share/top/gmx.ff/h2po4.itp

   1 ;
   2 ; Force field based on GROMOS with new charges as described in
   3 ; D. van der Spoel, K.A. Feenstra, M.A. Hemminga and H.J.C. Berendsen:
   4 ; Molecular modeling of the RNA binding N-terminal part of cowpea chlorotic
   5 ; mottle virus coat protein in solution with phosphate ions
   6 ; Biophys. J. 71 pp. 2920-2932 (1996)
   7 ;
   8 [ moleculetype ]
   9 ; name  nrexcl
  10 h2po4   4
  11
  12 [ atoms ]
  13 ;   nr    type   resnr  residu    atom    cgnr        charge          mass
  14 ; use charges from Janez Mavri
  15      1      OA       1     PI       O1       1          -0.777
  16      2      OA       1     PI       O2       1          -0.777
  17      3      OM       1     PI       O3       1          -0.943
  18      4      OM       1     PI       O4       1          -0.943
  19      5       P       1     PI        P       1           1.596
  20      6      HO       1     PI       H1       1           0.422
  21      7      HO       1     PI       H2       1           0.422
  22
  23 [ bonds ]
  24 ;  ai    aj funct           c0           c1
  25     5     1     1 1.637000e-01
  26     5     2     1 1.637000e-01
  27     5     3     1 1.478000e-01
  28     5     4     1 1.478000e-01
  29     6     1     1 0.943000e-01
  30     7     2     1 0.943000e-01
  31
  32 [ angles ]
  33 ;  ai    aj    ak funct           c0     c1
  34     2     5     1     1 1.015000e+02    400
  35     3     5     1     1 1.059000e+02
  36     4     5     1     1 1.082000e+02
  37     3     5     2     1 1.059000e+02
  38     4     5     2     1 1.082000e+02
  39     4     5     3     1 1.248000e+02
  40     6     1     5     1 1.082000e+02
  41     7     2     5     1 1.082000e+02
  42
  43 [ dihedrals ]
  44 ;  ai    aj    ak    al funct
  45     6     1     5     2     1
  46     7     2     5     1     1
  47