share/top/gmx.ff/aminoacids.rtp

   1 ;
   2 ;
   3 ;       This source code is part of
   4 ;
   5 ;        G   R   O   M   A   C   S
   6 ;
   7 ; GROningen MAchine for Chemical Simulations
   8 ;
   9 ;               VERSION 3.0b
  10 ;
  11 ; Copyright (c) 1991-2001
  12 ; BIOSON Research Institute, Dept. of Biophysical Chemistry
  13 ; University of Groningen, The Netherlands
  14 ;
  15 ; Please use these references in all publications using GROMACS:
  16 ; GROMACS: A message-passing parallel molecular dynamics implementation
  17 ; H.J.C. Berendsen, D. van der Spoel and R. van Drunen
  18 ; Comp. Phys. Comm. 91, 43-56 (1995)
  19 ;
  20 ; GROMACS 3.0: A package for molecular simulation and trajectory analysis
  21 ; Erik Lindahl, Berk Hess and David van der Spoel
  22 ; J. Mol. Mod. 7 pp. 306-317 (2001)
  23 ;
  24 ; Also check out our WWW page:
  25 ; http://www.gromacs.org
  26 ; or e-mail to:
  27 ; gromacs@gromacs.org
  28 ;
  29 ; And Hey:
  30 ; GROningen MAchine for Chemical Simulation
  31 ;
  32 [ bondedtypes ]
  33 ; Column 1 : default bondtype
  34 ; Column 2 : default angletype
  35 ; Column 3 : default proper dihedraltype
  36 ; Column 4 : default improper dihedraltype
  37 ; Column 5 : This controls the generation of dihedrals from the bonding.
  38 ;            All possible dihedrals are generated automatically. A value of
  39 ;            1 here means that all these are retained. A value of
  40 ;            0 here requires generated dihedrals be removed if
  41 ;              * there are any dihedrals on the same central atoms
  42 ;                specified in the residue topology, or
  43 ;              * there are other identical generated dihedrals
  44 ;                sharing the same central atoms, or
  45 ;              * there are other generated dihedrals sharing the
  46 ;                same central bond that have fewer hydrogen atoms
  47 ; Column 6 : number of neighbors to exclude from non-bonded interactions
  48 ; Column 7 : 1 = generate 1,4 interactions between pairs of hydrogen atoms
  49 ;            0 = do not generate such
  50 ; Column 8 : 1 = remove proper dihedrals if found centered on the same
  51 ;                bond as an improper dihedral
  52 ;            0 = do not generate such
  53 ; bonds  angles  dihedrals  impropers all_dihedrals nrexcl HH14 RemoveDih
  54      1       1          1          2        0         3      0     1
  55
  56 [ ABU ]
  57  [ atoms ]
  58      N     N  -0.280     0
  59      H     H   0.280     0
  60     CA   CH1   0.000     1
  61     CB   CH2   0.000     2
  62     CG   CH3   0.000     3
  63      C     C   0.380     4
  64      O     O  -0.380     4
  65  [ bonds ]
  66      N     H
  67      N    CA
  68     CA     C
  69      C     O
  70     -C     N
  71     CA    CB
  72     CB    CG
  73  [ impropers ]
  74      N    -C    CA     H
  75     -C   -CA     N    -O
  76     CA     N     C    CB
  77
  78 [ ACE ]
  79  [ atoms ]
  80     CA   CH3   0.000     0
  81      C     C   0.380     1
  82      O     O  -0.380     1
  83  [ bonds ]
  84      C    CA
  85      C     O
  86
  87 [ ADE ]
  88  [ atoms ]
  89      P     P   0.990     0
  90    O1P    OM  -0.635     0
  91    O2P    OM  -0.635     0
  92    O5*    OS  -0.360     0
  93    C5*   CS2   0.000     1
  94    C4*   CS1   0.160     2
  95    O4*    OS  -0.360     2
  96    C1*   CS1   0.200     2
  97     N9  NR5*  -0.200     3
  98     C4    CB   0.200     3
  99     N3   NR6  -0.360     4
 100     C2  CR61   0.360     4
 101     N1   NR6  -0.360     5
 102     C6    CB   0.360     5
 103     N6    NT  -0.830     6
 104    H61     H   0.415     6
 105    H62     H   0.415     6
 106     C5    CB   0.000     7
 107     N7   NR5  -0.360     8
 108     C8  CR51   0.360     8
 109    C2*   CS1   0.150     9
 110    O2*    OA  -0.548     9
 111    H2*    HO   0.398     9
 112    C3*   CS1   0.000    10
 113    O3*    OS  -0.360    11
 114  [ bonds ]
 115      P   O1P
 116      P   O2P
 117      P   O5*
 118    O5*   C5*
 119    C5*   C4*
 120    C4*   O4*
 121    C4*   C3*
 122    O4*   C1*
 123    C1*    N9
 124    C1*   C2*
 125     N9    C4
 126     N9    C8
 127     C4    N3
 128     C4    C5
 129     N3    C2
 130     C2    N1
 131     N1    C6
 132     C6    N6
 133     C6    C5
 134     N6   H61
 135     N6   H62
 136     C5    N7
 137     N7    C8
 138    C2*   O2*
 139    C2*   C3*
 140    O2*   H2*
 141    C3*   O3*
 142   -O3*     P
 143  [ impropers ]
 144    C4*   O4*   C5*   C3*
 145    C3*   C2*   O3*   C4*
 146    C1*    N9   O4*   C2*
 147     N9    C8    C4   C1*
 148     C4    N9    C8    N7
 149     C8    N9    C4    C5
 150     N9    C8    N7    C5
 151     N9    C4    C5    N7
 152     C8    N7    C5    C4
 153     C4    N9    N3    C5
 154     C5    C6    N7    C4
 155     N3    C4    C5    C6
 156     C4    C5    C6    N1
 157     C5    C4    N3    C2
 158     C5    C6    N1    C2
 159     C4    N3    C2    N1
 160     N3    C2    N1    C6
 161     C6    C5    N1    N6
 162     N6   H61   H62    C6
 163    C2*   O2*   C3*   C1*
 164
 165 [ AIB ]
 166  [ atoms ]
 167      N     N  -0.280     0
 168      H     H   0.280     0
 169     CA   CH1   0.000     1
 170     CB1  CH3   0.000     2
 171     CB2  CH3   0.000     3
 172      C     C   0.380     4
 173      O     O  -0.380     4
 174  [ bonds ]
 175      N     H
 176      N    CA
 177     CA     C
 178      C     O
 179     -C     N
 180     CA    CB1
 181     CA    CB2
 182  [ impropers ]
 183      N    -C    CA     H
 184     -C   -CA     N    -O
 185     CA     N     C    CB1
 186
 187 [ ALA ]
 188  [ atoms ]
 189      N     N  -0.280     0
 190      H     H   0.280     0
 191     CA   CH1   0.000     1
 192     CB   CH3   0.000     2
 193      C     C   0.380     3
 194      O     O  -0.380     3
 195  [ bonds ]
 196      N     H
 197      N    CA
 198     CA     C
 199      C     O
 200     -C     N
 201     CA    CB
 202  [ impropers ]
 203      N    -C    CA     H
 204     -C   -CA     N    -O
 205     CA     N     C    CB
 206
 207 [ ARG ]
 208  [ atoms ]
 209      N     N  -0.280     0
 210      H     H   0.280     0
 211     CA   CH1   0.000     1
 212     CB   CH2   0.000     2
 213     CG   CH2   0.000     3
 214     CD   CH2   0.090     4
 215     NE    NE  -0.110     4
 216     HE     H   0.240     4
 217     CZ     C   0.340     4
 218    NH1    NZ  -0.260     4
 219   HH11     H   0.240     4
 220   HH12     H   0.240     4
 221    NH2    NZ  -0.260     4
 222   HH21     H   0.240     4
 223   HH22     H   0.240     4
 224      C     C   0.380     5
 225      O     O  -0.380     5
 226  [ bonds ]
 227      N     H
 228      N    CA
 229     CA     C
 230      C     O
 231     -C     N
 232     CA    CB
 233     CB    CG
 234     CG    CD
 235     CD    NE
 236     NE    HE
 237     NE    CZ
 238     CZ   NH1
 239     CZ   NH2
 240    NH1  HH11
 241    NH1  HH12
 242    NH2  HH21
 243    NH2  HH22
 244  [ impropers ]
 245      N    -C    CA     H
 246     -C   -CA     N    -O
 247     CA     N     C    CB
 248     NE    CD    CZ    HE
 249     CZ   NH1   NH2    NE
 250    NH1  HH11  HH12    CZ
 251    NH2  HH21  HH22    CZ
 252
 253 [ ARGN ]
 254  [ atoms ]
 255      N     N  -0.280     0
 256      H     H   0.280     0
 257     CA   CH1   0.000     1
 258     CB   CH2   0.000     2
 259     CG   CH2   0.000     3
 260     CD   CH2   0.000     4
 261     NE    NE  -0.280     5
 262     HE     H   0.280     5
 263     CZ     C   0.150     6
 264    NH1    NE  -0.548     6
 265    HH1     H   0.398     6
 266    NH2    NZ  -0.830     7
 267   HH21     H   0.415     7
 268   HH22     H   0.415     7
 269      C     C   0.380     8
 270      O     O  -0.380     8
 271  [ bonds ]
 272      N     H
 273      N    CA
 274     CA     C
 275      C     O
 276     -C     N
 277     CA    CB
 278     CB    CG
 279     CG    CD
 280     CD    NE
 281     NE    HE
 282     NE    CZ
 283     CZ   NH1
 284     CZ   NH2
 285    NH1   HH1
 286    NH2  HH21
 287    NH2  HH22
 288  [ impropers ]
 289      N    -C    CA     H
 290     -C   -CA     N    -O
 291     CA     N     C    CB
 292     NE    CD    CZ    HE
 293     CZ   NH1   NH2    NE
 294    NH2  HH21  HH22    CZ
 295
 296 [ ASN ]
 297  [ atoms ]
 298      N     N  -0.280     0
 299      H     H   0.280     0
 300     CA   CH1   0.000     1
 301     CB   CH2   0.000     2
 302     CG     C   0.380     3
 303    OD1     O  -0.380     3
 304    ND2    NT  -0.830     4
 305   HD21     H   0.415     4
 306   HD22     H   0.415     4
 307      C     C   0.380     5
 308      O     O  -0.380     5
 309  [ bonds ]
 310      N     H
 311      N    CA
 312     CA     C
 313      C     O
 314     -C     N
 315     CA    CB
 316     CB    CG
 317     CG   OD1
 318     CG   ND2
 319    ND2  HD21
 320    ND2  HD22
 321  [ impropers ]
 322      N    -C    CA     H
 323     -C   -CA     N    -O
 324     CA     N     C    CB
 325     CG   OD1   ND2    CB
 326    ND2  HD21  HD22    CG
 327
 328 [ ASP ]
 329  [ atoms ]
 330      N     N  -0.280     0
 331      H     H   0.280     0
 332     CA   CH1   0.000     1
 333     CB   CH2   0.000     2
 334     CG     C   0.270     3
 335    OD1    OM  -0.635     3
 336    OD2    OM  -0.635     3
 337      C     C   0.380     4
 338      O     O  -0.380     4
 339  [ bonds ]
 340      N     H
 341      N    CA
 342     CA     C
 343      C     O
 344     -C     N
 345     CA    CB
 346     CB    CG
 347     CG   OD1
 348     CG   OD2
 349  [ impropers ]
 350      N    -C    CA     H
 351     -C   -CA     N    -O
 352     CA     N     C    CB
 353     CG   OD1   OD2    CB
 354
 355 [ ASPH ]
 356  [ atoms ]
 357      N     N  -0.280     0
 358      H     H   0.280     0
 359     CA   CH1   0.000     1
 360     CB   CH2   0.000     2
 361     CG     C   0.530     3
 362    OD1     O  -0.380     3
 363    OD2    OA  -0.548     3
 364    HD2    HO   0.398     3
 365      C     C   0.380     4
 366      O     O  -0.380     4
 367  [ bonds ]
 368      N     H
 369      N    CA
 370     CA     C
 371      C     O
 372     -C     N
 373     CA    CB
 374     CB    CG
 375     CG   OD1
 376     CG   OD2
 377    OD2   HD2
 378  [ impropers ]
 379      N    -C    CA     H
 380     -C   -CA     N    -O
 381     CA     N     C    CB
 382     CG   OD1   OD2    CB
 383
 384 [ ATP ]
 385  [ atoms ]
 386    AN9  NR5*  -0.200     0
 387    AC4    CB   0.200     0
 388    AN3   NR6  -0.360     1
 389    AC2  CR61   0.360     1
 390    AN1   NR6  -0.360     2
 391    AC6    CB   0.360     2
 392    AN6    NT  -0.830     3
 393   AH61     H   0.415     3
 394   AH62     H   0.415     3
 395    AC5    CB   0.000     4
 396    AN7   NR5  -0.360     5
 397    AC8  CR51   0.360     5
 398   AC1*   CS1   0.200     6
 399   AO4*    OS  -0.360     6
 400   AC4*   CS1   0.160     6
 401   AC2*   CS1   0.150     7
 402   AO2*    OA  -0.548     7
 403   AH2*    HO   0.398     7
 404   AC3*   CS1   0.150     8
 405   AO3*    OA  -0.548     8
 406   AH3*    HO   0.398     8
 407   AC5*   CS2   0.000     9
 408   AO5*    OS  -0.360    10
 409    APA     P   0.705    10
 410  AO1PA    OM  -0.635    10
 411  AO2PA    OM  -0.635    10
 412  AO3PA    OS  -0.360    11
 413    APB     P   0.705    11
 414  AO1PB    OM  -0.635    11
 415  AO2PB    OM  -0.635    11
 416  AO3PB    OS  -0.360    12
 417    APG     P   0.630    12
 418  AO1PG    OM  -0.635    12
 419  AO2PG    OM  -0.635    12
 420  AO3PG    OA  -0.548    12
 421  AH3PG    HO   0.398    12
 422  [ bonds ]
 423    AN9   AC4
 424    AN9   AC8
 425    AN9  AC1*
 426    AC4   AN3
 427    AC4   AC5
 428    AN3   AC2
 429    AC2   AN1
 430    AN1   AC6
 431    AC6   AN6
 432    AC6   AC5
 433    AN6  AH61
 434    AN6  AH62
 435    AC5   AN7
 436    AN7   AC8
 437   AC1*  AO4*
 438   AC1*  AC2*
 439   AO4*  AC4*
 440   AC4*  AC3*
 441   AC4*  AC5*
 442   AC2*  AO2*
 443   AC2*  AC3*
 444   AO2*  AH2*
 445   AC3*  AO3*
 446   AO3*  AH3*
 447   AC5*  AO5*
 448   AO5*   APA
 449    APA AO1PA
 450    APA AO2PA
 451    APA AO3PA
 452  AO3PA   APB
 453    APB AO1PB
 454    APB AO2PB
 455    APB AO3PB
 456  AO3PB   APG
 457    APG AO1PG
 458    APG AO2PG
 459    APG AO3PG
 460  AO3PG AH3PG
 461  [ impropers ]
 462    AN9   AC8   AC4  AC1*
 463    AC4   AN9   AC8   AN7
 464    AC8   AN9   AC4   AC5
 465    AN9   AC8   AN7   AC5
 466    AN9   AC4   AC5   AN7
 467    AC8   AN7   AC5   AC4
 468    AC4   AN9   AN3   AC5
 469    AC5   AC6   AN7   AC4
 470    AN3   AC4   AC5   AC6
 471    AC4   AC5   AC6   AN1
 472    AC5   AC4   AN3   AC2
 473    AC5   AC6   AN1   AC2
 474    AC4   AN3   AC2   AN1
 475    AN3   AC2   AN1   AC6
 476    AC6   AC5   AN1   AN6
 477    AN6  AH61  AH62   AC6
 478   AC1*   AN9  AO4*  AC2*
 479   AC4*  AO4*  AC5*  AC3*
 480   AC2*  AO2*  AC3*  AC1*
 481   AC3*  AC2*  AO3*  AC4*
 482
 483 [ BEN ]
 484  [ atoms ]
 485     C1    CB   0.000     0
 486     C2   CR6  -0.140     1
 487     H2   HCR   0.140     1
 488     C3   CR6  -0.140     2
 489     H3   HCR   0.140     2
 490     C4   CR6  -0.140     3
 491     H4   HCR   0.140     4
 492     C5   CR6  -0.140     5
 493     H5   HCR   0.140     6
 494     C6   CR6  -0.140     7
 495     H6   HCR   0.140     7
 496     C7     C   0.560     8
 497     N1    NZ  -0.260     8
 498    H11     H   0.240     8
 499    H12     H   0.240     8
 500     N2    NZ  -0.260     8
 501    H21     H   0.240     8
 502    H22     H   0.240     8
 503  [ bonds ]
 504     C1    C2
 505     C2    C3
 506     C3    C4
 507     C4    C5
 508     C5    C6
 509     C6    C1
 510     C1    C7
 511     C7    N1
 512     C7    N2
 513     C2    H2
 514     C3    H3
 515     C4    H4
 516     C5    H5
 517     C6    H6
 518     N1   H11
 519     N1   H12
 520     N2   H21
 521     N2   H22
 522  [ impropers ]
 523     C1    C2    C3    C4
 524     C2    C3    C4    C5
 525     C3    C4    C5    C6
 526     C4    C5    C6    C1
 527     C5    C6    C1    C2
 528     C6    C1    C2    C3
 529     C2    C1    C3    H2
 530     C3    C2    C4    H3
 531     C4    C3    C5    H4
 532     C5    C4    C6    H5
 533     C6    C5    C1    H6
 534     C1    C6    C2    C7
 535     C7    N1    N2    C1
 536     C6    C1    C7    N2
 537     C2    C1    C7    N1
 538     N1   H11   H12    C7
 539     N2   H21   H22    C7
 540
 541 [ C10 ]
 542  [ atoms ]
 543     C1   CP3   0.000     0
 544     C2   CP2   0.000     1
 545     C3   CP2   0.000     2
 546     C4   CP2   0.000     3
 547     C5   CP2   0.000     4
 548     C6   CP2   0.000     5
 549     C7   CP2   0.000     6
 550     C8   CP2   0.000     7
 551     C9   CP2   0.000     8
 552    C10   CP3   0.000     9
 553  [ bonds ]
 554     C1    C2
 555     C2    C3
 556     C3    C4
 557     C4    C5
 558     C5    C6
 559     C6    C7
 560     C7    C8
 561     C8    C9
 562     C9   C10
 563
 564 [ CA ]
 565  [ atoms ]
 566     CA    CA   2.000     0
 567
 568 [ CL ]
 569  [ atoms ]
 570     CL    CL  -1.000     0
 571
 572 [ CYS2 ]
 573  [ atoms ]
 574      N     N  -0.280     0
 575      H     H   0.280     0
 576     CA   CH1   0.000     1
 577     CB   CH2   0.000     2
 578     SG     S   0.000     3
 579      C     C   0.380     4
 580      O     O  -0.380     4
 581  [ bonds ]
 582      N     H
 583      N    CA
 584     CA     C
 585      C     O
 586     -C     N
 587     CA    CB
 588     CB    SG
 589  [ impropers ]
 590      N    -C    CA     H
 591     -C   -CA     N    -O
 592     CA     N     C    CB
 593
 594 [ CYSH ]
 595  [ atoms ]
 596      N     N  -0.280     0
 597      H     H   0.280     0
 598     CA   CH1   0.000     1
 599     CB   CH2   0.000     2
 600     SG     S  -0.064     3
 601     HG    HS   0.064     3
 602      C     C   0.380     4
 603      O     O  -0.380     4
 604  [ bonds ]
 605      N     H
 606      N    CA
 607     CA     C
 608      C     O
 609     -C     N
 610     CA    CB
 611     CB    SG
 612     SG    HG
 613  [ impropers ]
 614      N    -C    CA     H
 615     -C   -CA     N    -O
 616     CA     N     C    CB
 617
 618 [ CYT ]
 619  [ atoms ]
 620      P     P   0.990     0
 621    O1P    OM  -0.635     0
 622    O2P    OM  -0.635     0
 623    O5*    OS  -0.360     0
 624    C5*   CS2   0.000     1
 625    C4*   CS1   0.160     2
 626    O4*    OS  -0.360     2
 627    C1*   CS1   0.200     2
 628     N1  NR6*  -0.200     3
 629     C6  CR61   0.200     3
 630     C2    CB   0.380     4
 631     O2     O  -0.380     4
 632     N3   NR6  -0.360     5
 633     C4    CB   0.360     5
 634     N4    NT  -0.830     6
 635    H41     H   0.415     6
 636    H42     H   0.415     6
 637     C5  CR61   0.000     7
 638    C2*   CS1   0.150     8
 639    O2*    OA  -0.548     8
 640    H2*    HO   0.398     8
 641    C3*   CS1   0.000     9
 642    O3*    OS  -0.360    10
 643  [ bonds ]
 644      P   O1P
 645      P   O2P
 646      P   O5*
 647    O5*   C5*
 648    C5*   C4*
 649    C4*   O4*
 650    C4*   C3*
 651    O4*   C1*
 652    C1*    N1
 653    C1*   C2*
 654     N1    C6
 655     N1    C2
 656     C6    C5
 657     C2    O2
 658     C2    N3
 659     N3    C4
 660     C4    N4
 661     C4    C5
 662     N4   H41
 663     N4   H42
 664    C2*   O2*
 665    C2*   C3*
 666    O2*   H2*
 667    C3*   O3*
 668   -O3*     P
 669  [ impropers ]
 670    C4*   O4*   C5*   C3*
 671    C3*   C2*   O3*   C4*
 672    C1*    N1   O4*   C2*
 673     N1    C6    C2   C1*
 674     C2    N1    C6    C5
 675     C6    N1    C2    N3
 676     N1    C6    C5    C4
 677     N1    C2    N3    C4
 678     C6    C5    C4    N3
 679     C2    N3    C4    C5
 680     C2    N3    N1    O2
 681     C4    C5    N3    N4
 682     N4   H41   H42    C4
 683    C2*   O2*   C3*   C1*
 684
 685 [ CYT* ]
 686  [ atoms ]
 687    C4*   CS1   0.160     0
 688    O4*    OS  -0.360     0
 689    C1*   CS1   0.200     0
 690     N1  NR6*  -0.200     1
 691     C6  CR61   0.200     1
 692     C2    CB   0.380     2
 693     O2     O  -0.380     2
 694     N3   NR6  -0.360     3
 695     C4    CB   0.360     3
 696     N4    NT  -0.830     4
 697    H41     H   0.415     4
 698    H42     H   0.415     4
 699     C5  CR61   0.000     5
 700    C2*   CS1   0.150     6
 701    O2*    OA  -0.548     6
 702    H2*    HO   0.398     6
 703    C3*   CS1   0.000     7
 704    O3*    OS  -0.360     8
 705    SI1    SI   0.540     8
 706    OSI    OS  -0.360     8
 707    SI2    SI   0.540     8
 708    O5*    OS  -0.360     8
 709    C5*   CS2   0.000     9
 710    C11   CH1   0.000    10
 711   C111   CH3   0.000    11
 712   C112   CH3   0.000    12
 713    C12   CH1   0.000    13
 714   C121   CH3   0.000    14
 715   C122   CH3   0.000    15
 716    C21   CH1   0.000    16
 717   C211   CH3   0.000    17
 718   C212   CH3   0.000    18
 719    C22   CH1   0.000    19
 720   C221   CH3   0.000    20
 721   C222   CH3   0.000    21
 722  [ bonds ]
 723    C4*   O4*
 724    C4*   C3*
 725    C4*   C5*
 726    O4*   C1*
 727    C1*    N1
 728    C1*   C2*
 729     N1    C6
 730     N1    C2
 731     C6    C5
 732     C2    O2
 733     C2    N3
 734     N3    C4
 735     C4    N4
 736     C4    C5
 737     N4   H41
 738     N4   H42
 739    C2*   O2*
 740    C2*   C3*
 741    O2*   H2*
 742    C3*   O3*
 743    O3*   SI1
 744    SI1   OSI
 745    SI1   C11
 746    SI1   C12
 747    OSI   SI2
 748    SI2   O5*
 749    SI2   C21
 750    SI2   C22
 751    O5*   C5*
 752    C11  C111
 753    C11  C112
 754    C12  C121
 755    C12  C122
 756    C21  C211
 757    C21  C212
 758    C22  C221
 759    C22  C222
 760  [ impropers ]
 761    C4*   O4*   C5*   C3*
 762    C3*   C2*   O3*   C4*
 763    C2*   O2*   C3*   C1*
 764    C1*    N1   O4*   C2*
 765     N1    C6    C2   C1*
 766     C2    N1    C6    C5
 767     C6    N1    C2    N3
 768     N1    C6    C5    C4
 769     N1    C2    N3    C4
 770     C6    C5    C4    N3
 771     C2    N3    C4    C5
 772     C2    N3    N1    O2
 773     C4    C5    N3    N4
 774     N4   H41   H42    C4
 775    C11  C112  C111   SI1
 776    C12  C122  C121   SI1
 777    C21  C212  C211   SI2
 778    C22  C222  C221   SI2
 779
 780 [ DADE ]
 781  [ atoms ]
 782      P     P   0.990     0
 783    O1P    OM  -0.635     0
 784    O2P    OM  -0.635     0
 785    O5*    OS  -0.360     0
 786    C5*   CS2   0.000     1
 787    C4*   CS1   0.160     2
 788    O4*    OS  -0.360     2
 789    C1*   CS1   0.200     2
 790     N9  NR5*  -0.200     3
 791     C4    CB   0.200     3
 792     N3   NR6  -0.360     4
 793     C2  CR61   0.360     4
 794     N1   NR6  -0.360     5
 795     C6    CB   0.360     5
 796     N6    NT  -0.830     6
 797    H61     H   0.415     6
 798    H62     H   0.415     6
 799     C5    CB   0.000     7
 800     N7   NR5  -0.360     8
 801     C8  CR51   0.360     8
 802    C2*   CS2   0.000     9
 803    C3*   CS1   0.000    10
 804    O3*    OS  -0.360    11
 805  [ bonds ]
 806      P   O1P
 807      P   O2P
 808      P   O5*
 809    O5*   C5*
 810    C5*   C4*
 811    C4*   O4*
 812    C4*   C3*
 813    O4*   C1*
 814    C1*    N9
 815    C1*   C2*
 816     N9    C4
 817     N9    C8
 818     C4    N3
 819     C4    C5
 820     N3    C2
 821     C2    N1
 822     N1    C6
 823     C6    N6
 824     C6    C5
 825     N6   H61
 826     N6   H62
 827     C5    N7
 828     N7    C8
 829    C2*   C3*
 830    C3*   O3*
 831   -O3*     P
 832  [ impropers ]
 833    C4*   O4*   C5*   C3*
 834    C3*   C2*   O3*   C4*
 835    C1*    N9   O4*   C2*
 836     N9    C8    C4   C1*
 837     C4    N9    C8    N7
 838     C8    N9    C4    C5
 839     N9    C8    N7    C5
 840     N9    C4    C5    N7
 841     C8    N7    C5    C4
 842     C4    N9    N3    C5
 843     C5    C6    N7    C4
 844     N3    C4    C5    C6
 845     C4    C5    C6    N1
 846     C5    C4    N3    C2
 847     C5    C6    N1    C2
 848     C4    N3    C2    N1
 849     N3    C2    N1    C6
 850     C6    C5    N1    N6
 851     N6   H61   H62    C6
 852
 853 [ DCYT ]
 854  [ atoms ]
 855      P     P   0.990     0
 856    O1P    OM  -0.635     0
 857    O2P    OM  -0.635     0
 858    O5*    OS  -0.360     0
 859    C5*   CS2   0.000     1
 860    C4*   CS1   0.160     2
 861    O4*    OS  -0.360     2
 862    C1*   CS1   0.200     2
 863     N1  NR6*  -0.200     3
 864     C6  CR61   0.200     3
 865     C2    CB   0.380     4
 866     O2     O  -0.380     4
 867     N3   NR6  -0.360     5
 868     C4    CB   0.360     5
 869     N4    NT  -0.830     6
 870    H41     H   0.415     6
 871    H42     H   0.415     6
 872     C5  CR61   0.000     7
 873    C2*   CS2   0.000     8
 874    C3*   CS1   0.000     9
 875    O3*    OS  -0.360    10
 876  [ bonds ]
 877      P   O1P
 878      P   O2P
 879      P   O5*
 880    O5*   C5*
 881    C5*   C4*
 882    C4*   O4*
 883    C4*   C3*
 884    O4*   C1*
 885    C1*    N1
 886    C1*   C2*
 887     N1    C6
 888     N1    C2
 889     C6    C5
 890     C2    O2
 891     C2    N3
 892     N3    C4
 893     C4    N4
 894     C4    C5
 895     N4   H41
 896     N4   H42
 897    C2*   C3*
 898    C3*   O3*
 899   -O3*     P
 900  [ impropers ]
 901    C4*   O4*   C5*   C3*
 902    C3*   C2*   O3*   C4*
 903    C1*    N1   O4*   C2*
 904     N1    C6    C2   C1*
 905     C2    N1    C6    C5
 906     C6    N1    C2    N3
 907     N1    C6    C5    C4
 908     N1    C2    N3    C4
 909     C6    C5    C4    N3
 910     C2    N3    C4    C5
 911     C2    N3    N1    O2
 912     C4    C5    N3    N4
 913     N4   H41   H42    C4
 914
 915 [ DDPC ]
 916  [ atoms ]
 917     C1   CH3   0.124     0
 918     C2   CH3   0.124     0
 919     C3   CH3   0.124     0
 920     N4    NL   0.004     0
 921     C5   CH2   0.124     0
 922     C6   CH2   0.000     1
 923     O7    OS  -0.180     2
 924     P8     P   0.500     2
 925     O9    OM  -0.320     2
 926    O10    OM  -0.320     2
 927    O11    OS  -0.180     2
 928    C12   CH2   0.000     3
 929    C13   CH1   0.100     4
 930    O14    OS  -0.180     4
 931    C15     C   0.270     4
 932    O16     O  -0.190     4
 933    C17   CH2   0.000     5
 934    C18   CH2   0.000     6
 935    C19   CH2   0.000     7
 936    C20   CH2   0.000     8
 937    C21   CH2   0.000     9
 938    C22   CH2   0.000    10
 939    C23   CH2   0.000    11
 940    C24   CH2   0.000    12
 941    C25   CH3   0.000    13
 942    C26   CH2   0.100    14
 943    O27    OS  -0.180    14
 944    C28     C   0.270    14
 945    O29     O  -0.190    14
 946    C30   CH2   0.000    15
 947    C31   CH2   0.000    16
 948    C32   CH2   0.000    17
 949    C33   CH2   0.000    18
 950    C34   CH2   0.000    19
 951    C35   CH2   0.000    20
 952    C36   CH2   0.000    21
 953    C37   CH2   0.000    22
 954    C38   CH3   0.000    23
 955  [ bonds ]
 956     C1    N4
 957     C2    N4
 958     C3    N4
 959     N4    C5
 960     C5    C6
 961     C6    O7
 962     O7    P8
 963     P8    O9
 964     P8   O10
 965     P8   O11
 966    O11   C12
 967    C12   C13
 968    C13   O14
 969    O14   C15
 970    C15   O16
 971    C15   C17
 972    C17   C18
 973    C18   C19
 974    C19   C20
 975    C20   C21
 976    C21   C22
 977    C22   C23
 978    C23   C24
 979    C24   C25
 980    C13   C26
 981    C26   O27
 982    O27   C28
 983    C28   O29
 984    C28   C30
 985    C30   C31
 986    C31   C32
 987    C32   C33
 988    C33   C34
 989    C34   C35
 990    C35   C36
 991    C36   C37
 992    C37   C38
 993  [ impropers ]
 994    C13   O14   C26   C12
 995    C15   O14   C17   O16
 996    C28   O27   C30   O29
 997
 998 [ DGUA ]
 999  [ atoms ]
1000      P     P   0.990     0
1001    O1P    OM  -0.635     0
1002    O2P    OM  -0.635     0
1003    O5*    OS  -0.360     0
1004    C5*   CS2   0.000     1
1005    C4*   CS1   0.160     2
1006    O4*    OS  -0.360     2
1007    C1*   CS1   0.200     2
1008     N9  NR5*  -0.200     3
1009     C4    CB   0.200     3
1010     N3   NR6  -0.360     4
1011     C2    CB   0.360     4
1012     N2    NT  -0.830     5
1013    H21     H   0.415     5
1014    H22     H   0.415     5
1015     N1  NR6*  -0.280     6
1016     H1     H   0.280     6
1017     C6    CB   0.380     7
1018     O6     O  -0.380     7
1019     C5    CB   0.000     8
1020     N7   NR5  -0.360     9
1021     C8  CR51   0.360     9
1022    C2*   CS2   0.000    10
1023    C3*   CS1   0.000    11
1024    O3*    OS  -0.360    12
1025  [ bonds ]
1026      P   O1P
1027      P   O2P
1028      P   O5*
1029    O5*   C5*
1030    C5*   C4*
1031    C4*   O4*
1032    C4*   C3*
1033    O4*   C1*
1034    C1*    N9
1035    C1*   C2*
1036     N9    C4
1037     N9    C8
1038     C4    N3
1039     C4    C5
1040     N3    C2
1041     C2    N2
1042     C2    N1
1043     N2   H21
1044     N2   H22
1045     N1    H1
1046     N1    C6
1047     C6    O6
1048     C6    C5
1049     C5    N7
1050     N7    C8
1051    C2*   C3*
1052    C3*   O3*
1053   -O3*     P
1054  [ impropers ]
1055    C4*   O4*   C5*   C3*
1056    C3*   C2*   O3*   C4*
1057    C1*    N9   O4*   C2*
1058     N9    C8    C4   C1*
1059     C4    N9    C8    N7
1060     C8    N9    C4    C5
1061     N9    C8    N7    C5
1062     N9    C4    C5    N7
1063     C8    N7    C5    C4
1064     C4    N9    N3    C5
1065     C5    C6    N7    C4
1066     N3    C4    C5    C6
1067     C4    C5    C6    N1
1068     C5    C4    N3    C2
1069     C5    C6    N1    C2
1070     C4    N3    C2    N1
1071     N3    C2    N1    C6
1072     C2    N1    N3    N2
1073     N2   H21   H22    C2
1074     N1    C6    C2    H1
1075     C6    C5    N1    O6
1076
1077 [ DHF ]
1078  [ atoms ]
1079     N1   NR6  -0.360     0
1080     C2    CB   0.360     0
1081    NA2    NT  -0.830     1
1082   HA21     H   0.415     1
1083   HA22     H   0.415     1
1084     N3  NR6*  -0.280     2
1085    HA3     H   0.280     2
1086     C4    CB   0.380     3
1087    OA4     O  -0.380     3
1088    C4A    CB   0.000     4
1089     N5   NR6  -0.360     5
1090     C6    CB   0.360     5
1091     C7   CS2   0.000     6
1092     N8  NR6*  -0.280     7
1093    HA8     H   0.280     7
1094    C8A    CB   0.000     8
1095     C9   CH2   0.000     9
1096    N10  NR6*  -0.280    10
1097    H10     H   0.280    10
1098    C14    CB   0.000    11
1099    C13  CR61   0.000    12
1100    C15  CR61   0.000    13
1101    C12  CR61   0.000    14
1102    C16  CR61   0.000    15
1103    C11    CB   0.000    16
1104      C     C   0.380    17
1105      O     O  -0.380    17
1106      N     N  -0.280    18
1107      H     H   0.280    18
1108     CA   CH1   0.000    19
1109     CB   CH2   0.000    20
1110     CG   CH2   0.000    21
1111     CD     C   0.270    22
1112    OE1    OM  -0.635    22
1113    OE2    OM  -0.635    22
1114     CT     C   0.270    23
1115     O1    OM  -0.635    23
1116     O2    OM  -0.635    23
1117  [ bonds ]
1118     N1    C2
1119     N1   C8A
1120     C2   NA2
1121     C2    N3
1122    NA2  HA21
1123    NA2  HA22
1124     N3   HA3
1125     N3    C4
1126     C4   OA4
1127     C4   C4A
1128    C4A    N5
1129    C4A   C8A
1130     N5    C6
1131     C6    C7
1132     C6    C9
1133     C7    N8
1134     N8   HA8
1135     N8   C8A
1136     C9   N10
1137    N10   H10
1138    N10   C14
1139    C14   C13
1140    C14   C15
1141    C13   C12
1142    C15   C16
1143    C12   C11
1144    C16   C11
1145    C11     C
1146      C     O
1147      C     N
1148      N     H
1149      N    CA
1150     CA    CB
1151     CA    CT
1152     CB    CG
1153     CG    CD
1154     CD   OE1
1155     CD   OE2
1156     CT    O1
1157     CT    O2
1158  [ impropers ]
1159     C2    N1    N3   NA2
1160    NA2  HA21  HA22    C2
1161     N3    C2    C4   HA3
1162     C4    N3   C4A   OA4
1163     N1    C2    N3    C4
1164     C2    N3    C4   C4A
1165     N3    C4   C4A   C8A
1166     C4   C4A   C8A    N1
1167    C4A   C8A    N1    C2
1168    C8A    N1    C2    N3
1169    C4A    C4    N5   C8A
1170    C8A    N1    N8   C4A
1171    C4A    N5    C6    C7
1172     N5    C6    C7    N8
1173     C6    C7    N8   C8A
1174     C7    N8   C8A   C4A
1175     N8   C8A   C4A    N5
1176    C8A   C4A    N5    C6
1177     N8    C7   C8A   HA8
1178     C6    N5    C7    C9
1179    N10    C9   C14   H10
1180    C14   C13   C15   N10
1181    C14   C13   C12   C11
1182    C14   C15   C16   C11
1183    C13   C14   C15   C16
1184    C15   C14   C13   C12
1185    C13   C12   C11   C16
1186    C15   C16   C11   C12
1187    C11   C12   C16     C
1188      C   C11     N     O
1189      N     C    CA     H
1190     CA     N    CT    CB
1191     CD   OE1   OE2    CG
1192     CT    CA    O2    O1
1193
1194 [ DMSO ]
1195  [ atoms ]
1196     DS     S   0.540     0
1197     DO     O  -0.540     0
1198    DC1   CH3   0.000     1
1199    DC2   CH3   0.000     2
1200  [ bonds ]
1201     DS    DO
1202     DS   DC1
1203     DS   DC2
1204
1205 [ DPPC ]
1206  [ atoms ]
1207     C1   CH3   0.124     0
1208     C2   CH3   0.124     0
1209     C3   CH3   0.124     0
1210     N4    NL   0.004     0
1211     C5   CH2   0.124     0
1212     C6   CH2   0.000     1
1213     O7    OS  -0.180     2
1214     P8     P   0.500     2
1215     O9    OM  -0.320     2
1216    O10    OM  -0.320     2
1217    O11    OS  -0.180     2
1218    C12   CH2   0.000     3
1219    C13   CH1   0.100     4
1220    O14    OS  -0.180     4
1221    C15     C   0.270     4
1222    O16     O  -0.190     4
1223    C17   CH2   0.000     5
1224    C18   CH2   0.000     6
1225    C19   CH2   0.000     7
1226    C20   CH2   0.000     8
1227    C21   CH2   0.000     9
1228    C22   CH2   0.000    10
1229    C23   CH2   0.000    11
1230    C24   CH2   0.000    12
1231    C25   CH2   0.000    13
1232    C26   CH2   0.000    14
1233    C27   CH2   0.000    15
1234    C28   CH2   0.000    16
1235    C29   CH2   0.000    17
1236    C30   CH2   0.000    18
1237    C31   CH3   0.000    19
1238    C32   CH2   0.100    20
1239    O33    OS  -0.180    20
1240    C34     C   0.270    20
1241    O35     O  -0.190    20
1242    C36   CH2   0.000    21
1243    C37   CH2   0.000    22
1244    C38   CH2   0.000    23
1245    C39   CH2   0.000    24
1246    C40   CH2   0.000    25
1247    C41   CH2   0.000    26
1248    C42   CH2   0.000    27
1249    C43   CH2   0.000    28
1250    C44   CH2   0.000    29
1251    C45   CH2   0.000    30
1252    C46   CH2   0.000    31
1253    C47   CH2   0.000    32
1254    C48   CH2   0.000    33
1255    C49   CH2   0.000    34
1256    C50   CH3   0.000    35
1257  [ bonds ]
1258     C1    N4
1259     C2    N4
1260     C3    N4
1261     N4    C5
1262     C5    C6
1263     C6    O7
1264     O7    P8
1265     P8    O9
1266     P8   O10
1267     P8   O11
1268    O11   C12
1269    C12   C13
1270    C13   O14
1271    O14   C15
1272    C15   O16
1273    C15   C17
1274    C17   C18
1275    C18   C19
1276    C19   C20
1277    C20   C21
1278    C21   C22
1279    C22   C23
1280    C23   C24
1281    C24   C25
1282    C25   C26
1283    C26   C27
1284    C27   C28
1285    C28   C29
1286    C29   C30
1287    C30   C31
1288    C13   C32
1289    C32   O33
1290    O33   C34
1291    C34   O35
1292    C34   C36
1293    C36   C37
1294    C37   C38
1295    C38   C39
1296    C39   C40
1297    C40   C41
1298    C41   C42
1299    C42   C43
1300    C43   C44
1301    C44   C45
1302    C45   C46
1303    C46   C47
1304    C47   C48
1305    C48   C49
1306    C49   C50
1307  [ impropers ]
1308    C13   O14   C32   C12
1309    C15   O14   C17   O16
1310    C34   O33   C36   O35
1311
1312 [ DTHY ]
1313  [ atoms ]
1314      P     P   0.990     0
1315    O1P    OM  -0.635     0
1316    O2P    OM  -0.635     0
1317    O5*    OS  -0.360     0
1318    C5*   CS2   0.000     1
1319    C4*   CS1   0.160     2
1320    O4*    OS  -0.360     2
1321    C1*   CS1   0.200     2
1322     N1  NR6*  -0.200     3
1323     C6  CR61   0.200     3
1324     C2    CB   0.380     4
1325     O2     O  -0.380     4
1326     N3  NR6*  -0.280     5
1327     H3     H   0.280     5
1328     C4    CB   0.380     6
1329     O4     O  -0.380     6
1330     C5    CB   0.000     7
1331    C5M   CH3   0.000     8
1332    C2*   CS2   0.000     9
1333    C3*   CS1   0.000    10
1334    O3*    OS  -0.360    11
1335  [ bonds ]
1336      P   O1P
1337      P   O2P
1338      P   O5*
1339    O5*   C5*
1340    C5*   C4*
1341    C4*   O4*
1342    C4*   C3*
1343    O4*   C1*
1344    C1*    N1
1345    C1*   C2*
1346     N1    C6
1347     N1    C2
1348     C6    C5
1349     C2    O2
1350     C2    N3
1351     N3    H3
1352     N3    C4
1353     C4    O4
1354     C4    C5
1355     C5   C5M
1356    C2*   C3*
1357    C3*   O3*
1358   -O3*     P
1359  [ impropers ]
1360    C4*   O4*   C5*   C3*
1361    C3*   C2*   O3*   C4*
1362    C1*    N1   O4*   C2*
1363     N1    C6    C2   C1*
1364     C2    N1    C6    C5
1365     C6    N1    C2    N3
1366     N1    C6    C5    C4
1367     N1    C2    N3    C4
1368     C6    C5    C4    N3
1369     C2    N3    C4    C5
1370     C2    N3    N1    O2
1371     N3    C4    C2    H3
1372     C4    C5    N3    O4
1373     C5    C6    C4   C5M
1374
1375 [ ETH ]
1376  [ atoms ]
1377     EO    OM  -0.600     0
1378    EC1   CH2  -0.400     0
1379    EC2   CH3   0.000     1
1380  [ bonds ]
1381     EO   EC1
1382    EC1   EC2
1383
1384 [ ETHH ]
1385  [ atoms ]
1386     EH    HO   0.398     0
1387     EO    OA  -0.548     0
1388    EC1   CH2   0.150     0
1389    EC2   CH3   0.000     1
1390  [ bonds ]
1391     EH    EO
1392     EO   EC1
1393    EC1   EC2
1394
1395 [ F ]
1396  [ atoms ]
1397      F     F  -1.000     0
1398
1399 [ FAD ]
1400  [ atoms ]
1401     AP     P   1.560     0
1402    AO1    OM  -1.000     0
1403    AO2    OM  -1.000     0
1404   AO5*    OS  -0.560     0
1405   AC5*   CS2   0.000     1
1406   AC4*   CS1   0.160     2
1407   AO4*    OS  -0.360     2
1408   AC1*   CS1   0.200     2
1409    AN9  NR5*  -0.200     3
1410    AC4    CB   0.200     3
1411    AN3   NR6  -0.360     4
1412    AC2  CR61   0.360     4
1413    AN1   NR6  -0.360     5
1414    AC6    CB   0.360     5
1415    AN6    NT  -0.830     6
1416   HN61     H   0.415     6
1417   HN62     H   0.415     6
1418    AC5    CB   0.000     7
1419    AN7   NR5  -0.360     8
1420    AC8  CR51   0.360     8
1421   AC2*   CS1   0.150     9
1422   AO2*    OA  -0.548     9
1423   HO2*    HO   0.398     9
1424   AC3*   CS1   0.150    10
1425   AO3*    OA  -0.548    10
1426   HO3*    HO   0.398    10
1427     O3    OS   0.000    11
1428      P     P   1.560    12
1429    OP1    OM  -1.000    12
1430    OP2    OM  -1.000    12
1431    O5*    OS  -0.560    12
1432    C5*   CH2   0.000    13
1433    C4*   CH1   0.150    14
1434    O4*    OA  -0.548    14
1435    H4*    HO   0.398    14
1436    C3*   CH1   0.150    15
1437    O3*    OA  -0.548    15
1438    H3*    HO   0.398    15
1439    C2*   CH1   0.150    16
1440    O2*    OA  -0.548    16
1441    H2*    HO   0.398    16
1442    C1*   CH2   0.000    17
1443    N10  NR6*  -0.200    18
1444    C9A    CB   0.200    18
1445    C10    CB   0.360    19
1446     N1   NR6  -0.360    19
1447     C9    CB   0.000    20
1448     C8    CB   0.000    21
1449    C8M   CH3   0.000    22
1450     C7    CB   0.000    23
1451    C7M   CH3   0.000    24
1452     C6  CR61   0.000    25
1453    C5A    CB   0.100    26
1454     N5   NR6  -0.280    26
1455    C4A    CB   0.180    26
1456     C4     C   0.380    27
1457     O4     O  -0.380    27
1458     N3  NR6*  -0.280    28
1459     H3     H   0.280    28
1460     C2     C   0.380    29
1461     O2     O  -0.380    29
1462  [ bonds ]
1463     AP   AO1
1464     AP   AO2
1465     AP  AO5*
1466   AO5*  AC5*
1467   AC5*  AC4*
1468   AC4*  AO4*
1469   AC4*  AC3*
1470   AO4*  AC1*
1471   AC1*   AN9
1472   AC1*  AC2*
1473    AN9   AC4
1474    AN9   AC8
1475    AC4   AN3
1476    AC4   AC5
1477    AN3   AC2
1478    AC2   AN1
1479    AN1   AC6
1480    AC6   AN6
1481    AC6   AC5
1482    AN6  AH61
1483    AN6  AH62
1484    AC5   AN7
1485    AN7   AC8
1486   AC2*  AO2*
1487   AC2*  AC3*
1488   AO2*  HO2*
1489   AC3*  AO3*
1490   AO3*  HO3*
1491     N1    C2
1492     C2    O2
1493     C2    N3
1494     N3    H3
1495     N3    C4
1496     C4    O4
1497     C4   C4A
1498    C4A   C10
1499    C4A    N5
1500     N5   C5A
1501    C5A   C9A
1502    C5A    C6
1503     C6    C7
1504     C7   C7M
1505     C7    C8
1506     C8   C8M
1507     C8    C9
1508     C9   C9A
1509    C9A   N10
1510    N10   C1*
1511    N10   C10
1512    C10    C1
1513    C1*   C2*
1514    C2*   O2*
1515    C2*   C3*
1516    O2*   H2*
1517    C3*   O3*
1518    C3*   C4*
1519    O3*   H3*
1520    C4*   O4*
1521    C4*   C5*
1522    O4*   H4*
1523    C5*   O5*
1524    O5*     P
1525      P   OP1
1526      P   OP2
1527      P    O3
1528     O3    Ap
1529  [ impropers ]
1530   AC4*  AO4*  AC5*  AC3*
1531   AC3*  AC2*  AO3*  AC4*
1532   AC1*   AN9  AO4*  AC2*
1533    AN9   AC8   AC4  AC1*
1534    AC4   AN9   AC8   AN7
1535    AC8   AN9   AC4   AC5
1536    AN9   AC8   AN7   AC5
1537    AN9   AC4   AC5   AN7
1538    AC8   AN7   AC5   AC4
1539    AC4   AN9   AN3   AC5
1540    AC5   AC6   AN7   AC4
1541    AN3   AC4   AC5   AC6
1542    AC4   AC5   AC6   AN1
1543    AC5   AC4   AN3   AC2
1544    AC5   AC6   AN1   AC2
1545    AC4   AN3   AC2   AN1
1546    AN3   AC2   AN1   AC6
1547    AC6   AC5   AN1   AN6
1548    AN6  AH61  AH62   AC6
1549   AC2*  AO2*  AC3*  AC1*
1550   AC3*  AO3*  AC2*  AC4*
1551     C2    N3    C4   C4A
1552     C2    N1    N3    O2
1553     N3    C2    C4    H3
1554     C4    N3   C4A    O4
1555     N1    C2    N3    C4
1556     N3    C4   C4A   C10
1557     C4   C4A   C10    N1
1558    C4A   C10    N1    C2
1559    C10    N1    C2    N3
1560    C4A    C4    N5   C10
1561    C10    N1   N10   C4A
1562    N10   C10   C4A    N5
1563    N10   C9A   C5A    N5
1564    C5A    N5    C6   C9A
1565    C9A   N10    C9   C5A
1566    C5A    C6    C7    C8
1567     C6    C7    C8    C9
1568     C7    C8    C9   C9A
1569     C8    C9   C9A   C5A
1570     C9   C9A   C5A    C6
1571    C9A   C5A    C6    C7
1572     C7    C6    C8   CM7
1573     C8    C7    C9   CM8
1574    N10   C10   C9A   C1*
1575
1576 [ FMNO ]
1577  [ atoms ]
1578   FC9A    CB   0.200     0
1579   FN10  NR6*  -0.200     0
1580  FC10A    CB   0.360     1
1581    FN1   NR6  -0.360     1
1582    FC2    CB   0.380     2
1583    FO2     O  -0.380     2
1584    FN3  NR6*  -0.280     3
1585    FH3     H   0.280     3
1586    FC4    CB   0.380     4
1587    FO4     O  -0.380     4
1588   FC4A    CB   0.180     5
1589    FN5   NR6  -0.280     5
1590   FC5A    CB   0.100     5
1591    FC6  CR61   0.000     6
1592    FC7    CB   0.000     7
1593   FCM7   CH3   0.000     8
1594    FC8    CB   0.000     9
1595   FCM8   CH3   0.000    10
1596    FC9  CR61   0.000    11
1597    FCA   CH2   0.000    12
1598    FCB   CH1   0.150    13
1599    FOB    OA  -0.548    13
1600    FHB    HO   0.398    13
1601    FCG   CH1   0.150    14
1602    FOG    OA  -0.548    14
1603    FHG    HO   0.398    14
1604    FCD   CH1   0.150    15
1605    FOD    OA  -0.548    15
1606    FHD    HO   0.398    15
1607    FCE   CH2   0.150    16
1608    FOZ    OS  -0.360    16
1609    FPH     P   0.630    16
1610    FOH    OA  -0.548    16
1611    FHH    HO   0.398    16
1612   FOT1    OM  -0.635    16
1613   FOT2    OM  -0.635    16
1614  [ bonds ]
1615   FC9A  FN10
1616   FC9A  FC5A
1617   FC9A   FC9
1618   FN10 FC10A
1619   FN10   FCA
1620  FC10A   FN1
1621  FC10A  FC4A
1622    FN1   FC2
1623    FC2   FO2
1624    FC2   FN3
1625    FN3   FH3
1626    FN3   FC4
1627    FC4   FO4
1628    FC4  FC4A
1629   FC4A   FN5
1630    FN5  FC5A
1631   FC5A   FC6
1632    FC6   FC7
1633    FC7  FCM7
1634    FC7   FC8
1635    FC8  FCM8
1636    FC8   FC9
1637    FCA   FCB
1638    FCB   FOB
1639    FCB   FCG
1640    FOB   FHB
1641    FCG   FOG
1642    FCG   FCD
1643    FOG   FHG
1644    FCD   FOD
1645    FCD   FCE
1646    FOD   FHD
1647    FCE   FOZ
1648    FOZ   FPH
1649    FPH   FOH
1650    FPH  FOT1
1651    FPH  FOT2
1652    FOH   FHH
1653  [ impropers ]
1654    FC2   FN1   FN3   FO2
1655    FN3   FC2   FC4   FH3
1656    FC4   FN3  FC4A   FO4
1657    FN1   FC2   FN3   FC4
1658    FC2   FN3   FC4  FC4A
1659    FN3   FC4  FC4A FC10A
1660    FC4  FC4A FC10A   FN1
1661   FC4A FC10A   FN1   FC2
1662  FC10A   FN1   FC2   FN3
1663   FC4A   FC4   FN5 FC10A
1664  FC10A   FN1  FN10  FC4A
1665   FN10 FC10A  FC4A   FN5
1666   FN10  FC9A  FC5A   FN5
1667   FC5A   FN5   FC6  FC9A
1668   FC9A  FN10   FC9  FC5A
1669   FC5A   FC6   FC7   FC8
1670    FC6   FC7   FC8   FC9
1671    FC7   FC8   FC9  FC9A
1672    FC8   FC9  FC9A  FC5A
1673    FC9  FC9A  FC5A   FC6
1674   FC9A  FC5A   FC6   FC7
1675    FC7   FC6   FC8  FCM7
1676    FC8   FC7   FC9  FCM8
1677    FCB   FOB   FCG   FCA
1678    FCG   FOG   FCD   FCB
1679    FCD   FOD   FCE   FCG
1680
1681 [ FMNR ]
1682  [ atoms ]
1683   FC9A    CB   0.100     0
1684   FN10  NR6*  -0.200     0
1685  FC10A    CB   0.100     0
1686    FN1  NR6*  -0.280     1
1687    FH1     H   0.280     1
1688    FC2    CB   0.380     2
1689    FO2     O  -0.380     2
1690    FN3  NR6*  -0.280     3
1691    FH3     H   0.280     3
1692    FC4    CB   0.380     4
1693    FO4     O  -0.380     4
1694   FC4A    CB   0.000     5
1695    FN5  NR6*  -0.280     6
1696    FH5     H   0.280     6
1697   FC5A    CB   0.000     7
1698    FC6  CR61   0.000     8
1699    FC7    CB   0.000     9
1700   FCM7   CH3   0.000    10
1701    FC8    CB   0.000    11
1702   FCM8   CH3   0.000    12
1703    FC9  CR61   0.000    13
1704    FCA   CH2   0.000    14
1705    FCB   CH1   0.150    15
1706    FOB    OA  -0.548    15
1707    FHB    HO   0.398    15
1708    FCG   CH1   0.150    16
1709    FOG    OA  -0.548    16
1710    FHG    HO   0.398    16
1711    FCD   CH1   0.150    17
1712    FOD    OA  -0.548    17
1713    FHD    HO   0.398    17
1714    FCE   CH2   0.150    18
1715    FOZ    OS  -0.360    18
1716    FPH     P   0.630    18
1717    FOH    OA  -0.548    18
1718    FHH    HO   0.398    18
1719   FOT1    OM  -0.635    18
1720   FOT2    OM  -0.635    18
1721  [ bonds ]
1722   FC9A  FN10
1723   FC9A  FC5A
1724   FC9A   FC9
1725   FN10 FC10A
1726   FN10   FCA
1727  FC10A   FN1
1728  FC10A  FC4A
1729    FN1   FH1
1730    FN1   FC2
1731    FC2   FO2
1732    FC2   FN3
1733    FN3   FH3
1734    FN3   FC4
1735    FC4   FO4
1736    FC4  FC4A
1737   FC4A   FN5
1738    FN5   FH5
1739    FN5  FC5A
1740   FC5A   FC6
1741    FC6   FC7
1742    FC7  FCM7
1743    FC7   FC8
1744    FC8  FCM8
1745    FC8   FC9
1746    FCA   FCB
1747    FCB   FOB
1748    FCB   FCG
1749    FOB   FHB
1750    FCG   FOG
1751    FCG   FCD
1752    FOG   FHG
1753    FCD   FOD
1754    FCD   FCE
1755    FOD   FHD
1756    FCE   FOZ
1757    FOZ   FPH
1758    FPH   FOH
1759    FPH  FOT1
1760    FPH  FOT2
1761    FOH   FHH
1762  [ impropers ]
1763    FN1 FC10A   FC2   FH1
1764    FC2   FN1   FN3   FO2
1765    FN3   FC2   FC4   FH3
1766    FC4   FN3  FC4A   FO4
1767    FN1   FC2   FN3   FC4
1768    FC2   FN3   FC4  FC4A
1769    FN3   FC4  FC4A FC10A
1770    FC4  FC4A FC10A   FN1
1771   FC4A FC10A   FN1   FC2
1772  FC10A   FN1   FC2   FN3
1773   FC4A   FC4   FN5 FC10A
1774  FC10A   FN1  FN10  FC4A
1775   FN10 FC10A  FC4A   FN5
1776   FN10  FC9A  FC5A   FN5
1777   FC5A   FN5   FC6  FC9A
1778   FC9A  FN10   FC9  FC5A
1779   FC5A   FC6   FC7   FC8
1780    FC6   FC7   FC8   FC9
1781    FC7   FC8   FC9  FC9A
1782    FC8   FC9  FC9A  FC5A
1783    FC9  FC9A  FC5A   FC6
1784   FC9A  FC5A   FC6   FC7
1785    FC7   FC6   FC8  FCM7
1786    FC8   FC7   FC9  FCM8
1787    FCB   FOB   FCG   FCA
1788    FCG   FOG   FCD   FCB
1789    FCD   FOD   FCE   FCG
1790
1791 [ FMNS ]
1792  [ atoms ]
1793   FC9A    CB   0.200     0
1794   FN10  NR6*  -0.200     0
1795  FC10A    CB   0.360     1
1796    FN1   NR6  -0.360     1
1797    FC2    CB   0.380     2
1798    FO2     O  -0.380     2
1799    FN3  NR6*  -0.280     3
1800    FH3     H   0.280     3
1801    FC4    CB   0.380     4
1802    FO4     O  -0.380     4
1803   FC4A    CB   0.000     5
1804    FN5  NR6*  -0.280     6
1805    FH5     H   0.280     6
1806   FC5A    CB   0.000     7
1807    FC6  CR61   0.000     8
1808    FC7    CB   0.000     9
1809   FCM7   CH3   0.000    10
1810    FC8    CB   0.000    11
1811   FCM8   CH3   0.000    12
1812    FC9  CR61   0.000    13
1813    FCA   CH2   0.000    14
1814    FCB   CH1   0.150    15
1815    FOB    OA  -0.548    15
1816    FHB    HO   0.398    15
1817    FCG   CH1   0.150    16
1818    FOG    OA  -0.548    16
1819    FHG    HO   0.398    16
1820    FCD   CH1   0.150    17
1821    FOD    OA  -0.548    17
1822    FHD    HO   0.398    17
1823    FCE   CH2   0.150    18
1824    FOZ    OS  -0.360    18
1825    FPH     P   0.630    18
1826    FOH    OA  -0.548    18
1827    FHH    HO   0.398    18
1828   FOT1    OM  -0.635    18
1829   FOT2    OM  -0.635    18
1830  [ bonds ]
1831   FC9A  FN10
1832   FC9A  FC5A
1833   FC9A   FC9
1834   FN10 FC10A
1835   FN10   FCA
1836  FC10A   FN1
1837  FC10A  FC4A
1838    FN1   FC2
1839    FC2   FO2
1840    FC2   FN3
1841    FN3   FH3
1842    FN3   FC4
1843    FC4   FO4
1844    FC4  FC4A
1845   FC4A   FN5
1846    FN5   FH5
1847    FN5  FC5A
1848   FC5A   FC6
1849    FC6   FC7
1850    FC7  FCM7
1851    FC7   FC8
1852    FC8  FCM8
1853    FC8   FC9
1854    FCA   FCB
1855    FCB   FOB
1856    FCB   FCG
1857    FOB   FHB
1858    FCG   FOG
1859    FCG   FCD
1860    FOG   FHG
1861    FCD   FOD
1862    FCD   FCE
1863    FOD   FHD
1864    FCE   FOZ
1865    FOZ   FPH
1866    FPH   FOH
1867    FPH  FOT1
1868    FPH  FOT2
1869    FOH   FHH
1870  [ impropers ]
1871    FC2   FN1   FN3   FO2
1872    FN3   FC2   FC4   FH3
1873    FC4   FN3  FC4A   FO4
1874    FN1   FC2   FN3   FC4
1875    FC2   FN3   FC4  FC4A
1876    FN3   FC4  FC4A FC10A
1877    FC4  FC4A FC10A   FN1
1878   FC4A FC10A   FN1   FC2
1879  FC10A   FN1   FC2   FN3
1880   FC4A   FC4   FN5 FC10A
1881  FC10A   FN1  FN10  FC4A
1882   FN10 FC10A  FC4A   FN5
1883   FN10  FC9A  FC5A   FN5
1884   FC5A   FN5   FC6  FC9A
1885   FC9A  FN10   FC9  FC5A
1886   FC5A   FC6   FC7   FC8
1887    FC6   FC7   FC8   FC9
1888    FC7   FC8   FC9  FC9A
1889    FC8   FC9  FC9A  FC5A
1890    FC9  FC9A  FC5A   FC6
1891   FC9A  FC5A   FC6   FC7
1892    FC7   FC6   FC8  FCM7
1893    FC8   FC7   FC9  FCM8
1894    FCB   FOB   FCG   FCA
1895    FCG   FOG   FCD   FCB
1896    FCD   FOD   FCE   FCG
1897
1898 [ FOL ]
1899  [ atoms ]
1900     N1   NR6  -0.360     0
1901     C2    CB   0.360     0
1902    NA2    NT  -0.830     1
1903   HA21     H   0.415     1
1904   HA22     H   0.415     1
1905     N3  NR6*  -0.280     2
1906    HA3     H   0.280     2
1907     C4    CB   0.380     3
1908    OA4     O  -0.380     3
1909    C4A    CB   0.000     4
1910     N5   NR6  -0.360     5
1911     C6    CB   0.360     5
1912     C7  CR61   0.360     6
1913     N8   NR6  -0.360     6
1914    C8A    CB   0.000     7
1915     C9   CH2   0.000     8
1916    N10  NR6*  -0.280     9
1917    H10     H   0.280     9
1918    C14    CB   0.000    10
1919    C13  CR61   0.000    11
1920    C15  CR61   0.000    12
1921    C12  CR61   0.000    13
1922    C16  CR61   0.000    14
1923    C11    CB   0.000    15
1924      C     C   0.380    16
1925      O     O  -0.380    16
1926      N     N  -0.280    17
1927      H     H   0.280    17
1928     CA   CH1   0.000    18
1929     CB   CH2   0.000    19
1930     CG   CH2   0.000    20
1931     CD     C   0.270    21
1932    OE1    OM  -0.635    21
1933    OE2    OM  -0.635    21
1934     CT     C   0.270    22
1935     O1    OM  -0.635    22
1936     O2    OM  -0.635    22
1937  [ bonds ]
1938     N1    C2
1939     N1   C8A
1940     C2   NA2
1941     C2    N3
1942    NA2  HA21
1943    NA2  HA22
1944     N3   HA3
1945     N3    C4
1946     C4   OA4
1947     C4   C4A
1948    C4A    N5
1949    C4A   C8A
1950     N5    C6
1951     C6    C7
1952     C6    C9
1953     C7    N8
1954     N8   C8A
1955     C9   N10
1956    N10   H10
1957    N10   C14
1958    C14   C13
1959    C14   C15
1960    C13   C12
1961    C15   C16
1962    C12   C11
1963    C16   C11
1964    C11     C
1965      C     O
1966      C     N
1967      N     H
1968      N    CA
1969     CA    CB
1970     CA    CT
1971     CB    CG
1972     CG    CD
1973     CD   OE1
1974     CD   OE2
1975     CT    O1
1976     CT    O2
1977  [ impropers ]
1978     C2    N1    N3   NA2
1979    NA2  HA21  HA22    C2
1980     N3    C2    C4   HA3
1981     C4    N3   C4A   OA4
1982     N1    C2    N3    C4
1983     C2    N3    C4   C4A
1984     N3    C4   C4A   C8A
1985     C4   C4A   C8A    N1
1986    C4A   C8A    N1    C2
1987    C8A    N1    C2    N3
1988    C4A    C4    N5   C8A
1989    C8A    N1    N8   C4A
1990    C4A    N5    C6    C7
1991     N5    C6    C7    N8
1992     C6    C7    N8   C8A
1993     C7    N8   C8A   C4A
1994     N8   C8A   C4A    N5
1995    C8A   C4A    N5    C6
1996     C6    N5    C7    C9
1997    N10    C9   C14   H10
1998    C14   C13   C15   N10
1999    C14   C13   C12   C11
2000    C14   C15   C16   C11
2001    C13   C14   C15   C16
2002    C15   C14   C13   C12
2003    C13   C12   C11   C16
2004    C15   C16   C11   C12
2005    C11   C12   C16     C
2006      C   C11     N     O
2007      N     C    CA     H
2008     CA     N    CT    CB
2009     CD   OE1   OE2    CG
2010     CT    CA    O2    O1
2011
2012 [ GALB ]
2013  [ atoms ]
2014     C1   CS1   0.400     0
2015     O5    OS  -0.360     0
2016     C5   CS1   0.160     0
2017     C6   CS2   0.150     1
2018     O6    OA  -0.548     1
2019     H6    HO   0.398     1
2020     C2   CS1   0.150     2
2021     O2    OA  -0.548     2
2022     H2    HO   0.398     2
2023     C4   CS1   0.150     3
2024     O4    OA  -0.548     3
2025     H4    HO   0.398     3
2026     C3   CS1   0.160     4
2027     O3    OS  -0.360     4
2028  [ bonds ]
2029     C1    O5
2030     C1    C2
2031     O5    C5
2032     C5    C6
2033     C5    C4
2034     C6    O6
2035     O6    H6
2036     C2    O2
2037     C2    C3
2038     O2    H2
2039     C4    O4
2040     C4    C3
2041     O4    H4
2042     C3    O3
2043    -O3    C1
2044  [ impropers ]
2045     C1   -O3    O5    C2
2046     C5    O5    C6    C4
2047     C2    O2    C3    C1
2048     C4    O4    C3    C5
2049     C3    O3    C2    C4
2050
2051 [ GLCA ]
2052  [ atoms ]
2053     C1   CS1   0.400     0
2054     O5    OS  -0.360     0
2055     C5   CS1   0.160     0
2056     C6   CS2   0.150     1
2057     O6    OA  -0.548     1
2058     H6    HO   0.398     1
2059     C2   CS1   0.150     2
2060     O2    OA  -0.548     2
2061     H2    HO   0.398     2
2062     C3   CS1   0.150     3
2063     O3    OA  -0.548     3
2064     H3    HO   0.398     3
2065     C4   CS1   0.160     4
2066     O4    OS  -0.360     4
2067  [ bonds ]
2068     C1    O5
2069     C1    C2
2070     O5    C5
2071     C5    C6
2072     C5    C4
2073     C6    O6
2074     O6    H6
2075     C2    O2
2076     C2    C3
2077     O2    H2
2078     C3    O3
2079     C3    C4
2080     O3    H3
2081     C4    O4
2082    -O4    C1
2083  [ impropers ]
2084     C1    O5   -O4    C2
2085     C5    O5    C6    C4
2086     C2    O2    C3    C1
2087     C3    O3    C2    C4
2088     C4    C3    O4    C5
2089
2090 [ GLCB ]
2091  [ atoms ]
2092     C1   CS1   0.400     0
2093     O5    OS  -0.360     0
2094     C5   CS1   0.160     0
2095     C6   CS2   0.150     1
2096     O6    OA  -0.548     1
2097     H6    HO   0.398     1
2098     C3   CS1   0.150     2
2099     O3    OA  -0.548     2
2100     H3    HO   0.398     2
2101     C4   CS1   0.150     3
2102     O4    OA  -0.548     3
2103     H4    HO   0.398     3
2104     C2   CS1   0.160     4
2105     O2    OS  -0.360     4
2106  [ bonds ]
2107     C1    O5
2108     C1    C2
2109     O5    C5
2110     C5    C6
2111     C5    C4
2112     C6    O6
2113     O6    H6
2114     C3    O3
2115     C3    C4
2116     C3    C2
2117     O3    H3
2118     C4    O4
2119     O4    H4
2120     C2    O2
2121    -O2    C1
2122  [ impropers ]
2123     C1   -O2    O5    C2
2124     C5    O5    C6    C4
2125     C3    O3    C2    C4
2126     C4    C3    O4    C5
2127     C2    O2    C3    C1
2128
2129 [ GLN ]
2130  [ atoms ]
2131      N     N  -0.280     0
2132      H     H   0.280     0
2133     CA   CH1   0.000     1
2134     CB   CH2   0.000     2
2135     CG   CH2   0.000     3
2136     CD     C   0.380     4
2137    OE1     O  -0.380     4
2138    NE2    NT  -0.830     5
2139   HE21     H   0.415     5
2140   HE22     H   0.415     5
2141      C     C   0.380     6
2142      O     O  -0.380     6
2143  [ bonds ]
2144      N     H
2145      N    CA
2146     CA     C
2147      C     O
2148     -C     N
2149     CA    CB
2150     CB    CG
2151     CG    CD
2152     CD   OE1
2153     CD   NE2
2154    NE2  HE21
2155    NE2  HE22
2156  [ impropers ]
2157      N    -C    CA     H
2158     -C   -CA     N    -O
2159     CA     N     C    CB
2160     CD   OE1   NE2    CG
2161    NE2  HE21  HE22    CD
2162
2163 [ GLU ]
2164  [ atoms ]
2165      N     N  -0.280     0
2166      H     H   0.280     0
2167     CA   CH1   0.000     1
2168     CB   CH2   0.000     2
2169     CG   CH2   0.000     3
2170     CD     C   0.270     4
2171    OE1    OM  -0.635     4
2172    OE2    OM  -0.635     4
2173      C     C   0.380     5
2174      O     O  -0.380     5
2175  [ bonds ]
2176      N     H
2177      N    CA
2178     CA     C
2179      C     O
2180     -C     N
2181     CA    CB
2182     CB    CG
2183     CG    CD
2184     CD   OE1
2185     CD   OE2
2186  [ impropers ]
2187      N    -C    CA     H
2188     -C   -CA     N    -O
2189     CA     N     C    CB
2190     CD   OE1   OE2    CG
2191
2192 [ GLUH ]
2193  [ atoms ]
2194      N     N  -0.280     0
2195      H     H   0.280     0
2196     CA   CH1   0.000     1
2197     CB   CH2   0.000     2
2198     CG   CH2   0.000     3
2199     CD     C   0.530     4
2200    OE1     O  -0.380     4
2201    OE2    OA  -0.548     4
2202    HE2    HO   0.398     4
2203      C     C   0.380     5
2204      O     O  -0.380     5
2205  [ bonds ]
2206      N     H
2207      N    CA
2208     CA     C
2209      C     O
2210     -C     N
2211     CA    CB
2212     CB    CG
2213     CG    CD
2214     CD   OE1
2215     CD   OE2
2216    OE2   HE2
2217  [ impropers ]
2218      N    -C    CA     H
2219     -C   -CA     N    -O
2220     CA     N     C    CB
2221     CD   OE1   OE2    CG
2222
2223 [ GLY ]
2224  [ atoms ]
2225      N     N  -0.280     0
2226      H     H   0.280     0
2227     CA   CH2   0.000     1
2228      C     C   0.380     2
2229      O     O  -0.380     2
2230  [ bonds ]
2231      N     H
2232      N    CA
2233     CA     C
2234      C     O
2235     -C     N
2236  [ impropers ]
2237      N    -C    CA     H
2238     -C   -CA     N    -O
2239
2240 [ GUA ]
2241  [ atoms ]
2242      P     P   0.990     0
2243    O1P    OM  -0.635     0
2244    O2P    OM  -0.635     0
2245    O5*    OS  -0.360     0
2246    C5*   CS2   0.000     1
2247    C4*   CS1   0.160     2
2248    O4*    OS  -0.360     2
2249    C1*   CS1   0.200     2
2250     N9  NR5*  -0.200     3
2251     C4    CB   0.200     3
2252     N3   NR6  -0.360     4
2253     C2    CB   0.360     4
2254     N2    NT  -0.830     5
2255    H21     H   0.415     5
2256    H22     H   0.415     5
2257     N1  NR6*  -0.280     6
2258     H1     H   0.280     6
2259     C6    CB   0.380     7
2260     O6     O  -0.380     7
2261     C5    CB   0.000     8
2262     N7   NR5  -0.360     9
2263     C8  CR51   0.360     9
2264    C2*   CS1   0.150    10
2265    O2*    OA  -0.548    10
2266    H2*    HO   0.398    10
2267    C3*   CS1   0.000    11
2268    O3*    OS  -0.360    12
2269  [ bonds ]
2270      P   O1P
2271      P   O2P
2272      P   O5*
2273    O5*   C5*
2274    C5*   C4*
2275    C4*   O4*
2276    C4*   C3*
2277    O4*   C1*
2278    C1*    N9
2279    C1*   C2*
2280     N9    C4
2281     N9    C8
2282     C4    N3
2283     C4    C5
2284     N3    C2
2285     C2    N2
2286     C2    N1
2287     N2   H21
2288     N2   H22
2289     N1    H1
2290     N1    C6
2291     C6    O6
2292     C6    C5
2293     C5    N7
2294     N7    C8
2295    C2*   O2*
2296    C2*   C3*
2297    O2*   H2*
2298    C3*   O3*
2299   -O3*     P
2300  [ impropers ]
2301    C4*   O4*   C5*   C3*
2302    C3*   C2*   O3*   C4*
2303    C1*    N9   O4*   C2*
2304     N9    C8    C4   C1*
2305     C4    N9    C8    N7
2306     C8    N9    C4    C5
2307     N9    C8    N7    C5
2308     N9    C4    C5    N7
2309     C8    N7    C5    C4
2310     C4    N9    N3    C5
2311     C5    C6    N7    C4
2312     N3    C4    C5    C6
2313     C4    C5    C6    N1
2314     C5    C4    N3    C2
2315     C5    C6    N1    C2
2316     C4    N3    C2    N1
2317     N3    C2    N1    C6
2318     C2    N1    N3    N2
2319     N2   H21   H22    C2
2320     N1    C6    C2    H1
2321     C6    C5    N1    O6
2322    C2*   O2*   C3*   C1*
2323
2324 [ H2O ]
2325  [ atoms ]
2326     OW    OW  -0.820     0
2327    HW1    HW   0.410     0
2328    HW2    HW   0.410     0
2329  [ bonds ]
2330     OW   HW1
2331     OW   HW2
2332
2333 [ HEME ]
2334  [ atoms ]
2335     FE    FE   0.400     0
2336     NA    NP  -0.100     0
2337     NB    NP  -0.100     0
2338     NC    NP  -0.100     0
2339     ND    NP  -0.100     0
2340    CHA  CR61   0.000     1
2341    C1A   CHE   0.000     2
2342    C2A   CHE   0.000     3
2343    C3A   CHE   0.000     4
2344    C4A   CHE   0.000     5
2345    CMA   CH3   0.000     6
2346    CAA   CH2   0.000     7
2347    CBA   CH2   0.000     8
2348    CGA     C   0.270     9
2349    O1A    OM  -0.635     9
2350    O2A    OM  -0.635     9
2351    CHB  CR61   0.000    10
2352    C1B   CHE   0.000    11
2353    C2B   CHE   0.000    12
2354    C3B   CHE   0.000    13
2355    C4B   CHE   0.000    14
2356    CMB   CH3   0.000    15
2357    CAB  CR61   0.000    16
2358    CBB   CH2   0.000    17
2359    CHC  CR61   0.000    18
2360    C1C   CHE   0.000    19
2361    C2C   CHE   0.000    20
2362    C3C   CHE   0.000    21
2363    C4C   CHE   0.000    22
2364    CMC   CH3   0.000    23
2365    CAC  CR61   0.000    24
2366    CBC   CH2   0.000    25
2367    CHD  CR61   0.000    26
2368    C1D   CHE   0.000    27
2369    C2D   CHE   0.000    28
2370    C3D   CHE   0.000    29
2371    C4D   CHE   0.000    30
2372    CMD   CH3   0.000    31
2373    CAD   CH2   0.000    32
2374    CBD   CH2   0.000    33
2375    CGD     C   0.270    34
2376    O1D    OM  -0.635    34
2377    O2D    OM  -0.635    34
2378  [ bonds ]
2379     FE    NA
2380     FE    NB
2381     FE    NC
2382     FE    ND
2383     NA   C1A
2384    C1A   C2A
2385    C2A   C3A
2386    C3A   C4A
2387     NA   C4A
2388    C2A   CAA
2389    CAA   CBA
2390    CBA   CGA
2391    CGA   O1A
2392    CGA   O2A
2393    C3A   CMA
2394    C4A   CHB
2395    CHB   C1B
2396     NB   C1B
2397    C1B   C2B
2398    C2B   C3B
2399    C3B   C4B
2400     NB   C4B
2401    C2B   CMB
2402    C3B   CAB
2403    CAB   CBB
2404    C4B   CHC
2405    CHC   C1C
2406     NC   C1C
2407    C1C   C2C
2408    C2C   C3C
2409    C3C   C4C
2410     NC   C4C
2411    C2C   CMC
2412    C3C   CAC
2413    CAC   CBC
2414    C4C   CHD
2415    CHD   C1D
2416     ND   C1D
2417    C1D   C2D
2418    C2D   C3D
2419    C3D   C4D
2420     ND   C4D
2421    C2D   CMD
2422    C3D   CAD
2423    CAD   CBD
2424    CBD   CGD
2425    CGD   O1D
2426    CGD   O2D
2427    CHA   C4D
2428    CHA   C1A
2429  [ angles ]
2430 ;   ai    aj    ak
2431     NA    FE    NC     ANG_180_0
2432     NB    FE    ND     ANG_180_0
2433  [ dihedrals ]
2434 ;   ai    aj    ak    al
2435     ND    FE    NA   C1A       DIH_0_0_2
2436     NA    FE    NB   C1B       DIH_0_0_2
2437     NB    FE    NC   C1C       DIH_0_0_2
2438     NC    FE    ND   C1D       DIH_0_0_2
2439     FE    NA   C1A   CHA       DIH_0_0_2
2440     FE    NA   C4A   C3A       DIH_0_0_2
2441     FE    NB   C1B   CHB       DIH_0_0_2
2442     FE    NB   C4B   C3B       DIH_0_0_2
2443     FE    NC   C1C   CHC       DIH_0_0_2
2444     FE    NC   C4C   C3C       DIH_0_0_2
2445     FE    ND   C1D   CHD       DIH_0_0_2
2446     FE    ND   C4D   CHA       DIH_0_0_2
2447     NA   C1A   C2A   C3A       DIH_0_0_2
2448    C1A   C2A   C3A   C4A       DIH_0_0_2
2449    C2A   C3A   C4A    NA       DIH_0_0_2
2450     NB   C1B   C2B   C3B       DIH_0_0_2
2451    C1B   C2B   C3B   C4B       DIH_0_0_2
2452    C2B   C3B   C4B    NB       DIH_0_0_2
2453     NC   C1C   C2C   C3C       DIH_0_0_2
2454    C1C   C2C   C3C   C4C       DIH_0_0_2
2455    C2C   C3C   C4C    NC       DIH_0_0_2
2456     ND   C1D   C2D   C3D       DIH_0_0_2
2457    C1D   C2D   C3D   C4D       DIH_0_0_2
2458    C2D   C3D   C4D    ND       DIH_0_0_2
2459  [ impropers ]
2460     FE   C1A   C4A    NA
2461     FE   C1B   C4B    NB
2462     FE   C1C   C4C    NC
2463     FE   C1D   C4D    ND
2464    CHA    NA   C2A   C1A
2465    CHB    NA   C3A   C4A
2466    CHB    NB   C2B   C1B
2467    CHC    NB   C3B   C4B
2468    CHC    NC   C2C   C1C
2469    CHD    NC   C3C   C4C
2470    CHD    ND   C2D   C1D
2471    CHA    ND   C3D   C4D
2472    C2A   C1A   C3A   CAA
2473    C3A   C2A   C4A   CMA
2474    C2B   C1B   C3B   CMB
2475    C3B   C2B   C4B   CAB
2476    C2C   C1C   C3C   CMC
2477    C3C   C2C   C4C   CAC
2478    C2D   C1D   C3D   CMD
2479    C3D   C2D   C4D   CAD
2480    CBA   O1A   O2A   CGA
2481    CBD   O1D   O2D   CGD
2482
2483 [ HIS1 ]
2484  [ atoms ]
2485      N     N  -0.280     0
2486      H     H   0.280     0
2487     CA   CH1   0.000     1
2488     CB   CH2   0.000     2
2489     CG    CB   0.000     3
2490    ND1  NR5*   0.000     4
2491    HD1     H   0.190     5
2492    CD2  CR51   0.130     5
2493    CE1  CR51   0.260     5
2494    NE2   NR5  -0.580     5
2495      C     C   0.380     6
2496      O     O  -0.380     6
2497  [ bonds ]
2498      N     H
2499      N    CA
2500     CA     C
2501      C     O
2502     -C     N
2503     CA    CB
2504     CB    CG
2505     CG   ND1
2506     CG   CD2
2507    ND1   HD1
2508    ND1   CE1
2509    CD2   NE2
2510    CE1   NE2
2511  [ impropers ]
2512      N    -C    CA     H
2513     -C   -CA     N    -O
2514     CA     N     C    CB
2515     CG   ND1   CD2    CB
2516    CD2    CG   ND1   CE1
2517    ND1    CG   CD2   NE2
2518     CG   ND1   CE1   NE2
2519     CG   CD2   NE2   CE1
2520    CD2   NE2   CE1   ND1
2521    ND1    CG   CE1   HD1
2522
2523 [ HISA ]
2524  [ atoms ]
2525      N     N  -0.280     0
2526      H     H   0.280     0
2527     CA   CH1   0.000     1
2528     CB   CH2   0.000     2
2529     CG    CB   0.000     3
2530    ND1  NR5*   0.000     4
2531    HD1     H   0.190     5
2532    CD2  CR51   0.130     5
2533    CE1  CR51   0.260     5
2534    NE2   NR5  -0.580     5
2535      C     C   0.380     6
2536      O     O  -0.380     6
2537  [ bonds ]
2538      N     H
2539      N    CA
2540     CA     C
2541      C     O
2542     -C     N
2543     CA    CB
2544     CB    CG
2545     CG   ND1
2546     CG   CD2
2547    ND1   HD1
2548    ND1   CE1
2549    CD2   NE2
2550    CE1   NE2
2551  [ impropers ]
2552      N    -C    CA     H
2553     -C   -CA     N    -O
2554     CA     N     C    CB
2555     CG   ND1   CD2    CB
2556    CD2    CG   ND1   CE1
2557    ND1    CG   CD2   NE2
2558     CG   ND1   CE1   NE2
2559     CG   CD2   NE2   CE1
2560    CD2   NE2   CE1   ND1
2561    ND1    CG   CE1   HD1
2562
2563 [ HISB ]
2564  [ atoms ]
2565      N     N  -0.280     0
2566      H     H   0.280     0
2567     CA   CH1   0.000     1
2568     CB   CH2   0.000     2
2569     CG    CB   0.130     3
2570    ND1   NR5  -0.580     3
2571    CD2  CR51   0.000     3
2572    CE1  CR51   0.260     3
2573    NE2  NR5*   0.000     3
2574    HE2     H   0.190     3
2575      C     C   0.380     4
2576      O     O  -0.380     4
2577  [ bonds ]
2578      N     H
2579      N    CA
2580     CA     C
2581      C     O
2582     -C     N
2583     CA    CB
2584     CB    CG
2585     CG   ND1
2586     CG   CD2
2587    ND1   CE1
2588    CD2   NE2
2589    CE1   NE2
2590    NE2   HE2
2591  [ impropers ]
2592      N    -C    CA     H
2593     -C   -CA     N    -O
2594     CA     N     C    CB
2595     CG   ND1   CD2    CB
2596    CD2    CG   ND1   CE1
2597    ND1    CG   CD2   NE2
2598     CG   ND1   CE1   NE2
2599     CG   CD2   NE2   CE1
2600    CD2   NE2   CE1   ND1
2601    NE2   CD2   CE1   HE2
2602
2603 [ HISH ]
2604  [ atoms ]
2605      N     N  -0.280     0
2606      H     H   0.280     0
2607     CA   CH1   0.000     1
2608     CB   CH2   0.000     2
2609     CG    CB  -0.050     3
2610    ND1  NR5*   0.380     3
2611    HD1     H   0.300     3
2612    CD2  CR51   0.000     3
2613    CE1  CR51  -0.240     3
2614    NE2  NR5*   0.310     3
2615    HE2     H   0.300     3
2616      C     C   0.380     4
2617      O     O  -0.380     4
2618  [ bonds ]
2619      N     H
2620      N    CA
2621     CA     C
2622      C     O
2623     -C     N
2624     CA    CB
2625     CB    CG
2626     CG   ND1
2627     CG   CD2
2628    ND1   HD1
2629    ND1   CE1
2630    CD2   NE2
2631    CE1   NE2
2632    NE2   HE2
2633  [ impropers ]
2634      N    -C    CA     H
2635     -C   -CA     N    -O
2636     CA     N     C    CB
2637     CG   ND1   CD2    CB
2638    CD2    CG   ND1   CE1
2639    ND1    CG   CD2   NE2
2640     CG   ND1   CE1   NE2
2641     CG   CD2   NE2   CE1
2642    CD2   NE2   CE1   ND1
2643    ND1    CG   CE1   HD1
2644    NE2   CD2   CE1   HE2
2645
2646 [ HOH ]
2647  [ atoms ]
2648     OW    OW  -0.820     0
2649    HW1    HW   0.410     0
2650    HW2    HW   0.410     0
2651  [ bonds ]
2652     OW   HW1
2653     OW   HW2
2654
2655 [ HO4 ]
2656  [ atoms ]
2657    OW  OWT4    0.0      0
2658   HW1    HW    0.52     0
2659   HW2    HW    0.52     0
2660    MW    IW   -1.04     0
2661  [ bonds ]
2662    OW   HW1    gb_35
2663    OW   HW2    gb_35
2664
2665 [ HYP ]
2666  [ atoms ]
2667      N     N   0.000     0
2668     CA   CH1   0.000     1
2669     CB   CH2   0.000     2
2670     CG   CH1   0.150     3
2671    OD1    OA  -0.548     3
2672    HD1    HO   0.398     3
2673    CD2   CH2   0.000     4
2674      C     C   0.380     5
2675      O     O  -0.380     5
2676  [ bonds ]
2677      N    CA
2678     CA     C
2679      C     O
2680     -C     N
2681     CA    CB
2682     CB    CG
2683     CG   OD1
2684    OD1   HD1
2685     CG   CD2
2686    CD2     N
2687  [ impropers ]
2688      N    -C    CA   CD2
2689     -C   -CA     N    -O
2690     CA     N     C    CB
2691     CG   CD2    CB   OD1
2692
2693 [ ILE ]
2694  [ atoms ]
2695      N     N  -0.280     0
2696      H     H   0.280     0
2697     CA   CH1   0.000     1
2698     CB   CH1   0.000     2
2699    CG1   CH2   0.000     3
2700    CG2   CH3   0.000     4
2701     CD   CH3   0.000     5
2702      C     C   0.380     6
2703      O     O  -0.380     6
2704  [ bonds ]
2705      N     H
2706      N    CA
2707     CA     C
2708      C     O
2709     -C     N
2710     CA    CB
2711     CB   CG1
2712     CB   CG2
2713    CG1    CD
2714  [ impropers ]
2715      N    -C    CA     H
2716     -C   -CA     N    -O
2717     CA     N     C    CB
2718     CB   CG1   CG2    CA
2719
2720 [ LEU ]
2721  [ atoms ]
2722      N     N  -0.280     0
2723      H     H   0.280     0
2724     CA   CH1   0.000     1
2725     CB   CH2   0.000     2
2726     CG   CH1   0.000     3
2727    CD1   CH3   0.000     4
2728    CD2   CH3   0.000     5
2729      C     C   0.380     6
2730      O     O  -0.380     6
2731  [ bonds ]
2732      N     H
2733      N    CA
2734     CA     C
2735      C     O
2736     -C     N
2737     CA    CB
2738     CB    CG
2739     CG   CD1
2740     CG   CD2
2741  [ impropers ]
2742      N    -C    CA     H
2743     -C   -CA     N    -O
2744     CA     N     C    CB
2745     CG   CD2   CD1    CB
2746
2747 [ LYS ]
2748  [ atoms ]
2749      N     N  -0.280     0
2750      H     H   0.280     0
2751     CA   CH1   0.000     1
2752     CB   CH2   0.000     2
2753     CG   CH2   0.000     3
2754     CD   CH2   0.000     4
2755     CE   CH2   0.000     5
2756     NZ    NL  -0.830     5
2757    HZ1     H   0.415     5
2758    HZ2     H   0.415     5
2759      C     C   0.380     6
2760      O     O  -0.380     6
2761  [ bonds ]
2762      N     H
2763      N    CA
2764     CA     C
2765      C     O
2766     -C     N
2767     CA    CB
2768     CB    CG
2769     CG    CD
2770     CD    CE
2771     CE    NZ
2772     NZ   HZ1
2773     NZ   HZ2
2774  [ impropers ]
2775      N    -C    CA     H
2776     -C   -CA     N    -O
2777     CA     N     C    CB
2778     NZ    CE   HZ2   HZ1
2779
2780 [ LYSH ]
2781  [ atoms ]
2782      N     N  -0.280     0
2783      H     H   0.280     0
2784     CA   CH1   0.000     1
2785     CB   CH2   0.000     2
2786     CG   CH2   0.000     3
2787     CD   CH2   0.000     4
2788     CE   CH2   0.127     5
2789     NZ    NL   0.129     5
2790    HZ1     H   0.248     5
2791    HZ2     H   0.248     5
2792    HZ3     H   0.248     5
2793      C     C   0.380     6
2794      O     O  -0.380     6
2795  [ bonds ]
2796      N     H
2797      N    CA
2798     CA     C
2799      C     O
2800     -C     N
2801     CA    CB
2802     CB    CG
2803     CG    CD
2804     CD    CE
2805     CE    NZ
2806     NZ   HZ1
2807     NZ   HZ2
2808     NZ   HZ3
2809  [ impropers ]
2810      N    -C    CA     H
2811     -C   -CA     N    -O
2812     CA     N     C    CB
2813     NZ    CE   HZ2   HZ1
2814     NZ    CE   HZ1   HZ3
2815
2816 [ MEBMT ]
2817  [ atoms ]
2818      N     N   0.000     0
2819     CN   CH3   0.000     1
2820     CA   CH1   0.000     2
2821     CB   CH1   0.150     3
2822    OG1    OA  -0.548     3
2823    HG1    HO   0.398     3
2824    CG2   CH1   0.000     4
2825    CD1   CH3   0.000     5
2826    CD2   CH2   0.000     6
2827     CE  CR61   0.000     7
2828     CZ  CR61   0.000     8
2829     CH   CH3   0.000     9
2830      C     C   0.380    10
2831      O     O  -0.380    10
2832  [ bonds ]
2833      N    CN
2834      N    CA
2835     CA     C
2836      C     O
2837     -C     N
2838     CA    CB
2839     CB   OG1
2840    OG1   HG1
2841     CB   CG2
2842    CG2   CD1
2843    CG2   CD2
2844    CD2    CE
2845     CE    CZ
2846     CZ    CH
2847  [ impropers ]
2848      N    -C    CA    CN
2849     -C   -CA     N    -O
2850     CA     N     C    CB
2851     CB   OG1   CG2    CA
2852    CG2   CD1   CD2    CB
2853
2854 [ MELEU ]
2855  [ atoms ]
2856      N     N   0.000     0
2857     CN   CH3   0.000     1
2858     CA   CH1   0.000     2
2859     CB   CH2   0.000     3
2860     CG   CH1   0.000     4
2861    CD1   CH3   0.000     5
2862    CD2   CH3   0.000     6
2863      C     C   0.380     7
2864      O     O  -0.380     7
2865  [ bonds ]
2866      N    CN
2867      N    CA
2868     CA     C
2869      C     O
2870     -C     N
2871     CA    CB
2872     CB    CG
2873     CG   CD1
2874     CG   CD2
2875  [ impropers ]
2876      N    -C    CA    CN
2877     -C   -CA     N    -O
2878     CA     N     C    CB
2879     CG   CD1   CD2    CB
2880
2881 [ MET ]
2882  [ atoms ]
2883      N     N  -0.280     0
2884      H     H   0.280     0
2885     CA   CH1   0.000     1
2886     CB   CH2   0.000     2
2887     CG   CH2   0.000     3
2888     SD     S   0.000     4
2889     CE   CH3   0.000     5
2890      C     C   0.380     6
2891      O     O  -0.380     6
2892  [ bonds ]
2893      N     H
2894      N    CA
2895     CA     C
2896      C     O
2897     -C     N
2898     CA    CB
2899     CB    CG
2900     CG    SD
2901     SD    CE
2902  [ impropers ]
2903      N    -C    CA     H
2904     -C   -CA     N    -O
2905     CA     N     C    CB
2906
2907 [ MEVAL ]
2908  [ atoms ]
2909      N     N   0.000     0
2910     CN   CH3   0.000     1
2911     CA   CH1   0.000     2
2912     CB   CH1   0.000     3
2913    CG1   CH3   0.000     4
2914    CG2   CH3   0.000     5
2915      C     C   0.380     6
2916      O     O  -0.380     6
2917  [ bonds ]
2918      N    CN
2919      N    CA
2920     CA     C
2921      C     O
2922     -C     N
2923     CA    CB
2924     CB   CG1
2925     CB   CG2
2926  [ impropers ]
2927      N    -C    CA    CN
2928     -C   -CA     N    -O
2929     CA     N     C    CB
2930     CB   CG1   CG2    CA
2931
2932 [ MG ]
2933  [ atoms ]
2934     MG    MG   2.000     0
2935
2936 [ MTH ]
2937  [ atoms ]
2938     MH    HO   0.398     0
2939     MO    OA  -0.548     0
2940     MC   CH3   0.150     0
2941  [ bonds ]
2942     MH    MO
2943     MO    MC
2944
2945 [ MTXH ]
2946  [ atoms ]
2947     N1  NR6*  -0.280     0
2948    HA1     H   0.280     0
2949     C2    CB   0.000     1
2950    NA2    NT  -0.830     2
2951   HA21     H   0.415     2
2952   HA22     H   0.415     2
2953     N3   NR6  -0.360     3
2954     C4    CB   0.360     3
2955    NA4    NT  -0.830     4
2956   HA41     H   0.415     4
2957   HA42     H   0.415     4
2958    C4A    CB   0.000     5
2959     N5   NR6  -0.360     6
2960     C6    CB   0.360     6
2961     C7  CR61   0.360     7
2962     N8   NR6  -0.360     7
2963    C8A    CB   0.000     8
2964     C9   CH2   0.000     9
2965    N10  NR6*   0.000    10
2966   CM10   CH3   0.000    11
2967    C14    CB   0.000    12
2968    C13  CR61   0.000    13
2969    C15  CR61   0.000    14
2970    C12  CR61   0.000    15
2971    C16  CR61   0.000    16
2972    C11    CB   0.000    17
2973      C     C   0.380    18
2974      O     O  -0.380    18
2975      N     N  -0.280    19
2976      H     H   0.280    19
2977     CA   CH1   0.000    20
2978     CB   CH2   0.000    21
2979     CG   CH2   0.000    22
2980     CD     C   0.270    23
2981    OE1    OM  -0.635    23
2982    OE2    OM  -0.635    23
2983     CT     C   0.270    24
2984     O1    OM  -0.635    24
2985     O2    OM  -0.635    24
2986  [ bonds ]
2987     N1   HA1
2988     N1    C2
2989     N1   C8A
2990     C2   NA2
2991     C2    N3
2992    NA2  HA21
2993    NA2  HA22
2994     N3    C4
2995     C4   NA4
2996     C4   C4A
2997    NA4  HA41
2998    NA4  HA42
2999    C4A    N5
3000    C4A   C8A
3001     N5    C6
3002     C6    C7
3003     C6    C9
3004     C7    N8
3005     N8   C8A
3006     C9   N10
3007    N10  CM10
3008    N10   C14
3009    C14   C13
3010    C14   C15
3011    C13   C12
3012    C15   C16
3013    C12   C11
3014    C16   C11
3015    C11     C
3016      C     O
3017      C     N
3018      N     H
3019      N    CA
3020     CA    CB
3021     CA    CT
3022     CB    CG
3023     CG    CD
3024     CD   OE1
3025     CD   OE2
3026     CT    O1
3027     CT    O2
3028  [ impropers ]
3029     N1    C2   C8A   HA1
3030     C2    N1    N3   NA2
3031    NA2  HA21  HA22    C2
3032     C4    N3   C4A   NA4
3033    NA4  HA41  HA42    C4
3034     N1    C2    N3    C4
3035     C2    N3    C4   C4A
3036     N3    C4   C4A   C8A
3037     C4   C4A   C8A    N1
3038    C4A   C8A    N1    C2
3039    C8A    N1    C2    N3
3040    C4A    C4    N5   C8A
3041    C8A    N1    N8   C4A
3042    C4A    N5    C6    C7
3043     N5    C6    C7    N8
3044     C6    C7    N8   C8A
3045     C7    N8   C8A   C4A
3046     N8   C8A   C4A    N5
3047    C8A   C4A    N5    C6
3048     C6    N5    C7    C9
3049    N10    C9   C14  CM10
3050    C14   C13   C15   N10
3051    C14   C13   C12   C11
3052    C14   C15   C16   C11
3053    C13   C14   C15   C16
3054    C15   C14   C13   C12
3055    C13   C12   C11   C16
3056    C15   C16   C11   C12
3057    C11   C12   C16     C
3058      C   C11     N     O
3059      N     C    CA     H
3060     CA     N    CT    CB
3061     CD   OE1   OE2    CG
3062     CT    CA    O2    O1
3063
3064 [ NA ]
3065  [ atoms ]
3066     NA    NA   1.000     0
3067
3068 [ NAC ]
3069  [ atoms ]
3070      N     N  -0.280     0
3071      H     H   0.280     0
3072     CA   CH3   0.000     1
3073  [ bonds ]
3074      N     H
3075      N    CA
3076     -C     N
3077  [ impropers ]
3078      N    -C    CA     H
3079
3080 [ NADH ]
3081  [ atoms ]
3082     AP     P   0.760     0
3083   AO1P    OM  -0.635     0
3084   AO2P    OM  -0.635     0
3085   AO5*    OS  -0.360     0
3086    O3P    OS  -0.260     0
3087     NP     P   0.760     0
3088   NO1P    OM  -0.635     0
3089   NO2P    OM  -0.635     0
3090   NO5*    OS  -0.360     0
3091   AC5*   CS2   0.000     1
3092   AC4*   CS1   0.160     2
3093   AO4*    OS  -0.360     2
3094   AC1*   CS1   0.200     2
3095    AN9  NR5*  -0.200     3
3096    AC4    CB   0.200     3
3097    AN3   NR6  -0.360     4
3098    AC2  CR61   0.360     4
3099    AN1   NR6  -0.360     5
3100    AC6    CB   0.360     5
3101    AN6    NT  -0.830     6
3102   AH61     H   0.415     6
3103   AH62     H   0.415     6
3104    AC5    CB   0.000     7
3105    AN7   NR5  -0.360     8
3106    AC8  CR51   0.360     8
3107   AC2*   CS1   0.150     9
3108   AO2*    OA  -0.548     9
3109   AH2*    HO   0.398     9
3110   AC3*   CS1   0.150    10
3111   AO3*    OA  -0.548    10
3112   AH3*    HO   0.398    10
3113   NC5*   CS2   0.000    11
3114   NC4*   CS1   0.160    12
3115   NO4*    OS  -0.360    12
3116   NC1*   CS1   0.200    12
3117    NN1  NR6*  -0.200    13
3118    NC6  CR61   0.200    13
3119    NC2  CR61   0.000    13
3120    NC3    CB   0.000    13
3121    NC4   CS2   0.000    13
3122    NC5  CR61   0.000    13
3123    NC7     C   0.380    14
3124    NO7     O  -0.380    14
3125    NN7    NT  -0.830    15
3126   NH71     H   0.415    15
3127   NH72     H   0.415    15
3128   NC2*   CS1   0.150    16
3129   NO2*    OA  -0.548    16
3130   NH2*    HO   0.398    16
3131   NC3*   CS1   0.150    17
3132   NO3*    OA  -0.548    17
3133   NH3*    HO   0.398    17
3134  [ bonds ]
3135     AP  AO1P
3136     AP  AO2P
3137     AP  AO5*
3138     AP   O3P
3139   AO5*  AC5*
3140    O3P    NP
3141     NP  NO1P
3142     NP  NO2P
3143     NP  NO5*
3144   NO5*  NC5*
3145   AC5*  AC4*
3146   AC4*  AO4*
3147   AC4*  AC3*
3148   AO4*  AC1*
3149   AC1*   AN9
3150   AC1*  AC2*
3151    AN9   AC4
3152    AN9   AC8
3153    AC4   AN3
3154    AC4   AC5
3155    AN3   AC2
3156    AC2   AN1
3157    AN1   AC6
3158    AC6   AN6
3159    AC6   AC5
3160    AN6  AH61
3161    AN6  AH62
3162    AC5   AN7
3163    AN7   AC8
3164   AC2*  AO2*
3165   AC2*  AC3*
3166   AO2*  AH2*
3167   AC3*  AO3*
3168   AO3*  AH3*
3169   NC5*  NC4*
3170   NC4*  NO4*
3171   NC4*  NC3*
3172   NO4*  NC1*
3173   NC1*   NN1
3174   NC1*  NC2*
3175    NN1   NC6
3176    NN1   NC2
3177    NC6   NC5
3178    NC2   NC3
3179    NC3   NC4
3180    NC3   NC7
3181    NC4   NC5
3182    NC7   NO7
3183    NC7   NN7
3184    NN7  NH71
3185    NN7  NH72
3186   NC2*  NO2*
3187   NC2*  NC3*
3188   NO2*  NH2*
3189   NC3*  NO3*
3190   NO3*  NH3*
3191  [ impropers ]
3192   AC4*  AO4*  AC5*  AC3*
3193   AC3*  AC2*  AO3*  AC4*
3194   AC2*  AO2*  AC3*  AC1*
3195   AC1*   AN9  AO4*  AC2*
3196    AN9   AC8   AC4  AC1*
3197    AC4   AN9   AC8   AN7
3198    AC8   AN9   AC4   AC5
3199    AN9   AC8   AN7   AC5
3200    AN9   AC4   AC5   AN7
3201    AC8   AN7   AC5   AC4
3202    AC4   AN9   AN3   AC5
3203    AC5   AC6   AN7   AC4
3204    AN3   AC4   AC5   AC6
3205    AC4   AC5   AC6   AN1
3206    AC5   AC4   AN3   AC2
3207    AC5   AC6   AN1   AC2
3208    AC4   AN3   AC2   AN1
3209    AN3   AC2   AN1   AC6
3210    AC6   AC5   AN1   AN6
3211    AN6  AH61  AH62   AC6
3212   NC4*  NO4*  NC5*  NC3*
3213   NC3*  NC2*  NO3*  NC4*
3214   NC2*  NO2*  NC3*  NC1*
3215   NC1*   NN1  NO4*  NC2*
3216    NN1   NC6   NC2  NC1*
3217    NC2   NN1   NC6   NC5
3218    NC6   NN1   NC2   NC3
3219    NN1   NC6   NC5   NC4
3220    NN1   NC2   NC3   NC4
3221    NC6   NC5   NC4   NC3
3222    NC2   NC3   NC4   NC5
3223    NC3   NC4   NC2   NC7
3224    NC7   NO7   NN7   NC3
3225    NN7  NH71  NH72   NC7
3226
3227 [ NADP ]
3228  [ atoms ]
3229     AP     P   0.760     0
3230   AO1P    OM  -0.635     0
3231   AO2P    OM  -0.635     0
3232   AO5*    OS  -0.360     0
3233    O3P    OS  -0.260     0
3234     NP     P   0.760     0
3235   NO1P    OM  -0.635     0
3236   NO2P    OM  -0.635     0
3237   NO5*    OS  -0.360     0
3238   AC5*   CS2   0.000     1
3239   AC4*   CS1   0.160     2
3240   AO4*    OS  -0.360     2
3241   AC1*   CS1   0.200     2
3242    AN9  NR5*  -0.200     3
3243    AC4    CB   0.200     3
3244    AN3   NR6  -0.360     4
3245    AC2  CR61   0.360     4
3246    AN1   NR6  -0.360     5
3247    AC6    CB   0.360     5
3248    AN6    NT  -0.830     6
3249   AH61     H   0.415     6
3250   AH62     H   0.415     6
3251    AC5    CB   0.000     7
3252    AN7   NR5  -0.360     8
3253    AC8  CR51   0.360     8
3254   AC2*   CS1   0.150     9
3255   AO2*    OA  -0.548     9
3256   AH2*    HO   0.398     9
3257   AC3*   CS1   0.150    10
3258   AO3*    OA  -0.548    10
3259   AH3*    HO   0.398    10
3260   NC5*   CS2   0.000    11
3261   NC4*   CS1   0.160    12
3262   NO4*    OS  -0.360    12
3263   NC1*   CS1   0.200    12
3264    NN1  NR6*   0.100    13
3265    NC6  CR61   0.300    13
3266    NC2  CR61   0.250    13
3267    NC3    CB   0.000    13
3268    NC4  CR61   0.250    13
3269    NC5  CR61   0.100    13
3270    NC7     C   0.380    14
3271    NO7     O  -0.380    14
3272    NN7    NT  -0.830    15
3273   NH71     H   0.415    15
3274   NH72     H   0.415    15
3275   NC2*   CS1   0.150    16
3276   NO2*    OA  -0.548    16
3277   NH2*    HO   0.398    16
3278   NC3*   CS1   0.150    17
3279   NO3*    OA  -0.548    17
3280   NH3*    HO   0.398    17
3281  [ bonds ]
3282     AP  AO1P
3283     AP  AO2P
3284     AP  AO5*
3285     AP   O3P
3286   AO5*  AC5*
3287    O3P    NP
3288     NP  NO1P
3289     NP  NO2P
3290     NP  NO5*
3291   NO5*  NC5*
3292   AC5*  AC4*
3293   AC4*  AO4*
3294   AC4*  AC3*
3295   AO4*  AC1*
3296   AC1*   AN9
3297   AC1*  AC2*
3298    AN9   AC4
3299    AN9   AC8
3300    AC4   AN3
3301    AC4   AC5
3302    AN3   AC2
3303    AC2   AN1
3304    AN1   AC6
3305    AC6   AN6
3306    AC6   AC5
3307    AN6  AH61
3308    AN6  AH62
3309    AC5   AN7
3310    AN7   AC8
3311   AC2*  AO2*
3312   AC2*  AC3*
3313   AO2*  AH2*
3314   AC3*  AO3*
3315   AO3*  AH3*
3316   NC5*  NC4*
3317   NC4*  NO4*
3318   NC4*  NC3*
3319   NO4*  NC1*
3320   NC1*   NN1
3321   NC1*  NC2*
3322    NN1   NC6
3323    NN1   NC2
3324    NC6   NC5
3325    NC2   NC3
3326    NC3   NC4
3327    NC3   NC7
3328    NC4   NC5
3329    NC7   NO7
3330    NC7   NN7
3331    NN7  NH71
3332    NN7  NH72
3333   NC2*  NO2*
3334   NC2*  NC3*
3335   NO2*  NH2*
3336   NC3*  NO3*
3337   NO3*  NH3*
3338  [ impropers ]
3339   AC4*  AO4*  AC5*  AC3*
3340   AC3*  AC2*  AO3*  AC4*
3341   AC2*  AO2*  AC3*  AC1*
3342   AC1*   AN9  AO4*  AC2*
3343    AN9   AC8   AC4  AC1*
3344    AC4   AN9   AC8   AN7
3345    AC8   AN9   AC4   AC5
3346    AN9   AC8   AN7   AC5
3347    AN9   AC4   AC5   AN7
3348    AC8   AN7   AC5   AC4
3349    AC4   AN9   AN3   AC5
3350    AC5   AC6   AN7   AC4
3351    AN3   AC4   AC5   AC6
3352    AC4   AC5   AC6   AN1
3353    AC5   AC4   AN3   AC2
3354    AC5   AC6   AN1   AC2
3355    AC4   AN3   AC2   AN1
3356    AN3   AC2   AN1   AC6
3357    AC6   AC5   AN1   AN6
3358    AN6  AH61  AH62   AC6
3359   NC4*  NO4*  NC5*  NC3*
3360   NC3*  NC2*  NO3*  NC4*
3361   NC2*  NO2*  NC3*  NC1*
3362   NC1*   NN1  NO4*  NC2*
3363    NN1   NC6   NC2  NC1*
3364    NC2   NN1   NC6   NC5
3365    NC6   NN1   NC2   NC3
3366    NN1   NC6   NC5   NC4
3367    NN1   NC2   NC3   NC4
3368    NC6   NC5   NC4   NC3
3369    NC2   NC3   NC4   NC5
3370    NC3   NC4   NC2   NC7
3371    NC7   NO7   NN7   NC3
3372    NN7  NH71  NH72   NC7
3373
3374 [ NDPH ]
3375  [ atoms ]
3376     AP     P   0.760     0
3377   AO1P    OM  -0.635     0
3378   AO2P    OM  -0.635     0
3379   AO5*    OS  -0.360     0
3380    O3P    OS  -0.260     0
3381     NP     P   0.760     0
3382   NO1P    OM  -0.635     0
3383   NO2P    OM  -0.635     0
3384   NO5*    OS  -0.360     0
3385   AC5*   CS2   0.000     1
3386   AC4*   CS1   0.160     2
3387   AO4*    OS  -0.360     2
3388   AC1*   CS1   0.200     2
3389    AN9  NR5*  -0.200     3
3390    AC4    CB   0.200     3
3391    AN3   NR6  -0.360     4
3392    AC2  CR61   0.360     4
3393    AN1   NR6  -0.360     5
3394    AC6    CB   0.360     5
3395    AN6    NT  -0.830     6
3396   AH61     H   0.415     6
3397   AH62     H   0.415     6
3398    AC5    CB   0.000     7
3399    AN7   NR5  -0.360     8
3400    AC8  CR51   0.360     8
3401   AC2*   CS1   0.150     9
3402   AO2*    OS  -0.360     9
3403   AP2*     P   0.630     9
3404   AO6*    OM  -0.635     9
3405   AO7*    OM  -0.635     9
3406   AO8*    OA  -0.548     9
3407   AH8*    HO   0.398     9
3408   AC3*   CS1   0.150    10
3409   AO3*    OA  -0.548    10
3410   AH3*    HO   0.398    10
3411   NC5*   CS2   0.000    11
3412   NC4*   CS1   0.160    12
3413   NO4*    OS  -0.360    12
3414   NC1*   CS1   0.200    12
3415    NN1  NR6*  -0.200    13
3416    NC6  CR61   0.200    13
3417    NC2  CR61   0.000    13
3418    NC3    CB   0.000    13
3419    NC4   CS2   0.000    13
3420    NC5  CR61   0.000    13
3421    NC7     C   0.380    14
3422    NO7     O  -0.380    14
3423    NN7    NT  -0.830    15
3424   NH71     H   0.415    15
3425   NH72     H   0.415    15
3426   NC2*   CS1   0.150    16
3427   NO2*    OA  -0.548    16
3428   NH2*    HO   0.398    16
3429   NC3*   CS1   0.150    17
3430   NO3*    OA  -0.548    17
3431   NH3*    HO   0.398    17
3432  [ bonds ]
3433     AP  AO1P
3434     AP  AO2P
3435     AP  AO5*
3436     AP   O3P
3437   AO5*  AC5*
3438    O3P    NP
3439     NP  NO1P
3440     NP  NO2P
3441     NP  NO5*
3442   NO5*  NC5*
3443   AC5*  AC4*
3444   AC4*  AO4*
3445   AC4*  AC3*
3446   AO4*  AC1*
3447   AC1*   AN9
3448   AC1*  AC2*
3449    AN9   AC4
3450    AN9   AC8
3451    AC4   AN3
3452    AC4   AC5
3453    AN3   AC2
3454    AC2   AN1
3455    AN1   AC6
3456    AC6   AN6
3457    AC6   AC5
3458    AN6  AH61
3459    AN6  AH62
3460    AC5   AN7
3461    AN7   AC8
3462   AC2*  AO2*
3463   AC2*  AC3*
3464   AO2*  AP2*
3465   AP2*  AO6*
3466   AP2*  AO7*
3467   AP2*  AO8*
3468   AO8*  AH8*
3469   AC3*  AO3*
3470   AO3*  AH3*
3471   NC5*  NC4*
3472   NC4*  NO4*
3473   NC4*  NC3*
3474   NO4*  NC1*
3475   NC1*   NN1
3476   NC1*  NC2*
3477    NN1   NC6
3478    NN1   NC2
3479    NC6   NC5
3480    NC2   NC3
3481    NC3   NC4
3482    NC3   NC7
3483    NC4   NC5
3484    NC7   NO7
3485    NC7   NN7
3486    NN7  NH71
3487    NN7  NH72
3488   NC2*  NO2*
3489   NC2*  NC3*
3490   NO2*  NH2*
3491   NC3*  NO3*
3492   NO3*  NH3*
3493  [ impropers ]
3494   AC4*  AO4*  AC5*  AC3*
3495   AC3*  AC2*  AO3*  AC4*
3496   AC2*  AO2*  AC3*  AC1*
3497   AC1*   AN9  AO4*  AC2*
3498    AN9   AC8   AC4  AC1*
3499    AC4   AN9   AC8   AN7
3500    AC8   AN9   AC4   AC5
3501    AN9   AC8   AN7   AC5
3502    AN9   AC4   AC5   AN7
3503    AC8   AN7   AC5   AC4
3504    AC4   AN9   AN3   AC5
3505    AC5   AC6   AN7   AC4
3506    AN3   AC4   AC5   AC6
3507    AC4   AC5   AC6   AN1
3508    AC5   AC4   AN3   AC2
3509    AC5   AC6   AN1   AC2
3510    AC4   AN3   AC2   AN1
3511    AN3   AC2   AN1   AC6
3512    AC6   AC5   AN1   AN6
3513    AN6  AH61  AH62   AC6
3514   NC4*  NO4*  NC5*  NC3*
3515   NC3*  NC2*  NO3*  NC4*
3516   NC2*  NO2*  NC3*  NC1*
3517   NC1*   NN1  NO4*  NC2*
3518    NN1   NC6   NC2  NC1*
3519    NC2   NN1   NC6   NC5
3520    NC6   NN1   NC2   NC3
3521    NN1   NC6   NC5   NC4
3522    NN1   NC2   NC3   NC4
3523    NC6   NC5   NC4   NC3
3524    NC2   NC3   NC4   NC5
3525    NC3   NC4   NC2   NC7
3526    NC7   NO7   NN7   NC3
3527    NN7  NH71  NH72   NC7
3528
3529 [ NDPHN ]
3530  [ atoms ]
3531     AP     P   1.020     0
3532   AO1P    OA  -0.548     0
3533   AH1P    HO   0.398     0
3534   AO2P     O  -0.380     0
3535   AO5*    OS  -0.360     0
3536    O3P    OS  -0.260     0
3537     NP     P   1.020     0
3538   NO1P    OA  -0.548     0
3539   NH1P    HO   0.398     0
3540   NO2P     O  -0.380     0
3541   NO5*    OS  -0.360     0
3542   AC5*   CS2   0.000     1
3543   AC4*   CS1   0.160     2
3544   AO4*    OS  -0.360     2
3545   AC1*   CS1   0.200     2
3546    AN9  NR5*  -0.200     3
3547    AC4    CB   0.200     3
3548    AN3   NR6  -0.360     4
3549    AC2  CR61   0.360     4
3550    AN1   NR6  -0.360     5
3551    AC6    CB   0.360     5
3552    AN6    NT  -0.830     6
3553   AH61     H   0.415     6
3554   AH62     H   0.415     6
3555    AC5    CB   0.000     7
3556    AN7   NR5  -0.360     8
3557    AC8  CR51   0.360     8
3558   AC2*   CS1   0.150     9
3559   AO2*    OS  -0.360     9
3560   AP2*     P   0.890     9
3561   AO6*     O  -0.380     9
3562   AO7*    OA  -0.548     9
3563   AH7*    HO   0.398     9
3564   AO8*    OA  -0.548     9
3565   AH8*    HO   0.398     9
3566   AC3*   CS1   0.150    10
3567   AO3*    OA  -0.548    10
3568   AH3*    HO   0.398    10
3569   NC5*   CS2   0.000    11
3570   NC4*   CS1   0.160    12
3571   NO4*    OS  -0.360    12
3572   NC1*   CS1   0.200    12
3573    NN1  NR6*  -0.200    13
3574    NC6  CR61   0.200    13
3575    NC2  CR61   0.000    13
3576    NC3    CB   0.000    13
3577    NC4   CS2   0.000    13
3578    NC5  CR61   0.000    13
3579    NC7     C   0.380    14
3580    NO7     O  -0.380    14
3581    NN7    NT  -0.830    15
3582   NH71     H   0.415    15
3583   NH72     H   0.415    15
3584   NC2*   CS1   0.150    16
3585   NO2*    OA  -0.548    16
3586   NH2*    HO   0.398    16
3587   NC3*   CS1   0.150    17
3588   NO3*    OA  -0.548    17
3589   NH3*    HO   0.398    17
3590  [ bonds ]
3591     AP  AO1P
3592   AO1P  AH1P
3593     AP  AO2P
3594     AP  AO5*
3595     AP   O3P
3596   AO5*  AC5*
3597    O3P    NP
3598     NP  NO1P
3599   NO1P  NH1P
3600     NP  NO2P
3601     NP  NO5*
3602   NO5*  NC5*
3603   AC5*  AC4*
3604   AC4*  AO4*
3605   AC4*  AC3*
3606   AO4*  AC1*
3607   AC1*   AN9
3608   AC1*  AC2*
3609    AN9   AC4
3610    AN9   AC8
3611    AC4   AN3
3612    AC4   AC5
3613    AN3   AC2
3614    AC2   AN1
3615    AN1   AC6
3616    AC6   AN6
3617    AC6   AC5
3618    AN6  AH61
3619    AN6  AH62
3620    AC5   AN7
3621    AN7   AC8
3622   AC2*  AO2*
3623   AC2*  AC3*
3624   AO2*  AP2*
3625   AP2*  AO6*
3626   AP2*  AO7*
3627   AP2*  AO8*
3628   AO7*  AH7*
3629   AO8*  AH8*
3630   AC3*  AO3*
3631   AO3*  AH3*
3632   NC5*  NC4*
3633   NC4*  NO4*
3634   NC4*  NC3*
3635   NO4*  NC1*
3636   NC1*   NN1
3637   NC1*  NC2*
3638    NN1   NC6
3639    NN1   NC2
3640    NC6   NC5
3641    NC2   NC3
3642    NC3   NC4
3643    NC3   NC7
3644    NC4   NC5
3645    NC7   NO7
3646    NC7   NN7
3647    NN7  NH71
3648    NN7  NH72
3649   NC2*  NO2*
3650   NC2*  NC3*
3651   NO2*  NH2*
3652   NC3*  NO3*
3653   NO3*  NH3*
3654  [ impropers ]
3655   AC4*  AO4*  AC5*  AC3*
3656   AC3*  AC2*  AO3*  AC4*
3657   AC2*  AO2*  AC3*  AC1*
3658   AC1*   AN9  AO4*  AC2*
3659    AN9   AC8   AC4  AC1*
3660    AC4   AN9   AC8   AN7
3661    AC8   AN9   AC4   AC5
3662    AN9   AC8   AN7   AC5
3663    AN9   AC4   AC5   AN7
3664    AC8   AN7   AC5   AC4
3665    AC4   AN9   AN3   AC5
3666    AC5   AC6   AN7   AC4
3667    AN3   AC4   AC5   AC6
3668    AC4   AC5   AC6   AN1
3669    AC5   AC4   AN3   AC2
3670    AC5   AC6   AN1   AC2
3671    AC4   AN3   AC2   AN1
3672    AN3   AC2   AN1   AC6
3673    AC6   AC5   AN1   AN6
3674    AN6  AH61  AH62   AC6
3675   NC4*  NO4*  NC5*  NC3*
3676   NC3*  NC2*  NO3*  NC4*
3677   NC2*  NO2*  NC3*  NC1*
3678   NC1*   NN1  NO4*  NC2*
3679    NN1   NC6   NC2  NC1*
3680    NC2   NN1   NC6   NC5
3681    NC6   NN1   NC2   NC3
3682    NN1   NC6   NC5   NC4
3683    NN1   NC2   NC3   NC4
3684    NC6   NC5   NC4   NC3
3685    NC2   NC3   NC4   NC5
3686    NC3   NC4   NC2   NC7
3687    NC7   NO7   NN7   NC3
3688    NN7  NH71  NH72   NC7
3689
3690 [ NDPP ]
3691  [ atoms ]
3692     AP     P   0.760     0
3693   AO1P    OM  -0.635     0
3694   AO2P    OM  -0.635     0
3695   AO5*    OS  -0.360     0
3696    O3P    OS  -0.260     0
3697     NP     P   0.760     0
3698   NO1P    OM  -0.635     0
3699   NO2P    OM  -0.635     0
3700   NO5*    OS  -0.360     0
3701   AC5*   CS2   0.000     1
3702   AC4*   CS1   0.160     2
3703   AO4*    OS  -0.360     2
3704   AC1*   CS1   0.200     2
3705    AN9  NR5*  -0.200     3
3706    AC4    CB   0.200     3
3707    AN3   NR6  -0.360     4
3708    AC2  CR61   0.360     4
3709    AN1   NR6  -0.360     5
3710    AC6    CB   0.360     5
3711    AN6    NT  -0.830     6
3712   AH61     H   0.415     6
3713   AH62     H   0.415     6
3714    AC5    CB   0.000     7
3715    AN7   NR5  -0.360     8
3716    AC8  CR51   0.360     8
3717   AC2*   CS1   0.150     9
3718   AO2*    OS  -0.360     9
3719   AP2*     P   0.630     9
3720   AO6*    OM  -0.635     9
3721   AO7*    OM  -0.635     9
3722   AO8*    OA  -0.548     9
3723   AH8*    HO   0.398     9
3724   AC3*   CS1   0.150    10
3725   AO3*    OA  -0.548    10
3726   AH3*    HO   0.398    10
3727   NC5*   CS2   0.000    11
3728   NC4*   CS1   0.160    12
3729   NO4*    OS  -0.360    12
3730   NC1*   CS1   0.200    12
3731    NN1  NR6*   0.100    13
3732    NC6  CR61   0.300    13
3733    NC2  CR61   0.250    13
3734    NC3    CB   0.000    13
3735    NC4  CR61   0.250    13
3736    NC5  CR61   0.100    13
3737    NC7     C   0.380    14
3738    NO7     O  -0.380    14
3739    NN7    NT  -0.830    15
3740   NH71     H   0.415    15
3741   NH72     H   0.415    15
3742   NC2*   CS1   0.150    16
3743   NO2*    OA  -0.548    16
3744   NH2*    HO   0.398    16
3745   NC3*   CS1   0.150    17
3746   NO3*    OA  -0.548    17
3747   NH3*    HO   0.398    17
3748  [ bonds ]
3749     AP  AO1P
3750     AP  AO2P
3751     AP  AO5*
3752     AP   O3P
3753   AO5*  AC5*
3754    O3P    NP
3755     NP  NO1P
3756     NP  NO2P
3757     NP  NO5*
3758   NO5*  NC5*
3759   AC5*  AC4*
3760   AC4*  AO4*
3761   AC4*  AC3*
3762   AO4*  AC1*
3763   AC1*   AN9
3764   AC1*  AC2*
3765    AN9   AC4
3766    AN9   AC8
3767    AC4   AN3
3768    AC4   AC5
3769    AN3   AC2
3770    AC2   AN1
3771    AN1   AC6
3772    AC6   AN6
3773    AC6   AC5
3774    AN6  AH61
3775    AN6  AH62
3776    AC5   AN7
3777    AN7   AC8
3778   AC2*  AO2*
3779   AC2*  AC3*
3780   AO2*  AP2*
3781   AP2*  AO6*
3782   AP2*  AO7*
3783   AP2*  AO8*
3784   AO8*  AH8*
3785   AC3*  AO3*
3786   AO3*  AH3*
3787   NC5*  NC4*
3788   NC4*  NO4*
3789   NC4*  NC3*
3790   NO4*  NC1*
3791   NC1*   NN1
3792   NC1*  NC2*
3793    NN1   NC6
3794    NN1   NC2
3795    NC6   NC5
3796    NC2   NC3
3797    NC3   NC4
3798    NC3   NC7
3799    NC4   NC5
3800    NC7   NO7
3801    NC7   NN7
3802    NN7  NH71
3803    NN7  NH72
3804   NC2*  NO2*
3805   NC2*  NC3*
3806   NO2*  NH2*
3807   NC3*  NO3*
3808   NO3*  NH3*
3809  [ impropers ]
3810   AC4*  AO4*  AC5*  AC3*
3811   AC3*  AC2*  AO3*  AC4*
3812   AC2*  AO2*  AC3*  AC1*
3813   AC1*   AN9  AO4*  AC2*
3814    AN9   AC8   AC4  AC1*
3815    AC4   AN9   AC8   AN7
3816    AC8   AN9   AC4   AC5
3817    AN9   AC8   AN7   AC5
3818    AN9   AC4   AC5   AN7
3819    AC8   AN7   AC5   AC4
3820    AC4   AN9   AN3   AC5
3821    AC5   AC6   AN7   AC4
3822    AN3   AC4   AC5   AC6
3823    AC4   AC5   AC6   AN1
3824    AC5   AC4   AN3   AC2
3825    AC5   AC6   AN1   AC2
3826    AC4   AN3   AC2   AN1
3827    AN3   AC2   AN1   AC6
3828    AC6   AC5   AN1   AN6
3829    AN6  AH61  AH62   AC6
3830   NC4*  NO4*  NC5*  NC3*
3831   NC3*  NC2*  NO3*  NC4*
3832   NC2*  NO2*  NC3*  NC1*
3833   NC1*   NN1  NO4*  NC2*
3834    NN1   NC6   NC2  NC1*
3835    NC2   NN1   NC6   NC5
3836    NC6   NN1   NC2   NC3
3837    NN1   NC6   NC5   NC4
3838    NN1   NC2   NC3   NC4
3839    NC6   NC5   NC4   NC3
3840    NC2   NC3   NC4   NC5
3841    NC3   NC4   NC2   NC7
3842    NC7   NO7   NN7   NC3
3843    NN7  NH71  NH72   NC7
3844
3845 [ NH2 ]
3846  [ atoms ]
3847      N    NT  -0.830     0
3848     H1     H   0.415     0
3849     H2     H   0.415     0
3850  [ bonds ]
3851     -C     N
3852      N     H1
3853      N     H2
3854  [ impropers ]
3855     -C     H1   H2      N
3856     -C  -O      N       -CA
3857
3858 [ PDG ]
3859  [ atoms ]
3860      P     P   0.630     0
3861    O1P    OM  -0.635     0
3862    O2P    OM  -0.635     0
3863    O3P    OA  -0.548     0
3864    H3P    HO   0.398     0
3865    O4P    OS  -0.360     0
3866     C1   CH2   0.150     0
3867     C2   CH1   0.150     1
3868     O2    OA  -0.548     1
3869     H2    HO   0.398     1
3870     C3     C   0.270     2
3871    OT1    OM  -0.635     2
3872    OT2    OM  -0.635     2
3873  [ bonds ]
3874      P   O1P
3875      P   O2P
3876      P   O3P
3877      P   O4P
3878    O3P   H3P
3879    O4P    C1
3880     C1    C2
3881     C2    O2
3882     C2    C3
3883     O2    H2
3884     C3   OT1
3885     C3   OT2
3886  [ impropers ]
3887     C2    C1    C3    O2
3888     C3    C2   OT2   OT1
3889
3890 [ PFN ]
3891  [ atoms ]
3892   FC9A    CB   0.000     0
3893   FC10  CR61   0.000     1
3894  FC10A    CB   0.000     2
3895    FC1  CR61   0.000     3
3896    FC2  CR61   0.000     4
3897    FC3    CB   0.000     5
3898    FN3    NT  -0.830     6
3899   FH31     H   0.415     6
3900   FH32     H   0.415     6
3901    FC4  CR61   0.000     7
3902   FC4A    CB   0.150     8
3903    FN5  NR6*   0.285     8
3904    FH5     H   0.415     8
3905   FC5A    CB   0.150     8
3906    FC6  CR61   0.000     9
3907    FC7    CB   0.000    10
3908    FN7    NT  -0.830    11
3909   FH71     H   0.415    11
3910   FH72     H   0.415    11
3911    FC8  CR61   0.000    12
3912    FC9  CR61   0.000    13
3913  [ bonds ]
3914   FC9A  FC10
3915   FC9A  FC5A
3916   FC9A   FC9
3917   FC10 FC10A
3918  FC10A   FC1
3919  FC10A  FC4A
3920    FC1   FC2
3921    FC2   FC3
3922    FC3   FN3
3923    FC3   FC4
3924    FN3  FH31
3925    FN3  FH32
3926    FC4  FC4A
3927   FC4A   FN5
3928    FN5   FH5
3929    FN5  FC5A
3930   FC5A   FC6
3931    FC6   FC7
3932    FC7   FN7
3933    FC7   FC8
3934    FN7  FH71
3935    FN7  FH72
3936    FC8   FC9
3937  [ impropers ]
3938   FC9A  FC10 FC10A  FC4A
3939   FC10 FC10A  FC4A   FN5
3940  FC10A  FC4A   FN5  FC5A
3941   FC4A   FN5  FC5A  FC9A
3942    FN5  FC5A  FC9A  FC10
3943   FC5A  FC9A  FC10 FC10A
3944    FN5  FC4A  FC5A   FH5
3945  FC10A   FC1  FC10  FC4A
3946   FC4A   FC4   FN5 FC10A
3947   FC4A FC10A   FC1   FC2
3948  FC10A   FC1   FC2   FC3
3949    FC1   FC2   FC3   FC4
3950    FC2   FC3   FC4  FC4A
3951    FC3   FC4  FC4A FC10A
3952    FC4  FC4A FC10A   FC1
3953    FC3   FC2   FC4   FN3
3954    FN3  FH31  FH32   FC3
3955   FC5A   FN5   FC6  FC9A
3956   FC9A  FC10   FC9  FC5A
3957   FC5A   FC6   FC7   FC8
3958    FC6   FC7   FC8   FC9
3959    FC7   FC8   FC9  FC9A
3960    FC8   FC9  FC9A  FC5A
3961    FC9  FC9A  FC5A   FC6
3962   FC9A  FC5A   FC6   FC7
3963    FC7   FC8   FC6   FN7
3964    FN7  FH71  FH72   FC7
3965
3966 [ PHE ]
3967  [ atoms ]
3968      N     N  -0.280     0
3969      H     H   0.280     0
3970     CA   CH1   0.000     1
3971     CB   CH2   0.000     2
3972     CG    CB   0.000     3
3973    CD1   CR6  -0.140     4
3974    HD1   HCR   0.140     4
3975    CD2   CR6  -0.140     5
3976    HD2   HCR   0.140     5
3977    CE1   CR6  -0.140     6
3978    HE1   HCR   0.140     6
3979    CE2   CR6  -0.140     7
3980    HE2   HCR   0.140     7
3981     CZ   CR6  -0.140     8
3982     HZ   HCR   0.140     8
3983      C     C   0.380     9
3984      O     O  -0.380     9
3985  [ bonds ]
3986      N     H
3987      N    CA
3988     CA     C
3989      C     O
3990     -C     N
3991     CA    CB
3992     CB    CG
3993     CG   CD1
3994     CG   CD2
3995    CD1   HD1
3996    CD1   CE1
3997    CD2   HD2
3998    CD2   CE2
3999    CE1   HE1
4000    CE1    CZ
4001    CE2   HE2
4002    CE2    CZ
4003     CZ    HZ
4004  [ impropers ]
4005      N    -C    CA     H
4006     -C   -CA     N    -O
4007     CA     N     C    CB
4008     CG   CD1   CD2    CB
4009    CD2    CG   CD1   CE1
4010    CD1    CG   CD2   CE2
4011     CG   CD1   CE1    CZ
4012     CG   CD2   CE2    CZ
4013    CD1   CE1    CZ   CE2
4014    CD2   CE2    CZ   CE1
4015    CD1   HD1    CG   CE1
4016    CD2   HD2    CG   CE2
4017    CE1   HE1   CD1    CZ
4018    CE2   HE2   CD2    CZ
4019     CZ    HZ   CE1   CE2
4020
4021 [ PHL ]
4022  [ atoms ]
4023      N     N  -0.280     0
4024      H     H   0.280     0
4025     CA   CH1   0.000     1
4026     CB   CH2   0.000     2
4027     CG    CB   0.000     3
4028    CD1   CR6  -0.140     4
4029    HD1   HCR   0.140     4
4030    CD2   CR6  -0.140     5
4031    HD2   HCR   0.140     5
4032    CE1   CR6  -0.140     6
4033    HE1   HCR   0.140     6
4034    CE2   CR6  -0.140     7
4035    HE2   HCR   0.140     7
4036     CZ   CR6  -0.140     8
4037     HZ   HCR   0.140     8
4038     CX   CH2   0.150     9
4039     OY    OA  -0.548     9
4040     HY    HO   0.398     9
4041  [ bonds ]
4042      N     H
4043      N    CA
4044     CA     CX
4045     CX     OY
4046     HY1    OY
4047     -C     N
4048     CA    CB
4049     CB    CG
4050     CG   CD1
4051     CG   CD2
4052    CD1   HD1
4053    CD1   CE1
4054    CD2   HD2
4055    CD2   CE2
4056    CE1   HE1
4057    CE1    CZ
4058    CE2   HE2
4059    CE2    CZ
4060     CZ    HZ
4061  [ impropers ]
4062      N    -C    CA     H
4063     -C   -CA     N    -O
4064     CA     N     C    CB
4065     CG   CD1   CD2    CB
4066    CD2    CG   CD1   CE1
4067    CD1    CG   CD2   CE2
4068     CG   CD1   CE1    CZ
4069     CG   CD2   CE2    CZ
4070    CD1   CE1    CZ   CE2
4071    CD2   CE2    CZ   CE1
4072    CD1   HD1    CG   CE1
4073    CD2   HD2    CG   CE2
4074    CE1   HE1   CD1    CZ
4075    CE2   HE2   CD2    CZ
4076     CZ    HZ   CE1   CE2
4077
4078 [ PHEU ]
4079  [ atoms ]
4080      N     N  -0.280     0
4081      H     H   0.280     0
4082     CA   CH1   0.000     1
4083     CB   CH2   0.000     2
4084     CG    CB   0.000     3
4085    CD1  CR61   0.000     4
4086    CD2  CR61   0.000     5
4087    CE1  CR61   0.000     6
4088    CE2  CR61   0.000     7
4089     CZ  CR61   0.000     8
4090      C     C   0.380     9
4091      O     O  -0.380     9
4092  [ bonds ]
4093      N     H
4094      N    CA
4095     CA     C
4096      C     O
4097     -C     N
4098     CA    CB
4099     CB    CG
4100     CG   CD1
4101     CG   CD2
4102    CD1   CE1
4103    CD2   CE2
4104    CE1    CZ
4105    CE2    CZ
4106  [ impropers ]
4107      N    -C    CA     H
4108     -C   -CA     N    -O
4109     CA     N     C    CB
4110     CG   CD1   CD2    CB
4111    CD2    CG   CD1   CE1
4112    CD1    CG   CD2   CE2
4113     CG   CD1   CE1    CZ
4114     CG   CD2   CE2    CZ
4115    CD1   CE1    CZ   CE2
4116    CD2   CE2    CZ   CE1
4117
4118 [ PMB ]
4119  [ atoms ]
4120    PC8   CH3   0.000     0
4121    PC5    CB   0.000     1
4122    PC4  CR61   0.000     2
4123    PC6  CR61   0.000     3
4124    PC3  CR61   0.000     4
4125    PC7  CR61   0.000     5
4126    PC2    CB   0.000     6
4127    PC1   CH2   0.000     7
4128     PO    OM  -0.600     7
4129   PHC1     H  -0.200     7
4130   PHC2     H  -0.200     7
4131  [ bonds ]
4132    PC8   PC5
4133    PC5   PC4
4134    PC5   PC6
4135    PC4   PC3
4136    PC6   PC7
4137    PC3   PC2
4138    PC7   PC2
4139    PC2   PC1
4140    PC1    PO
4141    PC1  PHC1
4142    PC1  PHC2
4143  [ impropers ]
4144    PC5   PC4   PC6   PC8
4145    PC6   PC5   PC4   PC3
4146    PC4   PC5   PC6   PC7
4147    PC5   PC4   PC3   PC2
4148    PC5   PC6   PC7   PC2
4149    PC4   PC3   PC2   PC7
4150    PC6   PC7   PC2   PC3
4151    PC2   PC3   PC7   PC1
4152
4153 [ PMBH ]
4154  [ atoms ]
4155    PC8   CH3   0.000     0
4156    PC5    CB   0.000     1
4157    PC4  CR61   0.000     2
4158    PC6  CR61   0.000     3
4159    PC3  CR61   0.000     4
4160    PC7  CR61   0.000     5
4161    PC2    CB   0.000     6
4162    PC1   CH2  -0.050     7
4163     PO    OA  -0.548     7
4164     PH    HO   0.398     7
4165   PHC1     H   0.100     7
4166   PHC2     H   0.100     7
4167  [ bonds ]
4168    PC8   PC5
4169    PC5   PC4
4170    PC5   PC6
4171    PC4   PC3
4172    PC6   PC7
4173    PC3   PC2
4174    PC7   PC2
4175    PC2   PC1
4176    PC1    PO
4177     PO    PH
4178    PC1  PHC1
4179    PC1  PHC2
4180  [ impropers ]
4181    PC5   PC4   PC6   PC8
4182    PC6   PC5   PC4   PC3
4183    PC4   PC5   PC6   PC7
4184    PC5   PC4   PC3   PC2
4185    PC5   PC6   PC7   PC2
4186    PC4   PC3   PC2   PC7
4187    PC6   PC7   PC2   PC3
4188    PC2   PC3   PC7   PC1
4189
4190 [ PRO ]
4191  [ atoms ]
4192      N     N   0.000     0
4193     CA   CH1   0.000     1
4194     CB   CH2   0.000     2
4195     CG   CH2   0.000     3
4196     CD   CH2   0.000     4
4197      C     C   0.380     5
4198      O     O  -0.380     5
4199  [ bonds ]
4200      N    CA
4201     CA     C
4202      C     O
4203     -C     N
4204     CA    CB
4205     CB    CG
4206     CG    CD
4207     CD     N
4208  [ impropers ]
4209     -C   -CA     N    -O
4210     CA     N     C    CB
4211      N    -C    CA    CD
4212
4213 [ RTOL ]
4214  [ atoms ]
4215    C18   CH3   0.000     0
4216    C17   CH3   0.000     1
4217     C1    CB   0.000     2
4218     C2   CH2   0.000     3
4219     C3   CH2   0.000     4
4220     C4   CH2   0.000     5
4221     C5    CB   0.000     6
4222    C16   CH3   0.000     7
4223     C6    CB   0.000     8
4224     C7  CR61   0.000     9
4225     C8  CR61   0.000    10
4226     C9    CB   0.000    11
4227    C19   CH3   0.000    12
4228    C10  CR61   0.000    13
4229    C11  CR61   0.000    14
4230    C12  CR61   0.000    15
4231    C13    CB   0.000    16
4232    C20   CH3   0.000    17
4233    C14  CR61   0.000    18
4234    C15   CH2   0.150    19
4235    O21    OA  -0.548    19
4236    H21    HO   0.398    19
4237  [ bonds ]
4238    C18    C1
4239    C17    C1
4240     C1    C2
4241     C1    C6
4242     C2    C3
4243     C3    C4
4244     C4    C5
4245     C5   C16
4246     C5    C6
4247     C6    C7
4248     C7    C8
4249     C8    C9
4250     C9   C19
4251     C9   C10
4252    C10   C11
4253    C11   C12
4254    C12   C13
4255    C13   C20
4256    C13   C14
4257    C14   C15
4258    C15   O21
4259    O21   H21
4260  [ impropers ]
4261     C5    C4    C6   C16
4262     C6    C1    C7    C5
4263     C9    C8   C10   C19
4264    C13   C12   C14   C20
4265
4266 [ SAR ]
4267  [ atoms ]
4268      N     N   0.000     0
4269     CN   CH3   0.000     1
4270     CA   CH2   0.000     2
4271      C     C   0.380     3
4272      O     O  -0.380     3
4273  [ bonds ]
4274      N    CN
4275      N    CA
4276     CA     C
4277      C     O
4278     -C     N
4279  [ impropers ]
4280      N    -C    CA    CN
4281     -C   -CA     N    -O
4282
4283 [ SER ]
4284  [ atoms ]
4285      N     N  -0.280     0
4286      H     H   0.280     0
4287     CA   CH1   0.000     1
4288     CB   CH2   0.150     2
4289     OG    OA  -0.548     2
4290     HG    HO   0.398     2
4291      C     C   0.380     3
4292      O     O  -0.380     3
4293  [ bonds ]
4294      N     H
4295      N    CA
4296     CA     C
4297      C     O
4298     -C     N
4299     CA    CB
4300     CB    OG
4301     OG    HG
4302  [ impropers ]
4303      N    -C    CA     H
4304     -C   -CA     N    -O
4305     CA     N     C    CB
4306
4307 [ SO4 ]
4308  [ atoms ]
4309      S     S   0.540     0
4310     O1    OM  -0.635     0
4311     O2    OM  -0.635     0
4312     O3    OM  -0.635     0
4313     O4    OM  -0.635     0
4314  [ bonds ]
4315      S    O1
4316      S    O2
4317      S    O3
4318      S    O4
4319
4320 [ TEMP ]
4321  [ atoms ]
4322     O1     O  -0.200     0
4323     N1  NR5*  -0.036     0
4324     C1    CB   0.118     0
4325     C4    CB   0.118     0
4326     CA    CB   0.000     1
4327     C3  CR51   0.000     2
4328     C6   CH3   0.000     3
4329     C7   CH3   0.000     4
4330     C8   CH3   0.000     5
4331     C9   CH3   0.000     6
4332     C5     C   0.380     7
4333     O5     O  -0.380     7
4334  [ bonds ]
4335     O1    N1
4336     N1    C1
4337     N1    C4
4338     C1    CA
4339     C1    C6
4340     C1    C7
4341     C4    C3
4342     C4    C8
4343     C4    C9
4344     CA    C3
4345     CA    C5
4346     C5    O5
4347    -C5    O1
4348  [ impropers ]
4349     N1    C1    C4    O1
4350     N1    C1    CA    C3
4351     C1    CA    C3    C4
4352     CA    C3    C4    N1
4353     C3    C4    N1    C1
4354     C4    N1    C1    CA
4355     CA    C1    C3    C5
4356    -C5   -CA    O1   -O5
4357
4358 [ TFE ]
4359  [ atoms ]
4360      C     C   0.590     0
4361     F1     F  -0.200     0
4362     F2     F  -0.200     0
4363     F3     F  -0.200     0
4364    CH2   CH2   0.260     1
4365     OA    OA  -0.550     2
4366     OH    HO   0.300     2
4367  [ bonds ]
4368      C    F1
4369      C    F2
4370      C    F3
4371      C   CH2
4372    CH2    OA
4373     OA    OH
4374
4375 [ THF ]
4376  [ atoms ]
4377     N1   NR6  -0.360     0
4378     C2    CB   0.360     0
4379    NA2    NT  -0.830     1
4380   HA21     H   0.415     1
4381   HA22     H   0.415     1
4382     N3  NR6*  -0.280     2
4383    HA3     H   0.280     2
4384     C4    CB   0.380     3
4385    OA4     O  -0.380     3
4386    C4A    CB   0.000     4
4387     N5  NR6*  -0.280     5
4388    HA5     H   0.280     5
4389     C6   CS1   0.000     6
4390     C7   CS2   0.000     7
4391     N8  NR6*  -0.280     8
4392    HA8     H   0.280     8
4393    C8A    CB   0.000     9
4394     C9   CH2   0.000    10
4395    N10  NR6*  -0.280    11
4396    H10     H   0.280    11
4397    C14    CB   0.000    12
4398    C13  CR61   0.000    13
4399    C15  CR61   0.000    14
4400    C12  CR61   0.000    15
4401    C16  CR61   0.000    16
4402    C11    CB   0.000    17
4403      C     C   0.380    18
4404      O     O  -0.380    18
4405      N     N  -0.280    19
4406      H     H   0.280    19
4407     CA   CH1   0.000    20
4408     CB   CH2   0.000    21
4409     CG   CH2   0.000    22
4410     CD     C   0.270    23
4411    OE1    OM  -0.635    23
4412    OE2    OM  -0.635    23
4413     CT     C   0.270    24
4414     O1    OM  -0.635    24
4415     O2    OM  -0.635    24
4416  [ bonds ]
4417     N1    C2
4418     N1   C8A
4419     C2   NA2
4420     C2    N3
4421    NA2  HA21
4422    NA2  HA22
4423     N3   HA3
4424     N3    C4
4425     C4   OA4
4426     C4   C4A
4427    C4A    N5
4428    C4A   C8A
4429     N5   HA5
4430     N5    C6
4431     C6    C7
4432     C6    C9
4433     C7    N8
4434     N8   HA8
4435     N8   C8A
4436     C9   N10
4437    N10   H10
4438    N10   C14
4439    C14   C13
4440    C14   C15
4441    C13   C12
4442    C15   C16
4443    C12   C11
4444    C16   C11
4445    C11     C
4446      C     O
4447      C     N
4448      N     H
4449      N    CA
4450     CA    CB
4451     CA    CT
4452     CB    CG
4453     CG    CD
4454     CD   OE1
4455     CD   OE2
4456     CT    O1
4457     CT    O2
4458  [ impropers ]
4459     C2    N1    N3   NA2
4460    NA2  HA21  HA22    C2
4461     N3    C2    C4   HA3
4462     C4    N3   C4A   OA4
4463     N1    C2    N3    C4
4464     C2    N3    C4   C4A
4465     N3    C4   C4A   C8A
4466     C4   C4A   C8A    N1
4467    C4A   C8A    N1    C2
4468    C8A    N1    C2    N3
4469    C4A    C4    N5   C8A
4470    C8A    N1    N8   C4A
4471    C4A    N5    C6    C7
4472     N5    C6    C7    N8
4473     C6    C7    N8   C8A
4474     C7    N8   C8A   C4A
4475     N8   C8A   C4A    N5
4476    C8A   C4A    N5    C6
4477     N5   C4A    C6   HA5
4478     N8    C7   C8A   HA8
4479     C6    N5    C7    C9
4480    N10    C9   C14   H10
4481    C14   C13   C15   N10
4482    C14   C13   C12   C11
4483    C14   C15   C16   C11
4484    C13   C14   C15   C16
4485    C15   C14   C13   C12
4486    C13   C12   C11   C16
4487    C15   C16   C11   C12
4488    C11   C12   C16     C
4489      C   C11     N     O
4490      N     C    CA     H
4491     CA     N    CT    CB
4492     CD   OE1   OE2    CG
4493     CT    CA    O2    O1
4494
4495 [ THR ]
4496  [ atoms ]
4497      N     N  -0.280     0
4498      H     H   0.280     0
4499     CA   CH1   0.000     1
4500     CB   CH1   0.150     2
4501    OG1    OA  -0.548     2
4502    HG1    HO   0.398     2
4503    CG2   CH3   0.000     3
4504      C     C   0.380     4
4505      O     O  -0.380     4
4506  [ bonds ]
4507      N     H
4508      N    CA
4509     CA     C
4510      C     O
4511     -C     N
4512     CA    CB
4513     CB   OG1
4514     CB   CG2
4515    OG1   HG1
4516  [ impropers ]
4517      N    -C    CA     H
4518     -C   -CA     N    -O
4519     CA     N     C    CB
4520     CB   OG1   CG2    CA
4521
4522 [ TMP ]
4523  [ atoms ]
4524     N1   NR6  -0.360     0
4525     C2    CB   0.360     0
4526    NA2    NT  -0.830     1
4527   HA21     H   0.415     1
4528   HA22     H   0.415     1
4529     N3   NR6  -0.360     2
4530     C4    CB   0.360     2
4531    NA4    NT  -0.830     3
4532   HA41     H   0.415     3
4533   HA42     H   0.415     3
4534     C5    CB   0.000     4
4535     C6  CR61   0.000     5
4536     C7   CH2   0.000     6
4537    C11    CB   0.000     7
4538    C12  CR61   0.000     8
4539    C16  CR61   0.000     9
4540    C13    CB   0.180    10
4541    O13    OS  -0.360    10
4542   CM13   CH3   0.180    10
4543    C15    CB   0.180    11
4544    O15    OS  -0.360    11
4545   CM15   CH3   0.180    11
4546    C14    CB   0.180    12
4547    O14    OS  -0.360    12
4548   CM14   CH3   0.180    12
4549  [ bonds ]
4550     N1    C2
4551     N1    C6
4552     C2   NA2
4553     C2    N3
4554    NA2  HA21
4555    NA2  HA22
4556     N3    C4
4557     C4   NA4
4558     C4    C5
4559    NA4  HA41
4560    NA4  HA42
4561     C5    C6
4562     C5    C7
4563     C7   C11
4564    C11   C12
4565    C11   C16
4566    C12   C13
4567    C16   C15
4568    C13   O13
4569    C13   C14
4570    O13  CM13
4571    C15   O15
4572    C15   C14
4573    O15  CM15
4574    C14   O14
4575    O14  CM14
4576  [ impropers ]
4577     C2    N1    N3   NA2
4578    NA2  HA21  HA22    C2
4579     C4    N3    C5   NA4
4580    NA4  HA41  HA42    C4
4581     N1    C2    N3    C4
4582     C2    N3    C4    C5
4583     N3    C4    C5    C6
4584     C4    C5    C6    N1
4585     C5    C6    N1    C2
4586     C6    N1    C2    N3
4587     C5    C4    C6    C7
4588    C11   C12   C16    C7
4589    C11   C12   C13   C14
4590    C11   C16   C15   C14
4591    C12   C13   C14   C15
4592    C12   C11   C16   C15
4593    C16   C15   C14   C13
4594    C16   C11   C12   C13
4595    C13   C12   O13   C14
4596    C15   C16   O15   C14
4597    C14   C13   O14   C15
4598
4599 [ TMPH ]
4600  [ atoms ]
4601     N1  NR6*  -0.280     0
4602    HA1     H   0.280     0
4603     C2    CB   0.000     1
4604    NA2    NT  -0.830     2
4605   HA21     H   0.415     2
4606   HA22     H   0.415     2
4607     N3   NR6  -0.360     3
4608     C4    CB   0.360     3
4609    NA4    NT  -0.830     4
4610   HA41     H   0.415     4
4611   HA42     H   0.415     4
4612     C5    CB   0.000     5
4613     C6  CR61   0.000     6
4614     C7   CH2   0.000     7
4615    C11    CB   0.000     8
4616    C12  CR61   0.000     9
4617    C16  CR61   0.000    10
4618    C13    CB   0.180    11
4619    O13    OS  -0.360    11
4620   CM13   CH3   0.180    11
4621    C15    CB   0.180    12
4622    O15    OS  -0.360    12
4623   CM15   CH3   0.180    12
4624    C14    CB   0.180    13
4625    O14    OS  -0.360    13
4626   CM14   CH3   0.180    13
4627  [ bonds ]
4628     N1   HA1
4629     N1    C2
4630     N1    C6
4631     C2   NA2
4632     C2    N3
4633    NA2  HA21
4634    NA2  HA22
4635     N3    C4
4636     C4   NA4
4637     C4    C5
4638    NA4  HA41
4639    NA4  HA42
4640     C5    C6
4641     C5    C7
4642     C7   C11
4643    C11   C12
4644    C11   C16
4645    C12   C13
4646    C16   C15
4647    C13   O13
4648    C13   C14
4649    O13  CM13
4650    C15   O15
4651    C15   C14
4652    O15  CM15
4653    C14   O14
4654    O14  CM14
4655  [ impropers ]
4656     N1    C2    C6   HA1
4657     C2    N1    N3   NA2
4658    NA2  HA21  HA22    C2
4659     C4    N3    C5   NA4
4660    NA4  HA41  HA42    C4
4661     N1    C2    N3    C4
4662     C2    N3    C4    C5
4663     N3    C4    C5    C6
4664     C4    C5    C6    N1
4665     C5    C6    N1    C2
4666     C6    N1    C2    N3
4667     C5    C4    C6    C7
4668    C11   C12   C16    C7
4669    C11   C12   C13   C14
4670    C11   C16   C15   C14
4671    C12   C13   C14   C15
4672    C12   C11   C16   C15
4673    C16   C15   C14   C13
4674    C16   C11   C12   C13
4675    C13   C12   O13   C14
4676    C15   C16   O15   C14
4677    C14   C13   O14   C15
4678
4679 [ TMPHP ]
4680  [ atoms ]
4681     N1  NR6*  -0.360     0
4682    HA1     H   0.360     0
4683     C2    CB   0.600     1
4684    NA2    NT  -0.730     1
4685   HA21     H   0.415     1
4686   HA22     H   0.415     1
4687     N3   NR6  -0.360     2
4688     C4    CB   0.360     2
4689    NA4    NT  -0.830     3
4690   HA41     H   0.415     3
4691   HA42     H   0.415     3
4692     C5    CB   0.100     4
4693     C6  CR61   0.200     4
4694     C7   CH2   0.000     5
4695    C11    CB   0.000     6
4696    C12  CR61   0.000     7
4697    C16  CR61   0.000     8
4698    C13    CB   0.180     9
4699    O13    OS  -0.360     9
4700   CM13   CH3   0.180     9
4701    C15    CB   0.180    10
4702    O15    OS  -0.360    10
4703   CM15   CH3   0.180    10
4704    C14    CB   0.180    11
4705    O14    OS  -0.360    11
4706   CM14   CH3   0.180    11
4707  [ bonds ]
4708     N1   HA1
4709     N1    C2
4710     N1    C6
4711     C2   NA2
4712     C2    N3
4713    NA2  HA21
4714    NA2  HA22
4715     N3    C4
4716     C4   NA4
4717     C4    C5
4718    NA4  HA41
4719    NA4  HA42
4720     C5    C6
4721     C5    C7
4722     C7   C11
4723    C11   C12
4724    C11   C16
4725    C12   C13
4726    C16   C15
4727    C13   O13
4728    C13   C14
4729    O13  CM13
4730    C15   O15
4731    C15   C14
4732    O15  CM15
4733    C14   O14
4734    O14  CM14
4735  [ impropers ]
4736     N1    C2    C6   HA1
4737     C2    N1    N3   NA2
4738    NA2  HA21  HA22    C2
4739     C4    N3    C5   NA4
4740    NA4  HA41  HA42    C4
4741     N1    C2    N3    C4
4742     C2    N3    C4    C5
4743     N3    C4    C5    C6
4744     C4    C5    C6    N1
4745     C5    C6    N1    C2
4746     C6    N1    C2    N3
4747     C5    C4    C6    C7
4748    C11   C12   C16    C7
4749    C11   C12   C13   C14
4750    C11   C16   C15   C14
4751    C12   C13   C14   C15
4752    C12   C11   C16   C15
4753    C16   C15   C14   C13
4754    C16   C11   C12   C13
4755    C13   C12   O13   C14
4756    C15   C16   O15   C14
4757    C14   C13   O14   C15
4758
4759 [ TN2 ]
4760  [ atoms ]
4761      N     N  -0.280     0
4762      H     H   0.280     0
4763     CA   CH1   0.000     1
4764     CB   CH2   0.000     2
4765     CG    CB   0.000     3
4766    CD2   CR6  -0.140     4
4767    HD2   HCR   0.140     4
4768    CD1   CR6  -0.450     5
4769    HD1   HCR   0.280     5
4770    CE1   CR6  -0.110     5
4771    NE1     N   0.880     5
4772    OE2     O  -0.600     5
4773    OE3     O  -0.600     5
4774     CZ    CB   0.700     5
4775     OH    OA  -0.760     5
4776    CE2   CR6  -0.490     5
4777    HE2   HCR   0.150     5
4778      C     C   0.380     6
4779      O     O  -0.380     6
4780  [ bonds ]
4781      N     H
4782      N    CA
4783     CA     C
4784      C     O
4785     -C     N
4786     CA    CB
4787     CB    CG
4788     CG   CD1
4789     CG   CD2
4790    CD1   HD1
4791    CD1   CE1
4792    CD2   HD2
4793    CD2   CE2
4794    CE1   NE1
4795    NE1   OE2
4796    NE1   OE3
4797    CE1    CZ
4798    CE2   HE2
4799    CE2    CZ
4800     CZ    OH
4801  [ impropers ]
4802      N    -C    CA     H
4803     -C   -CA     N    -O
4804     CA     N     C    CB
4805     CG   CD1   CD2    CB
4806    CD2    CG   CD1   CE1
4807    CD1    CG   CD2   CE2
4808     CG   CD1   CE1    CZ
4809     CG   CD2   CE2    CZ
4810    CD1   CE1    CZ   CE2
4811    CD2   CE2    CZ   CE1
4812     CZ   CE1   CE2    OH
4813    CD1   HD1    CG   CE1
4814    CD2   HD2    CG   CE2
4815    CE2   HE2   CD2    CZ
4816    CE1   NE1   CD1    CZ
4817     CZ   CE1   NE1   OE2
4818    CD1   CE1   NE2   OE3
4819
4820 [ TRP ]
4821  [ atoms ]
4822      N     N  -0.280     0
4823      H     H   0.280     0
4824     CA   CH1   0.000     1
4825     CB   CH2   0.000     2
4826     CG    CB  -0.140     3
4827    CD1   CR5  -0.140     3
4828    HD1   HCR   0.140     3
4829    CD2    CB   0.000     3
4830    NE1  NR5*  -0.050     3
4831    HE1     H   0.190     3
4832    CE2    CB   0.000     4
4833    CE3   CR6  -0.140     5
4834    HE3   HCR   0.140     5
4835    CZ2   CR6  -0.140     6
4836    HZ2   HCR   0.140     6
4837    CZ3   CR6  -0.140     7
4838    HZ3   HCR   0.140     7
4839    CH2   CR6  -0.140     8
4840    HH2   HCR   0.140     8
4841      C     C   0.380     9
4842      O     O  -0.380     9
4843  [ bonds ]
4844      N     H
4845      N    CA
4846     CA     C
4847      C     O
4848     -C     N
4849     CA    CB
4850     CB    CG
4851     CG   CD1
4852     CG   CD2
4853    CD1   HD1
4854    CD1   NE1
4855    CD2   CE2
4856    CD2   CE3
4857    NE1   HE1
4858    NE1   CE2
4859    CE2   CZ2
4860    CE3   HE3
4861    CE3   CZ3
4862    CZ2   HZ2
4863    CZ2   CH2
4864    CZ3   HZ3
4865    CZ3   CH2
4866    CH2   HH2
4867  [ impropers ]
4868      N    -C    CA     H
4869     -C   -CA     N    -O
4870     CA     N     C    CB
4871     CG   CD1   CD2    CB
4872    CD2    CG   CD1   NE1
4873    CD1    CG   CD2   CE2
4874     CG   CD1   NE1   CE2
4875     CG   CD2   CE2   NE1
4876    CD1   NE1   CE2   CD2
4877    NE1   CD1   CE2   HE1
4878    CD2   CE2   CE3    CG
4879    CE2   CD2   CZ2   NE1
4880    CE3   CD2   CE2   CZ2
4881    CD2   CE2   CZ2   CH2
4882    CE2   CD2   CE3   CZ3
4883    CE2   CZ2   CH2   CZ3
4884    CD2   CE3   CZ3   CH2
4885    CE3   CZ3   CH2   CZ2
4886    CD1   HD1   NE1    CG
4887    CE3   HE3   CD2   CZ3
4888    CZ3   HZ3   CE3   CH2
4889    CZ2   HZ2   CE2   CH2
4890    CH2   HH2   CZ2   CZ3
4891
4892 [ TRPU ]
4893  [ atoms ]
4894      N     N  -0.280     0
4895      H     H   0.280     0
4896     CA   CH1   0.000     1
4897     CB   CH2   0.000     2
4898     CG    CB  -0.140     3
4899    CD1  CR51   0.000     3
4900    CD2    CB   0.000     3
4901    NE1  NR5*  -0.050     3
4902    HE1     H   0.190     3
4903    CE2    CB   0.000     4
4904    CE3  CR61   0.000     5
4905    CZ2  CR61   0.000     6
4906    CZ3  CR61   0.000     7
4907    CH2  CR61   0.000     8
4908      C     C   0.380     9
4909      O     O  -0.380     9
4910  [ bonds ]
4911      N     H
4912      N    CA
4913     CA     C
4914      C     O
4915     -C     N
4916     CA    CB
4917     CB    CG
4918     CG   CD1
4919     CG   CD2
4920    CD1   NE1
4921    CD2   CE2
4922    CD2   CE3
4923    NE1   HE1
4924    NE1   CE2
4925    CE2   CZ2
4926    CE3   CZ3
4927    CZ2   CH2
4928    CZ3   CH2
4929  [ impropers ]
4930      N    -C    CA     H
4931     -C   -CA     N    -O
4932     CA     N     C    CB
4933     CG   CD1   CD2    CB
4934    CD2    CG   CD1   NE1
4935    CD1    CG   CD2   CE2
4936     CG   CD1   NE1   CE2
4937     CG   CD2   CE2   NE1
4938    CD1   NE1   CE2   CD2
4939    NE1   CD1   CE2   HE1
4940    CD2   CE2   CE3    CG
4941    CE2   CD2   CZ2   NE1
4942    CE3   CD2   CE2   CZ2
4943    CD2   CE2   CZ2   CH2
4944    CE2   CD2   CE3   CZ3
4945    CE2   CZ2   CH2   CZ3
4946    CD2   CE3   CZ3   CH2
4947    CE3   CZ3   CH2   CZ2
4948
4949 [ TYR ]
4950  [ atoms ]
4951      N     N  -0.280     0
4952      H     H   0.280     0
4953     CA   CH1   0.000     1
4954     CB   CH2   0.000     2
4955     CG    CB   0.000     3
4956    CD1   CR6  -0.140     4
4957    HD1   HCR   0.140     4
4958    CD2   CR6  -0.140     5
4959    HD2   HCR   0.140     5
4960    CE1   CR6  -0.140     6
4961    HE1   HCR   0.140     6
4962    CE2   CR6  -0.140     7
4963    HE2   HCR   0.140     7
4964     CZ    CB   0.150     8
4965     OH    OA  -0.548     8
4966     HH    HO   0.398     8
4967      C     C   0.380     9
4968      O     O  -0.380     9
4969  [ bonds ]
4970      N     H
4971      N    CA
4972     CA     C
4973      C     O
4974     -C     N
4975     CA    CB
4976     CB    CG
4977     CG   CD1
4978     CG   CD2
4979    CD1   HD1
4980    CD1   CE1
4981    CD2   HD2
4982    CD2   CE2
4983    CE1   HE1
4984    CE1    CZ
4985    CE2   HE2
4986    CE2    CZ
4987     CZ    OH
4988     OH    HH
4989  [ impropers ]
4990      N    -C    CA     H
4991     -C   -CA     N    -O
4992     CA     N     C    CB
4993     CG   CD1   CD2    CB
4994    CD2    CG   CD1   CE1
4995    CD1    CG   CD2   CE2
4996     CG   CD1   CE1    CZ
4997     CG   CD2   CE2    CZ
4998    CD1   CE1    CZ   CE2
4999    CD2   CE2    CZ   CE1
5000     CZ   CE1   CE2    OH
5001    CD1   HD1    CG   CE1
5002    CD2   HD2    CG   CE2
5003    CE1   HE1   CD1    CZ
5004    CE2   HE2   CD2    CZ
5005
5006 [ TYRU ]
5007  [ atoms ]
5008      N     N  -0.280     0
5009      H     H   0.280     0
5010     CA   CH1   0.000     1
5011     CB   CH2   0.000     2
5012     CG    CB   0.000     3
5013    CD1  CR61   0.000     4
5014    CD2  CR61   0.000     5
5015    CE1  CR61   0.000     6
5016    CE2  CR61   0.000     7
5017     CZ    CB   0.150     8
5018     OH    OA  -0.548     8
5019     HH    HO   0.398     8
5020      C     C   0.380     9
5021      O     O  -0.380     9
5022  [ bonds ]
5023      N     H
5024      N    CA
5025     CA     C
5026      C     O
5027     -C     N
5028     CA    CB
5029     CB    CG
5030     CG   CD1
5031     CG   CD2
5032    CD1   CE1
5033    CD2   CE2
5034    CE1    CZ
5035    CE2    CZ
5036     CZ    OH
5037     OH    HH
5038  [ impropers ]
5039      N    -C    CA     H
5040     -C   -CA     N    -O
5041     CA     N     C    CB
5042     CG   CD1   CD2    CB
5043    CD2    CG   CD1   CE1
5044    CD1    CG   CD2   CE2
5045     CG   CD1   CE1    CZ
5046     CG   CD2   CE2    CZ
5047    CD1   CE1    CZ   CE2
5048    CD2   CE2    CZ   CE1
5049     CZ   CE1   CE2    OH
5050
5051 [ URA ]
5052  [ atoms ]
5053      P     P   0.990     0
5054    O1P    OM  -0.635     0
5055    O2P    OM  -0.635     0
5056    O5*    OS  -0.360     0
5057    C5*   CS2   0.000     1
5058    C4*   CS1   0.160     2
5059    O4*    OS  -0.360     2
5060    C1*   CS1   0.200     2
5061     N1  NR6*  -0.200     3
5062     C6  CR61   0.200     3
5063     C2    CB   0.380     4
5064     O2     O  -0.380     4
5065     N3  NR6*  -0.280     5
5066     H3     H   0.280     5
5067     C4    CB   0.380     6
5068     O4     O  -0.380     6
5069     C5  CR61   0.000     7
5070    C2*   CS1   0.150     8
5071    O2*    OA  -0.548     8
5072    H2*    HO   0.398     8
5073    C3*   CS1   0.000     9
5074    O3*    OS  -0.360    10
5075  [ bonds ]
5076      P   O1P
5077      P   O2P
5078      P   O5*
5079    O5*   C5*
5080    C5*   C4*
5081    C4*   O4*
5082    C4*   C3*
5083    O4*   C1*
5084    C1*    N1
5085    C1*   O2*
5086     N1    C6
5087     N1    C2
5088     C6    C5
5089     C2    O2
5090     C2    N3
5091     N3    H3
5092     N3    C4
5093     C4    O4
5094     C4    C5
5095    C2*   O2*
5096    C2*   C3*
5097    O2*   H2*
5098    C3*   O3*
5099   -O3*     P
5100  [ impropers ]
5101    C4*   O4*   C5*   C3*
5102    C3*   C2*   O3*   C4*
5103    C1*    N1   O4*   C2*
5104     N1    C6    C2   C1*
5105     C2    N1    C6    C5
5106     C6    N1    C2    N3
5107     N1    C6    C5    C4
5108     N1    C2    N3    C4
5109     C6    C5    C4    N3
5110     C2    N3    C4    C5
5111     C2    N3    N1    O2
5112     N3    C4    C2    H3
5113     C4    C5    N3    O4
5114    C2*   O2*   C3*   C1*
5115
5116 [ VAL ]
5117  [ atoms ]
5118      N     N  -0.280     0
5119      H     H   0.280     0
5120     CA   CH1   0.000     1
5121     CB   CH1   0.000     2
5122    CG1   CH3   0.000     3
5123    CG2   CH3   0.000     4
5124      C     C   0.380     5
5125      O     O  -0.380     5
5126  [ bonds ]
5127      N     H
5128      N    CA
5129     CA     C
5130      C     O
5131     -C     N
5132     CA    CB
5133     CB   CG1
5134     CB   CG2
5135  [ impropers ]
5136      N    -C    CA     H
5137     -C   -CA     N    -O
5138     CA     N     C    CB
5139     CB   CG2   CG1    CA
5140
5141 [ ZN ]
5142  [ atoms ]
5143     ZN    ZN   2.000     0