share/tutor/mixed/methanol.itp

   1 #ifndef _FF_GROMOS96
   2
   3 [ atomtypes ]
   4 ;   type      mass    charge    ptype       c6            c12
   5     OMet    15.999    -0.69     A       2.6169e-3      2.5231e-6
   6       OW    15.999    -0.82     A       2.6170e-3      2.6330e-6
   7     CMet    15.035     0.29     A       8.8758e-3     17.8426e-6
   8        H     1.008     0.4      A       0.0            0.0
   9       HW     1.008     0.41     A       0.0            0.0
  10 #endif
  11
  12 [ moleculetype ]
  13 ; name  nrexcl
  14 Methanol        2
  15
  16 [ atoms ]
  17 ;   nr  type    resnr   residu  atom    cgnr    charge  mass
  18 #ifdef _FF_GROMOS96
  19 1       CMet     1       MeOH    Me1     1        0.176 15.035
  20 2       OMet     1       MeOH    O2      1       -0.574 15.999
  21 3       H        1       MeOH    H3      1        0.398  1.008
  22 #else
  23 1       CMet     1       MeOH    Me1     1        0.29  15.035
  24 2       OMet     1       MeOH    O2      1       -0.69  15.999
  25 3       H        1       MeOH    H3      1        0.40   1.008
  26 #endif
  27
  28 [ bonds ]
  29 ;  ai  aj funct           c0           c1
  30 1       2       1          0.13600     376560.
  31 2       3       1          0.10000     313800.
  32
  33 [ angles ]
  34 ;  ai    aj    ak       funct   c0      c1
  35     1     2     3       1       108.53  397.5
  36