share/top/gmx2.ff/aminoacids.rtp

   1 ;
   2 ;
   3 ;       This source code is part of
   4 ;
   5 ;        G   R   O   M   A   C   S
   6 ;
   7 ; GROningen MAchine for Chemical Simulations
   8 ;
   9 ;               VERSION 3.0b
  10 ;
  11 ; Copyright (c) 1991-2001
  12 ; BIOSON Research Institute, Dept. of Biophysical Chemistry
  13 ; University of Groningen, The Netherlands
  14 ;
  15 ; Please use these references in all publications using GROMACS:
  16 ; GROMACS: A message-passing parallel molecular dynamics implementation
  17 ; H.J.C. Berendsen, D. van der Spoel and R. van Drunen
  18 ; Comp. Phys. Comm. 91, 43-56 (1995)
  19 ;
  20 ; GROMACS 3.0: A package for molecular simulation and trajectory analysis
  21 ; Erik Lindahl, Berk Hess and David van der Spoel
  22 ; J. Mol. Mod. 7 pp. 306-317 (2001)
  23 ;
  24 ; Also check out our WWW page:
  25 ; http://www.gromacs.org
  26 ; or e-mail to:
  27 ; gromacs@gromacs.org
  28 ;
  29 ; And Hey:
  30 ; Gyas ROwers Mature At Cryogenic Speed
  31 ;
  32 [ bondedtypes ]
  33 ; Column 1 : default bondtype
  34 ; Column 2 : default angletype
  35 ; Column 3 : default proper dihedraltype
  36 ; Column 4 : default improper dihedraltype
  37 ; Column 5 : This controls the generation of dihedrals from the bonding.
  38 ;            All possible dihedrals are generated automatically. A value of
  39 ;            1 here means that all these are retained. A value of
  40 ;            0 here requires generated dihedrals be removed if
  41 ;              * there are any dihedrals on the same central atoms
  42 ;                specified in the residue topology, or
  43 ;              * there are other identical generated dihedrals
  44 ;                sharing the same central atoms, or
  45 ;              * there are other generated dihedrals sharing the
  46 ;                same central bond that have fewer hydrogen atoms
  47 ; Column 6 : number of neighbors to exclude from non-bonded interactions
  48 ; Column 7 : 1 = generate 1,4 interactions between pairs of hydrogen atoms
  49 ;            0 = do not generate such
  50 ; Column 8 : 1 = remove proper dihedrals if found centered on the same
  51 ;                bond as an improper dihedral
  52 ;            0 = do not generate such
  53 ; bonds  angles  dihedrals  impropers all_dihedrals nrexcl HH14 RemoveDih
  54      1       1          1          2        0         3      0     1
  55
  56 [ ACE ]
  57  [ atoms ]
  58     CA    C3   0.000     1
  59    HA1    HC   0.000     1
  60    HA2    HC   0.000     1
  61    HA3    HC   0.000     1
  62      C     C   0.380     2
  63      O     O  -0.380     2
  64  [ bonds ]
  65     CA   HA1
  66     CA   HA2
  67     CA   HA3
  68     CA     C
  69      C     O
  70
  71 [ ALA ]
  72  [ atoms ]
  73      N     N  -0.280     0
  74      H     H   0.280     0
  75     CA    C1   0.000     1
  76     HA    HC   0.000     1
  77     CB    C3   0.000     2
  78    HB1    HC   0.000     2
  79    HB2    HC   0.000     2
  80    HB3    HC   0.000     2
  81      C     C   0.380     3
  82      O     O  -0.380     3
  83  [ bonds ]
  84      N     H
  85      N    CA
  86     CA    HA
  87     CA    CB
  88     CA     C
  89     CB   HB1
  90     CB   HB2
  91     CB   HB3
  92      C     O
  93     -C     N
  94  [ impropers ]
  95      N    -C    CA     H
  96     -C   -CA     N    -O
  97     CA     N     C    CB
  98
  99 [ ARG ]
 100  [ atoms ]
 101      N     N  -0.280     0
 102      H     H   0.280     0
 103     CA    C1   0.000     1
 104     HA    HC   0.000     1
 105     CB    C2   0.000     2
 106    HB1    HC   0.000     2
 107    HB2    HC   0.000     2
 108     CG    C2   0.000     3
 109    HG1    HC   0.000     3
 110    HG2    HC   0.000     3
 111     CD    C2   0.090     4
 112    HD1    HC   0.000     4
 113    HD2    HC   0.000     4
 114     NE    NE  -0.110     4
 115    HE     H   0.240     4
 116     CZ     C   0.340     4
 117    NH1    NZ  -0.260     4
 118   HH11     H   0.240     4
 119   HH12     H   0.240     4
 120    NH2    NZ  -0.260     4
 121   HH21     H   0.240     4
 122   HH22     H   0.240     4
 123      C     C   0.380     5
 124      O     O  -0.380     5
 125  [ bonds ]
 126      N     H
 127      N    CA
 128     CA    HA
 129     CA    CB
 130     CA     C
 131     CB   HB1
 132     CB   HB2
 133     CB    CG
 134     CG   HG1
 135     CG   HG2
 136     CG    CD
 137     CD   HD1
 138     CD   HD2
 139     CD    NE
 140     NE   HE
 141     NE    CZ
 142     CZ   NH1
 143     CZ   NH2
 144    NH1  HH11
 145    NH1  HH12
 146    NH2  HH21
 147    NH2  HH22
 148      C     O
 149     -C     N
 150  [ impropers ]
 151      N    -C    CA     H
 152     -C   -CA     N    -O
 153     CA     N     C    CB
 154     NE    CD    CZ    HE
 155     CZ   NH1   NH2    NE
 156    NH1  HH11  HH12    CZ
 157    NH2  HH21  HH22    CZ
 158
 159 [ ASN ]
 160  [ atoms ]
 161      N     N  -0.280     0
 162      H     H   0.280     0
 163     CA    C1   0.000     1
 164     HA    HC   0.000     1
 165     CB    C2   0.000     2
 166    HB1    HC   0.000     2
 167    HB2    HC   0.000     2
 168     CG     C   0.380     3
 169    OD1     O  -0.380     3
 170    ND2    NT  -0.830     4
 171   HD21     H   0.415     4
 172   HD22     H   0.415     4
 173      C     C   0.380     5
 174      O     O  -0.380     5
 175  [ bonds ]
 176      N     H
 177      N    CA
 178     CA    HA
 179     CA    CB
 180     CA     C
 181     CB   HB1
 182     CB   HB2
 183     CB    CG
 184     CG   OD1
 185     CG   ND2
 186    ND2  HD21
 187    ND2  HD22
 188      C     O
 189     -C     N
 190  [ impropers ]
 191      N    -C    CA     H
 192     -C   -CA     N    -O
 193     CA     N     C    CB
 194     CG   OD1   ND2    CB
 195    ND2  HD21  HD22    CG
 196
 197 [ ASP ]
 198  [ atoms ]
 199      N     N  -0.280     0
 200      H     H   0.280     0
 201     CA    C1   0.000     1
 202     HA    HC   0.000     1
 203     CB    C2   0.000     2
 204    HB1    HC   0.000     2
 205    HB2    HC   0.000     2
 206     CG     C   0.270     3
 207    OD1    OM  -0.635     3
 208    OD2    OM  -0.635     3
 209      C     C   0.380     4
 210      O     O  -0.380     4
 211  [ bonds ]
 212      N     H
 213      N    CA
 214     CA    HA
 215     CA    CB
 216     CA     C
 217     CB   HB1
 218     CB   HB2
 219     CB    CG
 220     CG   OD1
 221     CG   OD2
 222      C     O
 223     -C     N
 224  [ impropers ]
 225      N    -C    CA     H
 226     -C   -CA     N    -O
 227     CA     N     C    CB
 228     CG   OD1   OD2    CB
 229
 230 [ ASPH ]
 231  [ atoms ]
 232      N     N  -0.280     0
 233      H     H   0.280     0
 234     CA    C1   0.000     1
 235     HA    HC   0.000     1
 236     CB    C2   0.000     2
 237    HB1    HC   0.000     2
 238    HB2    HC   0.000     2
 239     CG     C   0.530     3
 240    OD1     O  -0.380     3
 241    OD2    OA  -0.548     3
 242    HD2    HO   0.398     3
 243      C     C   0.380     4
 244      O     O  -0.380     4
 245  [ bonds ]
 246      N     H
 247      N    CA
 248     CA    HA
 249     CA    CB
 250     CA     C
 251     CB   HB1
 252     CB   HB2
 253     CB    CG
 254     CG   OD1
 255     CG   OD2
 256    OD2   HD2
 257      C     O
 258     -C     N
 259  [ impropers ]
 260      N    -C    CA     H
 261     -C   -CA     N    -O
 262     CA     N     C    CB
 263     CG   OD1   OD2    CB
 264
 265 [ CYS2 ]
 266  [ atoms ]
 267      N     N  -0.280     0
 268      H     H   0.280     0
 269     CA    C1   0.000     1
 270     HA    HC   0.000     1
 271     CB    C2   0.000     2
 272    HB1    HC   0.000     2
 273    HB2    HC   0.000     2
 274     SG     S   0.000     3
 275      C     C   0.380     4
 276      O     O  -0.380     4
 277  [ bonds ]
 278      N     H
 279      N    CA
 280     CA    HA
 281     CA    CB
 282     CA     C
 283     CB   HB1
 284     CB   HB2
 285     CB    SG
 286      C     O
 287     -C     N
 288  [ impropers ]
 289      N    -C    CA     H
 290     -C   -CA     N    -O
 291     CA     N     C    CB
 292
 293 [ CYSH ]
 294  [ atoms ]
 295      N     N  -0.280     0
 296      H     H   0.280     0
 297     CA    C1   0.000     1
 298     HA    HC   0.000     1
 299     CB    C2   0.000     2
 300    HB1    HC   0.000     2
 301    HB2    HC   0.000     2
 302     SG     S  -0.064     3
 303     HG    HS   0.064     3
 304      C     C   0.380     4
 305      O     O  -0.380     4
 306  [ bonds ]
 307      N     H
 308      N    CA
 309     CA    HA
 310     CA    CB
 311     CA     C
 312     CB   HB1
 313     CB   HB2
 314     CB    SG
 315     SG    HG
 316      C     O
 317     -C     N
 318  [ impropers ]
 319      N    -C    CA     H
 320     -C   -CA     N    -O
 321     CA     N     C    CB
 322
 323 [ GLN ]
 324  [ atoms ]
 325      N     N  -0.280     0
 326      H     H   0.280     0
 327     CA    C1   0.000     1
 328     HA    HC   0.000     1
 329     CB    C2   0.000     2
 330    HB1    HC   0.000     2
 331    HB2    HC   0.000     2
 332     CG    C2   0.000     3
 333    HG1    HC   0.000     3
 334    HG2    HC   0.000     3
 335     CD     C   0.380     4
 336    OE1     O  -0.380     4
 337    NE2    NT  -0.830     5
 338   HE21     H   0.415     5
 339   HE22     H   0.415     5
 340      C     C   0.380     6
 341      O     O  -0.380     6
 342  [ bonds ]
 343      N     H
 344      N    CA
 345     CA    HA
 346     CA    CB
 347     CA     C
 348     CB   HB1
 349     CB   HB2
 350     CB    CG
 351     CG   HG1
 352     CG   HG2
 353     CG    CD
 354     CD   OE1
 355     CD   NE2
 356    NE2  HE21
 357    NE2  HE22
 358      C     O
 359     -C     N
 360  [ impropers ]
 361      N    -C    CA     H
 362     CA     N     C    CB
 363     CD   OE1   NE2    CG
 364    NE2  HE21  HE22    CD
 365     -C   -CA     N    -O
 366
 367 [ GLU ]
 368  [ atoms ]
 369      N     N  -0.280     0
 370      H     H   0.280     0
 371     CA    C1   0.000     1
 372     HA    HC   0.000     1
 373     CB    C2   0.000     2
 374    HB1    HC   0.000     2
 375    HB2    HC   0.000     2
 376     CG    C2   0.000     3
 377    HG1    HC   0.000     3
 378    HG2    HC   0.000     3
 379     CD     C   0.270     4
 380    OE1    OM  -0.635     4
 381    OE2    OM  -0.635     4
 382      C     C   0.380     5
 383      O     O  -0.380     5
 384  [ bonds ]
 385      N     H
 386      N    CA
 387     CA    HA
 388     CA    CB
 389     CA     C
 390     CB   HB1
 391     CB   HB2
 392     CB    CG
 393     CG   HG1
 394     CG   HG2
 395     CG    CD
 396     CD   OE1
 397     CD   OE2
 398      C     O
 399     -C     N
 400  [ impropers ]
 401      N    -C    CA     H
 402     CA     N     C    CB
 403     CD   OE1   OE2    CG
 404     -C   -CA     N    -O
 405
 406 [ GLUH ]
 407  [ atoms ]
 408      N     N  -0.280     0
 409      H     H   0.280     0
 410     CA    C1   0.000     1
 411     HA    HC   0.000     1
 412     CB    C2   0.000     2
 413    HB1    HC   0.000     2
 414    HB2    HC   0.000     2
 415     CG    C2   0.000     3
 416    HG1    HC   0.000     3
 417    HG2    HC   0.000     3
 418     CD     C   0.530     4
 419    OE1     O  -0.380     4
 420    OE2    OA  -0.548     4
 421    HE2    HO   0.398     4
 422      C     C   0.380     5
 423      O     O  -0.380     5
 424  [ bonds ]
 425      N     H
 426      N    CA
 427     CA    HA
 428     CA    CB
 429     CB    CA
 430     CB   HB1
 431     CB   HB2
 432     CB    CG
 433     CG   HG1
 434     CG   HG2
 435     CG    CD
 436     CD   OE1
 437     CD   OE2
 438    OE2   HE2
 439      C     O
 440     -C     N
 441  [ impropers ]
 442      N    -C    CA     H
 443     CA     N     C    CB
 444     CD   OE1   OE2    CG
 445     -C   -CA     N    -O
 446
 447 [ GLY ]
 448  [ atoms ]
 449      N     N  -0.280     0
 450      H     H   0.280     0
 451     CA    C2   0.000     1
 452    HA1    HC   0.000     1
 453    HA2    HC   0.000     1
 454      C     C   0.380     2
 455      O     O  -0.380     2
 456  [ bonds ]
 457      N     H
 458      N    CA
 459     CA   HA1
 460     CA   HA2
 461     CA     C
 462      C     O
 463     -C     N
 464  [ impropers ]
 465      N    -C    CA     H
 466     -C   -CA     N    -O
 467
 468 [ HIS1 ]
 469  [ atoms ]
 470      N     N  -0.280     0
 471      H     H   0.280     0
 472     CA    C1   0.000     1
 473     HA    HC   0.000     1
 474     CB    C2   0.000     2
 475    HB1    HC   0.000     2
 476    HB2    HC   0.000     2
 477     CG    CB   0.000     3
 478    ND1  NR5*   0.000     3
 479    HD1     H   0.190     3
 480    CD2   CR5   0.130     3
 481    HD2    HC   0.000     3
 482    CE1   CR5   0.260     3
 483    HE1    HC   0.000     3
 484    NE2  NR5*  -0.580     3
 485      C     C   0.380     4
 486      O     O  -0.380     4
 487  [ bonds ]
 488      N     H
 489      N    CA
 490     CA    HA
 491     CA    CB
 492     CA     C
 493     CB   HB1
 494     CB   HB2
 495     CB    CG
 496     CG   ND1
 497     CG   CD2
 498    ND1   HD1
 499    ND1   CE1
 500    CD2   HD2
 501    CD2   NE2
 502    CE1   HE1
 503    CE1   NE2
 504      C     O
 505     -C     N
 506  [ impropers ]
 507      N    -C    CA     H
 508     CA     N     C    CB
 509     CG   ND1   CD2    CB
 510    CD2    CG   ND1   CE1
 511    ND1    CG   CD2   NE2
 512     CG   ND1   CE1   NE2
 513     CG   CD2   NE2   CE1
 514    CD2   NE2   CE1   ND1
 515    ND1    CG   CE1   HD1
 516    CE1   ND1   NE2   HE1
 517    CD2    CG   NE2   HD2
 518     -C   -CA     N    -O
 519
 520 [ HISA ]
 521  [ atoms ]
 522      N     N  -0.280     0
 523      H     H   0.280     0
 524     CA    C1   0.000     1
 525     HA    HC   0.000     1
 526     CB    C2   0.000     2
 527    HB1    HC   0.000     2
 528    HB2    HC   0.000     2
 529     CG    CB   0.000     3
 530    ND1  NR5*   0.000     3
 531    HD1     H   0.190     3
 532    CD2   CR5   0.130     3
 533    HD2    HC   0.000     3
 534    CE1   CR5   0.260     3
 535    HE1    HC   0.000     3
 536    NE2   NR5  -0.580     3
 537      C     C   0.380     4
 538      O     O  -0.380     4
 539  [ bonds ]
 540      N     H
 541      N    CA
 542     CA    HA
 543     CA    CB
 544     CA     C
 545     CB   HB1
 546     CB   HB2
 547     CB    CG
 548     CG   ND1
 549     CG   CD2
 550    ND1   HD1
 551    ND1   CE1
 552    CD2   HD2
 553    CD2   NE2
 554    CE1   HE1
 555    CE1   NE2
 556      C     O
 557     -C     N
 558  [ impropers ]
 559      N    -C    CA     H
 560     CA     N     C    CB
 561     CG   ND1   CD2    CB
 562    CD2    CG   ND1   CE1
 563    ND1    CG   CD2   NE2
 564     CG   ND1   CE1   NE2
 565     CG   CD2   NE2   CE1
 566    CD2   NE2   CE1   ND1
 567    ND1    CG   CE1   HD1
 568    CD2    CG   NE2   HD2
 569    CE1   ND1   NE2   HE1
 570     -C   -CA     N    -O
 571
 572 [ HISB ]
 573  [ atoms ]
 574      N     N  -0.280     0
 575      H     H   0.280     0
 576     CA    C1   0.000     1
 577     HA    HC   0.000     1
 578     CB    C2   0.000     2
 579    HB1    HC   0.000     2
 580    HB2    HC   0.000     2
 581     CG    CB   0.130     3
 582    ND1   NR5  -0.580     3
 583    CD2   CR5   0.000     3
 584    HD2    HC   0.000     3
 585    CE1   CR5   0.260     3
 586    HE1    HC   0.000     3
 587    NE2  NR5*   0.000     3
 588    HE2     H   0.190     3
 589      C     C   0.380     4
 590      O     O  -0.380     4
 591  [ bonds ]
 592      N     H
 593      N    CA
 594     CA    HA
 595     CA    CB
 596     CA     C
 597     CB   HB1
 598     CB   HB2
 599     CB    CG
 600     CG   ND1
 601     CG   CD2
 602    ND1   CE1
 603    CD2   HD2
 604    CD2   NE2
 605    CE1   HE1
 606    CE1   NE2
 607    NE2   HE2
 608      C     O
 609     -C     N
 610  [ impropers ]
 611      N    -C    CA     H
 612     CA     N     C    CB
 613     CG   ND1   CD2    CB
 614    CD2    CG   ND1   CE1
 615    ND1    CG   CD2   NE2
 616     CG   ND1   CE1   NE2
 617     CG   CD2   NE2   CE1
 618    CD2   NE2   CE1   ND1
 619    CE1   ND1   NE2   HE1
 620    NE2   CD2   CE1   HE2
 621    CD2    CG   NE2   HD2
 622     -C   -CA     N    -O
 623
 624 [ HISH ]
 625  [ atoms ]
 626      N     N  -0.280     0
 627      H     H   0.280     0
 628     CA    C1   0.000     1
 629     HA    HC   0.000     1
 630     CB    C2   0.000     2
 631    HB1    HC   0.000     2
 632    HB2    HC   0.000     2
 633     CG    CB  -0.050     3
 634    ND1  NR5*   0.380     3
 635    HD1     H   0.300     3
 636    CD2   CR5   0.000     3
 637    HD2    HC   0.000     3
 638    CE1   CR5  -0.240     3
 639    HE1    HC   0.000     3
 640    NE2  NR5*   0.310     3
 641    HE2     H   0.300     3
 642      C     C   0.380     4
 643      O     O  -0.380     4
 644  [ bonds ]
 645      N     H
 646      N    CA
 647     CA    HA
 648     CA    CB
 649     CA     C
 650     CB   HB1
 651     CB   HB2
 652     CB    CG
 653     CG   ND1
 654     CG   CD2
 655    ND1   HD1
 656    ND1   CE1
 657    CD2   HD2
 658    CD2   NE2
 659    CE1   HE1
 660    CE1   NE2
 661    NE2   HE2
 662      C     O
 663     -C     N
 664  [ impropers ]
 665      N    -C    CA     H
 666     CA     N     C    CB
 667     CG   ND1   CD2    CB
 668    CD2    CG   ND1   CE1
 669    ND1    CG   CD2   NE2
 670     CG   ND1   CE1   NE2
 671     CG   CD2   NE2   CE1
 672    CD2   NE2   CE1   ND1
 673    ND1    CG   CE1   HD1
 674    CE1   ND1   NE2   HE1
 675    NE2   CE1   CD2   HE2
 676    CD2    CG   NE2   HD2
 677     -C   -CA     N    -O
 678
 679 [ HOH ]
 680  [ atoms ]
 681     OW    OW  -0.820     0
 682    HW1    HW   0.410     0
 683    HW2    HW   0.410     0
 684  [ bonds ]
 685     OW   HW1
 686     OW   HW2
 687
 688 [ HO4 ]
 689  [ atoms ]
 690    OW  OWT4    0.0     0
 691   HW1     H    0.52     0
 692   HW2     H    0.52     0
 693    MW    IW   -1.04     0
 694  [ bonds ]
 695    OW   HW1
 696    OW   HW2
 697
 698 [ HYP ]
 699  [ atoms ]
 700      N     N   0.000     0
 701     CA    C1   0.000     1
 702     HA    HC   0.000     1
 703     CB    C2   0.000     2
 704    HB1    HC   0.000     2
 705    HB2    HC   0.000     2
 706     CG    C1   0.150     3
 707     HG    HC   0.000     3
 708    OD1    OA  -0.548     3
 709    HD1    HO   0.398     3
 710    CD2    C2   0.000     4
 711    HD1    HC   0.000     4
 712    HD2    HC   0.000     4
 713      C     C   0.380     5
 714      O     O  -0.380     5
 715  [ bonds ]
 716      N    CA
 717     CA     C
 718      C     O
 719     -C     N
 720     CA    HA
 721     CA    CB
 722     CB   HB1
 723     CB   HB2
 724     CB    CG
 725     CG    HG
 726     CG   OD1
 727    OD1   HD1
 728     CG   CD2
 729    CD2   HD1
 730    CD2   HD2
 731    CD2     N
 732  [ impropers ]
 733      N    -C    CA   CD2
 734     -C   -CA     N    -O
 735     CA     N     C    CB
 736     CG   CD2    CB   OD1
 737
 738 [ ILE ]
 739  [ atoms ]
 740      N     N  -0.280     0
 741      H     H   0.280     0
 742     CA    C1   0.000     1
 743     HA    HC   0.000     1
 744     CB    C1   0.000     2
 745     HB    HC   0.000     2
 746    CG1    C2   0.000     3
 747   HG11    HC   0.000     3
 748   HG12    HC   0.000     3
 749    CG2    C3   0.000     4
 750   HG21    HC   0.000     4
 751   HG22    HC   0.000     4
 752   HG23    HC   0.000     4
 753     CD    C3   0.000     5
 754    HD1    HC   0.000     5
 755    HD2    HC   0.000     5
 756    HD3    HC   0.000     5
 757      C     C   0.380     6
 758      O     O  -0.380     6
 759  [ bonds ]
 760      N     H
 761      N    CA
 762     CA    HA
 763     CA    CB
 764     CA     C
 765     CB    HB
 766     CB   CG1
 767     CB   CG2
 768    CG1  HG11
 769    CG1  HG12
 770    CG1    CD
 771    CG2  HG21
 772    CG2  HG22
 773    CG2  HG23
 774     CD   HD1
 775     CD   HD2
 776     CD   HD3
 777      C     O
 778     -C     N
 779  [ impropers ]
 780      N    -C    CA     H
 781     -C   -CA     N    -O
 782     CA     N     C    CB
 783     CB   CG1   CG2    CA
 784
 785 [ LEU ]
 786  [ atoms ]
 787      N     N  -0.280     0
 788      H     H   0.280     0
 789     CA    C1   0.000     1
 790     HA    HC   0.000     1
 791     CB    C2   0.000     2
 792    HB1    HC   0.000     2
 793    HB2    HC   0.000     2
 794     CG    C1   0.000     3
 795     HG    HC   0.000     3
 796    CD1    C3   0.000     4
 797   HD11    HC   0.000     4
 798   HD12    HC   0.000     4
 799   HD13    HC   0.000     4
 800    CD2    C3   0.000     5
 801   HD21    HC   0.000     5
 802   HD22    HC   0.000     5
 803   HD23    HC   0.000     5
 804      C     C   0.380     6
 805      O     O  -0.380     6
 806  [ bonds ]
 807      N     H
 808      N    CA
 809     CA    HA
 810     CA    CB
 811     CA     C
 812     CB   HB1
 813     CB   HB2
 814     CB    CG
 815     CG    HG
 816     CG   CD1
 817     CG   CD2
 818    CD1  HD11
 819    CD1  HD12
 820    CD1  HD13
 821    CD2  HD21
 822    CD2  HD22
 823    CD2  HD23
 824      C     O
 825     -C     N
 826  [ impropers ]
 827      N    -C    CA     H
 828     -C   -CA     N    -O
 829     CA     N     C    CB
 830     CG   CD2   CD1    CB
 831
 832 [ LYS ]
 833  [ atoms ]
 834      N     N  -0.280     0
 835      H     H   0.280     0
 836     CA    C1   0.000     1
 837     HA    HC   0.000     1
 838     CB    C2   0.000     2
 839    HB1    HC   0.000     2
 840    HB2    HC   0.000     2
 841     CG    C2   0.000     3
 842    HG1    HC   0.000     3
 843    HG2    HC   0.000     3
 844     CD    C2   0.000     4
 845    HD1    HC   0.000     4
 846    HD2    HC   0.000     4
 847     CE    C2   0.000     5
 848    HE1    HC   0.000     5
 849    HE2    HC   0.000     5
 850     NZ    NL  -0.830     5
 851    HZ1     H   0.415     5
 852    HZ2     H   0.415     5
 853      C     C   0.380     6
 854      O     O  -0.380     6
 855  [ bonds ]
 856      N     H
 857      N    CA
 858     CA    HA
 859     CA    CB
 860     CA     C
 861     CB   HB1
 862     CB   HB2
 863     CB    CG
 864     CG   HG1
 865     CG   HG2
 866     CG    CD
 867     CD   HD1
 868     CD   HD2
 869     CD    CE
 870     CE   HE1
 871     CE   HE2
 872     CE    NZ
 873     NZ   HZ1
 874     NZ   HZ2
 875      C     O
 876     -C     N
 877  [ impropers ]
 878      N    -C    CA     H
 879     NZ    CE   HZ2    NZ
 880     -C   -CA     N    -O
 881     CA     N     C    CB
 882     NZ    CE   HZ2   HZ1
 883
 884 [ LYSH ]
 885  [ atoms ]
 886      N     N  -0.280     0
 887      H     H   0.280     0
 888     CA    C1   0.000     1
 889     HA    HC   0.000     1
 890     CB    C2   0.000     2
 891    HB1    HC   0.000     2
 892    HB2    HC   0.000     2
 893     CG    C2   0.000     3
 894    HG1    HC   0.000     3
 895    HG2    HC   0.000     3
 896     CD    C2   0.000     4
 897    HD1    HC   0.000     4
 898    HD2    HC   0.000     4
 899     CE    C2   0.127     5
 900    HE1    HC   0.000     5
 901    HE2    HC   0.000     5
 902     NZ    NL   0.129     5
 903    HZ1     H   0.248     5
 904    HZ2     H   0.248     5
 905    HZ3     H   0.248     5
 906      C     C   0.380     6
 907      O     O  -0.380     6
 908  [ bonds ]
 909      N     H
 910      N    CA
 911     CA    HA
 912     CA    CB
 913     CA     C
 914     CB   HB1
 915     CB   HB2
 916     CB    CG
 917     CG   HG1
 918     CG   HG2
 919     CG    CD
 920     CD   HD1
 921     CD   HD2
 922     CD    CE
 923     CE   HE1
 924     CE   HE2
 925     CE    NZ
 926     NZ   HZ1
 927     NZ   HZ2
 928     NZ   HZ3
 929      C     O
 930     -C     N
 931  [ impropers ]
 932      N    -C    CA     H
 933     -C   -CA     N    -O
 934     CA     N     C    CB
 935
 936 [ MET ]
 937  [ atoms ]
 938      N     N  -0.280     0
 939      H     H   0.280     0
 940     CA    C1   0.000     1
 941     HA    HC   0.000     1
 942     CB    C2   0.000     2
 943    HB1    HC   0.000     2
 944    HB2    HC   0.000     2
 945     CG    C2   0.000     3
 946    HG1    HC   0.000     3
 947    HG2    HC   0.000     3
 948     SD     S   0.000     4
 949     CE    C3   0.000     5
 950    HE1    HC   0.000     5
 951    HE2    HC   0.000     5
 952    HE3    HC   0.000     5
 953      C     C   0.380     6
 954      O     O  -0.380     6
 955  [ bonds ]
 956      N     H
 957      N    CA
 958     CA    HA
 959     CA    CB
 960     CA     C
 961     CB   HB1
 962     CB   HB2
 963     CB    CG
 964     CG   HG1
 965     CG   HG2
 966     CG    SD
 967     SD    CE
 968     CE   HE1
 969     CE   HE2
 970     CE   HE3
 971      C     O
 972     -C     N
 973  [ impropers ]
 974      N    -C    CA     H
 975     -C   -CA     N    -O
 976     CA     N     C    CB
 977
 978 [ NAC ]
 979  [ atoms ]
 980      N     N  -0.280     0
 981      H     H   0.280     0
 982     CA    C3   0.000     1
 983    HA1    HC   0.000     1
 984    HA2    HC   0.000     1
 985    HA3    HC   0.000     1
 986  [ bonds ]
 987      N     H
 988      N    CA
 989     CA   HA1
 990     CA   HA2
 991     CA   HA3
 992     -C     N
 993  [ impropers ]
 994      N    -C    CA     H
 995
 996 [ NH2 ]
 997  [ atoms ]
 998      N    NT  -0.830     0
 999     H1     H   0.415     0
1000     H2     H   0.415     0
1001  [ bonds ]
1002     -C     N
1003      N     H1
1004      N     H2
1005  [ impropers ]
1006     -C     H1   H2      N
1007     -C  -O      N       -CA
1008
1009 [ PHE ]
1010  [ atoms ]
1011      N     N  -0.280     0
1012      H     H   0.280     0
1013     CA    C1   0.000     1
1014     HA    HC   0.000     1
1015     CB    C2   0.000     2
1016    HB1    HC   0.000     2
1017    HB2    HC   0.000     2
1018     CG    CB   0.000     3
1019    CD1   CR6  -0.140     4
1020    HD1   HCR   0.140     4
1021    CD2   CR6  -0.140     5
1022    HD2   HCR   0.140     5
1023    CE1   CR6  -0.140     6
1024    HE1   HCR   0.140     6
1025    CE2   CR6  -0.140     7
1026    HE2   HCR   0.140     7
1027     CZ   CR6  -0.140     8
1028     HZ   HCR   0.140     8
1029      C     C   0.380     9
1030      O     O  -0.380     9
1031  [ bonds ]
1032      N     H
1033      N    CA
1034     CA    HA
1035     CA    CB
1036     CA     C
1037     CB   HB1
1038     CB   HB2
1039     CB    CG
1040     CG   CD1
1041     CG   CD2
1042    CD1   HD1
1043    CD1   CE1
1044    CD2   HD2
1045    CD2   CE2
1046    CE1   HE1
1047    CE1    CZ
1048    CE2   HE2
1049    CE2    CZ
1050     CZ    HZ
1051      C     O
1052     -C     N
1053  [ impropers ]
1054      N    -C    CA     H
1055     CA     N     C    CB
1056     CG   CD1   CD2    CB
1057    CD2    CG   CD1   CE1
1058    CD1    CG   CD2   CE2
1059     CG   CD1   CE1    CZ
1060     CG   CD2   CE2    CZ
1061    CD1   CE1    CZ   CE2
1062    CD2   CE2    CZ   CE1
1063    CD1   CE1    CG   HD1
1064    CE1    CZ   CD1   HE1
1065     CZ   CE2   CE1    HZ
1066    CE2   CD2    CZ   HE2
1067    CD2    CG   CE2   HD2
1068     -C   -CA     N    -O
1069
1070 [ PRO ]
1071  [ atoms ]
1072      N     N   0.000     0
1073     CA    C1   0.000     1
1074     HA    HC   0.000     1
1075     CB    C2   0.000     2
1076    HB1    HC   0.000     2
1077    HB2    HC   0.000     2
1078     CG    C2   0.000     3
1079    HG1    HC   0.000     3
1080    HG2    HC   0.000     3
1081     CD    C2   0.000     4
1082    HD1    HC   0.000     4
1083    HD2    HC   0.000     4
1084      C     C   0.380     5
1085      O     O  -0.380     5
1086  [ bonds ]
1087      N    CA
1088     CA    HA
1089     CA    CB
1090     CA     C
1091     CB   HB1
1092     CB   HB2
1093     CB    CG
1094     CG   HG1
1095     CG   HG2
1096     CG    CD
1097     CD   HD1
1098     CD   HD2
1099     CD     N
1100      C     O
1101     -C     N
1102  [ impropers ]
1103      N    -C    CA    CD
1104     -C   -CA     N    -O
1105     CA     N     C    CB
1106
1107 [ SER ]
1108  [ atoms ]
1109      N     N  -0.280     0
1110      H     H   0.280     0
1111     CA    C1   0.000     1
1112     HA    HC   0.000     1
1113     CB    C2   0.150     2
1114    HB1    HC   0.000     2
1115    HB2    HC   0.000     2
1116     OG    OA  -0.548     2
1117     HG    HO   0.398     2
1118      C     C   0.380     3
1119      O     O  -0.380     3
1120  [ bonds ]
1121      N     H
1122      N    CA
1123     CA    HA
1124     CA    CB
1125     CA     C
1126     CB   HB1
1127     CB   HB2
1128     CB    OG
1129     OG    HG
1130      C     O
1131     -C     N
1132  [ impropers ]
1133      N    -C    CA     H
1134     -C   -CA     N    -O
1135     CA     N     C    CB
1136
1137 [ THR ]
1138  [ atoms ]
1139      N     N  -0.280     0
1140      H     H   0.280     0
1141     CA    C1   0.000     1
1142     HA    HC   0.000     1
1143     CB    C1   0.150     2
1144     HB    HC   0.000     2
1145    OG1    OA  -0.548     2
1146    HG1    HO   0.398     2
1147    CG2    C3   0.000     3
1148   HG21    HC   0.000     3
1149   HG22    HC   0.000     3
1150   HG23    HC   0.000     3
1151      C     C   0.380     4
1152      O     O  -0.380     4
1153  [ bonds ]
1154      N     H
1155      N    CA
1156     CA    HA
1157     CA    CB
1158     CA     C
1159     CB    HB
1160     CB   OG1
1161     CB   CG2
1162    OG1   HG1
1163    CG2  HG21
1164    CG2  HG22
1165    CG2  HG23
1166      C     O
1167     -C     N
1168  [ impropers ]
1169      N    -C    CA     H
1170     -C   -CA     N    -O
1171     CA     N     C    CB
1172     CB   OG1   CG2    CA
1173
1174 [ TRP ]
1175  [ atoms ]
1176      N     N  -0.280     0
1177      H     H   0.280     0
1178     CA    C1   0.000     1
1179     HA    HC   0.000     1
1180     CB    C2   0.000     2
1181    HB1    HC   0.000     2
1182    HB2    HC   0.000     2
1183     CG    CB  -0.140     3
1184    CD1   CR5  -0.140     3
1185    HD1   HCR   0.140     3
1186    CD2    CB   0.000     3
1187    NE1  NR5*  -0.050     3
1188    HE1     H   0.190     3
1189    CE2    CB   0.000     4
1190    CE3   CR6  -0.140     5
1191    HE3   HCR   0.140     5
1192    CZ2   CR6  -0.140     6
1193    HZ2   HCR   0.140     6
1194    CZ3   CR6  -0.140     7
1195    HZ3   HCR   0.140     7
1196    CH2   CR6  -0.140     8
1197    HH2   HCR   0.140     8
1198      C     C   0.380     9
1199      O     O  -0.380     9
1200  [ bonds ]
1201      N     H
1202      N    CA
1203     CA    HA
1204     CA    CB
1205     CA     C
1206     CB   HB1
1207     CB   HB2
1208     CB    CG
1209     CG   CD1
1210     CG   CD2
1211    CD1   HD1
1212    CD1   NE1
1213    CD2   CE2
1214    CD2   CE3
1215    NE1   HE1
1216    NE1   CE2
1217    CE2   CZ2
1218    CE3   HE3
1219    CE3   CZ3
1220    CZ2   HZ2
1221    CZ2   CH2
1222    CZ3   HZ3
1223    CZ3   CH2
1224    CH2   HH2
1225      C     O
1226     -C     N
1227  [ impropers ]
1228      N    -C    CA     H
1229     CA     N     C    CB
1230     CG   CD1   CD2    CB
1231    CD2    CG   CD1   NE1
1232    CD1    CG   CD2   CE2
1233     CG   CD1   NE1   CE2
1234     CG   CD2   CE2   NE1
1235    CD1   NE1   CE2   CD2
1236    NE1   CD1   CE2   HE1
1237    CD1    CG   NE1   HD1
1238    CD2   CE2   CE3    CG
1239    CE2   CD2   CZ2   NE1
1240    CE3   CD2   CE2   CZ2
1241    CD2   CE2   CZ2   CH2
1242    CE2   CD2   CE3   CZ3
1243    CE2   CZ2   CH2   CZ3
1244    CD2   CE3   CZ3   CH2
1245    CE3   CZ3   CH2   CZ2
1246    CE3   CD2   CZ3   HE3
1247    CZ3   CE3   CH2   HZ3
1248    CH2   CZ3   CZ2   HH2
1249    CZ2   CH2   CE2   HZ2
1250     -C   -CA     N    -O
1251
1252 [ TYR ]
1253  [ atoms ]
1254      N     N  -0.280     0
1255      H     H   0.280     0
1256     CA    C1   0.000     1
1257     HA    HC   0.000     1
1258     CB    C2   0.000     2
1259    HB1    HC   0.000     2
1260    HB2    HC   0.000     2
1261     CG    CB   0.000     3
1262    CD1   CR6  -0.140     4
1263    HD1   HCR   0.140     4
1264    CD2   CR6  -0.140     5
1265    HD2   HCR   0.140     5
1266    CE1   CR6  -0.140     6
1267    HE1   HCR   0.140     6
1268    CE2   CR6  -0.140     7
1269    HE2   HCR   0.140     7
1270     CZ    CB   0.150     8
1271     OH    OA  -0.548     8
1272     HH    HO   0.398     8
1273      C     C   0.380     9
1274      O     O  -0.380     9
1275  [ bonds ]
1276      N     H
1277      N    CA
1278     CA    HA
1279     CA    CB
1280     CA     C
1281     CB   HB1
1282     CB   HB2
1283     CB    CG
1284     CG   CD1
1285     CG   CD2
1286    CD1   HD1
1287    CD1   CE1
1288    CD2   HD2
1289    CD2   CE2
1290    CE1   HE1
1291    CE1    CZ
1292    CE2   HE2
1293    CE2    CZ
1294     CZ    OH
1295     OH    HH
1296      C     O
1297     -C     N
1298  [ impropers ]
1299      N    -C    CA     H
1300     CA     N     C    CB
1301     CG   CD1   CD2    CB
1302    CD2    CG   CD1   CE1
1303    CD1    CG   CD2   CE2
1304     CG   CD1   CE1    CZ
1305     CG   CD2   CE2    CZ
1306    CD1   CE1    CZ   CE2
1307    CD2   CE2    CZ   CE1
1308    CD1   CE1    CG   HD1
1309    CE1   CD1    CZ   HE1
1310     CZ   CE1   CE2    OH
1311    CE2    CZ   CD2   HE2
1312    CD2   CE2    CG   HD2
1313     -C   -CA     N    -O
1314
1315 [ VAL ]
1316  [ atoms ]
1317      N     N  -0.280     0
1318      H     H   0.280     0
1319     CA    C1   0.000     1
1320     HA    HC   0.000     1
1321     CB    C1   0.000     2
1322     HB    HC   0.000     2
1323    CG1    C3   0.000     3
1324   HG11    HC   0.000     3
1325   HG12    HC   0.000     3
1326   HG13    HC   0.000     3
1327    CG2    C3   0.000     4
1328   HG21    HC   0.000     4
1329   HG22    HC   0.000     4
1330   HG23    HC   0.000     4
1331      C     C   0.380     5
1332      O     O  -0.380     5
1333  [ bonds ]
1334      N     H
1335      N    CA
1336     CA    HA
1337     CA    CB
1338     CA     C
1339     CB    HB
1340     CB   CG1
1341     CB   CG2
1342    CG1  HG11
1343    CG1  HG12
1344    CG1  HG13
1345    CG2  HG21
1346    CG2  HG22
1347    CG2  HG23
1348      C     O
1349     -C     N
1350  [ impropers ]
1351      N    -C    CA     H
1352     -C   -CA     N    -O
1353     CA     N     C    CB
1354     CB   CG2   CG1    CA
1355
1356 [ HEME ]
1357  [ atoms ]
1358     FE          FE      0.400     0
1359     NA          NP      -0.100     0
1360     NB          NP      -0.100     0
1361     NC          NP      -0.100     0
1362     ND          NP      -0.100     0
1363    CHA          CR61    0.000     1
1364    HHA          HC      0.000     1
1365    C1A          CHE     0.000     2
1366    C2A          CHE     0.000     3
1367    C3A          CHE     0.000     4
1368    C4A          CHE     0.000     5
1369    CMA          C3      0.000     6
1370    HMA1         HC      0       6
1371    HMA2         HC      0       6
1372    HMA3         HC      0       6
1373    CAA          C2      0.000     7
1374    HAA1         HC      0       7
1375    HAA2         HC      0       7
1376    CBA          C2      0.000     8
1377    HBA1         HC      0       8
1378    HBA2         HC      0       8
1379    CGA          C       0.270     9
1380    O1A          OM      -0.635     9
1381    O2A          OM      -0.635     9
1382    H2A          H       0       9
1383    CHB          CR61    0.000    10
1384    HHB          HC      0.000    10
1385    C1B          CHE     0.000    11
1386    C2B          CHE     0.000    12
1387    H2B          HC      0       12
1388    C3B          CHE     0.000    13
1389    C4B          CHE     0.000    14
1390    CMB          C3      0.000    15
1391    HMB1         HC      0       15
1392    HMB2         HC      0       15
1393    HMB3         HC      0       15
1394    CAB          CR61    0.000    16
1395    HAB1         HC      0.000    16
1396    HAB2         HC      0.000    16
1397    CBB          C2      0.000    17
1398    HBB1         HC      0.000    17
1399    HBB2         HC      0.000    17
1400    HBB3         HC      0.000    17
1401    CHC          CR61    0.000    18
1402    HHC          HC      0.000    18
1403    C1C          CHE     0.000    19
1404    C2C          CHE     0.000    20
1405    H2C          HC      0       20
1406    C3C          CHE     0.000    21
1407    C4C          CHE     0.000    22
1408    CMC          C3      0.000    23
1409    HMC1         HC      0       23
1410    HMC2         HC      0       23
1411    HMC3         HC      0       23
1412    CAC          CR61    0.000    24
1413    HAC1         HC      0       24
1414    HAC2         HC      0       24
1415    CBC          C3      0.000    25
1416    HBC1         HC      0       25
1417    HBC2         HC      0       25
1418    HBC3         HC      0       25
1419    CHD          CR61    0.000    26
1420    HHD          HC      0.000    26
1421    C1D          CHE     0.000    27
1422    C2D          CHE     0.000    28
1423    C3D          CHE     0.000    29
1424    C4D          CHE     0.000    30
1425    CMD          C3      0.000    31
1426    HMD1         HC      0       31
1427    HMD2         HC      0       31
1428    HMD3         HC      0       31
1429    CAD          C2      0.000    32
1430    HAD1         HC      0       32
1431    HAD2         HC      0       32
1432    CBD          C2      0.000    33
1433    HBD1         HC      0       33
1434    HBD2         HC      0       33
1435    CGD          C       0.270    34
1436    O1D          OM      -0.635    34
1437    O2D          OM      -0.635    34
1438    H2D          H       0       34
1439  [ bonds ]
1440     FE    NA
1441     FE    NB
1442     FE    NC
1443     FE    ND
1444     NA   C1A
1445    C1A   C2A
1446    C2A   C3A
1447    C3A   C4A
1448     NA   C4A
1449    C2A   CAA
1450    CAA   CBA
1451    CBA   CGA
1452    CGA   O1A
1453    CGA   O2A
1454    C3A   CMA
1455    CMA  HMA1
1456    CMA  HMA2
1457    CMA  HMA3
1458    C4A   CHB
1459    CHB   C1B
1460     NB   C1B
1461    C1B   C2B
1462    C2B   C3B
1463    C3B   C4B
1464     NB   C4B
1465    C2B   CMB
1466    CMB  HMB1
1467    CMB  HMB2
1468    CMB  HMB3
1469    C3B   CAB
1470    CAB   CBB
1471    C4B   CHC
1472    CHC   C1C
1473     NC   C1C
1474    C1C   C2C
1475    C2C   C3C
1476    C3C   C4C
1477     NC   C4C
1478    C2C   CMC
1479    CMC  HMC1
1480    CMC  HMC2
1481    CMC  HMC3
1482    C3C   CAC
1483    CAC   CBC
1484    C4C   CHD
1485    CHD   C1D
1486     ND   C1D
1487    C1D   C2D
1488    C2D   C3D
1489    C3D   C4D
1490     ND   C4D
1491    C2D   CMD
1492    CMD  HMD1
1493    CMD  HMD2
1494    CMD  HMD3
1495    C3D   CAD
1496    CAD   CBD
1497    CBD   CGD
1498    CGD   O1D
1499    CGD   O2D
1500    CHA   C4D
1501    CHA   C1A
1502  [ angles ]
1503 ;   ai    aj    ak
1504     NA    FE    NC     ANG_180_0
1505     NB    FE    ND     ANG_180_0
1506  [ dihedrals ]
1507 ;   ai    aj    ak    al
1508     ND    FE    NA   C1A       DIH_0_0_2
1509     NA    FE    NB   C1B       DIH_0_0_2
1510     NB    FE    NC   C1C       DIH_0_0_2
1511     NC    FE    ND   C1D       DIH_0_0_2
1512     FE    NA   C1A   CHA       DIH_0_0_2
1513     FE    NA   C4A   C3A       DIH_0_0_2
1514     FE    NB   C1B   CHB       DIH_0_0_2
1515     FE    NB   C4B   C3B       DIH_0_0_2
1516     FE    NC   C1C   CHC       DIH_0_0_2
1517     FE    NC   C4C   C3C       DIH_0_0_2
1518     FE    ND   C1D   CHD       DIH_0_0_2
1519     FE    ND   C4D   CHA       DIH_0_0_2
1520     NA   C1A   C2A   C3A       DIH_0_0_2
1521    C1A   C2A   C3A   C4A       DIH_0_0_2
1522    C2A   C3A   C4A    NA       DIH_0_0_2
1523     NB   C1B   C2B   C3B       DIH_0_0_2
1524    C1B   C2B   C3B   C4B       DIH_0_0_2
1525    C2B   C3B   C4B    NB       DIH_0_0_2
1526     NC   C1C   C2C   C3C       DIH_0_0_2
1527    C1C   C2C   C3C   C4C       DIH_0_0_2
1528    C2C   C3C   C4C    NC       DIH_0_0_2
1529     ND   C1D   C2D   C3D       DIH_0_0_2
1530    C1D   C2D   C3D   C4D       DIH_0_0_2
1531    C2D   C3D   C4D    ND       DIH_0_0_2
1532  [ impropers ]
1533     FE   C1A   C4A    NA
1534     FE   C1B   C4B    NB
1535     FE   C1C   C4C    NC
1536     FE   C1D   C4D    ND
1537    CHA    NA   C2A   C1A
1538    CHB    NA   C3A   C4A
1539    CHB    NB   C2B   C1B
1540    CHC    NB   C3B   C4B
1541    CHC    NC   C2C   C1C
1542    CHD    NC   C3C   C4C
1543    CHD    ND   C2D   C1D
1544    CHA    ND   C3D   C4D
1545    C2A   C1A   C3A   CAA
1546    C3A   C2A   C4A   CMA
1547    C2B   C1B   C3B   CMB
1548    C3B   C2B   C4B   CAB
1549    C2C   C1C   C3C   CMC
1550    C3C   C2C   C4C   CAC
1551    C2D   C1D   C3D   CMD
1552    C3D   C2D   C4D   CAD
1553    CBA   O1A   O2A   CGA
1554    CBD   O1D   O2D   CGD
1555
1556 [ OCT ]
1557  [ atoms ]
1558     C1    C3   0.0     0
1559    H11    HC   0.0     0
1560    H12    HC   0.0     0
1561    H13    HC   0.0     0
1562     C2    C2   0.0     1
1563    H21    HC   0.0     1
1564    H22    HC   0.0     1
1565     C3    C2   0.0     2
1566    H31    HC   0.0     2
1567    H32    HC   0.0     2
1568     C4    C2   0.0     3
1569    H41    HC   0.0     3
1570    H42    HC   0.0     3
1571     C5    C2   0.0     4
1572    H51    HC   0.0     4
1573    H52    HC   0.0     4
1574     C6    C2   0.0     5
1575    H61    HC   0.0     5
1576    H62    HC   0.0     5
1577     C7    C2   0.0     6
1578    H71    HC   0.0     6
1579    H72    HC   0.0     6
1580     C8    C2   0.15    7
1581    H81    HC   0.0     7
1582    H82    HC   0.0     7
1583     O9    OA  -0.548   7
1584    H10    HO   0.398   7
1585
1586  [ bonds ]
1587 C1      H11
1588 C1      H12
1589 C1      H13
1590 C1      C2
1591 C2      H21
1592 C2      H22
1593 C2      C3
1594 C3      H31
1595 C3      H32
1596 C3      C4
1597 C4      H41
1598 C4      H42
1599 C4      C5
1600 C5      H51
1601 C5      H52
1602 C5      C6
1603 C6      H61
1604 C6      H62
1605 C6      C7
1606 C7      H71
1607 C7      H72
1608 C7      C8
1609 C8      H81
1610 C8      H82
1611 C8      O9
1612 O9      H10
1613
1614
1615 [ ZN ]
1616  [ atoms ]
1617     ZN    ZN   2.000     0
1618
1619 [ CA ]
1620  [ atoms ]
1621     CA    CA   2.000     0
1622
1623