share/top/gmx.ff/aminoacids.hdb

   1 ABU     1
   2 1       1       H       N       -C      CA
   3 ACEH    1
   4 3       4       HA      CA      C       O
   5 AIB     1
   6 1       1       H       N       -C      CA
   7 ALA     1
   8 1       1       H       N       -C      CA
   9 ARG     4
  10 1       1       H       N       -C      CA
  11 1       1       HE      NE      CD      CZ
  12 2       3       HH1     NH1     CZ      NE
  13 2       3       HH2     NH2     CZ      NE
  14 ARGN    4
  15 1       1       H       N       -C      CA
  16 1       1       HE      NE      CD      CZ
  17 1       2       HH1     NH1     CZ      NE
  18 2       3       HH2     NH2     CZ      NE
  19 ASN     2
  20 1       1       H       N       -C      CA
  21 2       3       HD2     ND2     CG      CB
  22 ASP     1
  23 1       1       H       N       -C      CA
  24 ASP1    2
  25 1       1       H       N       -C      CA
  26 1       2       HD1     OD1     CG      CB
  27 ASPH    2
  28 1       1       H       N       -C      CA
  29 1       2       HD2     OD2     CG      CB
  30 BEN     7
  31 1       1       H2      C2      C1      C3
  32 1       1       H3      C3      C2      C4
  33 1       1       H4      C4      C3      C5
  34 1       1       H5      C5      C4      C6
  35 1       1       H6      C6      C5      C1
  36 2       3       H1      N1      C7      C1
  37 2       3       H2      N2      C7      C1
  38 CYS2    1
  39 1       1       H       N       -C      CA
  40 CYSH    2
  41 1       1       H       N       -C      CA
  42 1       2       HG      SG      CB      CA
  43 FAD     7
  44 2       3       HN6     AN6     AC6     AC5
  45 1       2       HO2*    AO2*    AC2*    AC1*
  46 1       2       HO3*    AO3*    AC3*    AC2*
  47 1       2       H4*     O4*     C4*     C5*
  48 1       2       H3*     O3*     C3*     C4*
  49 1       2       H2*     O2*     C2*     C3*
  50 1       2       H3      N3      C4      C4A
  51 GLN     2
  52 1       1       H       N       -C      CA
  53 2       3       HE2     NE2     CD      CG
  54 GLU     1
  55 1       1       H       N       -C      CA
  56 GLUH    2
  57 1       1       H       N       -C      CA
  58 1       2       HE2     OE2     CD      CG
  59 GLY     1
  60 1       1       H       N       -C      CA
  61 HIS1    2
  62 1       1       H       N       -C      CA
  63 1       1       HD1     ND1     CG      CE1
  64 HISA    2
  65 1       1       H       N       -C      CA
  66 1       1       HD1     ND1     CG      CE1
  67 HISB    2
  68 1       1       H       N       -C      CA
  69 1       1       HE2     NE2     CE1     CD2
  70 HISH    3
  71 1       1       H       N       -C      CA
  72 1       1       HD1     ND1     CG      CE1
  73 1       1       HE2     NE2     CE1     CD2
  74 HO4     1
  75 3       10      HW      OW
  76 HOH     1
  77 2       7       HW      OW
  78 HYP     1
  79 1       2       HD1     OD1     CG      CB
  80 ILE     1
  81 1       1       H       N       -C      CA
  82 LEU     1
  83 1       1       H       N       -C      CA
  84 LYS     2
  85 1       1       H       N       -C      CA
  86 2       4       HZ      NZ      CE      CD
  87 LYSH    2
  88 1       1       H       N       -C      CA
  89 3       4       HZ      NZ      CE      CD
  90 MET     1
  91 1       1       H       N       -C      CA
  92 NAC     1
  93 1       1       H       N       -C      CA
  94 NACH    2
  95 1       1       H       N       -C      CA
  96 3       4       HA      CA      N       NH
  97 NH2     1
  98 2       3       H       N       -C      -CA
  99 PHE     6
 100 1       1       H       N       -C      CA
 101 1       1       HD1     CD1     CG      CE1
 102 1       1       HD2     CD2     CG      CE2
 103 1       1       HE1     CE1     CD1     CZ
 104 1       1       HE2     CE2     CD2     CZ
 105 1       1       HZ      CZ      CE1     CE2
 106 PHEU    1
 107 1       1       H       N       -C      CA
 108 PHL     7
 109 1       1       H       N       -C      CA
 110 1       1       HD1     CD1     CG      CE1
 111 1       1       HD2     CD2     CG      CE2
 112 1       1       HE1     CE1     CD1     CZ
 113 1       1       HE2     CE2     CD2     CZ
 114 1       1       HZ      CZ      CE1     CE2
 115 1       2       HY      OY      CX      CA
 116 SER     2
 117 1       1       H       N       -C      CA
 118 1       2       HG      OG      CB      CA
 119 TFE     1
 120 1       2       H       O       CH2     C
 121 THR     2
 122 1       1       H       N       -C      CA
 123 1       2       HG1     OG1     CB      CA
 124 TRP     7
 125 1       1       H       N       -C      CA
 126 1       1       HD1     CD1     CG      NE1
 127 1       1       HE1     NE1     CD1     CE2
 128 1       1       HE3     CE3     CD2     CZ3
 129 1       1       HZ3     CZ3     CE3     CH2
 130 1       1       HH2     CH2     CZ3     CZ2
 131 1       1       HZ2     CZ2     CE2     CH2
 132 TRPU    2
 133 1       1       H       N       -C      CA
 134 1       1       HE1     NE1     CD1     CE2
 135 TYR     6
 136 1       1       H       N       -C      CA
 137 1       1       HD1     CD1     CG      CE1
 138 1       1       HD2     CD2     CG      CE2
 139 1       1       HE1     CE1     CD1     CZ
 140 1       1       HE2     CE2     CD2     CZ
 141 1       2       HH      OH      CZ      CE1
 142 TYRU    2
 143 1       1       H       N       -C      CA
 144 1       2       HH      OH      CZ      CE1
 145 VAL     1
 146 1       1       H       N       -C      CA