308 #cmakedefine HAVE_CXX11_REGEX
 309
 310 /* Define to 1 if you have the sysconf() function */
 311 #cmakedefine HAVE_SYSCONF
 312
 313 /* Define to 1 if you have the all the affinity functions in sched.h */
 314 #cmakedefine HAVE_SCHED_AFFINITY
 315
 316 /* Bytes in IEEE fp word are in big-endian order if set, little-endian if not.
 317    Only relevant when FLOAT_FORMAT_IEEE754 is defined. */
 318 #cmakedefine GMX_IEEE754_BIG_ENDIAN_BYTE_ORDER
 319
 320 /* The two words in a double precision variable are in b ig-endian order if
 321    set, little-endian if not. Do NOT assume this is the same as the byte
 322    order! Only relevant when FLOAT_FORMAT_IEEE754 is defined. */
 323 #cmakedefine GMX_IEEE754_BIG_ENDIAN_WORD_ORDER
 324
 325 /* Define if SIGUSR1 is present */
 326 #cmakedefine HAVE_SIGUSR1
 327
 328 /* Define to 1 to make fseeko visible on some hosts (e.g. glibc 2.2). */
 329 #cmakedefine _LARGEFILE_SOURCE
 330
 331 /* Define for large files, on AIX-style hosts. */
 332 #cmakedefine _LARGE_FILES
 333
 334 /* Some systems requires this to be set to 64 for large file support */
 335 #cmakedefine _FILE_OFFSET_BITS @_FILE_OFFSET_BITS@
 336
 337 /* Build special-purpose mdrun library */
 338 #cmakedefine GMX_FAHCORE
 339
 340 /* Enable gromacs quotes */
 341 #cmakedefine GMX_COOL_QUOTES
 342
 343 #ifdef GMX_FAHCORE
 344 #define FULLINDIRECT 1
 345 #define USE_FAH_XDR  1
 346 #include "swindirect.h"
 347 #endif
 348
 349 /* default name mangling maybe wrong on exotic plattforms */
 350 #define F77_FUNC(name,NAME) name ## _
 351
 352 /* Define if we have pipes */
 353 #cmakedefine HAVE_PIPES
 354
 355 /* Define if we have zlib */
 356 #cmakedefine HAVE_ZLIB
 357
 358 /*! \endcond */