src/CMakeLists.txt

   1 #
   2 # This file is part of the GROMACS molecular simulation package.
   3 #
   4 # Copyright (c) 2009,2010,2011,2012,2013 by the GROMACS development team.
   5 # Copyright (c) 2014,2015,2016,2017,2018 by the GROMACS development team.
   6 # Copyright (c) 2019,2020, by the GROMACS development team, led by
   7 # Mark Abraham, David van der Spoel, Berk Hess, and Erik Lindahl,
   8 # and including many others, as listed in the AUTHORS file in the
   9 # top-level source directory and at http://www.gromacs.org.
  10 #
  11 # GROMACS is free software; you can redistribute it and/or
  12 # modify it under the terms of the GNU Lesser General Public License
  13 # as published by the Free Software Foundation; either version 2.1
  14 # of the License, or (at your option) any later version.
  15 #
  16 # GROMACS is distributed in the hope that it will be useful,
  17 # but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
  18 # MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the GNU
  19 # Lesser General Public License for more details.
  20 #
  21 # You should have received a copy of the GNU Lesser General Public
  22 # License along with GROMACS; if not, see
  23 # http://www.gnu.org/licenses, or write to the Free Software Foundation,
  24 # Inc., 51 Franklin Street, Fifth Floor, Boston, MA  02110-1301  USA.
  25 #
  26 # If you want to redistribute modifications to GROMACS, please
  27 # consider that scientific software is very special. Version
  28 # control is crucial - bugs must be traceable. We will be happy to
  29 # consider code for inclusion in the official distribution, but
  30 # derived work must not be called official GROMACS. Details are found
  31 # in the README & COPYING files - if they are missing, get the
  32 # official version at http://www.gromacs.org.
  33 #
  34 # To help us fund GROMACS development, we humbly ask that you cite
  35 # the research papers on the package. Check out http://www.gromacs.org.
  36
  37 ######################################
  38 # Output compiler and CFLAGS used
  39 ######################################
  40 include(GetCompilerInfo.cmake)
  41 get_compiler_info(C BUILD_C_COMPILER)
  42 get_compiler_info(CXX BUILD_CXX_COMPILER)
  43 if(GMX_USE_CUDA)
  44     if(NOT GMX_CLANG_CUDA)
  45         GMX_SET_CUDA_NVCC_FLAGS()
  46     endif()
  47
  48     get_cuda_compiler_info(CUDA_COMPILER_INFO CUDA_DEVICE_COMPILER_FLAGS CUDA_HOST_COMPILER_FLAGS)
  49 endif()
  50
  51 string(TOUPPER "${CMAKE_BUILD_TYPE}" CMAKE_BUILD_TYPE_UPPER)
  52 configure_file(config.h.cmakein config.h)
  53 configure_file(gmxpre-config.h.cmakein gmxpre-config.h)
  54 configure_file(buildinfo.h.cmakein buildinfo.h ESCAPE_QUOTES)
  55 # Make a file with compiler flags used for libgromacs for each
  56 # langauge and build configuration.  The one that corresponds to
  57 # CMAKE_BUILD_TYPE is #included into buildinfo.h and populates the
  58 # fields e.g. printed to the log file.
  59 file(GENERATE
  60     OUTPUT ${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR}/compilerflaginfo-$<CONFIG>-$<COMPILE_LANGUAGE>.h
  61     INPUT ${CMAKE_CURRENT_SOURCE_DIR}/compilerflaginfo.h.cmakein
  62     CONDITION $<CONFIG:${CMAKE_BUILD_TYPE}>
  63     )
  64
  65 ####
  66 set(IGNORED_CLANG_ALL_WARNINGS
  67     "-Wno-c++98-compat -Wno-c++98-compat-pedantic" #No intention of C++98 compability
  68     "-Wno-source-uses-openmp" #Don't warn for no-omp build
  69     "-Wno-c++17-extensions"   #Allowed in attributes (compilers are required to ignore unknown attributes)
  70     "-Wno-documentation-unknown-command" #Custom commands are used
  71     "-Wno-covered-switch-default" #GCC gives maybe-uninitialized without default label and checks for illegal enum values.
  72     "-Wno-switch-enum" # default statement for enum is OK
  73
  74     # TODO uncomment the next few ignore lines when we upgrade to test with clang 8 in Jenkins
  75
  76     # The barriers we use for tMPI and Nbnxm are sufficient, but it's
  77     # not known whether they're excessive. We assume they not
  78     # excessive.
  79     # "-Wno-atomic-implicit-seq-cst"
  80
  81     # We need to use macros like
  82     # GMX_CATCH_ALL_AND_EXIT_WITH_FATAL_ERROR. Those will look strange
  83     # if they don't have a semicolon after them, and might confuse
  84     # tools like IDEs also.
  85     # "-Wno-extra-semi-stmt"
  86
  87     #Following ones are undecided/TODO
  88     "-Wno-disabled-macro-expansion"
  89     "-Wno-cast-align"
  90     "-Wno-reserved-id-macro"
  91     "-Wno-global-constructors"
  92     "-Wno-exit-time-destructors"
  93     "-Wno-unused-macros"
  94     "-Wno-weak-vtables"
  95     "-Wno-conditional-uninitialized"
  96     "-Wno-format-nonliteral"
  97     "-Wno-shadow"
  98     "-Wno-cast-qual"
  99     "-Wno-documentation"
 100     "-Wno-used-but-marked-unused"
 101     "-Wno-padded"
 102     "-Wno-float-equal"
 103     "-Wno-old-style-cast"
 104     "-Wno-conversion"
 105     "-Wno-double-promotion")
 106 string(REPLACE " " ";" IGNORED_CLANG_ALL_WARNINGS "${IGNORED_CLANG_ALL_WARNINGS}")
 107
 108 option(GMX_CLANG_TIDY "Use clang-tidy" OFF)
 109 if (GMX_CLANG_TIDY)
 110    if("${CMAKE_BUILD_TYPE}" STREQUAL "Debug")
 111    elseif("${CMAKE_BUILD_TYPE}" STREQUAL "RelWithAssert")
 112    elseif("${CMAKE_BUILD_TYPE}" STREQUAL "RelWithDebInfo")
 113    elseif("${CMAKE_BUILD_TYPE}" STREQUAL "ASAN")
 114    else()
 115        message(FATAL_ERROR "Can only use clang-tidy with build type containing asserts: Debug, RelWithAssert, RelWithDebInfo, ASAN.")
 116    endif()
 117    set(CMAKE_EXPORT_COMPILE_COMMANDS ON)
 118    mark_as_advanced(CMAKE_EXPORT_COMPILE_COMMANDS)
 119    set(CLANG_TIDY "clang-tidy" CACHE STRING "Name of clang-tidy executable")
 120    find_program(CLANG_TIDY_EXE NAMES "${CLANG_TIDY}"
 121        DOC "Path to clang-tidy executable")
 122    if(NOT CLANG_TIDY_EXE)
 123        message(FATAL_ERROR "clang-tidy not found.")
 124    endif()
 125    mark_as_advanced(CLANG_TIDY)
 126    mark_as_advanced(CLANG_TIDY_EXE)
 127 endif()
 128
 129 add_subdirectory(external)
 130
 131 if (BUILD_TESTING)
 132     if(NOT GMX_DEVELOPER_BUILD)
 133         set(UNITTEST_TARGET_OPTIONS EXCLUDE_FROM_ALL)
 134     endif()
 135     include(testutils/TestMacros.cmake)
 136     add_subdirectory(testutils)
 137 endif()
 138
 139 add_subdirectory(gromacs)
 140 add_subdirectory(programs)
 141
 142 # Activate targets for new C++ API components and docs.
 143 if(GMX_NATIVE_WINDOWS OR GMX_BUILD_MDRUN_ONLY OR NOT BUILD_SHARED_LIBS)
 144     # GMXAPI has not been tested in Microsoft environments.
 145     # GMXAPI relies on libgromacs and is incompatible with an `mdrun`-only build.
 146     # GMXAPI requires position-independent code
 147     set(_GMXAPI_DEFAULT OFF)
 148 else()
 149     set(_GMXAPI_DEFAULT ON)
 150 endif()
 151 option(GMXAPI "Experimental external interfaces" ${_GMXAPI_DEFAULT})
 152 if (GMXAPI)
 153    if (GMX_BUILD_MDRUN_ONLY)
 154        message(FATAL_ERROR "GMXAPI relies on libgromacs and is incompatible with GMX_BUILD_MDRUN_ONLY.")
 155    endif()
 156    if(NOT ${BUILD_SHARED_LIBS})
 157        # Note: this conditional should check for the existence of a libgromacs target supporting PIC
 158        # using the POSITION_INDEPENDENT_CODE property, but for now the only facility we have is the global
 159        # variable, BUILD_SHARED_LIBS.
 160        # TODO: gmxapi should gracefully build for dynamic linking or static linking for PIC or without.
 161        message(FATAL_ERROR "GMXAPI requires position-independent code. Set -DGMXAPI=OFF or -DBUILD_SHARED_LIBS=ON.")
 162    endif()
 163    add_subdirectory(api)
 164 endif()