share/top/gromos54a7.ff/aminoacids.hdb

   1 ABU     1
   2 1       1       H       N       -C      CA
   3 ACEH    1
   4 3       4       HA      CA      C       O
   5 AIB     1
   6 1       1       H       N       -C      CA
   7 ALA     1
   8 1       1       H       N       -C      CA
   9 ARG     4
  10 1       1       H       N       -C      CA
  11 1       1       HE      NE      CD      CZ
  12 2       3       HH1     NH1     CZ      NE
  13 2       3       HH2     NH2     CZ      NE
  14 ARGN    4
  15 1       1       H       N       -C      CA
  16 1       1       HE      NE      CD      CZ
  17 1       2       HH1     NH1     CZ      NE
  18 2       3       HH2     NH2     CZ      NE
  19 ASN     2
  20 1       1       H       N       -C      CA
  21 2       3       HD2     ND2     CG      CB
  22 ASP     1
  23 1       1       H       N       -C      CA
  24 ASP1    2
  25 1       1       H       N       -C      CA
  26 1       2       HD1     OD1     CG      CB
  27 ASPH    2
  28 1       1       H       N       -C      CA
  29 1       2       HD2     OD2     CG      CB
  30 ATP    4
  31 2      3       AH6     AN6     AC6     AC5
  32 1      2       AH2*    AO2*    AC2*    AC3*
  33 1      2       AH3*    AO3*    AC3*    AC2*
  34 1      2       AH3G    AO3G    APG     AO2G
  35 BEN     7
  36 1       1       H2      C2      C1      C3
  37 1       1       H3      C3      C2      C4
  38 1       1       H4      C4      C3      C5
  39 1       1       H5      C5      C4      C6
  40 1       1       H6      C6      C5      C1
  41 2       3       H1      N1      C7      C1
  42 2       3       H2      N2      C7      C1
  43 CYS2    1
  44 1       1       H       N       -C      CA
  45 CYSH    2
  46 1       1       H       N       -C      CA
  47 1       2       HG      SG      CB      CA
  48 DADE   3
  49 1      1       H2      C2      N1      N3
  50 1      1       H8      C8      N7      N9
  51 2      3       H6      N6      C6      C5
  52 DTHY   2
  53 1      1       H3      N3      C2      C4
  54 1      1       H6      C6      C5      N1
  55 FAD     7
  56 2       3       HN6     AN6     AC6     AC5
  57 1       2       HO2*    AO2*    AC2*    AC1*
  58 1       2       HO3*    AO3*    AC3*    AC2*
  59 1       2       H4*     O4*     C4*     C5*
  60 1       2       H3*     O3*     C3*     C4*
  61 1       2       H2*     O2*     C2*     C3*
  62 1       2       H3      N3      C4      C4A
  63 GLN     2
  64 1       1       H       N       -C      CA
  65 2       3       HE2     NE2     CD      CG
  66 GLU     1
  67 1       1       H       N       -C      CA
  68 GLUH    2
  69 1       1       H       N       -C      CA
  70 1       2       HE2     OE2     CD      CG
  71 GLY     1
  72 1       1       H       N       -C      CA
  73 HEME    4
  74 1       1       HHA     CHA     C1A     C4D
  75 1       1       HHB     CHB     C1B     C4A
  76 1       1       HHC     CHC     C1C     C4B
  77 1       1       HHD     CHD     C1D     C4C
  78 HIS1    4
  79 1       1       H       N       -C      CA
  80 1       1       HD1     ND1     CG      CE1
  81 1       1       HD2     CD2     CG      NE2
  82 1       1       HE1     CE1     ND1     NE2
  83 HIS2    4
  84 1       1       H       N       -C      CA
  85 1       1       HD1     ND1     CG      CE1
  86 1       1       HD2     CD2     CG      NE2
  87 1       1       HE1     CE1     ND1     NE2
  88 HISA    4
  89 1       1       H       N       -C      CA
  90 1       1       HD1     ND1     CG      CE1
  91 1       1       HD2     CD2     CG      NE2
  92 1       1       HE1     CE1     ND1     NE2
  93 HISB    4
  94 1       1       H       N       -C      CA
  95 1       1       HD2     CD2     CG      NE2
  96 1       1       HE1     CE1     ND1     NE2
  97 1       1       HE2     NE2     CE1     CD2
  98 HISH    5
  99 1       1       H       N       -C      CA
 100 1       1       HD1     ND1     CG      CE1
 101 1       1       HD2     CD2     CG      NE2
 102 1       1       HE1     CE1     ND1     NE2
 103 1       1       HE2     NE2     CE1     CD2
 104 HOH     1
 105 2       7       HW      OW
 106 HYP     1
 107 1       2       HD1     OD1     CG      CB
 108 ILE     1
 109 1       1       H       N       -C      CA
 110 LEU     1
 111 1       1       H       N       -C      CA
 112 LYS     2
 113 1       1       H       N       -C      CA
 114 2       4       HZ      NZ      CE      CD
 115 LYSH    2
 116 1       1       H       N       -C      CA
 117 3       4       HZ      NZ      CE      CD
 118 MET     1
 119 1       1       H       N       -C      CA
 120 NAC     1
 121 1       1       H       N       -C      CA
 122 NACH    2
 123 1       1       H       N       -C      CA
 124 3       4       HA      CA      N       NH
 125 NH2     1
 126 2       3       H       N       -C      -CA
 127 PHE     6
 128 1       1       H       N       -C      CA
 129 1       1       HD1     CD1     CG      CE1
 130 1       1       HD2     CD2     CG      CE2
 131 1       1       HE1     CE1     CD1     CZ
 132 1       1       HE2     CE2     CD2     CZ
 133 1       1       HZ      CZ      CE1     CE2
 134 PHEU    1
 135 1       1       H       N       -C      CA
 136 PHL     7
 137 1       1       H       N       -C      CA
 138 1       1       HD1     CD1     CG      CE1
 139 1       1       HD2     CD2     CG      CE2
 140 1       1       HE1     CE1     CD1     CZ
 141 1       1       HE2     CE2     CD2     CZ
 142 1       1       HZ      CZ      CE1     CE2
 143 1       2       HY      OY      CX      CA
 144 SER     2
 145 1       1       H       N       -C      CA
 146 1       2       HG      OG      CB      CA
 147 TFE     1
 148 1       2       H       O       CH2     C
 149 THR     2
 150 1       1       H       N       -C      CA
 151 1       2       HG1     OG1     CB      CA
 152 TRP     7
 153 1       1       H       N       -C      CA
 154 1       1       HD1     CD1     CG      NE1
 155 1       1       HE1     NE1     CD1     CE2
 156 1       1       HE3     CE3     CD2     CZ3
 157 1       1       HZ3     CZ3     CE3     CH2
 158 1       1       HH2     CH2     CZ3     CZ2
 159 1       1       HZ2     CZ2     CE2     CH2
 160 TRPU    2
 161 1       1       H       N       -C      CA
 162 1       1       HE1     NE1     CD1     CE2
 163 TYR     6
 164 1       1       H       N       -C      CA
 165 1       1       HD1     CD1     CG      CE1
 166 1       1       HD2     CD2     CG      CE2
 167 1       1       HE1     CE1     CD1     CZ
 168 1       1       HE2     CE2     CD2     CZ
 169 1       2       HH      OH      CZ      CE1
 170 TYRU    2
 171 1       1       H       N       -C      CA
 172 1       2       HH      OH      CZ      CE1
 173 VAL     1
 174 1       1       H       N       -C      CA