share/top/gmx.ff/dlg.itp

   1 ; topology for 1,2-dilauroyl-sn-glycerol. Peter Tieleman, April 2 1995
   2
   3 [ moleculetype ]
   4 ;name    nrexcl
   5 DLG         3
   6
   7 [ atoms ]
   8 ;   nr    type   resnr  residu    atom    cgnr        charge    ; total charge
   9      1     CH2       1    DLG     C1        1     0.1500       ; 0.15
  10      2      OA       1    DLG     OA2       1    -0.5480       ; -0.4
  11      3      HO       1    DLG     HO3       1     0.3980       ; 0
  12      4     CH1       1    DLG     C4        2     0.1000       ; 0.10
  13      5      OS       1    DLG     OS5       2    -0.1800       ; -0.08
  14      6       C       1    DLG     C6        2     0.2700       ; 0.19
  15      7       O       1    DLG     O7        2    -0.1900       ; 0
  16      8     CP2       1    DLG     C8        3     0
  17      9     CP2       1    DLG     C9        4     0
  18     10     CP2       1    DLG     C10       5     0
  19     11     CP2       1    DLG     C11       6     0
  20     12     CP2       1    DLG     C12       7     0
  21     13     CP2       1    DLG     C13       8     0
  22     14     CP2       1    DLG     C14       9     0
  23     15     CP2       1    DLG     C15      10     0
  24     16     CP2       1    DLG     C16      11     0
  25     17     CP2       1    DLG     C17      12     0
  26     18     CP3       1    DLG     C18      13     0
  27     19     CH2       1    DLG     C19      14     0.1000
  28     20      OS       1    DLG     OS2      14    -0.1800
  29     21       C       1    DLG     C21      14     0.2700
  30     22       O       1    DLG     O22      14    -0.1900
  31     23     CP2       1    DLG     C23      15     0
  32     24     CP2       1    DLG     C24      16     0
  33     25     CP2       1    DLG     C25      17     0
  34     26     CP2       1    DLG     C26      18     0
  35     27     CP2       1    DLG     C27      19     0
  36     28     CP2       1    DLG     C28      20     0
  37     29     CP2       1    DLG     C29      21     0
  38     30     CP2       1    DLG     C30      22     0
  39     31     CP2       1    DLG     C31      23     0
  40     32     CP2       1    DLG     C32      24     0
  41     33     CP3       1    DLG     C33      25     0
  42
  43 [ bonds ]
  44 ;  ai    aj funct           c0           c1
  45     3     2     1
  46     1     2     1
  47     1     4     1
  48     4     5     1
  49     6     5     1
  50     6     7     1
  51     8     6     1
  52     8     9     1
  53     9    10     1
  54    10    11     1
  55    11    12     1
  56    12    13     1
  57    13    14     1
  58    14    15     1
  59    15    16     1
  60    16    17     1
  61    17    18     1
  62    19     4     1
  63    19    20     1
  64    20    21     1
  65    21    22     1
  66    23    21     1
  67    23    24     1
  68    24    25     1
  69    25    26     1
  70    26    27     1
  71    27    28     1
  72    28    29     1
  73    29    30     1
  74    30    31     1
  75    31    32     1
  76    32    33     1
  77
  78 [ pairs ]
  79 ;  ai    aj funct
  80     1     6     1  ;
  81     1    20     1  ;
  82     2     5     1  ;
  83     2    19     1  ;
  84     3     4     1  ;
  85     4     7     1  ;
  86     4     8     1  ;
  87     4    21     1  ;
  88     5     9     1  ;
  89     5    20     1  ;
  90     6    10     1  ;
  91     6    19     1  ;
  92     7     9     1  ;
  93 ;    8    11     1 ; Not used for Ryckaert-Bellemans potential
  94 ;    9    12     1 ;
  95 ;   10    13     1 ;
  96 ;   11    14     1 ;
  97 ;   12    15     1 ;
  98 ;   13    16     1 ;
  99 ;   14    17     1 ;
 100 ;   15    18     1 ;
 101    19    22     1  ;
 102    19    23     1  ;
 103    20    24     1  ;
 104    21    25     1  ;
 105    22    24     1  ;
 106 ;   23    26     1 ;
 107 ;   24    27     1 ;
 108 ;   25    28     1 ;
 109 ;   26    29     1 ;
 110 ;   27    30     1 ;
 111 ;   28    31     1 ;
 112 ;   29    32     1 ;
 113 ;   30    33     1
 114
 115 [ angles ]
 116 ;  ai    aj    ak funct           c0           c1
 117     3     2     1     1
 118     4     1     2     1
 119     1     4     5     1
 120     4     5     6     1
 121     5     6     7     1
 122     8     6     7     1
 123     9     8     6     1
 124     8     9    10     1
 125     9    10    11     1
 126    10    11    12     1
 127    11    12    13     1
 128    12    13    14     1
 129    13    14    15     1
 130    14    15    16     1
 131    15    16    17     1
 132    16    17    18     1
 133     1     4    19     1
 134    19     4     5     1
 135     4    19    20     1
 136    19    20    21     1
 137    20    21    22     1
 138    23    21    22     1
 139    21    23    24     1
 140    23    24    25     1
 141    24    25    26     1
 142    25    26    27     1
 143    26    27    28     1
 144    27    28    29     1
 145    28    29    30     1
 146    29    30    31     1
 147    30    31    32     1
 148    31    32    33     1
 149
 150 [ dihedrals ]
 151 ;  ai    aj    ak    al funct           c0           c1           c2
 152     4     1     2     3     1
 153     2     1     4     5     1
 154     2     1     4    19     1
 155    20    19     4     1     1
 156    20    19     4     5     1
 157     1     4     5     6     1
 158    19     4     5     6     1
 159     7     6     5     4     1
 160     8     6     5     4     1
 161     9     8     6     5     1
 162     9     8     6     7     1
 163     6     8     9    10     1
 164     8     9    10    11     3
 165     9    10    11    12     3
 166    10    11    12    13     3
 167    11    12    13    14     3
 168    12    13    14    15     3
 169    13    14    15    16     3
 170    14    15    16    17     3
 171    15    16    17    18     3
 172    21    20    19     4     1
 173    22    21    20    19     1
 174    23    21    20    19     1
 175    24    23    21    20     1
 176    24    23    21    22     1
 177    21    23    24    25     1
 178    23    24    25    26     3
 179    24    25    26    27     3
 180    25    26    27    28     3
 181    26    27    28    29     3
 182    27    28    29    30     3
 183    28    29    30    31     3
 184    29    30    31    32     3
 185    30    31    32    33     3
 186
 187 [ dihedrals ]
 188 ;  ai    aj    ak    al funct
 189     4     1    19     5     2
 190     6     5     8     7     2
 191    21    20    23    22     2
 192
 193
 194
 195
 196
 197
 198
 199
 200
 201
 202
 203
 204
 205
 206
 207
 208